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鸡VLDLR基因多态性与蛋黄性状的关联分析 被引量:12
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作者 曹顶国 周艳 +6 位作者 雷秋霞 韩海霞 李福伟 李桂明 盛倩 王存芳 逯岩 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期849-856,共8页
本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 46... 本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 467nt处的G→A突变(V8467)和第17内含子13 876nt处的A→G突变(V13876)。最小二乘分析结果表明,V8467对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄高度有显著影响(P<0.05);V13876对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄比率和蛋黄高度有显著影响(P<0.05);而双倍型对蛋黄质量、蛋黄比率的影响均达到极显著水平(P<0.01),对蛋黄高度的影响达到显著水平(P<0.05)。结果提示:本研究检测到的VLDLR基因的V8467和V13876多态性位点可以作为蛋黄性状的候选分子标记。 展开更多
关键词 vldlr基因 蛋黄性状 SNPS 单倍型 PCR—RFLP
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灵昆鸡VLDLR和CTSD基因多态性与产蛋性状的相关性研究 被引量:3
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作者 张丽萍 刘雅丽 +5 位作者 熊化鑫 曾涛 田勇 周树和 林兴钦 卢立志 《中国农学通报》 2016年第26期6-14,共9页
为了研究极低密度脂蛋白受体(VLDLR)和溶酶体组织蛋白酶(CTSD)的单核苷酸多态性(SNPs),寻找与灵昆鸡产蛋性状相关的候选分子标记,以276只灵昆鸡母鸡为研究对象,采用直接测序法,检测VLDLR和CTSD基因在灵昆鸡中的SNPs,并分析各多态位点不... 为了研究极低密度脂蛋白受体(VLDLR)和溶酶体组织蛋白酶(CTSD)的单核苷酸多态性(SNPs),寻找与灵昆鸡产蛋性状相关的候选分子标记,以276只灵昆鸡母鸡为研究对象,采用直接测序法,检测VLDLR和CTSD基因在灵昆鸡中的SNPs,并分析各多态位点不同基因型与11个产蛋性状的相关性。结果表明:VLDLR基因存在1个突变位点C13444T,该位点不同基因型与哈氏单位、蛋黄重及蛋黄比例呈显著相关(P<0.05),在哈氏单位性状中,ZTW型为优势基因型,在蛋黄重及蛋黄比例性状中,ZCW型为优势基因型;CTSD基因有5个突变位点,其中,T2614C对蛋白高度和哈氏单位有显著影响(P<0.05),C9445T、C9475T对500日龄产蛋量和蛋重显著相关(P<0.05),C9457T对蛋重有显著影响(P<0.05),T11028C位点对蛋白高度有显著影响(P<0.05)。C13444T、C9457T、T11028C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),其他9个位点均处Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。结果提示:VLDLR和CTSD基因多态性可能与产蛋性状有关,可尝试作为灵昆鸡产蛋性状分子标记的候选基因,为以后的选育工作提供理论依据。 展开更多
关键词 vldlr基因 CTSD基因 单核苷酸多态性 产蛋性状
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鸡VLDLR基因在不同组织中的表达分析 被引量:2
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作者 魏瑞 王聪 +2 位作者 杨荔 吴静怡 张汤杰 《畜牧与兽医》 北大核心 2018年第7期60-63,共4页
极低密度脂蛋白受体(VLDLR)是低密度脂蛋白受体家族的一员,能以高亲和力结合富含Apo E的脂蛋白,是机体细胞摄取血液中富含甘油三酯的极低密度脂蛋白(VLDL)的主要受体。本研究旨在探讨VLDLR基因在鸡不同组织内的表达水平和分布情况,... 极低密度脂蛋白受体(VLDLR)是低密度脂蛋白受体家族的一员,能以高亲和力结合富含Apo E的脂蛋白,是机体细胞摄取血液中富含甘油三酯的极低密度脂蛋白(VLDL)的主要受体。本研究旨在探讨VLDLR基因在鸡不同组织内的表达水平和分布情况,为进一步研究VLDLR在肿瘤发生中的变化提供依据。采集成年鸡骨骼肌、肺脏、脂肪、脾脏、肝脏等组织,提取RNA,根据Gen Bank中的鸡VLDLR基因序列设计引物并进行RT-PCR扩增,检测鸡5种组织中VLDLR基因的相对表达水平。结果显示VLDLR基因在鸡不同组织间的表达存在差异,表现为肌肉表达量最高,肺脏和脂肪组织次之,肝脏表达量最低。相对表达量由高到低依次为骨骼肌(10.95±0.14)、肺脏(3.87±0.23)、脂肪组织(3.02±0.11)、脾脏(2.31±0.08)和肝脏(1.00±0.17)。本试验证实VLDLR基因在肺脏有较高的表达量,脾脏也有一定的表达。 展开更多
关键词 vldlr基因 MRNA 实时荧光定量PCR
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高邮鸭极低密度脂蛋白受体基因的克隆与序列分析
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作者 赵南南 王聪 张汤杰 《中国家禽》 北大核心 2016年第1期11-15,共5页
根据Gen Bank中的鸭极低密度脂蛋白受体(VLDLR)序列(登录号:XM_005011641.1)设计并合成引物,采用RT-PCR技术从高邮鸭肌肉组织中克隆出鸭VLDLR基因,并进行克隆和序列测定。结果表明,所获得的高邮鸭VLDLR基因长2 244 bp,编码747个氨... 根据Gen Bank中的鸭极低密度脂蛋白受体(VLDLR)序列(登录号:XM_005011641.1)设计并合成引物,采用RT-PCR技术从高邮鸭肌肉组织中克隆出鸭VLDLR基因,并进行克隆和序列测定。结果表明,所获得的高邮鸭VLDLR基因长2 244 bp,编码747个氨基酸,含一个37个氨基酸信号肽。序列比较发现,VLDLR基因与Gen Bank登录的连城白鸭与白改鸭杂交二代VLDLR基因核苷酸同源性为90.9%,与斑马鱼、人、原鸡等其它动物的VLDLR氨基酸同源性为63.2%~84.5%,表明VLDLR基因存在种的多样性,且亲缘关系越近,同源性越高。鸭VLDLR蛋白质是一个亲水性跨膜蛋白,其二级结构由α-螺旋、β-转角和无规则卷曲构成,在其胞外区有3个N-糖基化位点和8个O-糖基化位点。信号肽分析表明,VLDLR蛋白为分泌性蛋白,最有可能的切割位点位于第36位和37位氨基酸之间。高邮鸭VLDLR基因的成功克隆为进一步研究鸭VLDLR基因表达、生物学活性等奠定基础。 展开更多
关键词 高邮鸭 vldlr基因 克隆 序列分析
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高邮鸭VLDLR基因部分序列的多态性及其与腹脂率的关联分析
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作者 赵南南 张汤杰 《畜牧与兽医》 北大核心 2015年第7期41-44,共4页
极低密度脂蛋白受体(VLDLR)主要功能是结合富含载脂蛋白E的脂蛋白参与甘油三酯的代谢。通过基因测序方法检测了高邮鸭VLDLR基因部分序列的多态性,并利用最小二乘法分析其与腹脂率的关联性。结果显示:在第244 bp处发现G/A转换,同时在第23... 极低密度脂蛋白受体(VLDLR)主要功能是结合富含载脂蛋白E的脂蛋白参与甘油三酯的代谢。通过基因测序方法检测了高邮鸭VLDLR基因部分序列的多态性,并利用最小二乘法分析其与腹脂率的关联性。结果显示:在第244 bp处发现G/A转换,同时在第232 bp处发现C/T转换。群体中第244 bp处等位基因G为优势等位基因,基因频率为0.76,该位点属于同义多态;第232 bp处等位基因C为优势等位基因,基因频率为0.94,该位点属于同义突变。通过卡方检验,两位点均处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态(P>0.05)。最小二乘法分析结果表明,高邮鸭VLDLR基因第244 bp处AG型平均腹脂率(1.52%)极显著低于AA型和GG型(P<0.01);AA基因型腹脂率高于GG型,但两者之间差异不显著。这可能是一种杂合子优势,推测这种多态可能是通过改变VLDLR基因转录的效率而影响到脂肪沉积的。 展开更多
关键词 vldlr基因 多态性 腹脂率
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