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多形拟杆菌对肺癌细胞生物学行为及转录组基因表达的影响
1
作者 常靖 李想 +3 位作者 崔湘铧 王总飞 郭永军 张贺 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2023年第12期2511-2515,共5页
目的探讨多形拟杆菌对肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及转录组基因表达的影响。方法选用肺癌细胞系H1975和SK-MES-1,以细菌培养基为对照组,多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)上清液为处理组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析两组细胞... 目的探讨多形拟杆菌对肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及转录组基因表达的影响。方法选用肺癌细胞系H1975和SK-MES-1,以细菌培养基为对照组,多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)上清液为处理组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析两组细胞的增殖能力,采用划痕实验和Transwell实验分析两组细胞迁移及侵袭能力,通过转录组筛选两组细胞差异表达的基因,通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,探究差异基因集中的具体通路。组间比较采用t检验进行统计分析。结果与细菌培养基组比较,H1975细胞系和SK-MES-1细胞系中,细菌处理组细胞的增殖率显著下降(0.767±0.063比1.000±0.047、0.707±0.049比1.000±0.124),差异有统计学意义(t=7.827、5.838,P均<0.001),迁移水平(0.066±0.030比0.567±0.107,t=6.350,P<0.05;0.066±0.030比0.475±0.056,t=9.042,P<0.01)和侵袭水平(0.271±0.033比1.454±0.221,t=7.475,P<0.05;0.349±0.029比1.664±0.107,t=16.806,P<0.01)也显著下降,差异有统计学意义。通过GO和KEGG富集分析,发现丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(PIK3)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等在H1975和SK-MES-1细胞系的细菌处理组和培养基对照组之间差异有统计学意义。Venn分析发现转录延长因子1(TCEA1)和人内皮素2(EDN2)等在两个细胞系中均受到调控。结论多形拟杆菌可能通过TCEA1和EDN2基因调控肺癌H1975和SK-MES-1细胞系的生物学行为,发挥抑癌作用。 展开更多
关键词 肿瘤微生物 多形拟杆菌 肺癌 转录组测序
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高通量测序分析乳腺癌微生物群落特征
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作者 常靖 杨慧 +4 位作者 李想 李永 杨淑敏 夏庆欣 张贺 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2023年第10期2000-2003,共4页
目的分析乳腺癌患者肿瘤组织与癌旁组织微生物菌群多样性,筛选乳腺癌患者肿瘤组织中的特异性细菌。方法分析2021年2月至9月河南省肿瘤医院行乳腺癌根治术切除的20例乳腺癌患者的肿瘤组织(TT组)与配对瘤旁组织(TN组),采用Illumina HiSeq... 目的分析乳腺癌患者肿瘤组织与癌旁组织微生物菌群多样性,筛选乳腺癌患者肿瘤组织中的特异性细菌。方法分析2021年2月至9月河南省肿瘤医院行乳腺癌根治术切除的20例乳腺癌患者的肿瘤组织(TT组)与配对瘤旁组织(TN组),采用Illumina HiSeq高通量测序技术对乳腺癌患者组织样本进行细菌V3-V4区的16S rDNA测序及生物信息学分析,采用t检验进行计数资料比较。结果在门水平上,TT组与TN组的微生物菌群主要由变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门组成,累计含量>60%。微生物多样性分析显示,Chao1指数TN组比TT组为10167.59±2929.38比9044.89±2735.11(t=1.09,P>0.05),Ace指数TN组比TT组为12571.96±2859.65比11704.53±2855.75(t=0.81,P>0.05)。Beta多样性显示两组菌群结构差异有统计学意义(R=0.27,P<0.001)。门水平差异分析显示,变形菌门(TN组比TT组为42.63±16.76比52.08±9.53,t=-0.65)、放线菌门(TN组比TT组为6.13±2.55比9.02±1.77,t=-1.03)等在癌组织中明显增加(P<0.05),厚壁菌门(TN组比TT组为10.62±9.40比4.40±0.95,t=3.41)等明显减少(P<0.05)。线性判别分析(LDA)显示TT组中α变形菌纲、根瘤菌目、和变形菌门等为显著性差异菌,而TN组中链球菌属和假单胞菌属等为显著性差异菌。结论乳腺癌患者癌组织与癌旁组织的微生物群落结构存在明显差异,其中假单胞菌属、链球菌属等为差异微生物有助于筛选标志物。 展开更多
关键词 肿瘤微生物 16S rDNA 乳腺癌 多样性
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