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MALDI-TOF MS快速鉴定耐万古霉素屎肠球菌及其流行病学分型性能分析
被引量:
4
1
作者
吴思颖
王晓庆
+5 位作者
刘山泉
肖玉玲
何超
马莹
谢轶
康梅
《检验医学》
CAS
2020年第5期470-475,共6页
目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴别van A型万古霉素耐药屎肠球菌(VREfm)和万古霉素敏感屎肠球菌(VSEfm),并对VREfm进行流行病学相关性分析。方法收集139株屎肠球菌临床分离株,其中VREfm66株、VSEfm73株...
目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴别van A型万古霉素耐药屎肠球菌(VREfm)和万古霉素敏感屎肠球菌(VSEfm),并对VREfm进行流行病学相关性分析。方法收集139株屎肠球菌临床分离株,其中VREfm66株、VSEfm73株。采用聚合酶链反应(PCR)确定66株VREfm的万古霉素耐药基因。采用MALDI-TOFMS鉴定屎肠球菌。随机选取45株VREfm和50株VSEfm,采用ClinProTools 3.0软件对质谱峰进行分析并建立模型,用最佳模型验证另外的21株VREfm和23株VSEfm。随机选取21株VREfm进行多位点序列分型(MLST)分析,并采用MALDI-TOF MS对其进行层次聚类分析。结果MALDI-TOF MS鉴定出所有菌株均为屎肠球菌,鉴定分值为2.321~2.602。66株VREfm均为vanA基因型。采用ClinProTools 3.0软件建立的最佳模型进行外部验证时,敏感性和特异性分别为95.2%和95.7%。21株VREfm共有7种序列分型(ST)型别,以ST78最常见。MALDI-TOF MS将21株VREfm分为4个集群,绝大多数ST78菌株被归于同一集群,与ST78高度相关的其他ST型别也被归于此集群。结论在严格控制实验条件的前提下,MALDI-TOF MS可快速区分vanA型VREfm和VSEfm,但无法区分与VREfm高度相关的ST型别。
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关键词
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
万古霉素耐药屎肠球菌
万古霉素敏感屎肠球菌
多位
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职称材料
题名
MALDI-TOF MS快速鉴定耐万古霉素屎肠球菌及其流行病学分型性能分析
被引量:
4
1
作者
吴思颖
王晓庆
刘山泉
肖玉玲
何超
马莹
谢轶
康梅
机构
四川大学华西医院实验医学科
出处
《检验医学》
CAS
2020年第5期470-475,共6页
文摘
目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴别van A型万古霉素耐药屎肠球菌(VREfm)和万古霉素敏感屎肠球菌(VSEfm),并对VREfm进行流行病学相关性分析。方法收集139株屎肠球菌临床分离株,其中VREfm66株、VSEfm73株。采用聚合酶链反应(PCR)确定66株VREfm的万古霉素耐药基因。采用MALDI-TOFMS鉴定屎肠球菌。随机选取45株VREfm和50株VSEfm,采用ClinProTools 3.0软件对质谱峰进行分析并建立模型,用最佳模型验证另外的21株VREfm和23株VSEfm。随机选取21株VREfm进行多位点序列分型(MLST)分析,并采用MALDI-TOF MS对其进行层次聚类分析。结果MALDI-TOF MS鉴定出所有菌株均为屎肠球菌,鉴定分值为2.321~2.602。66株VREfm均为vanA基因型。采用ClinProTools 3.0软件建立的最佳模型进行外部验证时,敏感性和特异性分别为95.2%和95.7%。21株VREfm共有7种序列分型(ST)型别,以ST78最常见。MALDI-TOF MS将21株VREfm分为4个集群,绝大多数ST78菌株被归于同一集群,与ST78高度相关的其他ST型别也被归于此集群。结论在严格控制实验条件的前提下,MALDI-TOF MS可快速区分vanA型VREfm和VSEfm,但无法区分与VREfm高度相关的ST型别。
关键词
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
万古霉素耐药屎肠球菌
万古霉素敏感屎肠球菌
多位
Keywords
Matrix-assisted
laser
desorption
ionization-time
of
flight
mass
spectrometry
vancomycin
-resistant
enterococcus
faecium
vancomycin
-
susceptible
enterococcus
faecium
Multilocus
sequence
typing
分类号
R446.1 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MALDI-TOF MS快速鉴定耐万古霉素屎肠球菌及其流行病学分型性能分析
吴思颖
王晓庆
刘山泉
肖玉玲
何超
马莹
谢轶
康梅
《检验医学》
CAS
2020
4
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
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