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尿苷二磷酸葡萄糖促进三角褐指藻岩藻黄素积累的研究
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作者 陈星 张瑞豪 +2 位作者 潘克厚 李赟 朱葆华 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期52-59,共8页
岩藻黄素(Fucoxanthin)是自然界中丰富的类胡萝卜素,为提高微藻中岩藻黄素的含量,本实验主要通过叶绿素荧光参数法、高效液相色谱法等探究了外源添加不同浓度的尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)对三角褐指藻光合作用能力及岩藻黄素含量的影响。... 岩藻黄素(Fucoxanthin)是自然界中丰富的类胡萝卜素,为提高微藻中岩藻黄素的含量,本实验主要通过叶绿素荧光参数法、高效液相色谱法等探究了外源添加不同浓度的尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)对三角褐指藻光合作用能力及岩藻黄素含量的影响。研究表明,150μmol/L UDPG显著提高了三角褐指藻的光合作用能力,促进了三角褐指藻中岩藻黄素积累,其含量达到(9.57±0.81)mg/g,比对照组提高了161.76%。此外,硅甲藻黄素、硅藻黄素、β-胡萝卜素、紫黄质、叶绿素a和叶绿素c 2的含量分别比对照组提高了84.31%、79.73%、164.74%、123.04%、358.35%和2260.09%。研究结果表明,外源添加150μmol/L UDPG可显著促进三角褐指藻积累岩藻黄素。 展开更多
关键词 三角褐指藻 岩藻黄素 尿苷二磷酸葡萄糖 光合作用
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攀登科学最高峰的第三世界科学家——1970年诺贝尔化学奖得主卢伊斯·弗德里科·莱洛伊尔
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作者 陈彪 芮杨梦琳 +4 位作者 王春秀 朱玥玮 陈羽 黄晓雪 吴又进 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期761-767,共7页
阿根廷生物化学家卢伊斯·弗德里科·莱洛伊尔因发现糖核苷酸及其在碳水化合物生物合成中的作用而获1970年诺贝尔化学奖。莱洛伊尔一生不仅致力于科学研究,还积极推动阿根廷的大学和医学教育,建立了致力于科学研究的坎波马尔基... 阿根廷生物化学家卢伊斯·弗德里科·莱洛伊尔因发现糖核苷酸及其在碳水化合物生物合成中的作用而获1970年诺贝尔化学奖。莱洛伊尔一生不仅致力于科学研究,还积极推动阿根廷的大学和医学教育,建立了致力于科学研究的坎波马尔基金会。本文回顾了莱洛伊尔的科研成果、相关研究背景以及他的科研历程,分析了他能够获得成功的因素;讨论了名师对科研人员学术指导的重要作用、及时调节研究过程中产生的各类情绪的积极意义以及敢于大胆跨界探索对科研人员的重要性。 展开更多
关键词 1970年诺贝尔化学奖 卢伊斯·弗德里科·莱洛伊尔 糖核苷酸 尿苷二磷酸葡萄糖
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尿苷二磷酸葡萄糖的合成研究进展 被引量:4
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作者 祁超 《化学研究》 CAS 2004年第3期73-75,共3页
介绍了化学和酶法合成尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)及酶法合成13C标记UDPG的方法的优缺点及研究进展.
关键词 尿苷二磷酸葡萄糖 合成 化学方法 酶法 碳13标记
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重组β-环糊精糖基转移酶对莱鲍迪苷A的改性研究 被引量:1
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作者 田长城 刑伟 +2 位作者 陶志杰 吴翔宝 满云 《食品科技》 CAS 北大核心 2022年第10期225-230,共6页
为改善莱鲍迪苷A的口感,利用一种重组β-环糊精糖基转移酶对莱鲍迪苷A进行结构修饰,分析了不同糖基供体对催化衍生物的影响,对以尿苷二磷酸葡萄糖(U-DPG)为糖基供体形成的莱鲍迪苷A衍生物的结构进行了表征,同时优化了其催化工艺条件。... 为改善莱鲍迪苷A的口感,利用一种重组β-环糊精糖基转移酶对莱鲍迪苷A进行结构修饰,分析了不同糖基供体对催化衍生物的影响,对以尿苷二磷酸葡萄糖(U-DPG)为糖基供体形成的莱鲍迪苷A衍生物的结构进行了表征,同时优化了其催化工艺条件。结果表明,以U-DPG为糖基供体,重组β-环糊精糖基转移酶可以特异性地在莱鲍迪苷A的C19上以α-1,4糖苷键连接2个葡萄糖基;该酶在60℃、pH8.0条件下催化活性最佳,显示出较好的耐热性和耐碱性。正交实验结果表明在50℃、pH9.0和U-DPG/RA比例为7.5:1的条件下,莱鲍迪苷A衍生物的得率可达到56.3%;此外,与莱鲍迪苷A相比,形成的衍生物在后苦味上相对较弱。研究结果证明了重组β-环糊精糖基转移酶可用于改善莱鲍迪苷A的口感和提升甜菊糖苷产品的品质。 展开更多
关键词 β-环糊精糖基转移酶 莱鲍迪苷A 尿苷二磷酸葡萄糖 后苦味
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酵母UDP-葡萄糖合成途径的优化及黄酮葡萄糖苷的合成
5
作者 王惠敏 杨燕 +2 位作者 田雷瑜 周文龙 王伟 《中国医药生物技术》 2016年第3期229-235,共7页
目的研究在酿酒酵母细胞内高表达大肠杆菌UDP-葡萄糖合成途径的2个关键酶对工程酵母细胞的葡萄糖苷化反应活性的影响。方法利用PCR方法获得大肠杆菌磷酸葡萄糖变位酶(PGM)和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(Gal U)基因,构建整合型表达载体,转化酵... 目的研究在酿酒酵母细胞内高表达大肠杆菌UDP-葡萄糖合成途径的2个关键酶对工程酵母细胞的葡萄糖苷化反应活性的影响。方法利用PCR方法获得大肠杆菌磷酸葡萄糖变位酶(PGM)和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(Gal U)基因,构建整合型表达载体,转化酵母;同时共表达具有催化黄酮葡萄糖苷化的UDP-葡萄糖转移酶,研究摇瓶培养条件下PGM和Gal U基因的表达对工程细胞生物催化黄酮类化合物葡萄糖苷化的影响。结果在酵母细胞内表达大肠杆菌UDP-葡萄糖合成途径的2个关键酶PGM和Gal U,提高了组合表达UDP-葡萄糖转移酶的工程菌生物催化合成野黄芩素-7-O-葡萄糖苷的效率,表明PGM和Gal U基因的高表达能促进UDP-葡萄糖的合成;所构建的工程菌也能催化木犀草素、柚皮素、白杨素、汉黄芩素、木蝴蝶素A、黄芩素、槲皮素以及大豆黄酮等黄酮类化合物的葡萄糖苷化。结论组合表达大肠杆菌PGM和Gal U基因能促进酵母细胞内UDP-葡萄糖的合成,进而提高了工程细胞催化合成黄酮葡萄糖苷的效率。 展开更多
关键词 黄酮类 尿苷二磷酸葡糖 酿酒酵母菌 葡糖磷酸变位酶 葡糖转移酶类
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新生儿高胆红素血症病因的研究进展 被引量:27
6
作者 黄家虎 孙建华 《医学综述》 2021年第4期680-684,共5页
新生儿高胆红素血症(NHB)的发病因素较复杂,包括早产、胎膜早破、感染、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(UGT1A1)基因突变、母乳性黄疸、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)基因突变等多方面,如果治疗不及时易导致胆红素脑病,损害患儿的神经发... 新生儿高胆红素血症(NHB)的发病因素较复杂,包括早产、胎膜早破、感染、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(UGT1A1)基因突变、母乳性黄疸、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)基因突变等多方面,如果治疗不及时易导致胆红素脑病,损害患儿的神经发育,严重威胁患儿身心健康。以往的研究仅对围生或感染等某一方面进行分析,存在局限性。因此,需要对NHB的发病原因进行多方面探究,以明确NHB的发病因素,为NHB的早期治疗与预防提供依据,降低NHB的发生率。 展开更多
关键词 高胆红素血症 围生因素 感染 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶
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中国西南地区新生儿高胆红素血症基因多态性研究 被引量:7
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作者 刘玲 蒋榆辉 +3 位作者 聂潘荣 曾丽梅 段改原 李宇晨 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期672-678,共7页
目的探讨尿苷二磷酸葡萄糖醛基转移酶1A1(UGT1A1)、有机阴离子转运体1B1(SLCO1B1)及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因多态性与中国西南地区新生儿高胆红素血症的易感关联性。方法选取2016年9月至2019年12月籍贯为云南省、贵州省、四川省... 目的探讨尿苷二磷酸葡萄糖醛基转移酶1A1(UGT1A1)、有机阴离子转运体1B1(SLCO1B1)及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因多态性与中国西南地区新生儿高胆红素血症的易感关联性。方法选取2016年9月至2019年12月籍贯为云南省、贵州省、四川省的新生儿高胆红素血症患儿190例为病例组,同时随机选取200例同期住院的无黄疸新生儿为对照组。提取外周血DNA,采用Sequenom芯片进行17个SNP位点分型检测。比较两组间基因型与等位基因频率分布差异。结果病例组190例,男98例、女92例,平均胎龄(38.7±1.2)周。对照组200例,男116例、女84例,平均胎龄(38.9±1.3)周。病例组UGT1A1基因rs873478、rs34946978和rs4148323位点等位基因频率均高于对照组,病例组SLCO1B1基因rs72559748位点等位基因频率低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。2例男性高胆红素血症患儿检出G6PD基因rs72554664变异,检出率为1.05%。病例组和对照组之间风险等位基因个数分布差异有统计学意义(P<0.05),病例组风险等位基因≥2个的比例较高。结论UGT1A1基因rs873478、rs34946978和rs4148323多态性与中国西南地区新生儿高胆红素血症发生风险增加有关。SLCO1B1基因多态性与该地区新生儿高胆红素血症发生无显著关联。G6PD酶活性缺乏可能不是该地区新生儿高胆红素血症的主要风险因素。 展开更多
关键词 尿苷二磷酸葡萄糖醛基转移酶1A1 有机阴离子转运体1B1 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶 高胆红素血症 新生儿
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pH值对普鲁兰多糖发酵的影响及其机理分析 被引量:5
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作者 谈梦飞 高谦 +1 位作者 王建梓 乔长晟 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2018年第5期89-94,共6页
探究不同pH值条件对出芽短梗霉CGMCCNO.7055合成普鲁兰多糖的影响。同时通过测定合成普鲁兰多糖的前体尿苷二磷酸葡萄糖(uridine diphosphate glucose,UDPG)含量及其相关酶磷酸葡萄糖变位酶(phosphoglucomutase,PGM)和UDPG焦磷酸化酶(Ur... 探究不同pH值条件对出芽短梗霉CGMCCNO.7055合成普鲁兰多糖的影响。同时通过测定合成普鲁兰多糖的前体尿苷二磷酸葡萄糖(uridine diphosphate glucose,UDPG)含量及其相关酶磷酸葡萄糖变位酶(phosphoglucomutase,PGM)和UDPG焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UGPase)活性来分析普鲁兰多糖合成机理。结果发现一种双阶段调控pH值的方法,即第一阶段,发酵开始后24 h(OD620<0.5)控制初始pH 6.0;第二阶段,发酵24 h后(OD620>0.5)调控pH值到5.0并维持恒定,此阶段磷酸葡萄糖变位酶(PGM)和UDPG焦磷酸化酶(UGPase)活性最高。采用该方法使普鲁兰多糖产量达到(92.5±2.41)g/L,生物量达到(13.87±0.89)g/L,经相关性检验发现该发酵条件下普鲁兰多糖产量与尿苷二磷酸葡萄糖含量呈显著负相关关系。 展开更多
关键词 出芽短梗霉 普鲁兰多糖 PH值 磷酸葡萄糖变位酶(PGM) UDPG焦磷酸化酶(UGPase) 尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)
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重组大肠杆菌催化橙皮素合成新橙皮苷
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作者 张萱 刘世柯 +2 位作者 曾伟主 周景文 侯颖 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3011-3024,共14页
新橙皮苷是一种黄酮糖苷,广泛应用于食品和药品行业。目前新橙皮苷生产主要通过植物提取法,需要大量的有机溶剂,而生物转化法绿色环保、转化率高,具有较高的经济效益。本研究在大肠杆菌中引入拟南芥来源的糖基转移酶UGT73B2、葡萄来源... 新橙皮苷是一种黄酮糖苷,广泛应用于食品和药品行业。目前新橙皮苷生产主要通过植物提取法,需要大量的有机溶剂,而生物转化法绿色环保、转化率高,具有较高的经济效益。本研究在大肠杆菌中引入拟南芥来源的糖基转移酶UGT73B2、葡萄来源的鼠李糖合酶VvRHM-NRS和柚子来源的鼠李糖转移酶Cm1,2RhaT,构建了新橙皮苷的生物合成路径。通过模块优化和糖基供体强化后,重组菌株在5 L发酵罐中合成新橙皮苷的产量达到4.64 g/L,底物橙皮素的摩尔转化率为45.8%,这是目前报道的微生物中异源合成新橙皮苷的最高产量。本研究为新橙皮苷高产菌株的构建与应用奠定了基础,也为代谢工程改造微生物生产其他黄酮糖苷提供了借鉴。 展开更多
关键词 新橙皮苷 黄酮糖苷 二磷酸尿苷-葡萄糖 大肠杆菌
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基于尿苷二磷酸葡萄糖循环再生系统高效转化酪醇合成红景天苷
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作者 魏晨昱 黄珠莹 +4 位作者 沈知行 张显 饶志明 胡晓清 徐美娟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3127-3141,共15页
红景天苷是一种在食品、医药等领域应用广泛的功能性成分,其传统生产方法为植物提取,原料成本高昂且提取过程繁琐。本研究通过生物合成法,以酪醇为底物高效生产红景天苷。在利用糖基转移酶实现酪醇糖基化的同时,引入蔗糖合酶构建尿苷二... 红景天苷是一种在食品、医药等领域应用广泛的功能性成分,其传统生产方法为植物提取,原料成本高昂且提取过程繁琐。本研究通过生物合成法,以酪醇为底物高效生产红景天苷。在利用糖基转移酶实现酪醇糖基化的同时,引入蔗糖合酶构建尿苷二磷酸葡萄糖(uridine diphosphate glucose,UDPG)循环再生系统。通过比较,筛选出糖基转移酶UGT33以及蔗糖合酶AtSUS,构建重组大肠杆菌(Escherichia coli)BL21/pETDuet-AtSUS-UGT33,并针对基因的拷贝数进行了优化,确定糖基转移酶与蔗糖合酶的最优拷贝数比例为3:1。进一步对重组菌株的全细胞催化条件进行优化,在最适反应温度、pH、菌体量、底物浓度、适量金属离子的最优反应条件下,在5 L发酵罐转化24 h,红景天苷最高产量达到8.17 g/L。本研究为利用微生物高效生产红景天苷提供了一定的参考意义。 展开更多
关键词 红景天苷 糖基转移酶 蔗糖合酶 尿苷二磷酸葡萄糖循环再生 全细胞催化
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UGT1A1杂合突变与伊立替康所致不良反应的真实世界研究
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作者 左靖 孟珺 +4 位作者 李超 夏铮铮 唐浩淳 李安娜 马晓芙 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2024年第1期35-45,共11页
为了研究某三甲肿瘤专科医院患者UGT1A1基因型分布,探索真实世界中患者UGT1A1基因多态性与服用伊立替康后的不良反应的相关性,我们回顾性分析2017年5月至2021年12月该院42例接受UGT1A1基因检测的患者资料,总结其中31例服用伊立替康后其... 为了研究某三甲肿瘤专科医院患者UGT1A1基因型分布,探索真实世界中患者UGT1A1基因多态性与服用伊立替康后的不良反应的相关性,我们回顾性分析2017年5月至2021年12月该院42例接受UGT1A1基因检测的患者资料,总结其中31例服用伊立替康后其血液学以及非血液学不良反应的发生情况。结果表明:UGT1A128基因杂合突变率为21.9%,纯合突变率为4.9%,UGT1A16基因杂合突变率为31.5%,未检测到纯合突变型;本研究中UGT1A16及28杂合突变的患者较野生型患者血液学和非血液学不良反应未见显著性差异,血液学不良反应包括中性粒细胞减少、白细胞减少、血小板减少、血红蛋白减少,非血液学不良反应包括ALT/AST增高、ALP/GGT增高、胆红素增高、乏力、恶心、呕吐、迟发型腹泻;UGT1A16和28双位点突变的患者出现迟发性腹泻的发生率为100%。研究表明,UGT1A16和28双位点杂合突变的患者出现迟发性腹泻风险较高,需引起关注;UGT1A1杂合突变患者应用伊立替康后出现血液学及非血液学不良反应无显著性差异,但需进一步增加样本量证实这一结论。 展开更多
关键词 伊立替康 UGT1A1 尿苷二磷酸葡萄糖糖醛酸转移酶 基因多态性 不良反应
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构建高效糖配体再生重组菌生物催化合成莱鲍迪苷D 被引量:4
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作者 费理文 王勇 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第22期116-122,共7页
利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)蔗糖合酶AtSUS3构建活化糖配体尿苷二磷酸葡萄糖(uridine diphosphate glucose,UDPG)再生体系,与高效催化莱鲍迪苷D(rebaudioside D,RD)合成的糖基转移酶协同偶联完成RD的高效生物催化。从拟南芥cDNA... 利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)蔗糖合酶AtSUS3构建活化糖配体尿苷二磷酸葡萄糖(uridine diphosphate glucose,UDPG)再生体系,与高效催化莱鲍迪苷D(rebaudioside D,RD)合成的糖基转移酶协同偶联完成RD的高效生物催化。从拟南芥cDNA克隆获得AtSUS3基因,将其装配至pET28a获得表达质粒pLW105,随后pLW105与携带糖基转移酶EUGT11基因的质粒共转化大肠杆菌BL21(DE3)构建双酶共表达工程菌。在不添加UDPG或者尿核苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)的条件下,以上述双酶共表达工程菌全细胞催化莱鲍迪苷A(RA)获得的底物摩尔转化率大于80%,RD产量达到930 mg/L。随后构建双酶基因串连质粒pLW108及双酶共表达大肠杆菌BL21(DE3)工程菌。用串连质粒构建的工程菌催化效果与双质粒共转化相同。采用共表达双酶工程菌的发酵破碎粗酶进行催化,结果显示以粗酶催化可简化催化体系,并可将细胞催化体系所需高质量浓度蔗糖用量降至质量浓度5 g/100 mL,同时在不添加外源UDPG的条件下实现RD的高效生物催化,RA底物摩尔转化率达到93%,RD产量约为1 051 mg/L。 展开更多
关键词 甜菊糖苷 莱鲍迪苷D 尿苷二磷酸葡萄糖 蔗糖合酶 UDP-糖基转移酶 生物催化
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尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶的基因克隆及在原核细胞中的表达 被引量:4
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作者 张群伟 张雪峰 +1 位作者 黎文亮 葛忠良 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2000年第2期95-97,共3页
尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶是催化黄原胶生成的酶类之一 ,设想通过增加酶量来达到提高黄原胶产量的最终目的。方法 :提取基因组DNA作为模板 ,通过PCR扩增得到酶基因 ,经DNA体外重组构建表达质粒。结果 :实现在大肠杆菌中的表达 ,并成功转... 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶是催化黄原胶生成的酶类之一 ,设想通过增加酶量来达到提高黄原胶产量的最终目的。方法 :提取基因组DNA作为模板 ,通过PCR扩增得到酶基因 ,经DNA体外重组构建表达质粒。结果 :实现在大肠杆菌中的表达 ,并成功转化黄原胶菌株。转化过程提示黄原胶菌株可能具有某些特殊性。与文献报道比较有异同点。 展开更多
关键词 尿苷二磷酸葡糖脱氢酶 基因克隆 原核细胞 表达
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群体感应动态调控促进大肠杆菌合成红景天苷
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作者 沈玉平 贺茜 +2 位作者 周紫微 何春兰 张祖姣 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第14期110-117,I0001-I0003,共11页
红景天苷是一种高品质天然产物,极具应用和开发价值。目前,大肠杆菌从头合成红景天苷存在产量低和高比例中间产物酪醇残留等问题。为此,在前期获得的苯丙酮酸脱羧酶突变体ARO10F138L/D218G基础上,通过优选合成途径关键酶醇脱氢酶和尿苷... 红景天苷是一种高品质天然产物,极具应用和开发价值。目前,大肠杆菌从头合成红景天苷存在产量低和高比例中间产物酪醇残留等问题。为此,在前期获得的苯丙酮酸脱羧酶突变体ARO10F138L/D218G基础上,通过优选合成途径关键酶醇脱氢酶和尿苷二磷酸葡萄糖糖基转移酶,红景天苷产量达到(605.8±16.8) mg/L。敲除分支途径基因feaB,强化表达尿苷二磷酸葡萄糖合成关键基因pgm和galU,红景天苷产量提高95.0%,达到(1 156.3±44.2) mg/L。针对中间产物酪醇积累和发酵菌体密度低的问题,通过群体感应动态调控合成途径,降低了酪醇比例,减轻了其对底盘细胞的毒性作用,红景天苷产量提高36.3%,达到(1 484.6±21.4) mg/L,OD600值提高31.6%,达到8.18±0.23。在2 L发酵罐中,群体感应动态调控工程菌的红景天苷产量达到4.38 g/L,OD600值达到46.74,分别较对照提高48.2%和26.6%,发酵液中酪醇比例由33.7%下降至17.9%,展现了良好的生产潜力。该研究采用的群体感应动态调控策略,可有效降低中间产物积累,缓解毒性代谢物对底盘细胞的生长抑制,对其他糖苷类天然产物或高毒性化学品的生物合成具有良好的借鉴和参考意义。 展开更多
关键词 红景天苷 大肠杆菌 群体感应 动态调控 醇脱氢酶 尿苷二磷酸葡萄糖糖基转移酶
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UGP2基因与肿瘤关系的研究进展
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作者 杨月娥(综述) 周宇(审校) 《海南医学》 CAS 2023年第1期145-148,共4页
UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)在糖代谢特别是糖原生物合成过程中起重要作用,其将葡萄糖部分从1磷酸葡萄糖转移到MgUTP,生成UDP葡萄糖并释放焦磷酸盐PPi。研究表明,UGP2基因与多种肿瘤关系密切。本文对UGP2基因与肿瘤的关系研究进展做一... UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)在糖代谢特别是糖原生物合成过程中起重要作用,其将葡萄糖部分从1磷酸葡萄糖转移到MgUTP,生成UDP葡萄糖并释放焦磷酸盐PPi。研究表明,UGP2基因与多种肿瘤关系密切。本文对UGP2基因与肿瘤的关系研究进展做一综述。 展开更多
关键词 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2 消化道肿瘤 乳腺癌 白血病 甲状腺乳头状癌 肿瘤的靶向治疗
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尿苷二磷酸-葡萄糖4-差向异构酶编码基因galE影响甘薯青枯菌致病性和碳代谢
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作者 张鸿 林志坚 +6 位作者 祝金栋 林赵淼 李国良 许泳清 刘中华 邱永祥 邱思鑫 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期662-676,共15页
为明确尿苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)-葡萄糖4-差向异构酶编码基因galE的功能,通过构建甘薯青枯菌galE基因敲除菌株ΔgalE及回补菌株CΔgalE,探索galE基因与甘薯青枯菌致病相关表型间的关联及对甘薯青枯菌生理代谢的影响。结果表... 为明确尿苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)-葡萄糖4-差向异构酶编码基因galE的功能,通过构建甘薯青枯菌galE基因敲除菌株ΔgalE及回补菌株CΔgalE,探索galE基因与甘薯青枯菌致病相关表型间的关联及对甘薯青枯菌生理代谢的影响。结果表明:galE基因缺失显著降低了青枯菌对甘薯的致病性,并且影响了致病相关表型。ΔgalE菌落流动性、菌体泳动能力、胞外多糖含量和生物膜形成量均明显低于野生型SPRS911和CΔgalE。在半乳糖代谢途径中,galE基因缺失后,参与尿苷二磷酸葡糖与葡萄糖之间代谢的galU、pgm、glk基因表达量降低,D-葡萄糖-6-磷酸累积;与UDP-半乳糖代谢有关的dgoK、dgoAa、dgoAb、malZ和galM基因表达量升高。galE基因缺失还加强了甘薯青枯菌对于苹果酸的同化作用。上述研究结果说明,galE基因对青枯菌的致病性与碳代谢水平均有明显影响。 展开更多
关键词 甘薯青枯菌 甘薯瘟病 尿苷二磷酸-葡萄糖4-差向异构酶 胞外多糖 半乳糖代谢 碳代谢
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陆地棉UDPGP基因家族的鉴定及抗旱性分析 被引量:1
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作者 陈琴 李多露 +3 位作者 赵杰银 高文举 陈全家 曲延英 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期12-22,共11页
【目的】尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UDPGP)是植物碳水化合物代谢和细胞壁生物合成中的关键酶,但关于棉花UDPGP基因研究较少。对陆地棉UDPGP基因进行全基因组分析,为深入研究UDPGP基因... 【目的】尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UDPGP)是植物碳水化合物代谢和细胞壁生物合成中的关键酶,但关于棉花UDPGP基因研究较少。对陆地棉UDPGP基因进行全基因组分析,为深入研究UDPGP基因在棉花抗逆中的作用提供参考。【方法】利用已公布的陆地棉标准系TM-1基因组数据,通过生物信息学分析方法对陆地棉UDPGP基因进行全基因组鉴定,分析该家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、染色体定位、启动子区顺式作用元件、组织表达特异性和干旱胁迫下的表达模式。【结果】陆地棉UDPGP基因家族包含31个成员,不均等地分布在18条染色体上,可分为5个亚族。顺式作用元件分析发现,大部分UDPGP基因的启动子区域含有响应脱落酸、赤霉素、水杨酸、茉莉酸甲酯的顺式作用元件以及响应干旱的MYB结合位点。转录组分析表明,Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因响应干旱胁迫,且在棉花多个器官中较高水平表达;实时荧光定量聚合酶链式反应结果显示,干旱胁迫下,GhUDPGP10和GhUDPGP26在抗旱材料的根中表达量普遍较高;而在干旱敏感材料中,主要在叶中高表达,推测这两个基因在不同的遗传材料中抗逆作用机制不同。【结论】明确了陆地棉UDPGP基因家族成员的分布特征、结构特征以及系统进化特征,通过表达分析初步揭示了该家族Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因可能在棉花生长发育和抗旱响应中发挥功能,为解析Gh UDPGP基因的抗旱分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 陆地棉 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 抗旱性 表达模式
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尿苷二磷酸-葡萄糖6-脱氢酶在胰腺癌组织中表达及其意义的生物信息学分析 被引量:1
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作者 李文军 任龙飞 +2 位作者 赵素月 王乾合 朱克祥 《中国普通外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期324-332,共9页
背景与目的:尿苷二磷酸-葡萄糖6-脱氢酶(UGDH)是一种将UDP-葡萄糖转化为UDP-葡萄糖醛酸的代谢酶,通过参与糖胺聚糖在肿瘤组织中的生物合成来影响肿瘤的侵袭能力和耐药性。多项研究表明UGDH基因参与多种癌症的发生与发展,然而,目前尚无... 背景与目的:尿苷二磷酸-葡萄糖6-脱氢酶(UGDH)是一种将UDP-葡萄糖转化为UDP-葡萄糖醛酸的代谢酶,通过参与糖胺聚糖在肿瘤组织中的生物合成来影响肿瘤的侵袭能力和耐药性。多项研究表明UGDH基因参与多种癌症的发生与发展,然而,目前尚无胰腺癌中关于UGDH基因的研究,因此本研究应用生物信息学方法研究UGDH在胰腺癌中的表达及其意义。方法:基于Oncomine数据库分析4个数据集中胰腺癌组织中UGDH基因的差异表达;对TCGA中胰腺癌基因表达谱和生存数据进行生存分析。基于UALCAN数据库,分析TCGA中胰腺癌UGDH基因与其他基因的表达相关性,使用Pearson系数法,获得其明显正相关与负相关的基因,分别进行GO与KEGG通路富集分析。基于HGNC数据库提供的人类所有基因的注释,提取胰腺癌中所有mRNA的表达谱,利用GSEA分析软件,进行UGDH基因在胰腺癌中的基因基富集分析;利用GeneMANIA对UGDH基因进行单基因PPI网络分析,并进一步对网络中出现的基因用Metascape进行功能富集分析,用Cytoscape的MCODE插件对网络进行关键子网络分析。结果:UGDH基因在胰腺癌组织中的表达明显上调;UGDH低表达患者较UGDH高表患者总生存率升高、生存期更长(均P<0.05)。GO富集分析发现,UGDH及其共表达基因富集于内膜系统、RNA定位、蛋白酶体蛋白分解代谢过程、核质转运、核酸运输等与癌症相关生物学过程;KEGG通路富集分析显示,差异基因显著富集于内质网蛋白加工、自噬、泛素介导的蛋白水解、蛋白质输出、剪接体、RNA转运、mRNA监测通路、病毒致癌作用、长期抑制作用、结直肠癌、N-聚糖的生物合成、胰腺癌通路、鞘脂信号通路、癌症中的蛋白聚糖、肾细胞癌、人类巨细胞病毒感染、乙肝等癌症相关通路。GSEA分析富集于泛素介导的蛋白水解作用、氨基糖和核苷酸糖代谢、氨酰生物合成、卵母细胞减数分裂� 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 尿苷二磷酸葡糖脱氢酶 计算生物学
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尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)基因调控不同地源灵芝孢子粉次生代谢产物的差异
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作者 李明成 李亚晗 +4 位作者 刘佳琳 兰春阳 孙晓红 赵万涛 王立霞 《北华大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第4期484-489,共6页
目的探讨不同地源灵芝孢子粉携带尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因在转录水平上的差异表达,以及对灵芝多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)含量的影响.方法采集不同地源灵芝孢子粉共7批18... 目的探讨不同地源灵芝孢子粉携带尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因在转录水平上的差异表达,以及对灵芝多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)含量的影响.方法采集不同地源灵芝孢子粉共7批18份,通过水浸煮-醇沉法提取GLP,应用苯酚-硫酸法计算GLP含量.克隆、测序UGPase基因,荧光定量PCR检测UGPase-mRNA.结果灵芝孢子粉GLP检测结果显示:吉林产含量为(3.3610±0.0046)%,云南产含量为(2.8870±0.0059)%,××堂孢子粉含量为(2.3990±0.0053)%,差异具有统计学意义(P<0.05);克隆UGPase基因测序结果显示:不同地域灵芝孢子粉携带UGPase基因序列相同,与Genbank中UGPase基因序列(Sequence:KM260167.1)核苷酸同源性达100%.UGPase-mRNA检测结果显示:吉林产灵芝孢子粉为表达量最高.结论不同地源灵芝孢子粉GLP与UGPase-mRNA相对表达量存在差异.UGPase基因在高多糖灵芝菌株中存在明显的表达优势,与GLP的生物合成呈正相关,该机制为深入研究GLP的生物合成提供了理论依据. 展开更多
关键词 灵芝多糖 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 实时荧光定量PCR 基因表达量
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日本落叶松UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析
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作者 王菁 李爱 +2 位作者 王春国 宋文芹 陈成彬 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2013年第F10期76-81,共6页
以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据,经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UDPGDH)原序列,以该序列两端设计引物,在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列,序列长1443bp,编码480个氨基酸。qRT... 以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据,经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UDPGDH)原序列,以该序列两端设计引物,在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列,序列长1443bp,编码480个氨基酸。qRT—PCR结果分析表明:UDPGDH基因的表达量在落叶松杂交子代中远远高于亲本,正交子代的表达比反交子代高,说明UDPGDH在形成细胞壁半纤维素前体物过程中起着非常重要的作用,暗示UDPGDH在子代的高表达有利于杂种优势的形成。 展开更多
关键词 日本落叶松 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶 CDNA克隆 表达分析
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