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VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例
被引量：
1
1
作者
郑舒琳
钟容臻
+1 位作者
代亚楠
蔡开聪
《化学教育（中英文）》
CAS
北大核心
2022年第24期95-100,共6页
在“计算机在化学中的应用”课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导...
在“计算机在化学中的应用”课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导学生从定性和定量的角度对多肽与水分子间的氢键相互作用机制进行解析,能够丰富教师课堂教学手段,深化学生宏微观探析、证据推理与模型认知的化学学科核心能力。
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关键词
vmd
软件
氢键
径向分布函数
空间分布函数
原文传递
肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用
被引量：
6
2
作者
郑荣珍
严思仪
+2 位作者
刘亚男
杜芬芬
蔡开聪
《化学教育》
CAS
北大核心
2016年第12期67-70,共4页
主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分子瞬态结构进行统...
主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分子瞬态结构进行统计分析,有助于学生深化对蛋白质倾向于形成的二级结构的认识。
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关键词
vmd
软件
二级结构
蛋白质
可视化
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职称材料
题名
VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例
被引量：
1
1
作者
郑舒琳
钟容臻
代亚楠
蔡开聪
机构
福建师范大学化学与材料学院、福建省先进材料化工基础重点实验室
福建省理论与计算化学重点实验室
出处
《化学教育（中英文）》
CAS
北大核心
2022年第24期95-100,共6页
基金
国家自然科学基金(21103021)
福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划
+1 种基金
福建师范大学2022年大学生创新训练计划项目
福建师范大学教学改革研究项目(I202002103)。
文摘
在“计算机在化学中的应用”课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导学生从定性和定量的角度对多肽与水分子间的氢键相互作用机制进行解析,能够丰富教师课堂教学手段,深化学生宏微观探析、证据推理与模型认知的化学学科核心能力。
关键词
vmd
软件
氢键
径向分布函数
空间分布函数
Keywords
vmd
software
hydrogen
bond
radial
distribution
functions
spatial
distribution
functions
分类号
O641.3-4 [理学—物理化学]
G642 [理学—化学]
原文传递
题名
肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用
被引量：
6
2
作者
郑荣珍
严思仪
刘亚男
杜芬芬
蔡开聪
机构
福建师范大学化学与化工学院
福建省理论与计算化学重点实验室
出处
《化学教育》
CAS
北大核心
2016年第12期67-70,共4页
基金
国家自然科学基金(21103021)
福建省高校杰出青年科学人才培育计划(JA13063)
福建师范大学大学生创新创业项目(201510394056)
文摘
主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分子瞬态结构进行统计分析,有助于学生深化对蛋白质倾向于形成的二级结构的认识。
关键词
vmd
软件
二级结构
蛋白质
可视化
Keywords
vmd
software
secondary
structure
proteim
visualization
分类号
O629.73-4 [理学—有机化学]
G652 [理学—化学]
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职称材料
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作者
出处
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1
VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例
郑舒琳
钟容臻
代亚楠
蔡开聪
《化学教育（中英文）》
CAS
北大核心
2022
1
原文传递
2
肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用
郑荣珍
严思仪
刘亚男
杜芬芬
蔡开聪
《化学教育》
CAS
北大核心
2016
6
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职称材料
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