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猪解耦联蛋白基因3(UCP3)3′侧翼区突变位点多态性及其对胴体、肉质性状的影响 被引量:11
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作者 涂荣剑 邓昌彦 熊远 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期597-600,共4页
利用PCR-RFLP技术,分析了猪解耦联蛋白基因3(UCP3)的3′侧翼区一碱基变异区Ava 位点的多态性在不同猪群体间的基因型分布及其多态性对猪胴体、肉质性状的影响。结果表明:经χ2独立性检验,发现该多态片段3种基因类型在各品种间分布不一致... 利用PCR-RFLP技术,分析了猪解耦联蛋白基因3(UCP3)的3′侧翼区一碱基变异区Ava 位点的多态性在不同猪群体间的基因型分布及其多态性对猪胴体、肉质性状的影响。结果表明:经χ2独立性检验,发现该多态片段3种基因类型在各品种间分布不一致,杜洛克与中国地方猪种淮南猪、二花脸猪、清平猪、八眉猪相比差异极显著(P<0.01),中国地方猪种间比较差异均不显著(P>0.05);采用最小二乘法以及回归法分析了大白×梅山资源家系F2代139头个体的Ava 位点多态性与相应的胴体、肉质性状的连锁关系,未发现该位点对猪胴体、肉质性状的显著性影响。UCP3基因3′侧翼区多态位点基因片段在各猪群间分布类型的不同显示出中国地方猪种与外来猪种相比所具有的种质差异,但该位点是否用作为改良猪胴体、肉质性状的标记位点并在标记辅助选择中加以应用还有待进一步的研究。 展开更多
关键词 胴体 肉质性状 中国地方猪种 突变位点 蛋白基因 猪群 ucp3 多态性 影响 基因型分布
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秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性 被引量:9
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作者 韩瑞华 昝林森 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期806-812,共7页
采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第... 采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第775位发生G→A突变;AD基因型在951位发生G→T突变。方差分析结果表明,4个群体中AA基因型个体在宰前活体质量、胴体质量、胴体长、眼肌面积、系水力、大理石花纹中显著高于AB、AC、AD基因型个体(P<0.05);AB基因型个体的背膘厚显著高于AA、AC、AD基因型个体(P<0.05)。初步推断,AA基因型为优势基因型,A为优势等位基因,对选择有正向效应。 展开更多
关键词 秦川牛 ucp3基因 PCR-SSCP SNPS
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贵州地方猪种UCP3基因多态性与肉质性状的相关性分析 被引量:9
3
作者 胡倩 王嘉福 冉雪琴 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2008年第13期1-4,45,共5页
解耦联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)是调节能量和脂肪代谢的重要因子。以商品猪(杂交猪)为对照,采用SSCP方法对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的UCP3基因进行了多态性分析。结果表明:3个猪群体中,都检测到了3种基因型(AA、BB、AB),... 解耦联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)是调节能量和脂肪代谢的重要因子。以商品猪(杂交猪)为对照,采用SSCP方法对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的UCP3基因进行了多态性分析。结果表明:3个猪群体中,都检测到了3种基因型(AA、BB、AB),χ2独立性检验结果显示,3种基因型在3个群体间的分布不一致,糯谷猪和萝卜猪以AB基因型为主,杂交猪以BB基因型占优势,杂交猪与地方猪种之间的差异显著(P<0.01);对纯合基因型的UCP3基因片段进行克隆测序,证实AA基因型中UCP3基因外显子6编码区第842位碱基发生了单碱基突变(T→C),导致编码的氨基酸从苏氨酸突变为甲硫氨酸。进一步分析3种基因型与胴体和肉质性状之间的相关性,证明AB基因型个体的肉质最优,贵州地方猪种的大理石纹、肌内脂肪含量和嫩度3项指标显著优于商品猪(P<0.01),因此推测UCP3基因与贵州地方猪种的肉质性状具有相关性,可能是贵州地方猪种肉质性状的候选基因。 展开更多
关键词 肉质性状 ucp3基因 SSCP 胴体
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延边黄牛UCP2、UCP3基因多态性及其与生长性状的关联分析 被引量:6
4
作者 赵祎 王思寒 +5 位作者 刘磊 田佺 柳海星 李钟淑 张君正 戢爽 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第10期3691-3698,共8页
试验旨在探究延边黄牛解耦联蛋白2(uncoupling protein 2,UCP2)和解耦联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因多态性及其与生长性状的相关性。以120头24月龄的延边黄牛为试验对象,提取血液基因组DNA后构建混池,运用DNA测序法对UCP2、U... 试验旨在探究延边黄牛解耦联蛋白2(uncoupling protein 2,UCP2)和解耦联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因多态性及其与生长性状的相关性。以120头24月龄的延边黄牛为试验对象,提取血液基因组DNA后构建混池,运用DNA测序法对UCP2、UCP3基因进行测序分析,应用高分辨率熔解曲线分型技术对延边黄牛UCP2、UCP3基因进行分型检测,并结合生长性状数据进行关联分析。结果显示,在24月龄延边黄牛群体中,UCP2基因53412568 bp处存在C>G突变(g.53412568 C>G),产生2个等位基因:C和G,形成3种基因型:CG(0.358)、GG(0.125)和CC(0.516);UCP3基因53443536 bp处存在C>T突变(g.53443536 C>T),产生2个等位基因:C和T,形成3种基因型:CT(0.383)、CC(0.450)和TT(0.167)。关联分析显示,UCP2基因g.53412568 C>G位点CC基因型体重、腰角宽均显著高于GG基因型,CG基因型个体背高显著高于GG基因型(P<0.05);UCP3基因g.53443536 C>T位点CC基因型胸围显著高于TT基因型(P<0.05)。以上结果表明,UCP2和UCP3基因在延边黄牛生长发育过程中起到一定作用,可为延边黄牛现代分子育种后续研究提供参考。 展开更多
关键词 延边黄牛 ucp2基因 ucp3基因 SNP 生长性状
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岔路黑猪UCP3基因的多态性及其对胴体、肉质性状的影响 被引量:7
5
作者 张金枝 蔡兆伟 +3 位作者 罗玉衡 徐宁迎 郭晓令 沈叶兴 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期439-442,共4页
通过PCR-RFLP研究UCP3基因在岔路黑猪(56头)、皮岔猪(皮特兰×岔路黑猪10头)、嘉兴黑猪(50头)群体中的基因和基因型频率分布,测定21头纯种岔路黑猪的胴体和肉质性状,并利用一般线性模型分析UCP3基因型与以上性状的相关性。结果发现... 通过PCR-RFLP研究UCP3基因在岔路黑猪(56头)、皮岔猪(皮特兰×岔路黑猪10头)、嘉兴黑猪(50头)群体中的基因和基因型频率分布,测定21头纯种岔路黑猪的胴体和肉质性状,并利用一般线性模型分析UCP3基因型与以上性状的相关性。结果发现该基因对岔路猪胴体长、前背膘厚、后背膘厚、三点平均背膘厚有显著影响,且对岔路猪肉质性状中的L值、腿肌pH值、眼肌温度、眼肌导电率影响显著。 展开更多
关键词 岔路黑猪 ucp3基因 胴体性状 肉质性状
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2型糖尿病危险因素的多因素logistic回归分析 被引量:5
6
作者 鲁一兵 缪珩 +3 位作者 王华 何戎华 金卫新 华子春 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期277-280,共4页
目的 探讨多种因素与 2型糖尿病发生的关系。方法 对南京地区汉族 10 6例 2型糖尿病患者和 10 2例正常对照者解偶联蛋白 3(UCP3 )、激素敏感脂酶 (HSL)和蛋白酪氨酸磷酸化酶 1B(PTP 1B)基因的微卫星标记多态性进行分析 ,并结合临床参... 目的 探讨多种因素与 2型糖尿病发生的关系。方法 对南京地区汉族 10 6例 2型糖尿病患者和 10 2例正常对照者解偶联蛋白 3(UCP3 )、激素敏感脂酶 (HSL)和蛋白酪氨酸磷酸化酶 1B(PTP 1B)基因的微卫星标记多态性进行分析 ,并结合临床参数进行多因素非条件logistic回归分析。结果 单因素非条件logistic回归分析结果有显著意义的变量为年龄 ,收缩压 ,空腹胰岛素 ,胆固醇 ,甘油三酯 ,高密度脂蛋白 ,低密度脂蛋白 ,载脂蛋白B ,脂蛋白 (α) ,UCP3 等位基因 1、3、6和 7,HSL等位基因 5和 9。多因素非条件logistic回归分析发现 ,2型糖尿病的发病与UCP3 等位基因 6和 7、收缩压、载脂蛋白B、脂蛋白 (α)呈正相关 ,与HSL等位基因 5、高密度脂蛋白呈负相关 ,均具有统计学意义。结论 UCP3 基因等位基因 6和 7、收缩压、载脂蛋白B、脂蛋白 (α)在南京地区汉族人群 2型糖尿病的发病中可能起一定的作用 ,而HSL基因等位基因 5。 展开更多
关键词 Ⅱ型糖尿病 基因多态性 危险因素 非条件LOGISTIC回归分析 ucp3 HSL PTP-1B
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UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析 被引量:5
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作者 范一萍 王彦芳 陶聪 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第12期3627-3634,共8页
为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 b... 为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP 3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异。结果显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP 3基因表达量显著高于藏猪(P<0.05);在UCP 3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3171^-2928 bp)、CpG island2(-154^-2 bp)和CpG island3(+648^+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpG island2的甲基化水平(42.61%)高于巴马猪(24.49%)。本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26%、17.39%、26.09%、26.09%、26.09%、23.91%和34.78%。在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1)。结果表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP 3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP 3基因的表达。 展开更多
关键词 巴马猪 藏猪 ucp 3基因 脂肪组织 甲基化
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陆川猪与杜洛克猪正反交F1代UCP3基因表达差异研究 被引量:5
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作者 杨芳 龙开旭 +5 位作者 方程 夏利 郭亚芬 兰干球 谢炳坤 江明生 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第3期798-804,共7页
为培育优质猪品系,提高猪肉品质,本试验探索了陆川猪与杜洛克猪正反交F1代及其亲本陆川猪肌内脂肪含量和UCP3基因表达差异。试验分别选取陆川猪、陆川猪与杜洛克猪正反交F1代各8头,采用实时荧光定量RT-PCR方法测定肌肉中UCP3基因mRNA在... 为培育优质猪品系,提高猪肉品质,本试验探索了陆川猪与杜洛克猪正反交F1代及其亲本陆川猪肌内脂肪含量和UCP3基因表达差异。试验分别选取陆川猪、陆川猪与杜洛克猪正反交F1代各8头,采用实时荧光定量RT-PCR方法测定肌肉中UCP3基因mRNA在不同品种猪中的表达量,并测定眼肌面积和肌内脂肪含量,以分析UCP3基因的表达量与脂肪和眼肌面积的相关性。结果显示,3组猪在眼肌面积、肌内脂肪含量和UCP3基因mRNA表达量上均差异显著(P<0.05),且正反交F1代均遗传了杜洛克猪体型大、陆川猪肌内脂肪含量高的优势,UCP3基因的表达量与猪眼肌面积呈极显著负相关,与肌内脂肪含量呈极显著正相关。初步推断UCP3基因可作为影响猪脂肪性状的主效基因。 展开更多
关键词 陆川猪 正反交 肌内脂肪 ucp3基因 相关性
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猪UCP3基因第4内含子BccⅠ多态性检测及其与胴体和肉质性状的关联分析 被引量:5
9
作者 陈哲 于峰祥 +3 位作者 于建宁 徐小波 王公金 徐宁迎 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第6期1338-1343,共6页
为研究UCP3基因与猪胴体和肉质性状的相关性,采用测序结合PCR-RFLP技术检测UCP3基因内含子4内单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP在6个国内外猪种内的多态性分布。结果表明,首次发现一处由A→G突变导致的BccⅠ多态位点。该多态位点基因频率... 为研究UCP3基因与猪胴体和肉质性状的相关性,采用测序结合PCR-RFLP技术检测UCP3基因内含子4内单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP在6个国内外猪种内的多态性分布。结果表明,首次发现一处由A→G突变导致的BccⅠ多态位点。该多态位点基因频率和基因型频率在国内外猪种的分布存在较大差异,在国外猪种中,G等位基因频率较高,地方猪种的A等位基因频率较高。相关性分析结果表明,在长白猪群中,UCP3基因与6~7肋背膘厚有极显著相关性(P<0.01)。在商品猪群内,UCP3基因与6~7肋背膘厚和肌内脂肪含量极显著相关(P<0.01),而且在腰荐结合处,AG基因型个体背膘厚显著高于GG型个体(P<0.05)。因此推测,UCP3基因可能是影响猪脂肪性状的分子育种标记。 展开更多
关键词 ucp3基因 多态性 胴体性状 肉质性状
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安格斯牛UCP2和UCP3基因组织表达规律研究 被引量:3
10
作者 张娟 冯小芳 +6 位作者 母童 虎红红 马正旭 黄增文 王影 顾亚玲 蔡正云 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2021年第5期777-783,共7页
为了研究UCP2基因和UCP3基因在安格斯牛不同组织中的表达规律,运用实时荧光定量PCR技术检测UCP2和UCP3基因在安格斯牛心、肝、脾、肺、肾、大肠、小肠、背最长肌和皮下脂9种组织中的相对表达情况。结果表明:UCP2和UCP3在所检测的组织中... 为了研究UCP2基因和UCP3基因在安格斯牛不同组织中的表达规律,运用实时荧光定量PCR技术检测UCP2和UCP3基因在安格斯牛心、肝、脾、肺、肾、大肠、小肠、背最长肌和皮下脂9种组织中的相对表达情况。结果表明:UCP2和UCP3在所检测的组织中均有表达,且UCP2在肺脏中的相对表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次为脾脏和肾脏,其表达量极显著高于除肺脏外的其他组织(P<0.01),其余组织的表达量虽有差异,差异不显著(P>0.05);UCP3基因在皮下脂中的表达量极显著高于其他各组织(P<0.01),其次为肾脏和肺脏,背最长肌的相对表达量极显著高于大肠、小肠、心脏、肝脏和脾脏组织(P<0.01),其余各组织的相对表达量较低。通过对UCP2和UCP3基因在安格斯牛不同组织中的表达情况进行分析,揭示这两个基因在安格斯牛不同组织中的表达差异,为进一步拓展UCP2和UCP3基因在不同组织中的功能研究提供理论支持,在某种程度上为安格斯牛的育种提供一些基础资料。 展开更多
关键词 ucp2基因 ucp3基因 安格斯牛 组织表达
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杜长大猪UCP3基因克隆及白藜芦醇对其表达的影响 被引量:3
11
作者 崔悦悦 张广杰 +8 位作者 徐晓芙 夏琴 邹辉 江雨航 瞿秋红 蒋钦杨 黄艳娜 郭亚芬 兰干球 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期439-445,共7页
【目的】明确白藜芦醇对杜长大猪UCP3基因表达及脂肪代谢的影响,为揭示猪优良肉质性状形成机制打下基础。【方法】提取2月龄杜长大猪皮下脂肪组织RNA,采用RT-PCR扩增杜长大猪UCP3基因编码区(CDS)序列,运用在线软件对其进行生物信息学分... 【目的】明确白藜芦醇对杜长大猪UCP3基因表达及脂肪代谢的影响,为揭示猪优良肉质性状形成机制打下基础。【方法】提取2月龄杜长大猪皮下脂肪组织RNA,采用RT-PCR扩增杜长大猪UCP3基因编码区(CDS)序列,运用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测白藜芦醇(400 mg/kg,饲喂30 d)对杜长大猪脂肪中UCP3基因表达的影响。【结果】从杜长大猪皮下脂肪组织中成功克隆获得UCP3基因CDS序列,全长927 bp,共编码308个氨基酸,其蛋白分子质量33673.09 Da,理论等电点(pI)9.44;与普通猪的UCP3基因序列相比,杜长大猪UCP3基因编码序列共有9处发生碱基突变,其中4处为错义突变,导致UCP3蛋白有4处氨基酸突变,分别为第74位脯氨酸(Pro)→亮氨酸(Leu)、第150位甘氨酸(Gly)→精氨酸(Arg)、第203位Arg→Gly和第259位缬氨酸(Val)→Leu。杜长大猪UCP3基因CDS序列与普通猪UCP3基因CDS序列的同源性为99.0%,其UCP3蛋白二级结构中以α-螺旋占比最高(46.43%)、β-转角占比最低(7.47%),属于亲水性蛋白。饲喂白藜芦醇(400 mg/kg)能极显著上调杜长大猪皮下脂肪UCP3基因表达(P<0.01),其相对表达量是对照组(不饲喂白藜芦醇)的2.06倍。【结论】白藜芦醇是通过上调杜长大猪UCP3基因表达而影响其脂肪代谢。 展开更多
关键词 杜长大猪 解偶联蛋白(ucp) ucp3基因 生物信息学分析 白藜芦醇 基因表达
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牛UCP3和MYH1基因启动子在C2C12和3T3-L1细胞中的启动活性分析 被引量:2
12
作者 陈伟 许厚强 +4 位作者 陈祥 覃海 吴雨 黄明捷 卢贤君 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第12期3825-3832,共8页
为阐明牛解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)和肌球蛋白重链1(myosin heavy chain 1,MYH1)基因启动子的核心区及其在小鼠C2C12和3T3-L1两种细胞株中的启动活性,本研究利用PCR、双荧光素酶和脂质体转染等方法进行关岭牛UCP3和MYH1... 为阐明牛解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)和肌球蛋白重链1(myosin heavy chain 1,MYH1)基因启动子的核心区及其在小鼠C2C12和3T3-L1两种细胞株中的启动活性,本研究利用PCR、双荧光素酶和脂质体转染等方法进行关岭牛UCP3和MYH1基因启动子的扩增、重组载体构建和启动子活性分析。结果显示,试验成功构建了pGL3-Basic-UCP3-pro和pGL3-Basic-MYH1-pro重组真核表达载体,分别转染至小鼠C2C12和3T3-L1细胞后发现,UCP3、MYH1基因启动子的核心区分别为UCP3-P6(-385^+3 bp)和MYH1-P5(-255^+15 bp)区域;pGL3-Basic-MYH1-P2~pGL3-Basic-MYH1-P5在C2C12细胞中启动子活性均高于3T3-L1细胞,表明MYH1基因启动子活性在成肌细胞C2C12中较高。本研究阐明了UCP3和MYH1基因启动子的核心区及其启动子活性,为进一步研究UCP3和MYH1基因的转录调控机理提供了科学依据。 展开更多
关键词 ucp3基因 MYH1基因 启动子 C2C12细胞 3T3-L1细胞
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翘嘴鳜UCP3基因cDNA的克隆及其胚胎发育表达分析 被引量:2
13
作者 徐蕾 陈小保 +3 位作者 唐春 胡姜丽 宾石玉 张方亮 《广西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第1期92-97,共6页
本研究采用RT-PCR、3′-RACE和5′-RACE技术,从翘嘴鳜胚胎组织中克隆得到UCP3基因的全长cDNA序列(登录号:KP244309)为2 917bp。生物信息学分析表明:翘嘴鳜UCP3基因编码区为930bp,总共编码309个氨基酸;带负电荷的氨基酸残基数22个,带正... 本研究采用RT-PCR、3′-RACE和5′-RACE技术,从翘嘴鳜胚胎组织中克隆得到UCP3基因的全长cDNA序列(登录号:KP244309)为2 917bp。生物信息学分析表明:翘嘴鳜UCP3基因编码区为930bp,总共编码309个氨基酸;带负电荷的氨基酸残基数22个,带正电荷的氨基酸残基数35个。翘嘴鳜UCP3发育表达分析表明,UCP3在受精期、二细胞期、囊胚期、肌效期、心搏期、仔鱼期有低量表达,从囊胚期到神经胚期显著性增高并达最大值,神经胚期到肌效期显著性降低,肌效期、心搏期、仔鱼期都保持在低水平表达。 展开更多
关键词 翘嘴鳜 ucp3基因 克隆 胚胎发育 表达分析
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晋汾白猪背最长肌肌纤维类型和能量代谢特性分析 被引量:1
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作者 安家岐 何志强 +7 位作者 孙迪 李娇 赵天枝 高鹏飞 曹果清 郭晓红 蔡春波 李步高 《山西农业科学》 2023年第4期434-442,共9页
为了探究晋汾白猪背最长肌肌纤维类型和能量代谢的特点,试验采集6月龄晋汾白猪和大白猪背最长肌,采用HE染色检测肌纤维的直径和密度;通过qRT-PCR分别检测生肌调节因子、肌纤维类型标记基因、氧化磷酸化、糖酵解活性以及线粒体活性相关... 为了探究晋汾白猪背最长肌肌纤维类型和能量代谢的特点,试验采集6月龄晋汾白猪和大白猪背最长肌,采用HE染色检测肌纤维的直径和密度;通过qRT-PCR分别检测生肌调节因子、肌纤维类型标记基因、氧化磷酸化、糖酵解活性以及线粒体活性相关基因的表达模式;PCR扩增晋汾白猪UCP3基因的CDS序列,并进行信号肽预测分析,采用qRT-PCR和Western blot检测晋汾白猪和大白猪中UCP3基因的表达特性。结果表明,相较于大白猪,晋汾白猪背最长肌肌纤维直径较小,密度较大;晋汾白猪背最长肌中生肌调节因子MyoD和MyoG的表达量较低;Ⅰ型肌纤维标记基因Myh7的表达量较高,Ⅱ型肌纤维标记基因Myh2、Myh4和Myh1的表达量均较低;糖酵解活性相关基因LDHA和LDHB、氧化磷酸化相关基因UQCRC2和NDUFA9以及线粒体活性相关基因ATP5A1和PGC1α的表达量均较低;晋汾白猪UCP3基因的CDS序列共有927个碱基,且不存在信号肽;晋汾白猪背最长肌中UCP3基因表达量和蛋白含量均显著低于大白猪;UCP3在晋汾白猪背最长肌和皮下脂肪组织中的表达量较高,且90 d晋汾白猪背最长肌中的表达量明显高于0、180 d。综上,晋汾白猪背最长肌肌纤维直径较小,I型肌纤维含量较高,Ⅱa型和Ⅱb型肌纤维含量较低,糖酵解和氧化磷酸化的活性较低,且UCP3的表达量低于大白猪。 展开更多
关键词 背最长肌 肌纤维类型 能量代谢 ucp3基因
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盘羊与欧拉羊杂交后代UCP2、UCP3基因CDS区克隆与生物信息学分析
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作者 谭义洲 梁春年 +1 位作者 阎萍 潘和平 《中国草食动物科学》 CAS 2022年第2期1-9,共9页
研究旨在通过对盘羊与欧拉羊杂交后代UCP2、UCP3基因CDS区克隆并进行生物信息学分析,了解其生物学特性和结构。结果表明,杂交后代羊UCP2基因CDS区长931 bp,共有7个开放阅读框,编码309个氨基酸;UCP3基因CDS区长937 bp,共有5个开放阅读框... 研究旨在通过对盘羊与欧拉羊杂交后代UCP2、UCP3基因CDS区克隆并进行生物信息学分析,了解其生物学特性和结构。结果表明,杂交后代羊UCP2基因CDS区长931 bp,共有7个开放阅读框,编码309个氨基酸;UCP3基因CDS区长937 bp,共有5个开放阅读框,编码244个氨基酸。杂交后代羊与绵羊的亲缘关系最为相近,与马和西伯利亚雪橇犬的亲缘关系最远。杂交后代羊UCP2理论等电点9.64,不稳定指数36.27,半衰期30 h,总平均亲水性0.109,为稳定蛋白且表现疏水性;杂交后代羊UCP3理论等电点9.25,不稳定指数44.80,半衰期30 h,总平均亲水性-0.034,为不稳定蛋白且表现亲水性。UCP2、UCP3均属于非分泌蛋白且无信号肽。UCP2、UCP3都不具有跨膜螺旋结构;UCP2存在26处磷酸化修饰位点,UCP3存在23处磷酸化修饰位点。UCP2、UCP3蛋白二级结构组成均以α-螺旋为主。同时,通过亚细胞定位发现UCP2、UCP3蛋白均主要存在于细胞质内。研究结果对今后探索UCP2、UCP3生理功能可提供一定的科学基础和依据。 展开更多
关键词 盘羊 欧拉羊 ucp2 ucp3 基因克隆 生物信息学分析
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欧拉型藏羊UCP2和UCP3基因多态性及其与生长性状的关联分析
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作者 谭义洲 丁考仁青 +5 位作者 褚敏 郭宪 马晓明 包鹏甲 阎萍 梁春年 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2022年第11期1-8,16,共9页
【目的】探索欧拉型藏羊解偶联蛋白2(UCP2)和解偶联蛋白3(UCP3)基因的多态性及其与生长性状的关联性,为运用分子标记辅助育种方法提高欧拉型藏羊的生长性状提供理论依据。【方法】以239头成年欧拉型藏羊为试验对象,采用PCR产物直接测序... 【目的】探索欧拉型藏羊解偶联蛋白2(UCP2)和解偶联蛋白3(UCP3)基因的多态性及其与生长性状的关联性,为运用分子标记辅助育种方法提高欧拉型藏羊的生长性状提供理论依据。【方法】以239头成年欧拉型藏羊为试验对象,采用PCR产物直接测序技术检测UCP2和UCP3基因的遗传多态性,并将其与体质量、体高、体斜长和胸围生长性状进行关联性分析。【结果】在欧拉型藏羊UCP2基因上筛选出2个SNPs位点,分别为g.52130414 C>T和g.52130584 G>A,其中g.52130414 C>T位点产生TT、CT和CC 3种基因型,g.52130584 G>A位点产生AA、AG和GG 3种基因型;在UCP3基因上筛选出1个SNP位点g.52157335 C>T,产生CC、CT和TT 3种基因型。基因多态性分析表明,3个SNPs位点均为错义突变位点,属于中度多态,且均符合Hard-Weinberg平衡适应性检验(P>0.05)。关联分析结果显示,UCP2基因g.52130414 C>T位点TT基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(P<0.05);g.52130584 G>A位点AA基因型欧拉型藏羊体质量和体斜长均极显著高于AG和GG基因型(P<0.01),AA和GG基因型欧拉型藏羊胸围均显著高于AG基因型(P<0.05);UCP3基因g.52157335 C>T位点CC基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(P<0.05),TT基因型欧拉型藏羊胸围显著高于CT基因型(P<0.05)。3个多态位点基因型组合分析发现,5个发生频率较高的双倍型中,D5型欧拉型藏羊体质量极显著高于D1、D2、D3型(P<0.01),体高显著高于D3型(P<0.05),体斜长显著高于D1、D3、D4型(P<0.05)且极显著高于D2型(P<0.01)。【结论】UCP2和UCP3基因多态性与欧拉型藏羊的部分生长性状显著相关,UCP2和UCP3基因可作为欧拉型藏羊生长性状选育的候选基因。D5双倍型为优势基因型,可在选育工作中优先考虑。 展开更多
关键词 欧拉型藏羊 ucp2 ucp3 基因多态性 生长性状 关联分析
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鸡UCP3基因结构与功能的生物信息学分析
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作者 徐支青 邱桂如 +3 位作者 税斐 江洪峰 谢艳霞 程智中 《安徽科技学院学报》 2022年第4期1-8,共8页
目的:对鸡解偶联蛋白(UCP3)基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:借助生物信息分析软件解析鸡UCP3基因序列及其蛋白的理化性质、结构域、信号肽、跨膜结构和亚细胞定位等特性,并比较多物种氨基酸序列的同源性和遗传进化程度。结果... 目的:对鸡解偶联蛋白(UCP3)基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:借助生物信息分析软件解析鸡UCP3基因序列及其蛋白的理化性质、结构域、信号肽、跨膜结构和亚细胞定位等特性,并比较多物种氨基酸序列的同源性和遗传进化程度。结果:鸡UCP3基因序列长度为924 bp,编码307个氨基酸,氨基酸组成中以缬氨酸、丙氨酸和亮氨酸占比较高,超10%。鸡UCP3蛋白分子式为C_(1478)H_(2384)N_(410)O_(422)S_(15),相对分子质量为33130.58,理论等电点为9.50,不稳定系数为41.02,脂肪指数97.82,为疏水蛋白。预测UCP3蛋白结构特点,发现UCP3蛋白的结构以-螺旋(47.23%)为主,具有3个线粒体载体结构域,有25个磷酸化位点和2个O型糖基化位点,亚细胞定位显示其主要分布在线粒体中;信号肽预测表明其属于非分泌蛋白。同源性比对结果表明,在选用的14个物种中,鸡UCP3基因氨基酸序列与火鸡的同源性最高,达99.02%,而与哺乳类动物和水生动物同源性较低。构建的系统进化树中主要分为3支,其中禽类、哺乳类为相对独立的两支,鱼类和两栖动物为第3支。在系统进化树中,与火鸡的遗传距离最近,与同源性分析结果一致。结论:该分析结果将为深入研究鸡UCP3基因的结构和生物学功能提供重要参考。 展开更多
关键词 ucp3基因 生物信息学分析 同源性
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基于GEO数据库分析糖尿病心肌病的差异表达基因
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作者 陈嘉敏 李莹 +3 位作者 吴会会 刘鹏 郑燕 苏国海 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期545-554,共10页
目的通过对GEO数据库中有关糖尿病心肌病的mRNA芯片进行分析,筛选出导致糖尿病心肌病的关键基因。方法使用GEO数据库的在线分析工具GEO2R对数据集GSE4745和GSE5606进行差异基因分析后,在R中绘制差异表达基因火山图,利用在线韦恩图绘制... 目的通过对GEO数据库中有关糖尿病心肌病的mRNA芯片进行分析,筛选出导致糖尿病心肌病的关键基因。方法使用GEO数据库的在线分析工具GEO2R对数据集GSE4745和GSE5606进行差异基因分析后,在R中绘制差异表达基因火山图,利用在线韦恩图绘制工具分析两个数据集共同表达的差异基因,在R中利用clusterProfile包将差异表达基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析,GSEA软件进行基因集富集分析,同时使用STRING在线数据库构建差异基因对应蛋白的蛋白互作网络,利用Cytoscape的插件Cytohubba中最大集团中心算法计算出排名前10的基因,在原代大鼠心肌细胞中观察比较筛选出的关键基因在正常组和高糖组的表达情况。结果Pdk4、Ucp3、Hmgcs2、Asl6、Slc2a4与芯片分析结果相符,Pdk4、Ucp3、Hmgcs2在高糖(25 mmol/L)刺激72 h后的心肌细胞中表达增加,Acsl6、Slc2a4在高糖刺激后的心肌细胞中表达下降。结论Pdk4、Ucp3、Hmgcs2、Asl6、Slc2a4可能与糖尿病心肌病的发生发展相关,可能是糖尿病心肌病潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 糖尿病心肌病 GEO数据库 基因富集 Acsl6 Pdk4 Slc2a4 Hmgcs2 ucp3
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猪UCP3基因部分编码区序列分析及其单核苷酸多态与胴体、肉质性状的遗传效应 被引量:29
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作者 涂荣剑 邓昌彦 熊远著 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期807-812,共6页
以猪解耦联蛋白基因 3(UCP3)作为控制猪胴体与肉质性状主基因的候选基因。利用直接测序法对 4个品种猪骨骼肌中UCP3基因的部分编码区序列 (第 4外显子部分及第 5、6、7外显子全部片段 )进行比较分析 ,发现3个cSNP位点 ,其中ORF中第 84 ... 以猪解耦联蛋白基因 3(UCP3)作为控制猪胴体与肉质性状主基因的候选基因。利用直接测序法对 4个品种猪骨骼肌中UCP3基因的部分编码区序列 (第 4外显子部分及第 5、6、7外显子全部片段 )进行比较分析 ,发现3个cSNP位点 ,其中ORF中第 84 2碱基的突变可导致相应编码氨基酸序列的改变 :甲硫氨酸→苏氨酸 ,选取此位点作为猪UCP3基因的多态位点。用PCR SSCP检测方法在 3个品种猪中进行该cSNP位点多态性片段的基因型分型 ,结果显示在 3个猪群中表现出 3种基因型 (AA、AB、BB) ,χ2 独立性检验结果表明 3种基因型在各品种间分布不一致 ,梅山猪同大白、长白猪分别比较差异极显著 (P <0 0 1) ;对大白×梅山资源家系F2 代 139头个体进行了该多态片段的基因型鉴定 ,并对其基因型与所检测个体相应的胴体、肉质性状采用GLM分析进行遗传效应研究 ,结果表明 :该基因对一些胴体、肉质性状有显著性影响 ,并且该基因以加性效应为主 (如 ,眼肌高度、背最长肌色值、系水力的加性效应都达显著水平 )。因此 ,推测UCP3基因可能是影响猪胴体及肉质性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因 ,并且能够在分子标记辅助选择中用于对猪胴体。 展开更多
关键词 ucp3 cSNP PCR-SSCP 遗传效应分析
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解偶联蛋白3基因-55C→T变异与中国人体脂代谢、含量、分布及2型糖尿病的关系 被引量:5
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作者 申海莲 项坤三 贾伟平 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2002年第4期317-321,共5页
目的 研究解偶联蛋白 3(uncoupling protein 3,UCP3)基因 - 5 5 C→ T变异与中国人体脂含量、体脂代谢、体脂分布及 2型糖尿病的关系。方法 用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性检测了 16 5名糖耐量正常者 (男 /女为 6 9/ 96 )及 1... 目的 研究解偶联蛋白 3(uncoupling protein 3,UCP3)基因 - 5 5 C→ T变异与中国人体脂含量、体脂代谢、体脂分布及 2型糖尿病的关系。方法 用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性检测了 16 5名糖耐量正常者 (男 /女为 6 9/ 96 )及 15 1例 2型糖尿病患者 (男 /女为 6 2 / 89) UCP3基因 - 5 5 C→ T变异的基因型 ,核磁共振检测局部体脂含量 ,酶法及硫酸葡聚糖 -锰沉淀法测血总胆固醇及血高密度脂蛋白胆固醇 ,并用公式计算低密度脂蛋白胆固醇。结果  (1)非糖尿病中国人与白种人比较等位基因频率及基因型频率差异均无显著性 (P分别为 0 .112 0和 0 .0 6 4 6 ) ,与 Pima印地安人比较差异均有显著性 (P分别为 0 .0 10 5及 0 .0 314 )。 (2 )逐步回归分析发现 ,UCP3基因 - 5 5 C→ T变异的独立相关变量 :糖耐量正常男性组为血高密度脂蛋白胆固醇及低密度脂蛋白胆固醇 ,糖耐量正常女性组为股部脂肪面积 ,2型糖尿病男性组为血甘油三酯 ,2型糖尿病女性组为腰臀比。 (3) 2型糖尿病组与糖耐量正常组相比 ,等位基因频率的差异有显著性 (P为 0 .0 35 8)。携带 T等位基因发生 2型糖尿病的相对风险的比数比为 1.4 34(95 %可信区间为1.0 31~ 1.995 )。结论  UCP3基因 - 5 5 C→ T变异与中国人局部体脂含量、体脂代? 展开更多
关键词 解偶联蛋白3基因 体脂 2型糖尿病 ucp3 体脂代谢 体脂含量 体脂分布
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