植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶 Ⅱ.尿苷二磷酸-葡萄糖焦磷酸化酶 被引量：5

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作者 高振宇 黄大年 《生命的化学》 CAS CSCD 1998年第4期30-34,共5页

植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶Ⅱ．尿苷二磷酸┐葡萄糖焦磷酸化酶高振宇黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词ＵＧＰＵＤＰＧ负协同顺序机制基因表达调控尿苷二磷酸－葡萄糖焦磷酸化酶（ＵＧＰ，ＥＣ２．７．７．９）在植... 植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶Ⅱ．尿苷二磷酸┐葡萄糖焦磷酸化酶高振宇黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词ＵＧＰＵＤＰＧ负协同顺序机制基因表达调控尿苷二磷酸－葡萄糖焦磷酸化酶（ＵＧＰ，ＥＣ２．７．７．９）在植物、动物和细菌中广泛分布，在植物的... 展开更多

关键词 ugp UDPG 负协同 顺序机制 基因表达调控

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羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株UgpB蛋白B细胞抗原表位分析

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作者 周庆安 李军 +3 位作者 潘艳 陈泽祥 杨威 许力干 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第3期26-29,共4页

为了预测羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株Ugp B蛋白B细胞抗原表位情况,试验应用PCR方法对羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株的Ugp B基因进行扩增、克隆和测序,并应用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析Ugp B蛋白的α-螺旋、β-折叠、转... 为了预测羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株Ugp B蛋白B细胞抗原表位情况,试验应用PCR方法对羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株的Ugp B基因进行扩增、克隆和测序,并应用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析Ugp B蛋白的α-螺旋、β-折叠、转角区域和无规卷曲及应用Kyte-Doolittle方法、Karplus-Schulz方法、Emini方法和Jameson-Wolf方法分析蛋白的氨基酸亲水性、蛋白柔性区域、溶剂表面可能性和抗原指数。结果表明：NN1202和LA1105株的Ugp B蛋白在布氏杆菌种间高度保守,Ugp B蛋白的36∽41、48∽57、64∽72、78∽85、115∽19、131∽138、159∽174、180∽191、209∽221、248∽258、273∽280、293∽307、354∽372、378∽386、409∽419位氨基酸序列区域可能是优势B细胞抗原表位。说明Ugp B蛋白序列存在合成肽疫苗的靶位点。 展开更多

关键词 布氏杆菌 NN1202 LA1105 ugp B 抗原表位

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梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析

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作者 廖倩 黄艳 +3 位作者 胡尚连 曹颖 卢学琴 徐刚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期498-502,共5页

以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP（Genebank：KJ525752）。测序结果显示该序列全长1561 ... 以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP（Genebank：KJ525752）。测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422 bp,编码473个氨基酸。梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均含有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NBloop环和l-loop环。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90-379氨基酸,证明Df UGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。 展开更多

关键词 梁山慈竹 ugp 克隆 生物信息学

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铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子偏好性分析 被引量：17

4

作者 孙晶 何涛 +2 位作者 万闰兰 彭小凤 淳泽 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期759-766,共8页

尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主... 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主克隆的铁皮石斛UGP基因(GenBank登录号:KF711982.1)的密码子偏好性,并与其他物种的UGP基因以及基因组进行比较.结果显示,铁皮石斛UGP基因偏好使用A/T结尾的密码子,27种偏好密码子(RSCU>1)中偏好性较强的有TAA和CCU(RSCU≥2).与其他物种的UGP基因密码子使用对比后,发现不同物种UGP基因密码子使用偏好性存在一定差异.在9个所选物种的聚类分析中,发现基于UGP基因CDS序列聚类的进化树比基于RSCU的聚类更与传统的系统发育观点接近.与3种生物基因组密码子使用频率比较发现,与大肠杆菌基因组密码子使用频率差值较大的有23个,与酵母和拟南芥基因组差值较大的均有13个,这预示着铁皮石斛UGP基因在酵母和拟南芥中的表达效率较高.本研究结果为铁皮石斛UGP基因选择最佳的外源表达系统以及提高其表达水平奠定了前期的研究基础. 展开更多

关键词 铁皮石斛 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(ugp) 密码子偏好性 聚类分析

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基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定

5

作者 武乐 闵开元 +4 位作者 柳江枫 梁万丰 杨晔宏 胡刚 杨俊涛 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期147-153,共7页

目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数... 目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。 展开更多

关键词 浸润性乳腺癌 生物标志物 蛋白质编码基因 ugp2 C3orf80 SPC25

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黑木耳UGP基因家族全基因组鉴定及其与菌丝生长多糖合成的相关性研究

6

作者 苏世贤 吴媛 +12 位作者 刘翀 江苏燕 刘青媛 陈孟谈 龙茶 汪淘 徐彦军 田风华 韦金江 郎云龙 牟海林 徐乾城 李伟 《种子》 北大核心 2024年第4期69-80,共12页

黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,... 黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,通过生物信息学分析发现,UGP基因家族成员在真菌体内具有较高的保守性,成员数量少但仍发挥着重要作用,木耳属的4个UGPs则表现出了更高的保守性。在对黑木耳AhUGPs的启动子区域分析中发现了较多的光响应元件和激素响应元件,说明AhUGPs较易受到光和激素调节。在对AhUGPs的表征中,发现AhUGP1的表达水平与菌丝生长速度、菌丝生物量、多糖含量都显著相关,相较于AhUGP2,AhUGP1在菌丝生长和多糖合成中的重要性更高。 展开更多

关键词 黑木耳 ugp基因家族 多糖合成 菌丝生长

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西洋参破壁饮片抗疲劳、耐缺氧、耐低温作用及急性毒性研究 被引量：4

7

作者 唐琳 梅全喜 +4 位作者 高玉桥 林慧 胡莹 彭丽华 成金乐 《今日药学》 CAS 2021年第4期280-283,共4页

目的考察西洋参破壁饮片抗疲劳、耐缺氧和耐低温的药效作用及急性毒性作用,为西洋参破壁饮片的安全有效应用提供参考。方法以传统饮片作为对照,分别采用小鼠负重游泳法、常压耐缺氧和耐低温试验方法观察西洋参破壁饮片的药效作用;采用... 目的考察西洋参破壁饮片抗疲劳、耐缺氧和耐低温的药效作用及急性毒性作用,为西洋参破壁饮片的安全有效应用提供参考。方法以传统饮片作为对照,分别采用小鼠负重游泳法、常压耐缺氧和耐低温试验方法观察西洋参破壁饮片的药效作用;采用最大给药量法观察西洋参破壁饮片的急性毒性。结果同等剂量的西洋参破壁饮片和1/2剂量的西洋参破壁饮片对小鼠抗疲劳和耐缺氧的作用比传统饮片更显著(P<0.05);1/4剂量和1/8剂量的西洋参破壁饮片抗疲劳和耐缺氧的作用与传统饮片相近;以最大给药量法对小鼠灌胃给药西洋参破壁饮片(剂量相当于其传统饮片临床用量的11~22倍),未出现急性毒性反应。结论西洋参破壁饮片比传统饮片具有更显著的抗疲劳、耐缺氧的作用,且未见毒副作用,本研究为西洋参破壁饮片的安全性和高效利用提供初步参考。 展开更多

关键词 西洋参破壁饮片 抗疲劳 耐缺氧 耐低温 急性毒性

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噻菌灵诱导型水稻转化载体在花粉中的诱导条件研究

8

作者 柯建浩 廖耀平 +1 位作者 骆艺 穆虹 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期127-128,共2页

利用噻菌灵诱导pRNAi-IP-UGP2转化植株,对pRNAi-IP-UGP2载体在水稻花粉中的诱导条件及相应诱导效果进行了系统研究。结果表明,用50 mL噻菌灵溶液(0.8%)隔天喷施转化植株,需要在水稻抽穗前10 d以上诱导才能使该载体的IP启动子在花粉中具... 利用噻菌灵诱导pRNAi-IP-UGP2转化植株,对pRNAi-IP-UGP2载体在水稻花粉中的诱导条件及相应诱导效果进行了系统研究。结果表明,用50 mL噻菌灵溶液(0.8%)隔天喷施转化植株,需要在水稻抽穗前10 d以上诱导才能使该载体的IP启动子在花粉中具有较好的驱动效果。 展开更多

关键词 水稻 诱导型启动子 pRNAi-IP-ugp2

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抗尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2单克隆抗体的制备与鉴定 被引量：2

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作者 王婉 高媛 +10 位作者 杨金菊 柳晓兰 鞠艳芳 刘莉 陈志成 刘蓉 迟俊 邢维贤 高建恩 安立国 孙启鸿 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第3期563-566,共4页

本研究制备抗人尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2(UDP-glucose pyrophosphorylase2)的单克隆抗体(mAb)并进行初步鉴定。将正常成人肝组织匀浆离心并分离肝脏胞浆总蛋白,用肝脏胞浆总蛋白免疫BALB/c小鼠,采用杂交瘤技术制备单克隆抗体,通过间... 本研究制备抗人尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2(UDP-glucose pyrophosphorylase2)的单克隆抗体(mAb)并进行初步鉴定。将正常成人肝组织匀浆离心并分离肝脏胞浆总蛋白,用肝脏胞浆总蛋白免疫BALB/c小鼠,采用杂交瘤技术制备单克隆抗体,通过间接ELISA法、Western blot及免疫组织化学的方法对单克隆抗体进行特性鉴定,通过Uni-ZAP XR肝脏cDNA表达文库筛选鉴定抗体特异性。结果表明:通过间接ELISA筛选获得1株可稳定分泌抗人UGP2mAb的杂交瘤细胞系BAD062,其分泌的单克隆抗体的Ig亚类(型)为IgG2b(κ),Western blot结果显示该抗体可以特异地识别分子量为56kD的蛋白;应用单克隆抗体BAD062对人肝脏cDNA表达文库(Uni-ZAPXR)进行筛选,阳性噬菌斑测序结果显示2个阳性克隆插入序列均为UGP2。结论:单克隆抗体BAD062特异地识别抗原UGP2,该抗体可用于ELISA检测、Western blot、免疫组织化学实验,为UGP2的研究提供了有力的工具。 展开更多

关键词 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2 单克隆抗体 CDNA表达文库

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OsUgp2和otsAB基因共转化增强水稻抗旱抗寒能力 被引量：2

10

作者 郑彦丽 穆虹 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期265-272,共8页

本研究通过农杆菌介导的转化技术,将水稻尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(OsUgp2)与大肠杆菌海藻糖-6-磷酸合成酶/海藻糖-6-磷酸合成酶磷脂酶融合基因(otsAB)共表达载体转化水稻愈伤组织,对获得的转基因植株分别进行干旱和寒冷处理,试... 本研究通过农杆菌介导的转化技术,将水稻尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(OsUgp2)与大肠杆菌海藻糖-6-磷酸合成酶/海藻糖-6-磷酸合成酶磷脂酶融合基因(otsAB)共表达载体转化水稻愈伤组织,对获得的转基因植株分别进行干旱和寒冷处理,试图明确OsUgp2和otsAB共表达是否可以进一步提高转基因水稻植株的抗胁迫能力。表型观察结果显示OsUgp2和otsAB共表达植株(ABU)经干旱和寒冷处理后恢复生长的能力,较otsAB和OsUgp2分别过量表达的转化植株(AB和U)均有所提高。定量PCR检测结果显示:经干旱处理后,转化植株ABU中otsAB和OsUgp2的表达量较未处理植株分别提高1.92倍和1.67倍,与转化植株AB和U中otsAB和OsUgp2表达的增加量相近;而寒冷处理后,转化植株ABU中otsAB和Os-Ugp2的表达量分别增加2.68倍和2.04倍,明显高于转化植株AB和U中otsAB和OsUgp2表达的增加量。液相色谱检测结果显示:OsUgp2和otsAB共表达和单表达均可以提高转化植株中海藻糖的生物合成量,且共转化植株ABU中海藻糖的含量在干旱和寒冷处理前后均是最高的。干旱和寒冷处理后,共转化植株ABU中蔗糖含量的增加也较明显。本研究结果表明OsUgp2和otsAB共表达可以增加转基因水稻植株中海藻糖和蔗糖分子的含量,同时转基因水稻植株的抗旱和耐冷胁迫的能力也得到了一定提高。 展开更多

关键词 水稻 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 Osugp2 otsAB 共表达

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UCP600的新变化对出口商的影响及对策

11

作者 郑玮剑 《中国经贸》 2009年第22期12-12,共1页

本文通过对UCP600与UCP500的比较分析，针对UCP600的变化主要对我国出口商的影响进行深入、细致的研究，并对实务中应当注意的问题进行阐述。

关键词 ugp600 新变化 出口商

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猪UGP2基因表达模式和启动子活性分析

12

作者 Yu J Y 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第5期274-274,共1页

猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-t... 猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-time RTPCR结果表明,UGP2在梅山猪肝脏和骨骼肌中高表达;在不同类型的肌纤维中,UGP2在大白猪的比目鱼肌和背最长肌中高表达。在肌纤维发展的不同阶段,UGP2在大白猪早期生长阶段发挥重要作用,而在梅山猪中起作用较晚。此外,UGP2基因5′-侧翼序列具有启动子活性,尤其转录位点上游588bp序列活性最高。 展开更多

关键词 大白猪 梅山猪 ugp2基因 表达

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