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苜蓿花叶病毒RT-PCR和RT-qPCR检测技术体系的建立与应用
被引量:
7
1
作者
高艳玲
范国权
+6 位作者
程胜群
张威
邱彩玲
申宇
聂先舟
白艳菊
吕文河
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期515-527,共13页
为准确检测侵染马铃薯核心种苗和种薯的苜蓿花叶病毒(alfalfa mosaic virus,AMV),以AMV马铃薯分离株为阳性材料,建立AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的反转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和基于Ev...
为准确检测侵染马铃薯核心种苗和种薯的苜蓿花叶病毒(alfalfa mosaic virus,AMV),以AMV马铃薯分离株为阳性材料,建立AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的反转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和基于EvaGreen及TaqMan探针的反转录实时荧光定量PCR(reverse transcription real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)检测技术,比较3种方法的检测灵敏度,并测定不同马铃薯品种6种组织和桃蚜Myzus persicae、蓟马体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量。结果表明:建立的TaqMan探针RT-qPCR法对RNA 1和RNA 2的检测灵敏度分别为1.45×10^(1) copies/μL和1.46×10^(1) copies/μL,分别是EvaGreen RT-qPCR法和RT-PCR法的10倍;建立的TaqMan探针RT-qPCR法对RNA 3的检测灵敏度与EvaGreen RT-qPCR法相同,为1.15×10^(2) copies/μL,是RT-PCR法的10倍。丽薯15号6种组织中AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量为3.04×10^(6)~1.67×10^(8) copies/μL,以叶片中病毒平均含量最高;中薯21号6种组织中AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量为2.94×10^(2)~4.78×10^(8) copies/μL,未发现明显分布规律。蓟马体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量分别为8.64×10^(4)~4.76×10^(7)、2.13×10^(3)~1.50×10^(5)和8.08×10^(3)~4.96×10^(5) copies/μL,RNA 1的含量高于RNA 2和RNA 3。桃蚜体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量分别为4.71×10^(3)~3.44×10^(4)、2.22×10^(2)~1.32×10^(5)和5.41×10^(1)~8.08×10^(2) copies/μL,RNA 3的含量最低。表明RT-PCR法、TaqMan探针RT-qPCR法和EvaGreen RT-qPCR法均可有效扩增马铃薯6种组织和2种昆虫中的AMV。
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关键词
苜蓿花叶病毒
taqman
探针
rt
-
qpcr
EvaGreen
rt
-
qpcr
rt
-PCR
马铃薯
原文传递
题名
苜蓿花叶病毒RT-PCR和RT-qPCR检测技术体系的建立与应用
被引量:
7
1
作者
高艳玲
范国权
程胜群
张威
邱彩玲
申宇
聂先舟
白艳菊
吕文河
机构
东北农业大学农学院
黑龙江省农业科学院经济作物研究所
加拿大农业和农业食品部弗雷德里克顿研究发展中心
出处
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期515-527,共13页
基金
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(CARS-09-P16)
黑龙江省农业科学院院级课题(2018YYYF022)
黑龙江省农业科学院农业科技创新跨越工程(HNK2019CX19-06)。
文摘
为准确检测侵染马铃薯核心种苗和种薯的苜蓿花叶病毒(alfalfa mosaic virus,AMV),以AMV马铃薯分离株为阳性材料,建立AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的反转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和基于EvaGreen及TaqMan探针的反转录实时荧光定量PCR(reverse transcription real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)检测技术,比较3种方法的检测灵敏度,并测定不同马铃薯品种6种组织和桃蚜Myzus persicae、蓟马体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量。结果表明:建立的TaqMan探针RT-qPCR法对RNA 1和RNA 2的检测灵敏度分别为1.45×10^(1) copies/μL和1.46×10^(1) copies/μL,分别是EvaGreen RT-qPCR法和RT-PCR法的10倍;建立的TaqMan探针RT-qPCR法对RNA 3的检测灵敏度与EvaGreen RT-qPCR法相同,为1.15×10^(2) copies/μL,是RT-PCR法的10倍。丽薯15号6种组织中AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量为3.04×10^(6)~1.67×10^(8) copies/μL,以叶片中病毒平均含量最高;中薯21号6种组织中AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量为2.94×10^(2)~4.78×10^(8) copies/μL,未发现明显分布规律。蓟马体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量分别为8.64×10^(4)~4.76×10^(7)、2.13×10^(3)~1.50×10^(5)和8.08×10^(3)~4.96×10^(5) copies/μL,RNA 1的含量高于RNA 2和RNA 3。桃蚜体内AMV RNA 1、RNA 2和RNA 3的含量分别为4.71×10^(3)~3.44×10^(4)、2.22×10^(2)~1.32×10^(5)和5.41×10^(1)~8.08×10^(2) copies/μL,RNA 3的含量最低。表明RT-PCR法、TaqMan探针RT-qPCR法和EvaGreen RT-qPCR法均可有效扩增马铃薯6种组织和2种昆虫中的AMV。
关键词
苜蓿花叶病毒
taqman
探针
rt
-
qpcr
EvaGreen
rt
-
qpcr
rt
-PCR
马铃薯
Keywords
alfalfa
mosaic
virus
taqman
probe
rt
-
qpcr
EvaGreen
rt
-
qpcr
rt
-PCR
potato
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苜蓿花叶病毒RT-PCR和RT-qPCR检测技术体系的建立与应用
高艳玲
范国权
程胜群
张威
邱彩玲
申宇
聂先舟
白艳菊
吕文河
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
7
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