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肿瘤坏死因子受体超家族成员21在肝细胞癌中的表达及临床意义 被引量：1
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作者 刘哲睿 贾晓东 陆荫英 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2022年第3期201-209,共9页
目的基于生物信息学分析探讨肿瘤坏死因子受体超家族成员21(TNFRSF21)在肝细胞癌(HCC)中的表达和预后价值、潜在的生物学功能及对免疫微环境的影响。方法从高通量基因表达(GEO)数据库获取HCC细胞株数据集筛选共交集基因。从癌症基因组图... 目的基于生物信息学分析探讨肿瘤坏死因子受体超家族成员21(TNFRSF21)在肝细胞癌(HCC)中的表达和预后价值、潜在的生物学功能及对免疫微环境的影响。方法从高通量基因表达(GEO)数据库获取HCC细胞株数据集筛选共交集基因。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取HCC样本数据信息,分析TNFRSF21表达与总生存时间(OS)、临床病理特征的关系,以及在癌组织和癌旁组织中的表达情况。收集2009年7月至2010年10月手术切除的67例HCC组织及配对癌旁组织,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测TNFRSF21水平,分析HCC组织中TNFRSF21表达水平及与HCC患者OS的关系。通过STRING构建蛋白互作网络,采用基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,探讨TNFRSF21的生物学功能和肿瘤相关通路。使用TIMER和TISIDB数据库分析HCC中TNFRSF21表达与肿瘤免疫浸润细胞的相关性。结果基于GEO数据集,筛选出CSN5基因敲低的HepG2、Huh7细胞株与COP1基因敲低的HepG2、Huh7细胞株共同的差异表达基因TNFRSF21、CROT、APPBP2和CPD。基于TCGA数据库,TNFRSF21在50例癌旁组织中的中位表达量为3.125,而在374例HCC组织中为3.953(P<0.001)。HCC组织中TNFRSF21 mRNA的相对表达量为1.77±1.60,高于配对癌旁组织的1.07±0.83(P=0.002)。生存分析显示,仅TNFRSF21基因表达与OS有关(P=0.030)。67例HCC患者中,TNFRSF21低表达组的中位OS未达,显著优于高表达组的35.0个月(P=0.039)。根据TCGA数据库TNFRSF21表达中位值2.678将374例HCC患者分为TNFRSF21高表达组和低表达组,发现TNFRSF21表达与血清AFP水平(P<0.001)和血管侵犯(P=0.029)有关。STRING及富集分析发现,TNFRSF21可能通过APP、TARDD等配体参与NF-κB及JNK信号通路调控肿瘤的发生发展。TIMER分析显示,TNFRSF21表达与B细胞(r=0.299,P<0.001)、CD8+T细胞(r=0.242,P<0.001)、CD4+T细胞(r=0.417,P<0.001)、巨噬细胞(r=0.527,P<0.001)、中性粒细胞(r=0.389,P<0.001)及树突� 展开更多
关键词 肝细胞癌 肿瘤坏死因子受体超家族成员21 基因表达 肿瘤免疫浸润细胞 预后
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