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题名一种山黄麻丛枝病的分子检测与鉴定
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作者
万琼莲
苏帆
许杏萍
蔡红
王连春
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机构
玉溪师范学院化学生物与环境学院
云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室
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出处
《玉溪师范学院学报》
2020年第3期46-52,共7页
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基金
云南省教育厅科学研究基金项目资助性项目(2017ZZX176)
云南省教育厅科学研究基金项目指导性项目(2017ZDX136)
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文摘
以植原体通用引物P1/P7和R16F2n/R16R2对云南省峨山县发现的山黄麻丛枝病感病植株,总DNA进行巢式PCR扩增、克隆和测序,获得1 246bp原体16S rDNA序列.经iPhyClassifier植原体在线分类鉴定工具分析,显示该植原体与翠菊黄化植原体(Candidatus Phytoplasma asteris)相关,与该组参考株系(M30790)的序列相似性为99.6%,属16SrI组成员,16S rDNA的F2nR2片段的RFLP模型与16Sr I-B亚组的参考模型(AP006628)最为相似,相似系数F为0.96,推测是一个16SrI组新亚组.以MEGA软件和MUSCLE在线工具进行多序列比对和系统进化树构建,显示山黄麻丛枝植原体(SHMWB-ES)与16Sr I组成员聚为一支,在亚组构建中显示16Sr I组与16Sr I-B亚组的菌株BSP-Br1(EU423898)、16Sr I-X亚组的TLWBYN01(MN513329)、BG01(LT594117)及BG02(LT594118)菌株序列同源性都在99%以上,与前两者更高达为99.76%和99.84%.
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关键词
植原体
山黄麻
丛枝
分子检测
16S
rDNA
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Keywords
Phytoplasma
trema lour.
witches’-broom
molecular identification
16S rDNA
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分类号
S763.7
[农业科学—森林保护学]
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