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高迁移率蛋白A1——肿瘤新标志物
1
作者
黄薇
杨勤
《国际呼吸杂志》
2008年第1期59-62,共4页
高迁移率蛋白A1属于高迁移率蛋白家族成员,是一种广泛存在于真核生物细胞中,含量丰富的染色质结构转录因子,它具有3个AT-钩结构域,可通过修饰、弯曲或改变染色质/DNA的结构来调节基因转录。高迁移率蛋白A1与胚胎细胞的生长、凋亡...
高迁移率蛋白A1属于高迁移率蛋白家族成员,是一种广泛存在于真核生物细胞中,含量丰富的染色质结构转录因子,它具有3个AT-钩结构域,可通过修饰、弯曲或改变染色质/DNA的结构来调节基因转录。高迁移率蛋白A1与胚胎细胞的生长、凋亡过程和肿瘤进展密切相关,高迁移率蛋白A1基因被视为癌基因,是一种潜在的肿瘤标记物。该文主要介绍了高迁移率蛋白A1的结构、功能、主要特征及其在肺癌发病机制中可能的作用。
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关键词
高迁移率蛋白A1
AT-钩结构域
肺肿瘤
转录调节
原文传递
转录因子结合位点的计算分析方法
被引量:
8
2
作者
李婷婷
蒋博
+1 位作者
汪小我
张学工
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期334-347,共14页
基因组上众多基因和非编码转录体按照特定的规律有序地表达是细胞正常生命活动的基础。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录因子结合在基因启动子序列中的转录因子结合位点,启动基因的转录和控制基因的转录效率。分析转录因子结合位...
基因组上众多基因和非编码转录体按照特定的规律有序地表达是细胞正常生命活动的基础。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录因子结合在基因启动子序列中的转录因子结合位点,启动基因的转录和控制基因的转录效率。分析转录因子结合位点对研究基因调控系统有着重要意义,生物信息学在转录因子结合位点的研究中发挥着关键的作用。文章综述了分析蛋白质编码基因的转录因子结合位点的典型流程,总结了主要的算法、软件和资源,并简要评述了目前非编码RNA转录调控的研究现状。
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关键词
转录因子结合位点
模体识别
模体定位
非编码RNA转录调控
生物信息学
下载PDF
职称材料
猪繁殖与呼吸综合征病毒5'非翻译区一顶端茎环结构是病毒复制转录必需的顺式作用元件
被引量:
1
3
作者
高飞
郑浩
+5 位作者
姜一峰
李丽薇
郑海红
周艳君
韦祖樟
童光志
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第4期7-16,共10页
猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5'非翻译区(untranslated region,UTR)对病毒复制转录等生物合成过程至关重要,但其作用机制尚不清楚。本实验室分别在北美型(pAPRRS)与...
猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5'非翻译区(untranslated region,UTR)对病毒复制转录等生物合成过程至关重要,但其作用机制尚不清楚。本实验室分别在北美型(pAPRRS)与欧洲型PRRSV(pSHE)感染性克隆骨架的5'UTR与ORF1之间插入碱基"at"形成Nde I位点,构建了两个突变体pTLNd4和pSHEnde。结果显示插入后的碱基未影响病毒感染性。以两株突变体为骨架将两株感染性克隆的5'UTR互换,构建了突变体克隆pTLV8和pSHSP5。结果表明pTLV8仍具有感染性,而pSHSP5株拯救出病毒。对pSHSP5和pTLV8的RNA二级结构预测结果显示,虽然嵌合突变体pTLV8的5'端与亲本pAPRRS的二级结构差异较大,但转录调控序(transcription-regulating sequence,TRS)仍位于顶端茎环结构最突出的位置,并保证了TRS与ORF1之间的起始密码子AUG位于该茎环结构的顶端,而pSHSP5的顶端茎环结构则遭到了破坏。本研究结果表明TRS所在的顶端茎环结构在调控病毒复制转录过程中是关键的顺式作用元件之一,对其结构破坏的突变体将不能拯救出病毒。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
5’非翻译区
嵌合突变体
转录调控序列
二级结构预测
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职称材料
题名
高迁移率蛋白A1——肿瘤新标志物
1
作者
黄薇
杨勤
机构
贵阳医学院病理生理学教研室
出处
《国际呼吸杂志》
2008年第1期59-62,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(c03030203)、贵州省优秀科技人才省长基金资助项目(2005)
文摘
高迁移率蛋白A1属于高迁移率蛋白家族成员,是一种广泛存在于真核生物细胞中,含量丰富的染色质结构转录因子,它具有3个AT-钩结构域,可通过修饰、弯曲或改变染色质/DNA的结构来调节基因转录。高迁移率蛋白A1与胚胎细胞的生长、凋亡过程和肿瘤进展密切相关,高迁移率蛋白A1基因被视为癌基因,是一种潜在的肿瘤标记物。该文主要介绍了高迁移率蛋白A1的结构、功能、主要特征及其在肺癌发病机制中可能的作用。
关键词
高迁移率蛋白A1
AT-钩结构域
肺肿瘤
转录调节
Keywords
High mobility group proteinA1
AT-hook binding domain
Lung neoplasms
transcriptionregulation
分类号
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
转录因子结合位点的计算分析方法
被引量:
8
2
作者
李婷婷
蒋博
汪小我
张学工
机构
清华大学生物信息学教育部重点实验室
出处
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期334-347,共14页
基金
国家自然科学基金项目(60575014
30625012
+2 种基金
60721003)
国家863项目(2006AA02Z325)的资助
清华大学信息学院基础研究基金~~
文摘
基因组上众多基因和非编码转录体按照特定的规律有序地表达是细胞正常生命活动的基础。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录因子结合在基因启动子序列中的转录因子结合位点,启动基因的转录和控制基因的转录效率。分析转录因子结合位点对研究基因调控系统有着重要意义,生物信息学在转录因子结合位点的研究中发挥着关键的作用。文章综述了分析蛋白质编码基因的转录因子结合位点的典型流程,总结了主要的算法、软件和资源,并简要评述了目前非编码RNA转录调控的研究现状。
关键词
转录因子结合位点
模体识别
模体定位
非编码RNA转录调控
生物信息学
Keywords
Transcription factor binding sites
Motif discovery
Motif search
transcriptionregulation
of non-coding RNA
Bioinformatics
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
下载PDF
职称材料
题名
猪繁殖与呼吸综合征病毒5'非翻译区一顶端茎环结构是病毒复制转录必需的顺式作用元件
被引量:
1
3
作者
高飞
郑浩
姜一峰
李丽薇
郑海红
周艳君
韦祖樟
童光志
机构
中国农业科学院上海兽医研究所
广西大学动物科学技术学院
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第4期7-16,共10页
基金
国家自然科学基金(31300140)
863计划(2011AA10A208-2)
+1 种基金
科研院所基本科研业务费(2013JB01
2013JB02)
文摘
猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5'非翻译区(untranslated region,UTR)对病毒复制转录等生物合成过程至关重要,但其作用机制尚不清楚。本实验室分别在北美型(pAPRRS)与欧洲型PRRSV(pSHE)感染性克隆骨架的5'UTR与ORF1之间插入碱基"at"形成Nde I位点,构建了两个突变体pTLNd4和pSHEnde。结果显示插入后的碱基未影响病毒感染性。以两株突变体为骨架将两株感染性克隆的5'UTR互换,构建了突变体克隆pTLV8和pSHSP5。结果表明pTLV8仍具有感染性,而pSHSP5株拯救出病毒。对pSHSP5和pTLV8的RNA二级结构预测结果显示,虽然嵌合突变体pTLV8的5'端与亲本pAPRRS的二级结构差异较大,但转录调控序(transcription-regulating sequence,TRS)仍位于顶端茎环结构最突出的位置,并保证了TRS与ORF1之间的起始密码子AUG位于该茎环结构的顶端,而pSHSP5的顶端茎环结构则遭到了破坏。本研究结果表明TRS所在的顶端茎环结构在调控病毒复制转录过程中是关键的顺式作用元件之一,对其结构破坏的突变体将不能拯救出病毒。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
5’非翻译区
嵌合突变体
转录调控序列
二级结构预测
Keywords
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV)
5' untranslated region (5' UTR)
chimeric virus
transcriptionregul
ating sequence (TRS)
secondary structure
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高迁移率蛋白A1——肿瘤新标志物
黄薇
杨勤
《国际呼吸杂志》
2008
0
原文传递
2
转录因子结合位点的计算分析方法
李婷婷
蒋博
汪小我
张学工
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
8
下载PDF
职称材料
3
猪繁殖与呼吸综合征病毒5'非翻译区一顶端茎环结构是病毒复制转录必需的顺式作用元件
高飞
郑浩
姜一峰
李丽薇
郑海红
周艳君
韦祖樟
童光志
《中国动物传染病学报》
CAS
2014
1
下载PDF
职称材料
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