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直观队列命名法的基本原理及其在矩阵与拓扑指数计算中的应用 被引量:102
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作者 胡黔楠 梁逸曾 +2 位作者 王亚丽 郭方遒 黄兰芳 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期386-390,共5页
提出了一种用于拓扑结构输入的直观队列命名法(HQN),该方法结合了二维联接表与线性命名输入法的优点。在直观队列命名法(HQN)中,原子用元素周期表中的字母表示,第一个字母用大写表示,第二个字母(如果存在)用小写表示。键由构成键的原子... 提出了一种用于拓扑结构输入的直观队列命名法(HQN),该方法结合了二维联接表与线性命名输入法的优点。在直观队列命名法(HQN)中,原子用元素周期表中的字母表示,第一个字母用大写表示,第二个字母(如果存在)用小写表示。键由构成键的原子的编号联接来表示,单键由构成键的原子的编号一次联接表示,双键由构成键的原子的编号二次联接表示,三键由构成键的原子的编号三次联接表示。将分子中的键按顺序输入,然后将对应的原子类型标识在该原子的号码之后,同时输入字符串中,从而可得一个分子结构的HQN编码。该方法由分子的二维图可直观地直接得到,分子的编码由分子中的键与原子一个个排列而成,因而起名为直观队列命名法。在MATLAB环境下,用Matlab调入每个分子的字符串编码,然后对该编码进行识别与操作,并计算了8种矩阵,以及26种共300多个拓扑指数。 展开更多
关键词 直观队列命名法 基本原理 矩阵 拓扑指数 计算 应用 图论 分子结构
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河西走廊中部两种荒漠植物根系构型特征 被引量:63
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作者 单立山 李毅 +3 位作者 任伟 苏世平 董秋莲 耿东梅 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期25-31,共7页
在河西走廊中部,采用挖掘法挖取红砂和白刺根系,应用拓扑学与分形理论分析了根系构型的特征.结果表明:2种荒漠植物根系的拓扑指数均较小,根系分支模式均近似为叉状分支结构.红砂和白刺根系具有较好的分形特征,其分形维数分别为(1.18... 在河西走廊中部,采用挖掘法挖取红砂和白刺根系,应用拓扑学与分形理论分析了根系构型的特征.结果表明:2种荒漠植物根系的拓扑指数均较小,根系分支模式均近似为叉状分支结构.红砂和白刺根系具有较好的分形特征,其分形维数分别为(1.18±0.04)和(1.36±0.06);分形维数、分形丰度与根系平均连接长度均呈显著正相关.2种荒漠植物根系的平均连接长度均较大,以扩大植物的有效营养空间,从而适应干旱贫瘠的土壤环境.2种荒漠植物根系分支前的横截面积等于根系分支后的横截面积之和,验证了Leonardo da Vinci法则.对17个根系构型参数进行主成分分析,根系拓扑指数、根系连接数量、逐步分支率和根系直径4个根系构型参数能很好地表示2种荒漠植物根系构型特征. 展开更多
关键词 荒漠植物 根系构型 拓扑指数 分形维数 分支率 连接长度
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塔克拉玛干沙漠南缘三种防护林植物根系构型及其生态适应策略 被引量:51
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作者 郭京衡 曾凡江 +1 位作者 李尝君 张波 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期36-44,共9页
采用全根挖掘法挖取塔克拉玛干沙漠南缘3种主要防护林植物种——多枝柽柳(Tamarix ramosissima)、梭梭(Haloxylon ammodendron)和新疆杨(Populus alba var.pyramidalis)成年植株根系,测定并分析了根系构型及其拓扑结构。结果表明:1)多... 采用全根挖掘法挖取塔克拉玛干沙漠南缘3种主要防护林植物种——多枝柽柳(Tamarix ramosissima)、梭梭(Haloxylon ammodendron)和新疆杨(Populus alba var.pyramidalis)成年植株根系,测定并分析了根系构型及其拓扑结构。结果表明:1)多枝柽柳和梭梭的根系趋向于鱼尾状分支结构,新疆杨根系为叉状分支结构,根系分支结构的差异使其资源获取能力和对环境的适应能力有所差异;2)三种植物最小的根系平均连接长度为33.67 cm,多枝柽柳和梭梭的根系连接长度大于新疆杨,增加连接长度对植物在资源贫瘠的沙质土壤环境的生存有利;3)新疆杨的根系分支率显著高于多枝柽柳和梭梭,但其对干旱的适应性不如多枝柽柳和梭梭。4)三种植物根系分支均遵循Leonardo da Vinci法则,且不受根系直径的约束。三种防护林植物在水、养资源获取与土壤空间拓展方面具有差异性,表明在相似的极端干旱环境中3种植物采取了不同的生态适应策略。 展开更多
关键词 生态适应策略 Leonardo DA Vinci法则 根系构型 分支率 根系连接长度 拓扑指数
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硫醇和硫醚的沸点与分子结构之间关系的拓扑化学研究 被引量:40
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作者 王克强 胡英 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第3期230-233,共4页
根据分子拓扑学原理,用染色因子标识原子性质的差异,发展了一种适用于含杂原子分子体系结构性能关系研究的新方法。据此探讨了硫醇和硫醚的沸点与分子结构之间的关系,提出一个既能合理表征结构性能关系、又能预测沸点的定量关系式。
关键词 沸点 硫醇 硫醚 分子结构 拓扑化学
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拓扑指数F(′F)与气相色谱保留指数RI的相关性研究 被引量:30
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作者 杨锋 颜肖慈 +4 位作者 欧阳礼 罗明道 周培疆 望天志 屈松生 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1998年第5期497-500,共4页
用结构参数构成的矩阵定义了拓扑指数F(′F),计算了10个系列94个分子的 F(′F)值。发现F(′F)与这些化合物的气相色谱保留指数有好的相关性.相关系数均在0.97 以上。
关键词 拓扑指数 气相色谱 保留指数 相关性 保留值
全文增补中
饱和醇定量结构-保留相关研究中人工神经网络的应用 被引量:23
6
作者 郭伟强 卢鸯 郑小明 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期416-420,共5页
以拓扑指数(分子连接性指数)为结构描述符,用人工神经网络技术建立了醇类化合物的结构与色谱保留值的相关性模型。研究了网络构造对模型稳定性的影响,考察了模型在单一固定相上及多固定相上的适应性。与多元线性回归法相比较,人工... 以拓扑指数(分子连接性指数)为结构描述符,用人工神经网络技术建立了醇类化合物的结构与色谱保留值的相关性模型。研究了网络构造对模型稳定性的影响,考察了模型在单一固定相上及多固定相上的适应性。与多元线性回归法相比较,人工神经网络模型具有更好的预测结果,但外推能力较弱。 展开更多
关键词 定量结构-保留相关 饱和醇 气相色谱 分子结构 保留参数 人工神经网络 拓扑指数
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胺类化合物气相色谱保留指数与结构的相关性研究 被引量:24
7
作者 齐玉华 杨嘉安 许禄 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第2期223-227,共5页
应用Am指数和引力指数C1对在3种体系下的胺类化合物的气相色谱保留指数和结构进行了相关性研究,并运用最佳子变量集算法和人工神经网法进行了计算分析,在非极性固定相OV-101和极性固定相OV-225和NGA下均获得了比较好的相关模型。
关键词 拓扑指数 胺类化合物 气相色谱 保留指数 QSRR
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有机醇的结构与色谱保留指数的相关性拓扑指数法研究 被引量:23
8
作者 韩海洪 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期687-689,共3页
通过计算40种有机醇化合物分子结构的拓扑指数,用多元线性回归将它与气相色谱保留指数进行关联分析,结果获得了良好的相关性,因此,对有机醇各组分在气相色谱上保留指数的理论预测,可作为在色谱分离过程中识别各组分的一种参考方法。
关键词 有机醇 化学结构 色谱保留指数 拓扑指数 多元回归分析
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修正的拓扑指数及在色谱分析中的应用 被引量:26
9
作者 堵锡华 顾菊观 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第4期553-556,共4页
修正的拓扑指数mT被定义为:mT=Σ(δi·δj·δk···)0.5,δi为成键原子i的原子特征值,其中0T、1T对有机物呈现良好的结构选择性。mT与10个系列142个分子的气相色谱相对摩尔校正因子和13个酯分子的色谱保留指数... 修正的拓扑指数mT被定义为:mT=Σ(δi·δj·δk···)0.5,δi为成键原子i的原子特征值,其中0T、1T对有机物呈现良好的结构选择性。mT与10个系列142个分子的气相色谱相对摩尔校正因子和13个酯分子的色谱保留指数、相对保留值有很好的相关性。拓扑指数(mT)能较好地反映化合物的结构特征。运用多元回归分析和MATLAB方法结合,取得良好的结果。 展开更多
关键词 拓扑指数 色谱分析 应用 色谱保留指数 多元回归分析 原子特征值 结构选择性 相对保留值 校正因子 气相色谱 结构特征 有机物 相关性 化合物 AB方 分子 成键
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阿拉善高原2种荒漠植物根系构型及生态适应性特征 被引量:26
10
作者 马雄忠 王新平 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第17期6001-6008,共8页
根系构型决定了植物对资源的吸收方式,根系构型的变化是植物对环境的生态适应和有效生存策略。在阿拉善高原西南缘红砂(Reaumuria soongarica)⁃珍珠猪毛菜(Salsola passerina)混生群落采用传统挖掘法收集两种植物根系,基于量化的根系形... 根系构型决定了植物对资源的吸收方式,根系构型的变化是植物对环境的生态适应和有效生存策略。在阿拉善高原西南缘红砂(Reaumuria soongarica)⁃珍珠猪毛菜(Salsola passerina)混生群落采用传统挖掘法收集两种植物根系,基于量化的根系形态指标,利用几何拓扑学及分形理论分析了根系构型特征,探讨了该地区2种植物对干旱生境的生态适应策略。结果表明:红砂和珍珠猪毛菜根系均以水平分布占优,根系浅层化分布明显,混生的两种植物占据不同的生态位;2种荒漠植物均具有较大的比根长(SRL)和比表面积(SRA),红砂SRL=21.3 cm/g,SRA=7.6 cm2/g,珍珠SRL=22.4 cm/g,SRA=6.5 cm2/g,有利于水分和养分的获取;红砂根系拓扑指数(TI)、修正拓扑参数(qa和qb)分别为0.86、0.52、0.49,珍珠猪毛菜对应参数分别为0.93、0.76、0.73,表明2种植物根系均趋向于鱼尾形分支结构;根系分形维数值(FD红=1.488、FD珍=1.422)较小,而分形丰度值(lgK红=1.855、lgK珍=1.774)较大,表明2种植物分支相对简单,但空间拓展能力强,有利于对营养空间的占有。上述特征可能是阿拉善西南缘红砂⁃珍珠猪毛菜群落2种荒漠植物植物对干旱贫瘠生境的重要生态适应策略。 展开更多
关键词 阿拉善高原 适应策略 分形维数 根系构型 拓扑指数
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烷烃同系物气相色谱保留指数的分子拓扑研究 被引量:20
11
作者 聂长明 戴益民 +1 位作者 文松年 李忠海 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期1-6,共6页
定义了分子中原子的平衡电负性,并用原子的平衡电负性对分子图进行着色,在距离矩阵的基础上结合分子中各原子的支化度构建了一种新的拓扑指数N1,N2和N3。该拓扑指数对分子结构实现惟一性表征,具有优良的结构选择性。将拓扑指数N1,N2和N... 定义了分子中原子的平衡电负性,并用原子的平衡电负性对分子图进行着色,在距离矩阵的基础上结合分子中各原子的支化度构建了一种新的拓扑指数N1,N2和N3。该拓扑指数对分子结构实现惟一性表征,具有优良的结构选择性。将拓扑指数N1,N2和N3与烷烃在固定相角鲨烷(柱温50℃)及SE 30(柱温80℃)上的气相色谱保留指数进行多元线性回归,结果表明烷烃的气相色谱保留指数可分别定量描述为I(Squalane)=23 97842N1-3.86562N2+0 787379N3+42 33061,I(SE 30)=23 83937N1-3 5687N2+0 939876N3+22 11952。用上述回归方程对烷烃的气相色谱保留指数进行预测,结果表明预测值与实验值的平均相对误差均为1 31%,预测结果误差在实验误差范围内。 展开更多
关键词 烷烃 平衡电负性 原子 色谱保留指数 拓扑指数 定量结构-保留关系
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胡杨幼苗根系生长与构型对土壤水分的响应 被引量:25
12
作者 吕爽 张现慧 +3 位作者 张楠 夏延国 井家林 李景文 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1005-1012,共8页
胡杨实生幼苗成活率低是制约其更新与人工育苗保存的关键问题,而幼苗根系生长与构型是影响其存活的重要因素。该试验以1年生胡杨幼苗为材料,通过2种给水方式(断续给水和连续给水)下各6个土壤水分梯度处理的控制试验,探究胡杨幼苗根系生... 胡杨实生幼苗成活率低是制约其更新与人工育苗保存的关键问题,而幼苗根系生长与构型是影响其存活的重要因素。该试验以1年生胡杨幼苗为材料,通过2种给水方式(断续给水和连续给水)下各6个土壤水分梯度处理的控制试验,探究胡杨幼苗根系生长与构型对荒漠地区关键因子水分的响应特征。结果表明:(1)2种给水方式下干旱胁迫均使根冠比增加,且断续给水处理下幼苗根冠比显著大于连续给水。(2)一定程度的干旱处理还可以促进幼苗根系形态发育特征的发展和根系生物量的积累,但过度干旱胁迫或土壤水分含量过多都会抑制根系生长,并以连续给水、土壤含水量15%处理下幼苗根系最为发达。(3)幼苗深扎根能力强,其根宽深比在2种给水方式下均小于1,且断续给水处理显著小于连续给水处理;2种给水方式下根宽深比都与土壤水分含量呈显著正相关。(4)根系拓扑指数在2种给水方式下无显著差异且均接近1,但都与土壤水分含量呈显著负相关。即幼苗根系趋向鱼尾状分支结构,次级分支少,这种根系延伸策略有利于胡杨幼苗在干旱贫瘠的土壤环境中生存。(5)根系构型参数的主成分分析显示,总根长、总根表面积、根宽深比和拓扑指数在2种给水方式下都能很好地表示胡杨幼苗根系构型特征。可见,胡杨幼苗根系通过构筑鱼尾状分支结构、增加垂直根纵向延伸能力和增大根冠比适应干旱环境;水分对于胡杨幼苗根系生长与构型作用显著,根系对水分因子的响应对于胡杨幼苗适应水分异质性环境具有重要意义。 展开更多
关键词 胡杨 幼苗 水分 根系 构型 拓扑指数
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一种新的拓扑指数~0X(~1X)与气相色谱保留指数RI的相关性研究 被引量:23
13
作者 堵锡华 冯长君 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2001年第3期330-332,共3页
在邻接矩阵的基础上 ,建立化合物的主量子数拓扑指数 mX :0 X =Σ(δi) 0 .5,1X =Σ(δi·δj) 0 .5,并计算了 13个系列 94个分子的0 X、1X值。发现0 X或1X与这些化合物的气相色谱保留指数RI有很好的相关性。相关系数均在 0 .97以... 在邻接矩阵的基础上 ,建立化合物的主量子数拓扑指数 mX :0 X =Σ(δi) 0 .5,1X =Σ(δi·δj) 0 .5,并计算了 13个系列 94个分子的0 X、1X值。发现0 X或1X与这些化合物的气相色谱保留指数RI有很好的相关性。相关系数均在 0 .97以上 ,略优于文献方法。并且物理意义明确 ,计算简单 ,使用方便。 展开更多
关键词 原子结构参数 拓扑指数 气相色谱 保留指数 相关性
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醇、酸的定量结构与性质/活性相关性 被引量:21
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作者 堵锡华 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第8期508-512,共5页
在邻接矩阵的基础上 ,建立一种新的拓扑指数 mT :mT =Σ(δi·δj·δk… ) 0 .5,其中 :0 T =Σ(δi) 0 .5,1T =Σ(δi·δj) 0 .5,并计算了 61种化合物分子的0 T、1T值。发现 mT与这些化合物的气相色谱保留指数RI有很好的... 在邻接矩阵的基础上 ,建立一种新的拓扑指数 mT :mT =Σ(δi·δj·δk… ) 0 .5,其中 :0 T =Σ(δi) 0 .5,1T =Σ(δi·δj) 0 .5,并计算了 61种化合物分子的0 T、1T值。发现 mT与这些化合物的气相色谱保留指数RI有很好的相关性。线性回归方程为 :RI =4 2 .7880 +1 3 8.1 681 0 T -4 8.64 2 81T ,相关系数R =0 9997,拓扑指数 (mT) 展开更多
关键词 拓扑指数 有机物 气相色谱 保留指数 定量结构 性质 活性 相关性
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应用拓扑方法计算有机化合物烷烃的沸点 被引量:22
15
作者 王克强 李勤 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 1999年第3期250-253,共4页
根据分子结构的特点,用距离矩阵和染色矩阵表征分子中原子的特性和连接性,用染色因子标识原子性质的差异,发展了一种直接根据分子结构信息计算有机化合物烷烃沸点的方法.对752 种烷烃(C1 到C100)的计算结果表明,沸点的... 根据分子结构的特点,用距离矩阵和染色矩阵表征分子中原子的特性和连接性,用染色因子标识原子性质的差异,发展了一种直接根据分子结构信息计算有机化合物烷烃沸点的方法.对752 种烷烃(C1 到C100)的计算结果表明,沸点的预测值十分接近实验值,平均误差为0.43% ,计算精度优于文献方法. 展开更多
关键词 烷烃 沸点 拓扑指数 分子结构 有机化合物
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铁路快捷货运网络鲁棒性分析 被引量:21
16
作者 张振江 张玉召 王小荣 《中国安全科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期150-156,共7页
为保障铁路快捷货运运营面对突发事件时的稳定性,采用复杂网络及鲁棒优化理论,研究铁路快捷货运网络(REFN)拓扑特性及鲁棒性。首先,计算网络特征统计参数,分析REFN拓扑特性;然后,评价REFN中的重要节点,建立基于线路等级、度值、介数的... 为保障铁路快捷货运运营面对突发事件时的稳定性,采用复杂网络及鲁棒优化理论,研究铁路快捷货运网络(REFN)拓扑特性及鲁棒性。首先,计算网络特征统计参数,分析REFN拓扑特性;然后,评价REFN中的重要节点,建立基于线路等级、度值、介数的综合评价指标;最后,计算不同攻击方式下的鲁棒性指标,对比分析有无级联失效情况下REFN鲁棒性。结果表明:与传统复杂网络节点重要性评价指标相比,考虑线路等级计算出的重要节点对网络鲁棒性影响更大;REFN在随机攻击下具有鲁棒性,在蓄意攻击下表现出较强的脆弱性,在考虑级联失效的情况下网络的脆弱性更加突出。 展开更多
关键词 铁路快捷货运网络(REFN) 鲁棒性 级联失效 拓扑特性 评价指标
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一个新的拓扑指数用于芳烃化合物溶解度、分配系数及生物毒性的研究 被引量:20
17
作者 余训民 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期31-37,共7页
在分子拓扑理论的基础上,提出了一个新的拓扑指数YX,井用YX研究了芳烃化合物的溶解度、分配系数及生物毒(活)性,给出了相关方程.结果表明,新方法计算方便,物理意义明确,预测值与相应的实验值较吻合.
关键词 拓扑指数 芳烃化合物 溶解度 分配系数 生物毒性 QSAR 生物活性
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脂肪醇物理化学性质的分子拓扑研究 被引量:18
18
作者 秦正龙 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第6期436-439,共4页
借助于电负性和主量子数定义的原子结构参数为Ai,由Ai 建构的新拓扑指数nP = (Ai·Aj·Ak…… ) 0 .5,其中 ,0 P = (Ai) 0 .5,1P = (Ai·Aj) 0 .5.0 P与脂肪醇的摩尔折射Rm、辛醇 /水分配系数lgKow,0 P及1P与脂肪醇的摩尔... 借助于电负性和主量子数定义的原子结构参数为Ai,由Ai 建构的新拓扑指数nP = (Ai·Aj·Ak…… ) 0 .5,其中 ,0 P = (Ai) 0 .5,1P = (Ai·Aj) 0 .5.0 P与脂肪醇的摩尔折射Rm、辛醇 /水分配系数lgKow,0 P及1P与脂肪醇的摩尔磁化率Xm、蒸发热Hv 的相关系数分别为 0 .994 7,0 .994 1,0 .9998,0 .996 8,均优于文献方法 .0 P和1P与脂肪醇的气相色谱保留指数RI也具有良好的相关性 ,相关系数为 0 .996 7.nP是一种较为理想的拓扑指数 。 展开更多
关键词 分子拓扑 拓扑指数 脂肪醇 理化性质 相关性 电负性 结构
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不饱和烃的理化性质与分子拓扑指数的关系研究 被引量:17
19
作者 倪才华 冯志云 李良超 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第4期359-363,共5页
定义并分别求算了不饱和烃(烯烃、炔烃、烷基苯)的价键连通性指数和价键信息拓扑指数,将拓扑指数分别与这些物质的标准生成热、标准熵、标准生成自由能等一系列理化性质相关联,用计算机回归方法确定了不同性质的最佳函数形式.回归的复... 定义并分别求算了不饱和烃(烯烃、炔烃、烷基苯)的价键连通性指数和价键信息拓扑指数,将拓扑指数分别与这些物质的标准生成热、标准熵、标准生成自由能等一系列理化性质相关联,用计算机回归方法确定了不同性质的最佳函数形式.回归的复相关系数和重新计算的误差结果显示拓扑指数与理化性质具有优良的相关性. 展开更多
关键词 拓扑指数 理化性质 不饱和烃 物理化学性质
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酚的拓扑指数在色谱分析中的应用 被引量:17
20
作者 杨林 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期50-52,共3页
关键词 拓扑指数 色谱保留指数 色谱分析
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