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基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病病原分型的初步研究
被引量:
9
1
作者
李桂满
罗春蕊
+4 位作者
刘艳艳
姜黎黎
周晓芳
寸建萍
田炳均
《中国病毒病杂志》
CAS
2021年第4期271-274,共4页
目的评估基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原分型方法的准确性,建立快速简易的手足口病病原分型方法。方法用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对...
目的评估基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原分型方法的准确性,建立快速简易的手足口病病原分型方法。方法用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对2020年云南省曲靖市送检的49株已用VP1区基因序列分型的肠道病毒进行VP4/VP2结合区基因扩增并测序,获得VP4/VP2结合区分型结果。将VP4/VP2结合区基因分型结果与VP1区分型结果进行一致性评价,利用Mega 5.2软件对毒株基因组序列进行分析。结果49株肠道病毒经VP4/VP2结合区基因序列分型,共分出5个型别,包括肠道病毒(enterovirus,EV)-A组48株4个型别,EV-B组1株1个型别,未分离到EV-C、EV-D。与VP1区分型结果比较,EV-A、EV-B组病毒分型符合率100%,但EV-B组病毒只检测到1株。结论基于VP4/VP2结合区的手足口病病原分型方法对EV-A组病毒能准确分型,对EV-B、EV-C和EV-D组病毒的分型准确率有待积累更多病毒型别进一步研究。
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关键词
手足口病
vp
4
/
vp
2
结合
区
测序分型
肠道病毒
柯萨奇病毒
原文传递
题名
基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病病原分型的初步研究
被引量:
9
1
作者
李桂满
罗春蕊
刘艳艳
姜黎黎
周晓芳
寸建萍
田炳均
机构
昆明市疾病预防控制中心微生物检验科
云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所
出处
《中国病毒病杂志》
CAS
2021年第4期271-274,共4页
基金
国家“十三五”艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项(2017ZX10103010)。
文摘
目的评估基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原分型方法的准确性,建立快速简易的手足口病病原分型方法。方法用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对2020年云南省曲靖市送检的49株已用VP1区基因序列分型的肠道病毒进行VP4/VP2结合区基因扩增并测序,获得VP4/VP2结合区分型结果。将VP4/VP2结合区基因分型结果与VP1区分型结果进行一致性评价,利用Mega 5.2软件对毒株基因组序列进行分析。结果49株肠道病毒经VP4/VP2结合区基因序列分型,共分出5个型别,包括肠道病毒(enterovirus,EV)-A组48株4个型别,EV-B组1株1个型别,未分离到EV-C、EV-D。与VP1区分型结果比较,EV-A、EV-B组病毒分型符合率100%,但EV-B组病毒只检测到1株。结论基于VP4/VP2结合区的手足口病病原分型方法对EV-A组病毒能准确分型,对EV-B、EV-C和EV-D组病毒的分型准确率有待积累更多病毒型别进一步研究。
关键词
手足口病
vp
4
/
vp
2
结合
区
测序分型
肠道病毒
柯萨奇病毒
Keywords
Hand
foot and mouth disease
vp
4
/
vp
2
junction region
Typing by sequencing
Enterovirus
Coxackievirus
分类号
R512 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病病原分型的初步研究
李桂满
罗春蕊
刘艳艳
姜黎黎
周晓芳
寸建萍
田炳均
《中国病毒病杂志》
CAS
2021
9
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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