期刊文献+
共找到36篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
人肺鳞癌组织的比较蛋白质组学研究 被引量:14
1
作者 汤参娥 李萃 +6 位作者 肖志强 章晓鹏 陈主初 易红 李建玲 段朝军 梁宋平 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期274-279,共6页
目的利用蛋白质组学方法建立人肺鳞癌组织及其癌旁正常支气管上皮组织的差异蛋白质表达谱。方法对20例人肺鳞癌组织和配对的癌旁正常支气管上皮组织进行比较蛋白质组学研究,即利用双向凝胶电泳(2-DE)分离二者总蛋白质后,经图像分析识别... 目的利用蛋白质组学方法建立人肺鳞癌组织及其癌旁正常支气管上皮组织的差异蛋白质表达谱。方法对20例人肺鳞癌组织和配对的癌旁正常支气管上皮组织进行比较蛋白质组学研究,即利用双向凝胶电泳(2-DE)分离二者总蛋白质后,经图像分析识别差异表达的蛋白,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质。结果(1)比较分析20例肺鳞癌及正常配对组织的2-DE图谱,找到差异蛋白质点76个;(2)对68个差异蛋白质点进行了肽质量指纹图分析,鉴定出一些与瘤基因、细胞周期调控、信号转导等有关的肺鳞癌相关蛋白;(3)肺鳞癌相关蛋白mdm2、c-Jun和表皮生长因子受体(EGFR)在人肺鳞癌组织中高表达,而在正常对照中均表达下调,与蛋白质组的分析鉴定结果是一致的。结论成功鉴定了68个肺鳞癌相关蛋白,为进一步筛选用于肺鳞癌诊断、治疗和预后评估的肺鳞癌分子标志物奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 肺鳞癌组织 蛋白质组学 支气管上皮组织 差异蛋白质表达谱
原文传递
草鱼HSP70基因cDNA部分序列克隆及其组织表达差异 被引量:12
2
作者 林亚秋 郑玉才 吉红 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第4期67-71,共5页
根据鲤热休克蛋白70(Heat shock protein,HSP70)序列(AY120894)设计并合成一对引物,以草鱼(Cteno-pharyngodon idella)肝胰脏组织总RNA为模板,RT-PCR扩增获得草鱼HSP70基因cDNA部分序列,并进行了组织表达差异性研究。结果显示:所获为序... 根据鲤热休克蛋白70(Heat shock protein,HSP70)序列(AY120894)设计并合成一对引物,以草鱼(Cteno-pharyngodon idella)肝胰脏组织总RNA为模板,RT-PCR扩增获得草鱼HSP70基因cDNA部分序列,并进行了组织表达差异性研究。结果显示:所获为序列为480 bp,获得GeneBank登陆号为FJ483832。序列测序结果显示,HSP70扩增序列与鲤、斑马鱼、鲋的同源性为:93%、91%、93%。另外,所获序列HSP70在草鱼脂肪、肌肉、肠、脑、粘液、性腺、鳔、肝胰脏、心脏、脾脏、鳃、鳍12个组织的表达存在差异,HSP70在草鱼这12个组织中均检测到表达,其中在鳍中表达最高,极显著高于其他组织(P<0.01);在鳔中表达次之,且与脑、心脏、性腺中表达差异不显著;在粘液中表达最低。 展开更多
关键词 热休克蛋白(HSP70) 克隆 组织差异 草鱼(Ctenopharyngodon idella)
下载PDF
Comparative Proteome Analysis of Human Lung Squamous Carcinoma Tissue 被引量:11
3
作者 LI Cui TANG Can'e +3 位作者 DUAN Chaojun YI Hong XIAO Zhiqiang CHEN Zhuchu 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2006年第4期232-239,共8页
Objective: To establish the two-dimensional electrophoresis profiles with high resolution and reproducibility from human lung squamous carcinoma tissue and paired normal tumor-adjacent bronchial epithelial tissue, an... Objective: To establish the two-dimensional electrophoresis profiles with high resolution and reproducibility from human lung squamous carcinoma tissue and paired normal tumor-adjacent bronchial epithelial tissue, and to identify differential expression tumor-associated proteins by using proteome analysis. Methods: Comparative proteome analysis with 20 human lung squamous carcinoma tissues and the paired normal bronchial epithelial tissues adjacent to tumors was carried out. The total proteins of human lung squamous carcinoma tissue and paired normal tumor-adjacent bronchial epithelial tissue were separated by means of immobilized pH gradient-based two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) and silver staining. The differential expression proteins were analyzed and then identified by matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). Results: (1) Well-resolved, reproducible 2-DE patterns of human lung squamous carcinoma and adjacent normal bronchial epithelial tissues were obtained. For tumor tissue, average spots of 3 gels were 1567±46, and 1436±54 spots were matched with an average matching rate of 91.6%. For control, average spots of 3 gels were 1349±58, and 1228±35 spots were matched with an average matching rate of 91.03%. The average position deviation of matched spots was 0.924±0.128 mm in IEF direction, and 1.022±0.205 mm in SDS-PAGE direction; (2) A total of 1178±56 spots were matched between the eleetrophoretie maps of 20 human lung squamous carcinoma tissues and paired normal tumor-adjacent bronchial epithelial tissues. Seventy-six differentially expressed proteins were screened; (3) Sixty-eight differential proteins were identified by PMF, some proteins were the products of oneogenes, and others involved in the regulation of cell cycle and signal transduetion; (4) In order to validate the reliability of the identified results, the expression of 3 proteins mdm2, c-jun and EGFR, which was correlated with lung squamous carcino 展开更多
关键词 human lung squamous carcinoma tissue normal bronchial epithelial tissue PROTEOME differential expression protein
下载PDF
不同毛色山羊皮肤组织Agouti基因mRNA及其编码ASIP差异表达研究 被引量:8
4
作者 张天 张丽英 +2 位作者 李祥龙 周荣艳 李兰会 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1932-1938,共7页
旨在探讨Agouti基因调控山羊毛色机制,采用SYBR Green real-time PCR和蛋白免疫印迹方法分别检测了不同毛色山羊皮肤组织中Agouti基因mRNA及其所编码ASIP蛋白的差异表达。结果表明,Agouti基因mRNA在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表... 旨在探讨Agouti基因调控山羊毛色机制,采用SYBR Green real-time PCR和蛋白免疫印迹方法分别检测了不同毛色山羊皮肤组织中Agouti基因mRNA及其所编码ASIP蛋白的差异表达。结果表明,Agouti基因mRNA在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表达量依次为白色>黑色>棕色;mRNA表达量在棕色和白色、棕色和黑色山羊皮肤之间均存在显著差异(P<0.05),在白色和黑色山羊皮肤之间差异不显著(P>0.05)。ASIP在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表达量:白色>棕色>黑色;ASIP表达量在白色和黑色山羊皮肤组织之间存在显著差异(P<0.05),但在白色和棕色、棕色和黑色山羊皮肤组织之间差异均不显著(P>0.05)。研究结果提示,Agouti基因在不同毛色山羊皮肤组织中可能存在不同调控机制。 展开更多
关键词 山羊 Agouti基因 皮肤组织 mRNA ASIP 差异表达
下载PDF
草鱼PPARα和PPARγ基因的克隆与组织表达差异 被引量:7
5
作者 林亚秋 吉红 郑玉才 《水产科学》 CAS 北大核心 2011年第2期94-97,共4页
根据GenBank上登录的过氧化物酶体增殖物激活受体s(Peroxisome proliferator activated receptor,PPARs)基因序列设计2对引物,提取草鱼肝脏组织总RNA,经RT-PCR扩增获得了PPARα624 bp和PPARγ438 bp。并利用半定量RT-PCR分析了草鱼PPAR... 根据GenBank上登录的过氧化物酶体增殖物激活受体s(Peroxisome proliferator activated receptor,PPARs)基因序列设计2对引物,提取草鱼肝脏组织总RNA,经RT-PCR扩增获得了PPARα624 bp和PPARγ438 bp。并利用半定量RT-PCR分析了草鱼PPARα和PPARγ基因的mRNA组织表达特性,结果在肝胰脏、脂肪、肌肉、肠、脑、性腺、鳔、肝胰脏、心脏、脾脏和鳃均检测到PPARα和PPARγ基因的表达,在黏液中未检测到表达。且PPARα在肝胰脏中表达最高,PPARγ在脂肪组织中表达最高。 展开更多
关键词 PPARΑ PPARΓ 克隆 组织差异 草鱼
下载PDF
鲤鱼HSP70基因组织表达差异研究 被引量:6
6
作者 林亚秋 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第11期4915-4916,5077,共3页
[目的]研究HSP70是否可作为鲤鱼养殖中的应激监测指标。[方法]根据鲤鱼HSP70序列(AY120894)设计并合成1对引物,提取鲤鱼肝脏组织总RNA,通过RT-PCR方法克隆得到鲤鱼HSP70部分cDNA片段,然后检测其在鲤鱼心脏、肠、粘液、性腺、鳔、鳃、鳍... [目的]研究HSP70是否可作为鲤鱼养殖中的应激监测指标。[方法]根据鲤鱼HSP70序列(AY120894)设计并合成1对引物,提取鲤鱼肝脏组织总RNA,通过RT-PCR方法克隆得到鲤鱼HSP70部分cDNA片段,然后检测其在鲤鱼心脏、肠、粘液、性腺、鳔、鳃、鳍等不同组织中的表达差异。[结果]RT-PCR扩增获得鲤鱼HSP70基因cDNA部分序列为480 bp。将测序后推测的氨基酸序列与其他种类的鱼进行同源性比较,结果发现与鲤鱼、斑马鱼、虹鳟、牙鲆、剑尾鱼、鲋鱼的同源性依次为96%、98%、98%、96%、96%、96%。HSP70在鲤鱼8个组织中均检测到表达,其中在心脏中表达最高,其次是鳔、鳍,二者之间无显著差异(P>0.05),在肠、粘液与脂肪3个组织中的表达无显著差异(P>0.05),但显著高于在性腺与鳃中的表达水平(P<0.05)。[结论]HSP70作为鲤鱼养殖中应激程度、应激能力、健康状况检测的分子标记物是可行的。 展开更多
关键词 HSP70 克隆 组织差异 鲤鱼
下载PDF
草鱼HSP90基因cDNA序列克隆及其组织表达差异 被引量:5
7
作者 林亚秋 郑玉才 +2 位作者 吉红 贺庆华 黄吉芹 《水产科学》 CAS 北大核心 2009年第8期439-442,共4页
根据斑马鱼HSP90(Heat shock protein)序列(NM_131328)设计并合成一对引物,提取草鱼肝脏组织总RNA,RT-PCR扩增获得草鱼HSP90基因cDNA部分序列596 bp,获得GenBank登陆号为FJ517554。将测序结果利用DNAman软件与其他几种已知序列的鱼进行... 根据斑马鱼HSP90(Heat shock protein)序列(NM_131328)设计并合成一对引物,提取草鱼肝脏组织总RNA,RT-PCR扩增获得草鱼HSP90基因cDNA部分序列596 bp,获得GenBank登陆号为FJ517554。将测序结果利用DNAman软件与其他几种已知序列的鱼进行比对,结果表明,草鱼HSP90与斑马鱼、鲤、鲋的同源性依次为90%、89%、92%。同时利用半定量(Semi-quantitative,SQ)RT-PCR技术检测HSP90在草鱼脂肪、肌肉、肠、脑、粘液、性腺、鳔、肝脏、心脏、脾脏、鳃、鳍12个组织的表达差异。结果表明,HSP90在草鱼除了鳍外的其他11个组织中均检测到表达,其中在心脏中表达最高,但与鳃、性腺、脑、脾脏中的表达无显著差异(P>0.05),在脂肪、粘液、鳔组织中的表达显著低于其他几种组织(P<0.05),在肝脏、肌肉与肠中的表达无显著差异(P>0.05)。 展开更多
关键词 HSP90 克隆 组织差异 草鱼
下载PDF
子宫内膜异位症患者异位内膜组织中差异表达microRNA的筛选 被引量:5
8
作者 李晶晶 黄志雄 +3 位作者 杨琳 陈清西 陈琼华 吴荣锋 《中华生殖与避孕杂志》 CSCD 北大核心 2021年第6期512-521,共10页
目的:探讨微小 RNA(microRNA,miRNA)在子宫内膜异位症(endometriosis,EMS)患者异位内膜组织中的表达特征。方法:收集2018年4月至2019年10月期间于厦门大学附属第一医院妇产科就诊EMS 患者异位内膜组织和对照组在位内膜组织开展实验。利... 目的:探讨微小 RNA(microRNA,miRNA)在子宫内膜异位症(endometriosis,EMS)患者异位内膜组织中的表达特征。方法:收集2018年4月至2019年10月期间于厦门大学附属第一医院妇产科就诊EMS 患者异位内膜组织和对照组在位内膜组织开展实验。利用Illumina平台的miRNA测序检测内膜组织中 miRNA的表达情况。通过生物信息学分析差异表达的miRNAs及其潜在靶基因在EMS发生、发展中的作用。结合文献挑选6个具有显著差异的miRNAs(miR-98-5p、let-7c-5p、miR-495-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p、miR-148b-3p),应用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)进行验证,并在构建miRNA-基因调控网络后初步验证其潜在靶基因。结果:测序结果显示,相比对照组,EMS患者异位内膜组织中有69个miRNAs出现差异表达(差异倍数>1.5, P<0.05),其中表达上调22个,表达下调47个。基因本体分析显示,差异表达的miRNAs所调控的靶基因在生物学过程中集中在与蛋白质修饰、发育调控、细胞代谢和形态结构等相关。KEGG pathway分析显示,靶基因富集于蛋白质功能、自噬、AGE-RAGE及MAPK信号通路中。qRT-PCR结果显示miR-98-5p、let-7c-5p、miR-200b-3p、miR-200c-3p的表达情况与测序结果一致。miRNA-基因共表达网络显示 miRNAs与所预测的靶基因间的相互关系。miRNAs潜在靶基因的qRT-PCR验证结果显示,miR-200b-3p、miR-200c-3p与 ZEB2呈负相关,miR-98-5p与 PGRMC1呈负相关,miR-98-5p、let-7c-5p与 ADIPOR2呈正相关。 结论:miR-98-5p、let-7c-5p、miR-200b-3p和miR-200c-3p在EMS患者异位内膜组织中存在显著差异表达,可能参与EMS的发生、发展。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 微小RNA 异位内膜 在位内膜 差异表达
原文传递
人支气管上皮不典型增生与浸润癌组织的比较蛋白质组学研究 被引量:3
9
作者 吴晓英 陈主初 +5 位作者 肖志强 李萃 汪春年 李建玲 冯雪萍 张鹏飞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1006-1017,共12页
为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物 ,采用改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 (two dimensionalelectrophoresis,2 DE) ,应用ImageMaster 2D分... 为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物 ,采用改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 (two dimensionalelectrophoresis,2 DE) ,应用ImageMaster 2D分析软件、Student’st 检验识别差异蛋白质点 ,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assistedlaserdesorption/ionizationtime of flightmassspectrometry ,MALDI TOF MS)得到相应的肽质指纹图 (peptidemassfingerprint,PMF) ,搜索数据库鉴定差异蛋白质 .由此获得人支气管上皮不典型增生和浸润癌组织的 2 DE图谱及其凝胶的平均蛋白质点数 (12 73 0 0± 4 3 31,132 6 0 0± 6 6 6 3) ,且两阶段间平均差异蛋白质点数为 5 6 0 0± 8 96 .取 38个差异蛋白质点进行PMF分析 ,鉴定出一些与细胞生长、分化或肿瘤发生等有关的蛋白质 ,随即应用免疫组化检测差异蛋白质EGFR、c Jun、Mdm2在两类组织中的表达 ,其结果也显示了类似的表达差异 .支气管上皮不典型增生恶性转化过程中存在蛋白质的差异表达 ,这些差异蛋白质可能以不同的方式参与了癌变过程 ,且EGFR、c Jun、Mdm2的免疫组化验证结果与质谱结果的一致性表明 。 展开更多
关键词 比较蛋白质组学 人支气管上皮 差异表达蛋白质 免疫组化 分子标志物
下载PDF
cDNA芯片研发及其在肥胖患者脂肪基因差异表达研究中的应用 被引量:3
10
作者 赵萸 骆天红 +8 位作者 王侃侃 张济 郑培烝 赵春军 刘优萍 郑升 顾燕云 李果 罗敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1067-1078,共12页
为了加快基因功能的研究 ,利用已有的来源于不同组织的cDNA克隆 ,并通过交换和购买补充了低丰度和染色体覆盖不完全的部分cDNA ,研制开发出具有相当代表性、覆盖较完全的高密度cDNA表达型基因芯片 ,每张芯片上含有 384个质控DNA和 12 6... 为了加快基因功能的研究 ,利用已有的来源于不同组织的cDNA克隆 ,并通过交换和购买补充了低丰度和染色体覆盖不完全的部分cDNA ,研制开发出具有相当代表性、覆盖较完全的高密度cDNA表达型基因芯片 ,每张芯片上含有 384个质控DNA和 12 6 30个cDNA探针 ,其中包括 12 5 0 8个Unigene和 12 2个表达序列标签 (EST) .利用这些芯片 ,对肥胖患者及正常人内脏脂肪组织基因表达谱进行了初步研究 ,并发现在肥胖患者内脏脂肪组织差异表达的基因 ,其中上调的有与凋亡相关的基因、与免疫有关的基因以及与能量代谢有关的基因等 ,而下调的主要是与脂肪酸及胆固醇合成有关的基因 。 展开更多
关键词 cDNA芯片 肥胖 脂肪组织 差异表达
下载PDF
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响 被引量:4
11
作者 李薇懿 李国春 +6 位作者 魏乐心 钱勤 郭晴晴 杨诗锦 杨晓娟 王鹏程 陈杨 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2022年第5期1933-1943,共11页
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,... 目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。 展开更多
关键词 凉血通瘀方 miRNA 高通量测序 大鼠脑组织 差异表达 急性脑出血
下载PDF
固醇调节元件结合蛋白在动物脂肪代谢中的研究进展 被引量:3
12
作者 卓伟华 王继文 蒋立 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2005年第2期39-41,共3页
本文首先阐述固醇调节元件结合蛋白 (SREBPs)的结构、分类和基因定位 ,然后叙述SREBPs的组织表达差异性及其所引起的不同动物脂肪生成的组织差异性 。
关键词 畜牧、兽医科学基础学科 固醇调节元件结合蛋白 综述 组织差异表达 调控机理
下载PDF
结直肠癌血瘀证肿瘤组织与正常组织差异表达蛋白比较 被引量:3
13
作者 柴仲秋 周冰 +1 位作者 张静莎 韩云雨 《世界中医药》 CAS 2022年第24期3496-3500,共5页
目的:比较结直肠癌血瘀证肿瘤组织与正常组织的差异表达蛋白。方法:采用临床调查方法,对结直肠癌患者进行证候分析,留取血瘀证患者术后标本的肿瘤组织和远端正常肠黏膜组织,运用iTRAQ定量蛋白质组学比较2种组织的差异表达蛋白,并应用Met... 目的:比较结直肠癌血瘀证肿瘤组织与正常组织的差异表达蛋白。方法:采用临床调查方法,对结直肠癌患者进行证候分析,留取血瘀证患者术后标本的肿瘤组织和远端正常肠黏膜组织,运用iTRAQ定量蛋白质组学比较2种组织的差异表达蛋白,并应用Metascape进行富集和分析。结果:在血瘀证组织比较中,肿瘤组织较远端正常组织差异表达蛋白总数为55个,其中上调13个,功能与调节型胞吐作用相关,下调42个,差异表达蛋白多集中在红细胞吸收氧气并释放二氧化碳、超分子纤维组织、表皮细胞分化、核心组织、NABA核心母体、对无机物的反应、Nop56p相关前rRNA复合体、中性粒细胞迁移、DNA结合的调控、水解酶活性负调节、脂肪酸衍生物代谢过程、上皮细胞增殖的正调控和生物氧化等通路。结论:血瘀证肿瘤组织与正常组织间的差异表达蛋白,其中红细胞吸收氧气并释放二氧化碳、角化、核心组织、超分子纤维组织、血压调节和整合素途径等生物过程相关蛋白可能对血瘀证的形成产生重要作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 蛋白质组学 定量 血瘀证 肿瘤组织 正常组织 差异表达 蛋白
下载PDF
Isolation, Identification and Tissue Expression Profile Analysis of One Novel Differentially Expressed Sequence Tag in the Longissimus dorsi Muscle from Meishan, Meishan × Large White Hybrid and Large White Pigs 被引量:2
14
作者 LIUYong-gang XIONGYuan-zhu DENGChang-yan 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2004年第11期856-861,共6页
In order to detect the molecular mechanism of heterosis in pigs, the mRNA differential display technique was performed to investigate the differences of gene expression in the Longissimus dorsi tissue from Meishan, ... In order to detect the molecular mechanism of heterosis in pigs, the mRNA differential display technique was performed to investigate the differences of gene expression in the Longissimus dorsi tissue from Meishan, Meishan × Large White hybrid and Large White pigs with nine 3'-end anchored primers in combination with ten 5'-end arbitrary primers and nearly 3000 reproducible bands were examined. One novel expressed sequence tag (EST4, GenBank accession number: AY553914) that was differentially expressed in Meishan, Meishan× Large White hybrid and Large White pigs was isolated from the Longissimus dorsi muscle tissue and identified through semi-quantitative RT-PCR. BLAST analysis revealed that the 350 bp long EST (EST4) was not homologous to any of the known porcine genes. Tissue expression profile analyses showed that the EST4 was expressed in most of tissues.LIU Yong-gang, Ph D candidate 展开更多
关键词 mRNA differential display Semi-quantitative RT-PCR tissue expression profile ANALYSIS
下载PDF
宫内妊娠和输卵管妊娠绒毛组织中HIF-1α、Beclin-1、LC-3蛋白表达差异性研究 被引量:2
15
作者 林銮如 卢文静 袁烁 《生殖医学杂志》 CAS 2023年第5期716-722,共7页
目的 检测宫内妊娠和输卵管妊娠绒毛组织中缺氧诱导因子1α(HIF-1α)、自噬标志蛋白(Beclin-1)、微管相关蛋白轻链3(LC-3)的表达情况,分析滋养层细胞在宫内、宫外不同环境中的缺氧状态及自噬表达的差异。方法 宫内妊娠绒毛组织取材于202... 目的 检测宫内妊娠和输卵管妊娠绒毛组织中缺氧诱导因子1α(HIF-1α)、自噬标志蛋白(Beclin-1)、微管相关蛋白轻链3(LC-3)的表达情况,分析滋养层细胞在宫内、宫外不同环境中的缺氧状态及自噬表达的差异。方法 宫内妊娠绒毛组织取材于2021年9—12月于广州中医药大学第一附属医院妇科门诊就诊的正常宫内妊娠6~8周、要求终止妊娠的6例患者(宫内妊娠组);输卵管妊娠绒毛组织取材于同时期妇科住院部妊娠6~8周、手术确诊输卵管妊娠且切除患侧输卵管的6例患者(输卵管妊娠组)。比较宫内妊娠和输卵管妊娠绒毛组织结构的差异,通过免疫组化、免疫荧光方法检测宫内妊娠和输卵管妊娠滋养层细胞中HIF-1α、Beclin-1、LC-3蛋白的相对表达量。结果 宫内妊娠和输卵管妊娠绒毛组织在病理结构上具有明显差异。免疫组化检测结果显示,输卵管妊娠组绒毛组织中HIF-1α、Beclin-1、LC-3蛋白的相对表达量均显著高于宫内妊娠组(P<0.05);免疫荧光检测结果显示,输卵管妊娠组绒毛组织中HIF-1α、LC-3蛋白的相对表达量均显著高于宫内妊娠组(P<0.05),而Beclin-1蛋白的相对表达量两组间无显著性差异(P>0.05)。结论 输卵管妊娠时滋养层细胞处于更缺氧的环境中,且对细胞自噬起正向促进作用。 展开更多
关键词 宫内妊娠 输卵管妊娠 绒毛组织 缺氧状态 自噬 差异性表达
下载PDF
滇陆猪Nramp1基因多态性对其在组织中表达的影响 被引量:3
16
作者 张斌 韩敏 +5 位作者 相德才 刘韶娜 沙茜 张桂生 赵智勇 赵彦光 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期202-208,共7页
【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基... 【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基因进行扩增,以DNASTAR 5.0进行序列比对分析及多态性(SNP)位点检测;同时利用实时荧光定量PCR检测Nramp1基因在滇陆猪各组织中的相对表达量,并运用SPSS 19.0分析Nramp1基因多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响。【结果】在滇陆猪Nramp1基因第5外显子、第5内含子和第6外显子上分别发现SNP1(T→C)、SNP2(A→G)和SNP3(G→A)等3个SNPs位点,都只存在2种基因型,且SNP1位点和SNP3位点在试验猪群体中属于低度多态[多态信息含量(PIC)/杂合度(He)<0.25)],SNP2位点属于中度多态(0.25肝脏>脾脏>心脏;此外,Nramp1基因在不同基因型滇陆猪群体中表现出的组织差异表达也不同,尤其是Nramp1基因在SNP2位点纯合群体肝脏中的相对表达量显著低于在杂合群体肝脏中的相对表达量,说明Nramp1基因多态性变异对其在滇陆猪组织中的表达有显著影响。【结论】Nramp1基因SNP位点变异能影响Nramp1基因在滇陆猪各组织中的表达变化,从而影响机体的免疫应答反应,其中SNP2位点可作为滇陆猪抗病育种的分子标记。 展开更多
关键词 滇陆猪 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1) 多态性位点(SNPs) 基因型 组织差异表达
下载PDF
蒙古马(斑点)胎儿期黑白毛色区域皮肤组织相关基因表达分析 被引量:3
17
作者 白东义 拉希玛 +9 位作者 图格琴 赵若阳 陶娜拉 韩海格 丁文淇 贾紫洁 刘慧莹 王文兴 黄博光 芒来 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期96-105,共10页
为确定相关候选基因在毛色产生过程中的差异,以及相互之间的关系,试图解析胎儿期蒙古马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古马(斑点)奠定基础,本研究以蒙古马(斑点)胎儿为研究对象,首先对胎儿期蒙古马体躯白色和黑色区域皮肤... 为确定相关候选基因在毛色产生过程中的差异,以及相互之间的关系,试图解析胎儿期蒙古马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古马(斑点)奠定基础,本研究以蒙古马(斑点)胎儿为研究对象,首先对胎儿期蒙古马体躯白色和黑色区域皮肤组织制作石蜡切片,进行组织学观察,其次对胎儿期蒙古马白色和黑色区域皮肤进行RNA-seq,构建mRNA表达谱,筛选相关差异表达基因,进行GO和KEGG功能富集分析。结果表明:1)通过组织学观察,黑色素在胎儿黑色皮肤组织表皮里沉积很明显,毛乳头、毛母质部位均有黑色素沉积。相反,白色皮肤组织中没有黑色素沉淀;2)RNA-seq筛选毛色产生差异的相关基因,共鉴定出660个基因,其表达量在黑白2个不同颜色皮肤组织中存在显著差异(P<0.05),其中197个基因在蒙古马胎儿黑色皮肤组织表达量较高,59个基因在蒙古马胎儿白色皮肤组织表达量较高。差异表达基因TYR、TYRP1、DCT、PAX3和DAPL1等富集到了黑色素生成通路。综上,胎儿时期蒙古马的毛色形成主要由黑色素形成相关基因决定,可为后期蒙古斑点马选育环节中对毛色的筛选提供科学理论依据。 展开更多
关键词 蒙古马(斑点) 胎儿 皮肤组织 差异表达mRNA
原文传递
鸡OBR基因在肉鸡和蛋鸡肝脏组织中差异表达的研究 被引量:3
18
作者 王桂华 李辉 +1 位作者 王启贵 王宇祥 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第5期650-655,共6页
瘦蛋白受体(OBR)属于Ⅰ类细胞因子超家族受体,其在瘦蛋白的信号转导途径中起着关键的作用。本研究采用半定量RT-PCR方法检测鸡OBR基因在不同发育阶段(1日龄,2,4,6,8和10周龄)的肉鸡和蛋鸡肝脏组织中的表达情况。结果发现,OBR基因在肉鸡... 瘦蛋白受体(OBR)属于Ⅰ类细胞因子超家族受体,其在瘦蛋白的信号转导途径中起着关键的作用。本研究采用半定量RT-PCR方法检测鸡OBR基因在不同发育阶段(1日龄,2,4,6,8和10周龄)的肉鸡和蛋鸡肝脏组织中的表达情况。结果发现,OBR基因在肉鸡和蛋鸡肝脏中表达存在差异,除4周龄外,其它时期肉鸡OBR基因表达水平均高于蛋鸡。研究结果同时表明,饲料能量水平影响OBR基因的表达水平。 展开更多
关键词 OBR基因 肝脏组织 差异表达
下载PDF
草鱼PAX7基因的克隆、序列分析及组织表达 被引量:2
19
作者 甘甜 冷向军 +3 位作者 郭婷 胡静 魏静 李小勤 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期152-158,共7页
配对盒基因7(Paired box 7 gene,PAX7)在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照Gen Bank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物... 配对盒基因7(Paired box 7 gene,PAX7)在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照Gen Bank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物,进行反转录PCR扩增,获得草鱼PAX7基因的部分序列,长645 bp,编码214个氨基酸,包含编码128个氨基酸的PAX7蛋白配对框(PD)。氨基酸序列比对结果发现,草鱼PAX7基因与其他物种具有高度的相似性,与斑马鱼、线鳍电鳗、日本青鳉、金头鲷、虹鳟、大西洋鲑、北极嘉鱼、人、野牦牛、褐家鼠和小鼠的PAX7氨基酸序列同源性可达90%-97%;各物种PAX7部分氨基酸序列的系统进化树结果显示,草鱼与斑马鱼、日本青鳉、北极嘉鱼、大西洋鲑、虹鳟、线鳍电鳗和金头鲷聚为一大支,小鼠、褐家鼠,野牦牛与人类另聚一支,所得结果符合物种传统分类进化地位。运用实时荧光定量PCR检测草鱼PAX7基因在各组织中的差异表达,结果显示PAX7基因在肌肉中表达量最高;其次是前肠和皮肤,在心、脑、肾和肝中仅少量表达,所得结果与该基因的功能相一致。 展开更多
关键词 PAX7基因 草鱼 序列分析 组织差异表达
下载PDF
基于生物信息学的胰腺导管腺癌核心风险基因筛选和分析
20
作者 景晓莹 彭亮 +3 位作者 谢娜娜 吕环环 党洁 马占兵 《宁夏医科大学学报》 2023年第3期258-267,289,共11页
目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因型-组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)数据库,通过差异表达和加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选分析胰腺导管腺癌(p... 目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因型-组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)数据库,通过差异表达和加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选分析胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)潜在生物标记物,为其诊断、治疗和改善不良预后提供分子基础。方法 检索TCGA和GTEx数据库中PDAC组织和正常组织的转录组数据,综合应用差异表达分析、GO富集分析、KEGG通路分析、WGCNA分析、蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)和生存分析获得核心基因。结果 通过差异表达分析共鉴定出4 346个差异表达基因(differential expression genes,DEGs),其中上调表达2 284个,下调表达2 062个。通过GO和KEGG富集分析显示,DEGs功能主要与间充质细胞向上皮细胞转化和上皮细胞向间充质细胞转化等密切相关。成功筛选出PDAC中高表达的10个核心风险基因,包括TOP2A、MAD2L1、TPX2、RACGAP1、PRC1、KIF23、NUSAP1、PLK1、SMC4和CHEK1,主要参与细胞周期的调控、DNA复制和有丝分裂过程。结论 TOP2A、MAD2L1、TPX2、RACGAP1、PRC1、KIF23、NUSAP1、PLK1、SMC4和CHEK1是与PDAC组织学分级和预后高度相关的核心风险基因,可能参与其发病过程。 展开更多
关键词 胰腺导管腺癌 癌症基因组图谱数据库 基因型-组织表达数据库 差异表达 加权基因共表达网络 生物信息学
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部