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长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
被引量:
3
1
作者
原晓龙
陈剑
+3 位作者
张传光
毕玮
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2016年第1期14-20,24,共8页
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、...
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。
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关键词
长松萝
NRPS
基因克隆
生物信息学分析
分子系统进化分析
诱导表达
下载PDF
职称材料
题名
长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
被引量:
3
1
作者
原晓龙
陈剑
张传光
毕玮
王娟
王毅
机构
云南省林业科学院
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
云南农业大学
出处
《西部林业科学》
CAS
2016年第1期14-20,24,共8页
基金
国家自然科学青年科学基金项目(31400488)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
文摘
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。
关键词
长松萝
NRPS
基因克隆
生物信息学分析
分子系统进化分析
诱导表达
Keywords
usnea
longissimi
NRPS
gene
clone
bioinformatics
analysis
molecular
phylogeny
evolution
inducible
expression
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
R285 [医药卫生—中医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
原晓龙
陈剑
张传光
毕玮
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2016
3
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参考文献
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