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基于Tomoper CoMFA方法对香豆素类苯扎酰胺类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的3D-QSAR研究及分子设计
1
作者
仝建波
边帅
+2 位作者
罗钉
张星
冯怡
《物理化学进展》
2020年第4期38-50,共13页
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类蛋白酶,其对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用,可以作为治疗癌症和其他疾病的治疗靶点。组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACIs)可增加细胞内组蛋白的乙酰化程度,抑制肿瘤细胞的增殖。本文采用易...
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类蛋白酶,其对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用,可以作为治疗癌症和其他疾病的治疗靶点。组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACIs)可增加细胞内组蛋白的乙酰化程度,抑制肿瘤细胞的增殖。本文采用易位体比较分子力场(Tomoper CoMFA)方法对一系列以香豆素为基础的苯扎酰胺类化合物作为HDACs抑制剂的HCT116细胞系和A2780细胞系进行三维定量构效关系研究(3D-QSAR),对生成的模型进行交叉验证和非交叉验证。HCT116细胞系交叉验证系数q2= 0.517,非交叉验证系数r2 = 0.880,A2780细胞系交叉验证系数q2 = 0.572,非交叉验证系数r2= 0.869。最后采用Topomer search技术在ZINC数据库中进行虚拟筛选,最终设计出16个具有更高活性的新型HDACIs化合物。
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关键词
组蛋白去乙酰化酶
易位体比较分子力场
组蛋白去乙酰化酶抑制剂
三维定量构效关系
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职称材料
题名
基于Tomoper CoMFA方法对香豆素类苯扎酰胺类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的3D-QSAR研究及分子设计
1
作者
仝建波
边帅
罗钉
张星
冯怡
机构
陕西科技大学化学与化工学院
陕西省轻化工助剂重点实验室
出处
《物理化学进展》
2020年第4期38-50,共13页
文摘
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类蛋白酶,其对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用,可以作为治疗癌症和其他疾病的治疗靶点。组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACIs)可增加细胞内组蛋白的乙酰化程度,抑制肿瘤细胞的增殖。本文采用易位体比较分子力场(Tomoper CoMFA)方法对一系列以香豆素为基础的苯扎酰胺类化合物作为HDACs抑制剂的HCT116细胞系和A2780细胞系进行三维定量构效关系研究(3D-QSAR),对生成的模型进行交叉验证和非交叉验证。HCT116细胞系交叉验证系数q2= 0.517,非交叉验证系数r2 = 0.880,A2780细胞系交叉验证系数q2 = 0.572,非交叉验证系数r2= 0.869。最后采用Topomer search技术在ZINC数据库中进行虚拟筛选,最终设计出16个具有更高活性的新型HDACIs化合物。
关键词
组蛋白去乙酰化酶
易位体比较分子力场
组蛋白去乙酰化酶抑制剂
三维定量构效关系
Keywords
HDACs
tomoper
comfa
HDACIs
3D-QSAR
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Tomoper CoMFA方法对香豆素类苯扎酰胺类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的3D-QSAR研究及分子设计
仝建波
边帅
罗钉
张星
冯怡
《物理化学进展》
2020
0
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