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实时荧光定量PCR标准品的制备及应用 被引量：37
1
作者 罗勇军 刘昕 《重庆医学》 CAS CSCD 2005年第3期414-415,共2页
目的　探讨并建立快速而准确用于实时荧光定量PCR标准品的方法。方法　通过培养细胞,提取总RNA并逆转录为cDNA后做PCR,电泳,胶回收,T A克隆,测序后,大量提取质粒,送公司定量。结果　获得了预期希望的质粒。结论　该方法能大量制备质粒... 目的　探讨并建立快速而准确用于实时荧光定量PCR标准品的方法。方法　通过培养细胞,提取总RNA并逆转录为cDNA后做PCR,电泳,胶回收,T A克隆,测序后,大量提取质粒,送公司定量。结果　获得了预期希望的质粒。结论　该方法能大量制备质粒标准品,在实验中取得较满意的效果。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 标准品 taqman探针
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猪繁殖与呼吸综合征病毒实时PCR检测方法的建立 被引量：26
2
作者 黄娟 姜平 +3 位作者 张常印 唐泰山 李永东 张治涛 《中国病毒学》 CSCD 2005年第5期530-533,共4页
设计合成了一套引物和TaqMan探针,以扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒的核衣壳蛋白基因,通过反应条件的优化,在国内首次建立了快速定量检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的实时PCR方法,并用该法检测患病猪的肺脏等样品。结果表明该方法具有较好的... 设计合成了一套引物和TaqMan探针,以扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒的核衣壳蛋白基因,通过反应条件的优化,在国内首次建立了快速定量检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的实时PCR方法,并用该法检测患病猪的肺脏等样品。结果表明该方法具有较好的特异性和重复性,对PRRSV细胞培养物的检测下限为0.01TCID50,敏感性比常规RT-PCR高100倍;对10份PRRS疑似猪肺脏样品检测5份为阳性,与病毒分离的阳性符合率为100%。该方法具有快速、灵敏、准确、低污染等优点,在PRRSV的早期检测、预防控制、进出口检疫及基础研究中会起到重要作用。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 taqman 实时pcr
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牛结节性皮肤病病毒野毒株TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：31
3
作者 聂福平 孟向阁 +6 位作者 王昱 杨俊 李贤良 王国民 韩雪清 李应国 侯长军 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期403-409,共7页
为鉴别牛结节性皮肤病病毒野毒株(wild type lumpy skin disease virus,WT LSDV),本研究根据GenBank中发表的WT LSDV全基因组序列,设计并合成1对特异性引物和MGB探针,优化反应条件,建立了鉴别检测WT LSDV的TaqMan-MGB荧光定量PCR方法。... 为鉴别牛结节性皮肤病病毒野毒株(wild type lumpy skin disease virus,WT LSDV),本研究根据GenBank中发表的WT LSDV全基因组序列,设计并合成1对特异性引物和MGB探针,优化反应条件,建立了鉴别检测WT LSDV的TaqMan-MGB荧光定量PCR方法。结果显示,该方法仅对WT LSDV核酸有特异性扩增,对LSDV疫苗株等其他病毒核酸无交叉反应;标准曲线在一定浓度范围内呈现良好的线性关系,标准曲线为y=-3.361 x+34.979,R^2>0.999,扩增效率为98.39%,最低检测限为4.6 copies/μL。组内、组间重复性试验的变异系数均小于3%。对63份模拟临床样品的检测结果显示,本研究建立荧光定量PCR方法的阳性检出率为90.57%,OIE推荐的普通PCR方法的阳性检出率为64.15%,两种方法检测临床样品均为WT LSDV核酸阴性。结果表明,建立的WT LSDV TaqMan-MGB荧光定量PCR方法特异、敏感、快速、重复性好,且能快速准确地检测WT LSDV,适用于临床样品的鉴别检测,为该病的鉴别、监测、防控提供了技术支撑。 展开更多
关键词 牛结节性皮肤病病毒野毒株 荧光定量pcr taqman-MGB
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用基于TaqMan探针的Real-time PCR技术定量检测副溶血弧菌 被引量：25
4
作者 蔡潭溪 蒋鲁岩 黄克和 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期638-642,共5页
副溶血弧菌是一种引起食源性疾病的重要病原菌,传统的鉴定方法费时费力且容易出现假阴性,建立一种定量检测副溶血弧菌基因的方法尤为重要。根据GenBank公布的副溶血弧菌的gyrB基因序列设计一对引物和TaqMan探针,建立了基于TaqMan探针的R... 副溶血弧菌是一种引起食源性疾病的重要病原菌,传统的鉴定方法费时费力且容易出现假阴性,建立一种定量检测副溶血弧菌基因的方法尤为重要。根据GenBank公布的副溶血弧菌的gyrB基因序列设计一对引物和TaqMan探针,建立了基于TaqMan探针的RealtimePCR方法。通过对9种细菌(12株菌株)的DNA进行扩增,结果所有4株副溶血弧菌均可产生扩增曲线,其他8株非副溶血弧菌均不产生扩增曲线,证明了引物和探针具有很高的特异性。细菌纯培养物品和人工布菌的检测敏感度分别为1CFUPCR反应体系和10CFUPCR反应体系,相关系数均为0.99(r2=0.99),整个试验可在1h内完成。建立的方法可用于海产品中副溶血弧菌的快速定量检测。 展开更多
关键词 taqman探针 real-time pcr 副溶血弧菌gyrB基因 定量检测
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大鲵虹彩病毒TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：28
5
作者 周勇 曾令兵 +5 位作者 孟彦 周群兰 张辉 高正勇 肖艺 孙建滨 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期772-778,共7页
利用PCR技术扩增出大鲵虹彩病毒(giant salamander iridovirus,GSIV)主要衣壳蛋白(MCP)编码区长度为1 392 bp的片段,克隆到pMD19-T载体上,构建重组质粒pMD19-T-MCP。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pMD19-T-MCP重组质粒,作为标准模... 利用PCR技术扩增出大鲵虹彩病毒(giant salamander iridovirus,GSIV)主要衣壳蛋白(MCP)编码区长度为1 392 bp的片段,克隆到pMD19-T载体上,构建重组质粒pMD19-T-MCP。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pMD19-T-MCP重组质粒,作为标准模板进行TaqMan实时荧光定量PCR扩增,制作标准曲线,建立了大鲵虹彩病毒的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。制作的标准曲线有极好的线性关系,且线性范围宽,相关系数为0.990 19。组内重复试验的CT值标准偏差为0.52%。检测结果显示,该方法对大鲵虹彩病毒的检测有高度的特异性,与锦鲤疱疹病毒、弗氏柠檬酸杆菌、嗜水气单胞菌以及鲤上皮瘤细胞基因组DNA之间均无交叉反应,特异性好,检测总DNA灵敏度为10个病毒核酸分子拷贝数,约1.1×10-3 pg/μL病毒核酸,较之常规PCR的敏感度高出约1 000倍。研究建立的大鲵虹彩病毒TaqMan实时荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强,对大鲵虹彩病毒病的快速诊断与病毒病原定量检测有重要意义。 展开更多
关键词 大鲵 虹彩病毒 主要衣壳蛋白 taqman实时荧光定量pcr
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toxR基因作为荧光定量PCR靶基因设计TaqMan探针快速检测副溶血弧菌 被引量：28
6
作者 覃倚莹 吴晖 +4 位作者 肖性龙 杨晓泉 张经纬 余以刚 李惠芳 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1837-1842,共6页
以toxR基因为靶基因,通过优化反应条件建立了快速检测副溶血弧菌的TaqMan实时荧光PCR方法。特异性试验表明,该方法能选择性检测副溶血弧菌,而与金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单增李斯特杆菌等多种常见的食源性病原菌没有交叉反应;灵敏度... 以toxR基因为靶基因,通过优化反应条件建立了快速检测副溶血弧菌的TaqMan实时荧光PCR方法。特异性试验表明,该方法能选择性检测副溶血弧菌,而与金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单增李斯特杆菌等多种常见的食源性病原菌没有交叉反应;灵敏度试验表明,该方法最少可检测到25个拷贝的toxR基因重组质粒,对纯培养物和模拟食品样品直接检测的灵敏度分别为21 cfu/mL和210 cfu/g;重复性试验表明,同一样品于试验内及试验间的变异系数分别为0.9%和1.3%;所制作的标准曲线在2.5×101～2.5×106拷贝数之间有较好的线性关系,能对副溶血弧菌进行准确的定量分析。结果表明,本研究所建立的副溶血弧菌实时荧光PCR检测方法具有特异性好、灵敏度高、重复性好的特点,能进行定量检测,而且检测时间从核酸抽提到出实验结果仅需要3 h,是快速检测副溶血弧菌的有效手段。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 实时荧光定量pcr toxR基因 taqman探针 检测
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2013年苏州地区肉及其制品掺假情况调查 被引量：25
7
作者 金萍 丁洪流 +2 位作者 李培 范丽丽 傅春玲 《中国食品卫生杂志》 北大核心 2014年第2期168-172,共5页
目的了解苏州地区肉及其制品的掺假情况,通过对肉类种源与标签明示肉源进行比对,鉴别摻假食品,为加强食品标签管理提供依据。方法运用自建的动物源性食品种源判定Taqman实时荧光PCR检测体系对苏州地区的肉及其制品进行种源判定,与标签... 目的了解苏州地区肉及其制品的掺假情况,通过对肉类种源与标签明示肉源进行比对,鉴别摻假食品,为加强食品标签管理提供依据。方法运用自建的动物源性食品种源判定Taqman实时荧光PCR检测体系对苏州地区的肉及其制品进行种源判定,与标签明示肉源进行比对,鉴别摻假食品。结果本次调查共检验涉及32个生产单位的90份样品,总不符合率为25.6%(23/90)。检测的44份牛肉及其制品中有12份与标签不符,8份用猪肉部分替代牛肉,1份以鸭肉部分代替牛肉进行销售;此外有3份不含有牛肉成分,存在猪、鸡、鸭源性肉类之外的肉类成分。共检测羊肉及其制品16份,有2份用鸭肉代替羊肉出售,3份羊肉样品中掺入了部分猪成分,其中1份样品还存在单个样品掺杂两种外源肉类的现象(猪源性和鸭源性)。检测猪肉及其制品19份,其中2份样品含有标签未注明的鸡肉成分。在所检测的11份混合肉类样品中有4份成分与标签不符,主要是以廉价的鸡肉取代/部分取代相对高价的牛肉和猪肉。结论肉制品掺假情况明显,用猪肉、鸭肉部分代替牛肉和羊肉仍是主要的掺假手段,牛肉掺假样品主要是熟制牛肉制品,而火锅食用羊肉卷样品则是羊肉掺假高危品,开展肉制品摻假检测对规范肉制品市场具有积极意义。此外,3份未知种源成分的牛肉样品提示在现有检测基础上还需扩大检测范围,防患于未然。 展开更多
关键词 taqman实时荧光pcr 肉制品 掺假 检测 苏州地区 食品安全
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荧光定量RT-PCR快速检测乙型流感病毒核酸 被引量：22
8
作者 卢亦愚 严菊英 +2 位作者 冯燕 史雯 茅海燕 《浙江预防医学》 2005年第3期1-3,共3页
目的　建立以特异性荧光探针为特点的TaqMan荧光定量RT -PCR方法用于检测乙型流感病毒核酸。方法　根据GenBank登录的流感毒株序列 ,应用生物学软件进行序列比对 ,在乙型流感病毒核蛋白(NP)基因的保守区设计引物和TaqMan探针进行筛选 ,... 目的　建立以特异性荧光探针为特点的TaqMan荧光定量RT -PCR方法用于检测乙型流感病毒核酸。方法　根据GenBank登录的流感毒株序列 ,应用生物学软件进行序列比对 ,在乙型流感病毒核蛋白(NP)基因的保守区设计引物和TaqMan探针进行筛选 ,对荧光定量RT -PCR反应条件进行优化 ,检测该方法的特异性和灵敏度。此外还对疑似乙型流感含漱液标本进行检测。结果　该方法对乙型流感病毒的检测有高度的特异性 ,对甲1 型、甲3型、禽流感病毒H5、SARS病毒及其他呼吸道病毒均无交叉反应 ,检测的灵敏度达 0 0 1TCID50 ,可从疑似流感患者含漱液中直接检测流感病毒核酸 ,从病毒核酸提取至完成检测仅需 3h左右。结论　本研究建立的TaqMan荧光定量RT -PCR是一种快速检测乙型流感病毒特异、敏感的新方法。 展开更多
关键词 荧光定量RT-pcr taqman探针 乙型流感病毒 检测
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大洋臀纹粉蚧和南洋臀纹粉蚧TaqMan实时荧光PCR检测方法 被引量：22
9
作者 徐浪 余道坚 +2 位作者 焦懿 王银竹 陈志粦 《植物检疫》 北大核心 2010年第2期24-28,共5页
臀纹粉蚧属有多个种类是重要的农业害虫,大洋臀纹粉蚧(Planococcus minor(Maskell))和南洋臀纹粉蚧(Planococcus lilacius Cockerell)是我国有重要检疫意义的有害生物。这两种臀纹粉蚧经常从进口泰国和东南亚水果口岸检疫中截获,但形态... 臀纹粉蚧属有多个种类是重要的农业害虫,大洋臀纹粉蚧(Planococcus minor(Maskell))和南洋臀纹粉蚧(Planococcus lilacius Cockerell)是我国有重要检疫意义的有害生物。这两种臀纹粉蚧经常从进口泰国和东南亚水果口岸检疫中截获,但形态学方法很难进行准确鉴定。本研究首次利用mtDNA COI基因设计了两条特异性探针,应用TaqMan实时荧光PCR方法对大洋臀纹粉蚧和南洋臀纹粉蚧进行了快速准确鉴定。 展开更多
关键词 大洋臀纹粉蚧 南洋臀纹粉蚧 taqman实时荧光pcr MGB探针
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土壤中南方根结线虫的实时荧光PCR检测和定量 被引量：22
10
作者 宋志强 王暄 +3 位作者 林宇 迟元凯 鞠玉亮 李红梅 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期255-260,共6页
为了准确测定土壤中南方根结线虫Meloidogyne incognita的群体密度,根据序列特异性扩增区标记设计了南方根结线虫特异性引物和TaqMan探针,分别建立了卵和2龄幼虫的实时荧光PCR定量检测体系,并将该检测体系与显微镜计数法进行了比较。结... 为了准确测定土壤中南方根结线虫Meloidogyne incognita的群体密度,根据序列特异性扩增区标记设计了南方根结线虫特异性引物和TaqMan探针,分别建立了卵和2龄幼虫的实时荧光PCR定量检测体系,并将该检测体系与显微镜计数法进行了比较。结果表明,引物Mi-F/R及探针Mi-probe对南方根结线虫具有高度特异性,建立的标准曲线循环阈值与卵和2龄幼虫数量的对数值之间具有良好的线性关系,相关系数分别为0.9771和0.9853,扩增效率均为90%,检测灵敏度为10-1个卵及10-3条2龄幼虫;对10个田间土壤样本的检测显示,实时荧光PCR定量检测与显微镜计数法测定的南方根结线虫卵和2龄幼虫数量呈显著正相关,且两种方法对2龄幼虫的测定结果无显著差异。 展开更多
关键词 南方根结线虫 2龄幼虫 卵 实时荧光pcr taqman探针
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虾肝肠胞虫TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量：22
11
作者 骆云慧 石坚 +3 位作者 方磊 孟庆珍 张鑫 钱冬 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期847-852,共6页
为建立一种灵敏、特异、快速地检测虾肝肠胞虫的方法,以虾肝肠胞虫的保守序列为靶序列,利用Primer Premier 5.0和Primer Express 2.0软件分别设计引物和TaqMan探针,开展了虾肝肠胞虫的TaqMan荧光定量PCR检测技术研究。将虾肝肠胞虫目标... 为建立一种灵敏、特异、快速地检测虾肝肠胞虫的方法,以虾肝肠胞虫的保守序列为靶序列,利用Primer Premier 5.0和Primer Express 2.0软件分别设计引物和TaqMan探针,开展了虾肝肠胞虫的TaqMan荧光定量PCR检测技术研究。将虾肝肠胞虫目标片段克隆到p MD 19-T载体上构建重组质粒,然后以10倍梯度稀释的重组质粒作为标准品。根据标准品拷贝数与Ct值的关系绘制标准曲线,其斜率为-3.239,相关系数r^2=0.996。重复性试验结果表明,该方法 Ct值的变异系数为0.94%~1.13%,具有良好的稳定性。特异性检测结果显示,该方法对白斑综合征病毒、传染性皮下及造血组织坏死病毒、高致病性副溶血弧菌、微孢子虫感染的对虾肌肉组织等的检测结果均为阴性,表明无交叉反应,具有良好特异性。应用建立的方法对宁波和嘉兴地区15批凡纳滨对虾样品进行检测,发现有6批感染虾肝肠胞虫。利用标准曲线对感染虾肝肠胞虫的虾不同组织进行了定量分析。本研究建立的虾肝肠胞虫TaqMan荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强,对虾肝肠胞虫病的快速诊断与病原定量检测有重要意义,可广泛应用于实验室和现场快速检测。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 虾肝肠胞虫 taqman 荧光定量pcr
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塞尼卡谷病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：22
12
作者 樊晓旭 赵永刚 +3 位作者 迟田英 哈登楚日亚 吴晓东 王志亮 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期959-962,共4页
为建立一种快速、灵敏的塞尼卡谷病毒(SVV)检测方法,本研究针对病毒基因保守区域设计了一对引物和探针,并优化反应条件,建立了检测SVV的TaqMan荧光定量PCR方法。结果表明,以重组质粒为标准品建立的标准曲线在2.8×107拷贝/μL^2.8&#... 为建立一种快速、灵敏的塞尼卡谷病毒(SVV)检测方法,本研究针对病毒基因保守区域设计了一对引物和探针,并优化反应条件,建立了检测SVV的TaqMan荧光定量PCR方法。结果表明,以重组质粒为标准品建立的标准曲线在2.8×107拷贝/μL^2.8×10~1拷贝/μL范围内具有良好的线性关系;该方法与口蹄疫、猪繁殖与呼吸综合征、猪瘟、猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎病毒均无交叉反应;检测灵敏度可达2.8拷贝/μL,灵敏度高于普通PCR;批内和批间的变异系数为1.73%~4.00%,具有良好的稳定性。本研究建立的TaqMan荧光定量PCR方法可以用于SVV的检测,还可以作为诊断技术储备,应对我国未来可能出现流行的猪原发性疱疹病。 展开更多
关键词 塞尼卡谷病毒 荧光定量pcr taqman探针
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Taq Man荧光定量RT-PCR快速检测甲3型流感病毒 被引量：20
13
作者 严菊英 卢亦愚 +2 位作者 冯燕 史雯 茅海燕 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第2期169-172,共4页
目的建立一种特异、灵敏、快速的荧光定量RTPCR方法用于检测甲3型流感病毒核酸。方法根据GenBank登录的流感毒株序列,应用生物学软件进行序列比对,在甲3型流感病毒血凝素(HA)基因的保守区设计引物和TaqMan探针、并进行筛选。对荧光RT-PC... 目的建立一种特异、灵敏、快速的荧光定量RTPCR方法用于检测甲3型流感病毒核酸。方法根据GenBank登录的流感毒株序列,应用生物学软件进行序列比对,在甲3型流感病毒血凝素(HA)基因的保守区设计引物和TaqMan探针、并进行筛选。对荧光RT-PCR反应条件进行优化,检测该方法的特异性和灵敏度。并对疑似流感含漱液标本进行检测。结果该方法对甲3型流感病毒的检测有高度的特异性,对甲1型、乙型、禽流感病毒H5、SARS病毒及其他呼吸道病毒均无交叉反应,检测的灵敏度达0.01TCID50,可从疑似流感患者含漱液中直接检测流感病毒核酸,从病毒核酸提取至完成检测仅需3h左右。结论本研究建立的TaqMan荧光定量RTPCR是一种快速检测甲3型流感病毒特异、敏感的新方法。 展开更多
关键词 荧光定量RT-pcr taqman探针 甲3型流感病毒 临床标本 检测
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非洲猪瘟病毒TaqMan探针法荧光定量PCR检测方法建立 被引量：19
14
作者 任名 牛婷婷 +3 位作者 于婉琪 孙海伟 邬静 陈鸿军 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第3期42-48,共7页
为建立一种快速、准确的非洲猪瘟病毒(ASFV)分子检测方法,以2018年8月分离的SY18毒株P72基因序列(GenBank登录号:MH713612.1)为参考毒株,人工合成质粒标准品,命名为pcDNA3-P72,基于该毒株P72基因序列,在1627~1876 bp处设计一对特异性引... 为建立一种快速、准确的非洲猪瘟病毒(ASFV)分子检测方法,以2018年8月分离的SY18毒株P72基因序列(GenBank登录号:MH713612.1)为参考毒株,人工合成质粒标准品,命名为pcDNA3-P72,基于该毒株P72基因序列,在1627~1876 bp处设计一对特异性引物和TaqMan探针,优化反应体系及条件,本研究成功建立了基于P72基因的TaqMan探针qPCR方法,并与OIE的特异性引物和TaqMan探针进行灵敏度、稳定性和特异性比较.结果显示:本研究建立的qPCR检测方法,标准曲线线性关系良好,R^2值可达到0.9932,灵敏性最低能检测到10 copies/μL,与OIE引物扩增灵敏度相当,比普通PCR方法高100倍.该方法重复性良好,批内和批间变异系数均小于1%.这一方法为我国非洲猪瘟疫情的快速确诊提供了必要的分子诊断工具. 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 taqman 荧光定量pcr 分子诊断
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应用Taq Man荧光PCR定性定量检测炭疽芽孢杆菌 被引量：18
15
作者 李伟 俞东征 +2 位作者 海荣 魏建春 马凤琴 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第4期312-316,共5页
目的　发展一种快速、敏感、特异的检测炭疽芽孢杆菌的方法。方法　应用基于TaqMan荧光探针的实时(real time)PCR技术,针对致病炭疽毒株的两个质粒pXO1、pXO2上的pagA ,cap基因和染色体上的ropB基因设计引物和探针定性、定量检测炭疽芽... 目的　发展一种快速、敏感、特异的检测炭疽芽孢杆菌的方法。方法　应用基于TaqMan荧光探针的实时(real time)PCR技术,针对致病炭疽毒株的两个质粒pXO1、pXO2上的pagA ,cap基因和染色体上的ropB基因设计引物和探针定性、定量检测炭疽芽孢杆菌。构造并应用上述探针的外标对照及pagA的内标对照,采用多重荧光定量PCR技术建立荧光定量方法并发现假阴性;采用UDG抗污染和ROX矫正背景噪音,提高检验能力;用该方法检测炭疽芽孢杆菌疫苗株感染的动物脾脏标本,盲法评价该方法在实际工作的应用。结论　该方法能特异、灵敏、高效地检测炭疽芽孢杆菌,该方法的推广和应用对有效防范炭疽生物恐怖袭击、提高突发事件应对能力、快速诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 荧光定量pcr taqman 定量分析
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TaqMan MGB探针实时聚合酶链反应检测登革病毒 被引量：18
16
作者 柯昌文 郑夔 +3 位作者 张欣 周惠琼 段金花 林立丰 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第8期716-720,共5页
目的建立一种敏感、特异、重复性好的登革病毒(Dengue Virus, DV)鉴定方法.方法根据DV 3'端非编码区基因保守序列,设计一套特异性引物和TaqMan MGB探针.利用1998～2004年收集的26份登革热病人临床血清标本,15例乙脑病人血清,DV 4个... 目的建立一种敏感、特异、重复性好的登革病毒(Dengue Virus, DV)鉴定方法.方法根据DV 3'端非编码区基因保守序列,设计一套特异性引物和TaqMan MGB探针.利用1998～2004年收集的26份登革热病人临床血清标本,15例乙脑病人血清,DV 4个血清型标准毒株及23株1978～1997年DV 地方流行株和相关西尼罗病毒、日本脑炎病毒、麻疹病毒、基孔肯亚病毒等毒株,同时用克隆了1型DV 基因组3'端非编码区序列片段的质粒DNA作为阳性对照,检测所建立方法的特异性、敏感性.结果所建立方法的最低检测限约为每反应5个基因拷贝.用该方法检测4个血清型DV 标准毒株、23株DV 地方流行株和26例分离到DV 的阳性血清标本,检出率为100 %;用该方法检测15例乙脑病人血清、10例麻疹病人血清和西尼罗病毒、日本脑炎病毒、麻疹病毒、基孔肯亚病毒,结果均为阴性.结论新建的TaqMan MGB探针检测DV 方法是实验室早期诊断登革热较理想的方法. 展开更多
关键词 登革病毒 taqman MGB探针 实时聚合酶链反应
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猪伪狂犬病毒Taqman-MGB荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量：18
17
作者 郑敏 毛凝 +2 位作者 黄梅清 陈仕龙 陈少莺 《中国农学通报》 CSCD 2013年第17期37-41,共5页
建立可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法。根据猪伪狂犬病病毒gE基因序列,设计一对特异引物和探针,通过优化反应条件,建立了可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法,... 建立可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法。根据猪伪狂犬病病毒gE基因序列,设计一对特异引物和探针,通过优化反应条件,建立了可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法,同时验证该方法的特异性、敏感性、重复性,并对30份疑似病料进行临床检测。本研究所建立的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法灵敏度可达2.23×10拷贝/μL,比常规PCR检测方法高100倍;与猪圆环病毒2型(PCV2)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖和呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)均无交叉反应,具有高特异性;对30份疑似病料的TaqMan荧光定量PCR和普通PCR检测阳性率分别为40%和33%,两者符合率90%。该方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可同时检测大量样品,可适合于PRV的临床诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒(PRV) taqman-MGB 荧光定量pcr
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牛传染性鼻气管炎病毒TaqMan-MGB荧光定量PCR方法的建立 被引量：18
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作者 乔波 陈楠楠 +2 位作者 赵静虎 王华欣 朱战波 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期282-285,共4页
为建立牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)的TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据IBRVgB基因保守区域设计特异性引物和MGB探针,并采用矩阵法优化了PCR反应条件。结果显示,标准曲线相关系数(R2)为0.998,103拷贝/μL^108拷贝/μL内具有较好的... 为建立牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)的TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据IBRVgB基因保守区域设计特异性引物和MGB探针,并采用矩阵法优化了PCR反应条件。结果显示,标准曲线相关系数(R2)为0.998,103拷贝/μL^108拷贝/μL内具有较好的线性关系。对牛呼吸道合胞体、牛病毒性腹泻粘膜病1型、牛副流感病毒3型的cDNA进行检测,结果均为阴性,特异性良好。该方法对IBRV检测的灵敏度可达到1.49×101拷贝/μL,是常规PCR灵敏度的100倍,重复性试验表明该方法的组内和组间变异系数均小于1.5%。应用建立的方法与普通PCR方法分别对17份疑似临床呼吸道症状牛鼻黏液拭子样品进行检测,该方法检测的阳性率比传统PCR法检测的阳性率提高了约12%。研究表明建立的IBRV TaqMan-MGB荧光定量PCR方法灵敏、快速、特异性强、重复性好,适用于临床疑似样品的快速定量检测。 展开更多
关键词 taqman-MGB探针 荧光定量pcr牛传染性鼻气管炎
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鲤疱疹病毒Ⅱ型TaqMan real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量：18
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作者 周勇 曾令兵 +2 位作者 张辉 范玉顶 徐进 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期607-613,共7页
针对鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)DNA解旋酶基因编码区序列设计特异性引物,利用PCR技术扩增出长度为1 446 bp的基因编码区片段,克隆到pMD19T载体上,构建重组质粒。经PCR鉴定与测序分析确认正确后,以10倍梯度稀释重组... 针对鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)DNA解旋酶基因编码区序列设计特异性引物,利用PCR技术扩增出长度为1 446 bp的基因编码区片段,克隆到pMD19T载体上,构建重组质粒。经PCR鉴定与测序分析确认正确后,以10倍梯度稀释重组质粒,作为标准模板进行TaqMan real-time PCR扩增,制作标准曲线,建立了鲤疱疹病毒Ⅱ型的荧光定量PCR检测方法。检测结果显示,标准曲线的相关系数(R2)达到0.999 1,斜率为-3.412;对初始模板定量检测的范围为1×101～1×107copies/μL;特异性试验结果表明,该方法可特异性地检测出鲤疱疹病毒Ⅱ型,而对大鲵虹彩病毒(GSIV)、锦鲤疱疹病毒(KHV)以及空白对照无检测信号。取江苏射阳和宝应两地疑似患病鲫组织核酸作为模板进行荧光定量PCR,结果表明反应体系中的病毒量分别为6.89×104copies/μL和3.02×102copies/μL。本研究建立的鲤疱疹病毒Ⅱ型TaqMan实时荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强,对因鲤疱疹病毒Ⅱ感染引起的养殖鲫造血器官坏死症的诊断与病毒病原定量检测有重要意义。 展开更多
关键词 鲫 造血器官坏死症 鲤疱疹病毒Ⅱ型 taqman real-time pcr 检测方法
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实时荧光定量TaqMan-PCR检测鸭瘟病毒方法的建立 被引量：8
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作者 索化夷 汤承 +3 位作者 岳华 汤明 景波 韩鹏 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期332-335,340,共5页
根据GenBank中鸭瘟病毒UL6和UL7基因的序列,设计了一对特异性引物及TaqMan探针,扩增位于UL6和UL7基因第891￣991位长度为101bp片段。以DPV标准强株DNA为模板,建立了实时荧光定量PCR检测鸭瘟病毒的方法。该方法只能在鸭瘟病毒DNA样本中... 根据GenBank中鸭瘟病毒UL6和UL7基因的序列,设计了一对特异性引物及TaqMan探针,扩增位于UL6和UL7基因第891￣991位长度为101bp片段。以DPV标准强株DNA为模板,建立了实时荧光定量PCR检测鸭瘟病毒的方法。该方法只能在鸭瘟病毒DNA样本中检出荧光信号,最小检出量为1.57×102copies(23.7fg);线性范围达8个数量级;平行复管检测,组内变异系数为0.84%(n=20),同一组样本(n=6)间隔30d重复检测,结果无显著性差异;对试验感染鸭肝脏和脑组织中鸭瘟病毒的检出率为100%(40/40),对临床病例的检测结果与病毒分离鉴定结果一致;从核酸提取到报告检测结果仅需3h;对鸭正常组织、鸡传染性喉气管炎病毒、鸭病毒性肝炎病毒、鸡源大肠杆菌、鸭源多杀性巴氏杆菌、鸭副伤寒沙门氏菌等非鸭瘟病毒DNA检测,不出现非特异性荧光信号。 展开更多
关键词 鸭瘟病毒 实时荧光定量pcr taqman探针
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