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U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
1
作者
宋伟
朱贝贝
+4 位作者
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期634-638,共5页
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)...
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)的21个潜在功能标签SNP位点在筛查人群(武汉地区378例新发肝癌病例和461例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段得到的阳性位点进一步在验证人群(北京地区428例新发肝癌病例和647例非肿瘤对照)中采用TaqMan基因分型技术进行验证.采用加法交互模型分析吸烟/饮酒及遗传因素的交互作用.结果 两阶段人群中均观察到SF3A1基因的rs5994293与肝癌发病风险存在显著关联.合并分析显示,以携带TT基因型者为参照,携带G等位基因者的肝癌发病风险降低30%(OR=0.70,95%CI:0.58 - 0.84,FDR-P=0.000 5);合并阶段在HBsAg阴性者中观察到吸烟合并饮酒和rs5994293 TT基因型之间存在加法交互作用.结论 携带SF3A1 rs5994293 T等位基因可能增加肝癌发生风险,但仍需大样本研究及功能研究的验证。
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关键词
肝癌
u
2
依赖型
mrna
剪接
复合体
吸烟
饮酒
单核苷酸多态性
原文传递
题名
U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
1
作者
宋伟
朱贝贝
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
机构
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院流行病和卫生统计学系
华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病和卫生统计学系
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期634-638,共5页
基金
教育部博士点基金(20111106120020)
国家科技重大专项(2012ZX10004904,2013ZX10002002006002)
文摘
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)的21个潜在功能标签SNP位点在筛查人群(武汉地区378例新发肝癌病例和461例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段得到的阳性位点进一步在验证人群(北京地区428例新发肝癌病例和647例非肿瘤对照)中采用TaqMan基因分型技术进行验证.采用加法交互模型分析吸烟/饮酒及遗传因素的交互作用.结果 两阶段人群中均观察到SF3A1基因的rs5994293与肝癌发病风险存在显著关联.合并分析显示,以携带TT基因型者为参照,携带G等位基因者的肝癌发病风险降低30%(OR=0.70,95%CI:0.58 - 0.84,FDR-P=0.000 5);合并阶段在HBsAg阴性者中观察到吸烟合并饮酒和rs5994293 TT基因型之间存在加法交互作用.结论 携带SF3A1 rs5994293 T等位基因可能增加肝癌发生风险,但仍需大样本研究及功能研究的验证。
关键词
肝癌
u
2
依赖型
mrna
剪接
复合体
吸烟
饮酒
单核苷酸多态性
Keywords
Hepatocell
u
lar cancer
u
2
small n
u
clear ribon
u
cleoproteins
Smoking
Drinking
Single n
u
cleotide polymorphism
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
宋伟
朱贝贝
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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已选择
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参考文献
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