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鸭病毒性肝炎病毒分离鉴定及VP1基因序列分析 被引量：8
1
作者 王劭 朱小丽 +3 位作者 程晓霞 陈仕龙 林锋强 陈少莺 《福建农业学报》 CAS 2008年第4期359-363,共5页
应用无母源抗体的鸭胚从疑似病毒性鸭肝炎的病麻鸭肝脏中分离到1株病毒。该分离毒能致死鸡胚、番鸭胚和麻鸭胚,死胚尿囊液均无血凝性;病毒能被鸭病毒性肝炎高免血清特异性中和;病毒人工感染3日龄麻鸭发病率和死亡率均达50%,并从病死鸭... 应用无母源抗体的鸭胚从疑似病毒性鸭肝炎的病麻鸭肝脏中分离到1株病毒。该分离毒能致死鸡胚、番鸭胚和麻鸭胚,死胚尿囊液均无血凝性;病毒能被鸭病毒性肝炎高免血清特异性中和;病毒人工感染3日龄麻鸭发病率和死亡率均达50%,并从病死鸭肝脏中回收到分离毒;RT-PCR扩增结果表明分离毒为I型DHV阳性,同时将此扩增的1 052 bp目的片段克隆到pMD18-T载体,对重组阳性质粒进行序列测定和分析表明分离毒的VP1基因与台湾省分离株DHV-03D的亲缘关系最近,同源率为95.7%,对VP1氨基酸潜在位点分析发现该分离毒具有野毒的分子特征。上述结果表明该分离毒为Ⅰ型鸭肝炎病毒,命名为DHV-NA株。 展开更多
关键词 鸭病毒性肝炎病毒 分离 鉴定 vp1基因序列
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基于VP1区基因序列测定的肠道病毒分型方法在手足口病病原鉴定中的应用 被引量：1
2
作者 邓红 黄永迪 +2 位作者 阿依古丽.伊尔哈力 马合木提 岳锡宏 《疾病预防控制通报》 2016年第6期1-4,共4页
目的应用基于VP1区基因序列测定的分子分型方法鉴定手足口病相关肠道病毒病原型别。方法使用肠道病毒VP1区种属特异性,采用逆转录—聚合酶链式反应(RT-PCR)方法扩增VP1区基因序列,对扩增产物进行序列测定,运用Chromas Pro1.7.6、MEGA 5... 目的应用基于VP1区基因序列测定的分子分型方法鉴定手足口病相关肠道病毒病原型别。方法使用肠道病毒VP1区种属特异性,采用逆转录—聚合酶链式反应(RT-PCR)方法扩增VP1区基因序列,对扩增产物进行序列测定,运用Chromas Pro1.7.6、MEGA 5.05等生物信息学软件进行序列核对及拼接,将序列提交肠道病毒分型网站(Enterovirus Genotyping Tool 0.5)鉴定型别。结果 40份其他肠道病毒(非EV-A71、非CVA16)核酸阳性的手足口病病例临床标本,先行采用商品化实时荧光RT-PCR试剂盒鉴定出31份柯萨奇病毒A组6型(CVA6)、2份柯萨奇病毒A组10型(CVA10);对其余待鉴定的7份样本,采用肠道病毒特异性引物进行VP1基因序列扩增和测序并分析,鉴定出柯萨奇病毒A组4型(CVA4)4株和A组9型(CVA9)、埃可病毒14(E-14)各1株,另1株为EV-A71。结论基于VP1区基因序列测定的肠道病毒分型方法具有较好的敏感性和简便、快速的特点,可用于手足口病及其他肠道病毒感染的实验室诊断和相关的研究。 展开更多
关键词 肠道病毒 vp1基因序列 分型鉴定
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2015—2016年新疆EV71VP1区基因特征分析
3
作者 邓红 黄永迪 +2 位作者 樊旭成 马合木提 岳锡宏 《疾病预防控制通报》 2017年第1期1-4,共4页
目的分析并掌握2015—2016年新疆引起手足口病的EV71毒株的基因特征。方法收集2015年和2016年新疆各地(州)手足口病临床样本,从EV71阳性样本中随机抽取56份(2015年和2016年各28份),扩增VP1区基因并进行序列测定,用Chromas Pro 1.7.6,Bio... 目的分析并掌握2015—2016年新疆引起手足口病的EV71毒株的基因特征。方法收集2015年和2016年新疆各地(州)手足口病临床样本,从EV71阳性样本中随机抽取56份(2015年和2016年各28份),扩增VP1区基因并进行序列测定,用Chromas Pro 1.7.6,Bio Edit 7.1.9及MEGA 5.05等软件分析序列。结果共获得51株毒株的VP1区基因序列,新疆株之间核苷酸序列同源性为93.5%~100.0%,EV71新疆株与EV71 C4a基因亚型代表株同源性最高,为95.4%~97.9%,与EV71 C4b基因亚型代表株同源性为90.0%~93.2%,与EV71原型株之间同源性仅为81.9%~83.6%;多数2015年新疆株与2014年深圳株(SHZH2014JB141330327)及2015年福建株(FJQZ246/CHN/2015)亲缘关系较近,核苷酸同源性为97.6%~99.2%;多数2016年毒株与2016年北京株(BJ2016/5XCHFM-155)亲缘关系更近,核苷酸序列同源性为98.7%~99.5%。结论 2015年和2016年EV71新疆株均属于C4a基因亚型,相互之间同源性较高,与国内其他地区同时期毒株关系较近;2015年与2016年EV71新疆株在进化树上有分别归属两支的趋势。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71型 vp1基因序列
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鸡群中鸡传染性贫血病原与抗体检测及分离株VP1基因序列分析
4
作者 冯笑艳 胡明雪 +10 位作者 林雨萌 刘长军 李凯 祁小乐 崔红玉 高立 王素艳 陈运通 王笑梅 张艳萍 高玉龙 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期52-58,共7页
为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群... 为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群病原阳性鸡分离到的分离株进行VP1基因序列分析。结果显示,B群和S群CAV抗体阳性率分别为62.7%(79/126)和68.2%(88/129),病原阳性率分别为43.0%(49/114)和62.3%(48/77),其中,B群和S群中抗体和病原双阴性的鸡分别为23.7%(27/114)和15.6%(12/77),而抗体和病原双阳性的鸡分别高达28.1%(32/114)和46.8%(36/77);在双阳性鸡中,B群和S群分别有62.5%(20/32)和58.3%(21/36)抗体滴度在1.0×10^(4)及以上,从B群病原阳性鸡全血中分离到一株CAV(HLJ/2022株),分离株HLJ/2022第394位氨基酸为谷氨酰胺,具有强毒的分子特征;两个鸡群的环境拭子CAV阳性率为10.0%(3/30),存在于消毒前的鸡蛋表面、更衣处和鞋底。研究表明,检测鸡群的CAV抗体阳性率在62.7%以上,病原阳性率在43.0%以上,抗体滴度在1.0×104及以上CAV仍可存在,CAV流行株(HLJ/2022)具有强毒分子特征,鸡群环境中存在CAV污染,结果为CIA防控提供重要的参考意见。 展开更多
关键词 鸡传染性贫血病毒 血清学检测 病原学检测 病毒分离鉴定 vp1基因序列分析
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人类埃可病毒7型的基因特征分析 被引量：2
5
作者 黄国斐 田炳均 +3 位作者 丁峥嵘 汤晶晶 张杰 赵智娴 《中国病毒病杂志》 CAS 2012年第5期374-378,共5页
目的对来自11个国家和中国2个省份不同时间分离的60株埃可病毒7型(ECHO virus 7,ECH-O 7)病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank中用BLASTN软件搜索不同国家、不同时间发表的ECHO 7VP1区基因序列,共搜索到97个序列,去除相同序列后,... 目的对来自11个国家和中国2个省份不同时间分离的60株埃可病毒7型(ECHO virus 7,ECH-O 7)病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank中用BLASTN软件搜索不同国家、不同时间发表的ECHO 7VP1区基因序列,共搜索到97个序列,去除相同序列后,共得到60株ECHO 7病毒VP1区序列,用MEGA软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统发生树。结果 60株病毒可分为4个基因型(基因型A～D),A基因型单独由ECHO 7原型株Wallace组成,B、C基因型各由1个亚型组成,D基因型由3个亚型组成,每个亚型又分为不同的组。不同毒株的核苷酸差异率为5.9%～23.2%(氨基酸差异率为1.0%～13.0%),不同基因型之间的核苷酸差异率为15.4%～22.5%(氨基酸差异率为1.7%～7.3%)。结论 ECHO 7病毒存在不同的基因型/亚型,不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间,同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。 展开更多
关键词 埃可病毒7型 基因特征分析 进化树 vp1区基因序列
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柯萨奇病毒A组16型连续四年分离株基因差异研究
6
作者 郑官增 袁文平 +3 位作者 李桂霞 裘丹红 沈伟伟 王金富 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第3期316-318,共3页
目的了解同一地区不同年份CA16基因变异状况。方法在同一地区用同一方法分离CA16；随机抽取第一代细胞分离到的病毒株，测定VPl区基因序列，应用DNAstar和DNAman分子生物学软件对VPl基因进行分析比较。结果在2008年一2011年从104份标本... 目的了解同一地区不同年份CA16基因变异状况。方法在同一地区用同一方法分离CA16；随机抽取第一代细胞分离到的病毒株，测定VPl区基因序列，应用DNAstar和DNAman分子生物学软件对VPl基因进行分析比较。结果在2008年一2011年从104份标本中分离到47株CA16，病毒分离阳性率为45．2％；4年来，8株CA16核苷酸同源性为90．3％-100．0％，其中2010年分离的二株病毒核苷酸同源性为90．3％；8株CA16氨基酸同源性为97．9％-100．0％。结论由于在同一地区不同时间分离的CA16基因存在较大差异，因此选择CA16疫苗株时，应进行各种基因型及同一基因亚型中氨基酸变异较大毒株的交叉保护试验。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 同一地区不同年份 vp1区基因序列 疫苗株选择
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