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大劣按蚊Torso⁃like基因鉴定分子结构及表达特征
1
作者
朱凌倩
胡小康
+2 位作者
许静
李石柱
冯欣宇
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期584-590,共7页
目的鉴定大劣按蚊Torso⁃like(tsl)基因及表达特征,为深入研究tsl基因功能提供理论基础。方法根据黑腹果蝇和冈比亚按蚊tsl基因,检索大劣按蚊全基因组并鉴别大劣按蚊tsl基因,设计特异性引物,并采用PCR和逆转录PCR技术扩增目的基因。利用...
目的鉴定大劣按蚊Torso⁃like(tsl)基因及表达特征,为深入研究tsl基因功能提供理论基础。方法根据黑腹果蝇和冈比亚按蚊tsl基因,检索大劣按蚊全基因组并鉴别大劣按蚊tsl基因,设计特异性引物,并采用PCR和逆转录PCR技术扩增目的基因。利用生物信息学软件分析tsl基因编码TSL蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、蛋白质二级结构和三级结构,并进行系统发育进化分析。利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在大劣按蚊各组织中的表达水平。结果大劣按蚊tsl基因全长16751 bp,CDS区长1134 bp,编码377个氨基酸。TSL蛋白属于亲水性稳定蛋白。经生物信息学预测,TSL蛋白为位于膜外的分泌蛋白,且包含信号肽;其二级结构含α⁃螺旋(51.72%)、延伸链(12.20%)、β⁃折叠(4.78%)和无规则卷曲(31.30%),且能以5cj9.1.A为模板进行3D同源建模。系统发育进化分析发现大劣按蚊TSL蛋白与法老按蚊TSL蛋白亲缘关系较近。实时荧光定量PCR检测显示,tsl基因在大劣按蚊头、胸、腹、足均有表达,且在头部表达量最高、足部表达量较低。结论本研究从基因组水平鉴定了大劣按蚊tsl基因,分析了其蛋白结构及组织特异性表达特征,为进一步深入研究该基因功能奠定了基础。
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关键词
大劣按蚊
torso
⁃
like
基因
鉴定
分子结构
生物信息学
原文传递
题名
大劣按蚊Torso⁃like基因鉴定分子结构及表达特征
1
作者
朱凌倩
胡小康
许静
李石柱
冯欣宇
机构
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所、国家热带病研究中心、WHO热带病合作中心、科技部国家级热带病国际联合研究中心、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室
上海交通大学医学院全球健康学院
出处
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期584-590,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(81802039)
国家科技重大专项(2016ZX10004222⁃004)。
文摘
目的鉴定大劣按蚊Torso⁃like(tsl)基因及表达特征,为深入研究tsl基因功能提供理论基础。方法根据黑腹果蝇和冈比亚按蚊tsl基因,检索大劣按蚊全基因组并鉴别大劣按蚊tsl基因,设计特异性引物,并采用PCR和逆转录PCR技术扩增目的基因。利用生物信息学软件分析tsl基因编码TSL蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、蛋白质二级结构和三级结构,并进行系统发育进化分析。利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在大劣按蚊各组织中的表达水平。结果大劣按蚊tsl基因全长16751 bp,CDS区长1134 bp,编码377个氨基酸。TSL蛋白属于亲水性稳定蛋白。经生物信息学预测,TSL蛋白为位于膜外的分泌蛋白,且包含信号肽;其二级结构含α⁃螺旋(51.72%)、延伸链(12.20%)、β⁃折叠(4.78%)和无规则卷曲(31.30%),且能以5cj9.1.A为模板进行3D同源建模。系统发育进化分析发现大劣按蚊TSL蛋白与法老按蚊TSL蛋白亲缘关系较近。实时荧光定量PCR检测显示,tsl基因在大劣按蚊头、胸、腹、足均有表达,且在头部表达量最高、足部表达量较低。结论本研究从基因组水平鉴定了大劣按蚊tsl基因,分析了其蛋白结构及组织特异性表达特征,为进一步深入研究该基因功能奠定了基础。
关键词
大劣按蚊
torso
⁃
like
基因
鉴定
分子结构
生物信息学
Keywords
Anopheles dirus
torso
⁃
like
gene
Characterization
Molecular structure
Bioinformatics analysis
分类号
R382.31 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大劣按蚊Torso⁃like基因鉴定分子结构及表达特征
朱凌倩
胡小康
许静
李石柱
冯欣宇
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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