奶牛TLR2基因遗传变异与乳房炎体细胞评分的相关研究 被引量：20

1

作者 马腾壑 许尚忠 +3 位作者 王兴平 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期332-336,共5页

选用中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共207头奶牛为研究对象,采用PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP(CRS-RFLP)技术对其TLR2基因进行多态性研究,发现TLR2基因第2外显子上T/G,G/A和G/A 3个突变,分别是EcoRⅤ,HaeⅢ和HhaⅠ限制性内切酶... 选用中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共207头奶牛为研究对象,采用PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP(CRS-RFLP)技术对其TLR2基因进行多态性研究,发现TLR2基因第2外显子上T/G,G/A和G/A 3个突变,分别是EcoRⅤ,HaeⅢ和HhaⅠ限制性内切酶的酶切多态位点,其中T/G突变引起蛋白质氨基酸天冬氨酸/谷氨酸的变化。对3个酶切多态位点进行基因型分析,χ2检验表明:中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛在3个酶切多态位点都达到了Hardy-Weinberg平衡。中国西门塔尔牛在3个酶切多态位点PIC为最高。运用SAS9.0软件,采用最小二乘拟合一般线性模型分析了3个酶切多态位点与中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛体细胞评分(SCS)的关系,结果表明:在这3个酶切多态位点中,只有EcoRⅤ酶切多态位点BB基因型个体的SCS显著低于AA和AB基因型个体(P<0.05),说明BB基因型可能为抵御乳房炎的有利基因型。 展开更多

关键词 奶牛 乳房炎 tlr2基因 PCR-RFLP CRS-RFLP体细胞评分

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TLR2基因多态性与奶牛体细胞评分的相关性研究 被引量：14

2

作者 白杰 林嘉鹏 +3 位作者 袁芳 侯敏 李文蓉 刘明军 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期356-362,共7页

旨在分析Toll-样受体2在奶牛隐性乳房炎中的作用。本研究以同一牛场内的中国荷斯坦奶牛和新疆褐牛为研究对象,选取奶牛体细胞数小于20万和大于100万的个体各15头,对TLR2基因进行测序,然后对发现的多态位点进行PCR-RFLP检测,分析这些位... 旨在分析Toll-样受体2在奶牛隐性乳房炎中的作用。本研究以同一牛场内的中国荷斯坦奶牛和新疆褐牛为研究对象,选取奶牛体细胞数小于20万和大于100万的个体各15头,对TLR2基因进行测序,然后对发现的多态位点进行PCR-RFLP检测,分析这些位点与体细胞评分(SCS)的相关性。结果发现了TLR2基因E+189、E+631和E+2260 3个SNP位点,其中E+631和E+2260位点为本试验首次发现。E+189、E+631和E+2260 3个SNP位点在2个品种内均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);3个位点在2个品种间的基因型分布差异都极显著(P<0.01)。分析每个SNP位点与SCS的相关性,显示TLR2E+189位点AA比BB和AB基因型个体的SCS高(P<0.05),AB与BB基因型个体的SCS差异不显著(P>0.05);说明BB基因型个体的乳房炎发病率低。而TLR2E+631的SCS和TLR2E+189位点表现相似,但各个基因型个体间的SCS差异不显著(P>0.05)。E+2260位点AA基因型个体比AB的SCS低(P>0.05)。新疆褐牛的SCS低于荷斯坦牛(P<0.01),说明新疆褐牛乳房炎发病率比荷斯坦牛低。在发现的3个SNP位点中,E+189位点对奶牛的SCS有显著影响(P<0.05),TLR2基因SNP位点在2个品种内的分布差异可能是新疆褐牛比荷斯坦牛乳房炎发病率低的原因之一。 展开更多

关键词 新疆褐牛 tlr2基因 隐性乳房炎 体细胞评分

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TLR2基因多态性及其与奶牛乳房炎的相关分析 被引量：9

3

作者 刘利 黄金明 +5 位作者 王长法 王洪梅 李秋玲 李建斌 张嘉保 仲跻峰 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2009年第9期45-52,共8页

【目的】研究牛Toll样受体蛋白2基因(TLR2)的多态性及其与中国荷斯坦奶牛乳房炎的关系。【方法】以中国荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究对象,利用DNA测序、PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP(CRS-RFLP)技术对TLR2基因多态性及其与中国... 【目的】研究牛Toll样受体蛋白2基因(TLR2)的多态性及其与中国荷斯坦奶牛乳房炎的关系。【方法】以中国荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究对象,利用DNA测序、PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP(CRS-RFLP)技术对TLR2基因多态性及其与中国荷斯坦奶牛乳房炎的关系进行研究。【结果】经DNA测序,在牛TLR2基因的3′非翻译区发现1个新的SNP,即mRNA序列的3 008位发生了T/C突变。TLR2基因编码区(c.651G>A,c.827A>G)和3′非翻译区(c.3008T>C)有3个突变位点,分别是PstI,Hin1Ⅱ和HhaI限制性内切酶的酶切多态位点。3个多态位点在各品种牛之间的基因型频率和等位基因频率差异较大;经χ2适合性检验,除鲁西黄牛的HhaI酶切位点处于非Hardy-Weinberg平衡状态外,3种牛在其他位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。只有Hin1Ⅱ酶切多态位点与牛乳中的体细胞评分(SCS)存在相关性,含有B等位基因的个体SCS显著低于含有A等位基因的个体(P<0.05)。中国荷斯坦奶牛在3个酶切位点形成了H1-H8共8种单倍型,产生了H1H1、H1H2、H1H3、H1H4、H1H7和H1H8等6种单倍型组合,其中H1H1的频率最高(55.89%),H1H4的SCS最低(3.17),且不同单倍型组合与SCS存在相关性。【结论】TLR2基因可用作奶牛抗乳房炎性状的辅助选择标记。 展开更多

关键词 牛 乳房炎 tlr2基因 体细胞评分 单倍型

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中国荷斯坦牛TLR2基因SNPs的快速筛查及等位基因频率的估算 被引量：8

4

作者 杨永江 吴恩芸 +8 位作者 任稳稳 马博妍 高成宏 李宏旭 刘丽霞 曹忻 臧荣鑫 杨具田 张丽 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1321-1327,共7页

为了快速筛查Toll样受体2基因的SNPs,采用DNA池和直接测序法确定了荷斯坦牛TLR2基因的多个SNP突变方式,估算了各SNP的等位基因频率,并利用生物信息学方法预测突变对TLR2 m RNA和蛋白的影响。结果显示,在荷斯坦牛TLR2基因内共发现6个核... 为了快速筛查Toll样受体2基因的SNPs,采用DNA池和直接测序法确定了荷斯坦牛TLR2基因的多个SNP突变方式,估算了各SNP的等位基因频率,并利用生物信息学方法预测突变对TLR2 m RNA和蛋白的影响。结果显示,在荷斯坦牛TLR2基因内共发现6个核苷酸突变位点,分别为T602A、G10900C、G11047C、A11076T、C12077T、T10634G,其中T10634G为错义突变,导致第64位氨基酸由原来的谷氨酸(Gly)替换为天冬氨酸(Asp)。研究结果可为中国荷斯坦牛的抗病育种提供实验依据。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 tlr2基因 DNA池 等位基因频率

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不同鸡种TLR1和TLR2基因SNP检测分析 被引量：3

5

作者 张之宣 营凡 +2 位作者 王慧华 李鹏 赵桂苹 《中国家禽》 北大核心 2014年第5期6-10,共5页

本研究利用DNA直接测序技术对9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和1个引进品种(白来航蛋鸡)鸡Toll样受体1(chTLR1-1、chTLR1-2)、Toll样受体2(chTLR2-1、chTLR2-2)基因的... 本研究利用DNA直接测序技术对9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和1个引进品种(白来航蛋鸡)鸡Toll样受体1(chTLR1-1、chTLR1-2)、Toll样受体2(chTLR2-1、chTLR2-2)基因的全部外显子、部分内含子及5′调控区的序列进行单核苷酸多态性(SNPs)检测。结果共发现了27个SNP位点,96%的SNPs位于编码区,其中33%的SNPs为错义突变。chTLR2-1基因在所有品种中均未发现SNP位点,chTLR1-1、chTLR1-2和chTLR2-2基因在9个地方品种中突变位点较为丰富,且不同品种间SNP数量差别较大,但在白来航蛋鸡中均未发现SNPs位点。本试验为进一步开展地方鸡种chTLR1和chTLR2基因多态性与抗病研究提供了理论依据。 展开更多

关键词 鸡 tlr1基因 tlr2基因 SNP

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TLR2和TLR4基因在独龙牛不同组织器官中的表达分布

6

作者 亐开兴 黄梅芬 +3 位作者 和占星 王蕾 胡柠檬 胡映开 《特种经济动植物》 2023年第12期4-9,共6页

以4头独龙牛公牛为研究对象,采用qPCR技术检测,以GAPDH基因为内参,建立TLR2、TLR4基因qPCR标准曲线,测定独龙牛各组织器官的TLR2、TLR4基因及基因相对表达量。结果表明,TLR2基因在独龙牛的心、肺、背部脂肪表达较高,TLR4在独龙牛心、背... 以4头独龙牛公牛为研究对象,采用qPCR技术检测,以GAPDH基因为内参,建立TLR2、TLR4基因qPCR标准曲线,测定独龙牛各组织器官的TLR2、TLR4基因及基因相对表达量。结果表明,TLR2基因在独龙牛的心、肺、背部脂肪表达较高,TLR4在独龙牛心、背部脂肪表达较高,而在免疫器官和胃肠道中的表达量相对较低,可能与独龙牛的健康和营养水平有关,动物健康则TLRs低水平表达。 展开更多

关键词 独龙牛 tlr2基因 tlr4基因 基因表达

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甘肃高山细毛羊TLR2基因遗传多态性及其与乳房炎相关性 被引量：4

7

作者 张欣 张小丽 +4 位作者 马小军 李发弟 张晨 陈富强 宋晓育 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期1357-1361,共5页

以286只甘肃高山细毛羊为研究对象,利用PCR-SSCP方法结合测序的方法进行TLR2基因多态位点检测,并通过构建一般线性模型分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性,以期为甘肃高山细毛羊乳房炎抗性选育提供参考。结果显示,试验群体发现2种... 以286只甘肃高山细毛羊为研究对象,利用PCR-SSCP方法结合测序的方法进行TLR2基因多态位点检测,并通过构建一般线性模型分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性,以期为甘肃高山细毛羊乳房炎抗性选育提供参考。结果显示,试验群体发现2种等位基因控制的3种基因型(AA、AB、BB),其中B等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.71,而A等位基因频率则为0.29。经χ2适合性检验,突变达到Hardy-weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果与Gen Bank中绵羊TLR2基因序列比对显示,扩增片段分有5处核苷酸多态位点,并导致了3处发生氨基酸改变。AA型个体的SCS均值显著低于AB、BB型(P<0.05),A等位基因基因型可作为乳房炎抗性的优良基因。因此,可将TLR2基因作为甘肃高山细毛羊乳房炎抗感性候选基因应用于乳房炎抗性筛选。 展开更多

关键词 甘肃高山细毛羊 tlr2基因 乳房炎 PCR-SSCP 体细胞评分

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巴马香猪TLR2基因cDNA的克隆及生物信息学分析 被引量：4

8

作者 徐汉进 雍艳红 +1 位作者 安立龙 巨向红 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期949-953,共5页

利用NCBI公布的TLR2基因序列设计引物,RT-PCR克隆巴马香猪(Sus barbatus)TLR2基因。核酸序列分析表明,巴马香猪TLR2基因开放阅读框长2358bp,编码785个氨基酸,该蛋白等电点为7.52,相对分子质量为89480;与普通猪比对发现,巴马香猪TLR2基因... 利用NCBI公布的TLR2基因序列设计引物,RT-PCR克隆巴马香猪(Sus barbatus)TLR2基因。核酸序列分析表明,巴马香猪TLR2基因开放阅读框长2358bp,编码785个氨基酸,该蛋白等电点为7.52,相对分子质量为89480;与普通猪比对发现,巴马香猪TLR2基因有15个碱基发生突变;与小鼠、狗、鸡、牛、羊和人的同源性分别为73.4%,82.4%,59.5%,85.3%,84.6%,82.4%。TLR2膜外区蛋白为背侧多个α螺旋和内侧多个β折叠平行交替排列构成一个弯曲状螺旋结构;N末端存在信号肽,且可能在21～22位氨基酸处存在裂解位点;胞外区有4个明显的LRR,分别位于第76～99、360～385、413～432和457～476位氨基酸区;膜外区含6个N连接的糖基化位点。 展开更多

关键词 巴马香猪 tlr2基因 生物信息学分析

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中国荷斯坦牛TLR2基因遗传多态性的研究 被引量：3

9

作者 张翠霞 王洪梅 +4 位作者 李建斌 王长法 赖松家 李秋玲 仲跻峰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第5期35-39,共5页

以297头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以TLR2(Toll like receptor 2)基因为目的基因,扩增目的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP和CRS-RFLP技术方法来检测TLR2基因第2外显子的遗传多态性。结果发现:exon 2存在10098(T/G),10111(G/A)和11541(C/... 以297头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以TLR2(Toll like receptor 2)基因为目的基因,扩增目的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP和CRS-RFLP技术方法来检测TLR2基因第2外显子的遗传多态性。结果发现:exon 2存在10098(T/G),10111(G/A)和11541(C/T)3个单核苷酸突变,其中11541位点的T/C突变为首次报道。分别选择EcoRV、HaeⅢ、DraⅠ等3种限制性内切酶检测其多态性。10098位点有3种基因型(AA,AB,BB),A、B等位基因频率分别为0.784 5,0.215 5;10111位点有2种基因型(CC,CD),C、D等位基因频率分别为0.9858,0.0142;11541位点有3种基因型(EE,EF,FF),E、F等位基因频率分别为0.0993,0.9007。10098位点T-G碱基突变导致天冬氨酸突变为谷氨酸(Asp63Glu),10111位点G-A碱基突变引起甘氨酸突变为丝氨酸(Gly68Ser)。TLR2基因外显子2上的3个位点基因型在研究群体中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。10098,10111,11541 3个位点的多态信息含量、杂合度、有效等位基因数分别为0.2809/0.3381/1.5108,0.0279/0.0279/1.0287和0.1434/0.1789/1.2179。10098位点达到中度多态,其余2个位点处于低度多态。TLR2基因可作为候选遗传标记,进行深入研究。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 tlr2基因 基因多态性 PCR-RFLP CRS-RFLP

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大通牦牛TLR2基因序列特征分析 被引量：3

10

作者 彭帅 陈朗 +3 位作者 郑天宇 陆会宁 张丽 刘丽霞 《中国奶牛》 2019年第8期20-24,共5页

本研究以大通牦牛为研究对象,采用DNA混合池扩增后直接测序的方法获得TLR2基因CDS区,利用生物信息学方法预测及分析了大通牦牛TLR2蛋白的理化性质和结构功能等,并与南阳黄牛、荷斯坦牛进行对比分析。结果显示,大通牦牛TLR2蛋白是由784... 本研究以大通牦牛为研究对象,采用DNA混合池扩增后直接测序的方法获得TLR2基因CDS区,利用生物信息学方法预测及分析了大通牦牛TLR2蛋白的理化性质和结构功能等,并与南阳黄牛、荷斯坦牛进行对比分析。结果显示,大通牦牛TLR2蛋白是由784个氨基酸组成的不稳定亲水性功能蛋白,且膜外区富集亮氨酸重复序列,可辅助识别病原微生物。说明TLR2在大通牦牛免疫应答及信号传导中发挥着重要作用,且可能在大通牦牛的抗病性及生产性能上起作用。 展开更多

关键词 大通牦牛 tlr2基因 生物信息学 序列分析

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TLR2基因多态性与中国汉族儿童结核病易感性的关联研究 被引量：3

11

作者 徐放 谢兰品 +7 位作者 董雅坤 綦辉 孙琳 李洁琼 肖婧 焦伟伟 申晨 申阿东 《中国循证儿科杂志》 CSCD 2014年第6期441-446,共6页

目的探讨TLR2基因5个SNP位点多态性与中国汉族儿童结核病(TB)易感性的关联。方法以2005年2月至2010年10月在北京儿童医院临床诊断和确诊的TB且排除其他肺部感染的病例作为TB组,并根据感染部位和严重程度分别分为肺TB亚组、肺外TB亚组和... 目的探讨TLR2基因5个SNP位点多态性与中国汉族儿童结核病(TB)易感性的关联。方法以2005年2月至2010年10月在北京儿童医院临床诊断和确诊的TB且排除其他肺部感染的病例作为TB组,并根据感染部位和严重程度分别分为肺TB亚组、肺外TB亚组和重症TB亚组、非重症TB亚组;以健康查体且除外TB的儿童作为对照组。应用高通量Mass ARRAY技术对于TLR2基因的5个SNP位点:rs3804099(等位基因C/T)、rs1898830(等位基因A/G)、rs7656411(等位基因G/T)、rs11935252(等位基因A/G)、rs7696323(等位基因C/T)行基因分型,比较5个SNP位点各基因型和等位基因频率在TB组和对照组的差异,同时采用显性遗传和隐性遗传模式分析各TB亚组与对照组基因型的差异。结果 TB组345例,平均年龄(5.6±4.7)岁,男219例;肺TB亚组151例(43.8%),肺外TB亚组194例;重症TB亚组155例(44.9%),非重症TB亚组190例。对照组385例,年龄(6.1±3.8)岁,男226例。Hardy-Weinberg检验提示TLR2基因的5个SNP位点在TB组和对照组的基因型分布均符合遗传平衡(P=0.154~0.992)。调整了年龄和性别因素后,rs3804099位点TC、CC型和C等位基因频率TB组和对照组比较,OR=0.929~1.071;rs1898830位点GA、GG型和G等位基因频率TB组和对照组比较,OR=1.100~1.411;rs7656411位点GT、TT型和T等位基因频率TB组和对照组比较,OR=0.812~1.110;rs11935252位点GA、GG型和A等位基因频率TB组和对照组比较,OR=0.497~1.189;rs7656323位点CT、CC型和C等位基因频率TB组和对照组比较,OR=0.888~1.034;,差异均无统计学意义(P均>0.05)。5个SNP按照显性和隐性遗传模式分析,各基因型TB组和对照组间差异均无统计学意义(P均>0.05)。2TLR2基因的5个SNP位点在显性或隐性遗传模式下,基因型频率在肺TB亚组、肺外TB亚组和对照组比较,OR=0.737~1.326;重症TB亚组、非重症TB亚组和对照组比较,OR=0.675~1.248;差异均无统计学意义(P均>0.05)。3TLR2基因5个SNP位点在各染色体之� 展开更多

关键词 结核病 儿童 tlr2基因

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中国荷斯坦牛TLR_2基因SNPs快速筛查及...等位基因频率估算 被引量：2

12

作者 杨永江 吴恩芸 +5 位作者 任稳稳 马博妍 李宏旭 高成宏 刘丽霞 张丽 《中国奶牛》 2018年第5期20-23,共4页

为了探讨Toll样受体2基因与荷斯坦牛乳腺炎抗性的相关性,本研究选取中国荷斯坦牛为试验对象构建DNA池,设计4对特异性引物,并结合克隆测序法对中国荷斯坦牛TLR_2基因编码区进行多态性筛查。结果显示,荷斯坦牛TLR_2基因编码区有6个核苷酸... 为了探讨Toll样受体2基因与荷斯坦牛乳腺炎抗性的相关性,本研究选取中国荷斯坦牛为试验对象构建DNA池,设计4对特异性引物,并结合克隆测序法对中国荷斯坦牛TLR_2基因编码区进行多态性筛查。结果显示,荷斯坦牛TLR_2基因编码区有6个核苷酸突变位点,分别为T602A-Intron2、G10900C-Exon2、G11047C-Exon2、A11076T-Exon2、C12077T-Exon2、T10634G-Exon2,其中T10634G-Exon2为错义突变,其余均为同义突变,SNPs突变前后等位基因频率有明显差异。6个SNPs等位基因频率分别由0.8067、0.7843、0.7959、0.7647、0.6897、0.8413突变为0.1933、0.2157、0.2041、0.2353、0.3103、0.1587。研究结果可为中国荷斯坦牛的分子抗病育种提供理论依据。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 tlr2基因 DNA池 多态性 等位基因频率估算

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海南五指山猪TLR2基因克隆及生物信息学分析 被引量：2

13

作者 张艳 黄丽丽 +2 位作者 刘海隆 林哲敏 谭树义 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第9期37-40,44,286,287,共7页

为了探讨海南五指山猪TLR2基因的分子结构特征及相关遗传变异,为研究TLR2基因遗传变异与免疫疾病的关系打下基础,试验采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明:获得2 649 bp的五指山猪TLR2基因的DNA序列... 为了探讨海南五指山猪TLR2基因的分子结构特征及相关遗传变异,为研究TLR2基因遗传变异与免疫疾病的关系打下基础,试验采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明:获得2 649 bp的五指山猪TLR2基因的DNA序列,其基因编码区全长2 358 bp,编码785个氨基酸;与Gen Bank中发布的普通猪TLR2基因序列相比,共发现9处突变,其中在编码区序列存在2处突变,属于有义突变;与普通猪、马、牛、绵羊、人、黑猩猩、猕猴、犬、小鼠、鸡、斑马鱼的氨基酸序列的一致性分别为99.7%、82.1%、81.4%、80.6%、78.4%、78.4%、77.8%、77.3%、68.2%、50.7%、40.4%;五指山猪TLR2编码的蛋白主要位于质膜,属于分泌性蛋白、亲水性蛋白和跨膜蛋白,有信号肽和5个糖基化修饰位点,存在较多的丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)磷酸化位点;不同物种TLR2基因在进化过程中具有较高的保守性。说明TLR2基因可作为今后研究海南五指山猪免疫疾病的重要指标之一。 展开更多

关键词 海南 五指山猪 tlr2基因 克隆 生物信息学分析 序列分析

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DNA池快速筛查奶牛TLR_2基因多态性及等位基因频率估算 被引量：1

14

作者 杨永江 吴恩芸 +5 位作者 禹保军 刘容秀 马博妍 岳仁宽 刘丽霞 张丽 《现代畜牧兽医》 2018年第5期7-11,共5页

为了探讨Toll样受体2基因多态性,本试验选取中国荷斯坦牛为试验对象构建DNA池,并结合直接测序法对TLR_2基因编码区进行多态性筛查。结果显示,快速筛查到6个核苷酸位点,分别为T^(602)A、G^(10900)C、G^(11047)C、A^(11076)T、C^(12077)T... 为了探讨Toll样受体2基因多态性,本试验选取中国荷斯坦牛为试验对象构建DNA池,并结合直接测序法对TLR_2基因编码区进行多态性筛查。结果显示,快速筛查到6个核苷酸位点,分别为T^(602)A、G^(10900)C、G^(11047)C、A^(11076)T、C^(12077)T、T^(10634)G,其中T^(10634)G为错义突变,氨基酸由原来的谷氨酸(Gly)转变为天冬氨酸(Asp),SNPs突变前后等位基因频率有明显差异。研究结果可为中国荷斯坦牛的分子遗传育种提供理论依据。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 tlr2基因 多态性 DNA池

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务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析 被引量：1

15

作者 姜涛 秦雅晶 +3 位作者 罗皎兰 米小梅 王进千 刘丽霞 《中国奶牛》 2021年第3期14-19,共6页

采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对TLR2基因mRNA和蛋白质结构的影响。结果表明,务川黑牛TLR2基因共有18个SNP位点,其中有9个位点是错义突变... 采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对TLR2基因mRNA和蛋白质结构的影响。结果表明,务川黑牛TLR2基因共有18个SNP位点,其中有9个位点是错义突变,分别导致相应的氨基酸发生改变。生物信息学分析发现,T978A、G1010A和G1688A位点导致mRNA自由能升高,降低了mRNA二级结构稳定性,其余位点均导致自由能降低,增加了mRNA二级结构稳定性。预测结果显示,务川黑牛TLR2基因各SNP位点的蛋白质二级结构和三级结构也相应发生了改变。研究结果可为务川黑牛TLR2基因的深入研究提供基础资料,为务川黑牛抗病分子标记筛选提供理论基础。 展开更多

关键词 务川黑牛 tlr2基因 SNP 生物信息学

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奶牛TLR2基因EcoRⅤ酶切多态性与体细胞评分的关联分析 被引量：1

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作者 马腾壑 许尚忠 +3 位作者 王兴平 高雪 任红艳 陈金宝 《中国草食动物》 2007年第1期5-7,共3页

利用PCR-RFLP技术对中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛3个奶牛品种207头个体的TLR2基因进行多态性分析。结果表明:3个奶牛群体的扩增片段为448bp,PCR产物经限制性内切酶EcoRⅤ酶切后均表现出中度多态,其中中国西门塔尔牛PIC为最高... 利用PCR-RFLP技术对中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛3个奶牛品种207头个体的TLR2基因进行多态性分析。结果表明:3个奶牛群体的扩增片段为448bp,PCR产物经限制性内切酶EcoRⅤ酶切后均表现出中度多态,其中中国西门塔尔牛PIC为最高,且3个奶牛品种在该基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。最小二乘值表明:该酶切多态位点对3个奶牛品种SCS的影响达到了显著水平(P<0.05),且BB基因型个体的SCS显著低于AA和AB基因型个体(P<0.05),说明BB基因型为抗乳房炎的有利基因型。 展开更多

关键词 奶牛 乳房炎 tlr2基因 PCR—RFLP 体细胞评分

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人TLR2基因启动子活性的研究

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作者 李苗 罗恩杰 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期485-486,492,共3页

目的鉴定TLR2启动子结构,探索调控TLR2基因高水平转录的启动片段。方法利用生物信息学软件分析TLR2基因启动子结构,构建TLR2启动子序列系列截短的萤光素酶报告基因重组体,脂质体法转染分化成熟的U937细胞,应用双荧光素酶活性检测系统检... 目的鉴定TLR2启动子结构,探索调控TLR2基因高水平转录的启动片段。方法利用生物信息学软件分析TLR2基因启动子结构,构建TLR2启动子序列系列截短的萤光素酶报告基因重组体,脂质体法转染分化成熟的U937细胞,应用双荧光素酶活性检测系统检测启动子的活性。结果-403^+20 bp和-190^+20 bp具有高转录活性,-140^+20 bp和-88^+20 bp启动子活性最低。结论人TLR2基因-190^-140 bp是主要的转录调控区,是进一步研究DNA结合蛋白的调控靶序列。 展开更多

关键词 tlr2基因 转录 启动子

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奶牛TLR2基因核苷酸突变位点筛选及序列特征分析

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作者 彭帅 郑天宇 +3 位作者 任稳稳 陈朗 张丽 刘丽霞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期5026-5031,共6页

采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区核苷酸突变位点进行筛选,构建TLR2基因系统进化树,通过生物信息学方法预测并分析中国荷斯坦牛TLR2蛋白的理化性质及结构特征。结果表明,中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区共有5... 采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区核苷酸突变位点进行筛选,构建TLR2基因系统进化树,通过生物信息学方法预测并分析中国荷斯坦牛TLR2蛋白的理化性质及结构特征。结果表明,中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区共有5个核苷酸突变位点(T189G,G455A,A631G,C1632T和T1707C),且中国荷斯坦牛与新疆褐牛、野牛高度同源(99.2%)。序列特征分析结果表明,中国荷斯坦牛TLR2蛋白由784个氨基酸组成,并同时含有亮氨酸重复序列(LRRs)和Toll同源结构域(TIR)的不稳定亲水性跨膜功能蛋白质。本研究结果揭示了TLR2基因结构特点和蛋白质理化性质,为该基因作用机理的深入研究和牛的抗病育种提供理论基础。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 tlr2基因 序列特征

原文传递

牛TLR2基因多态性研究进展

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作者 彭帅 付保强 +3 位作者 郑天宇 陈朗 朱乔峰 刘丽霞 《中国牛业科学》 2018年第6期85-87,共3页

TLR2(Toll样受体2)是一种跨膜受体蛋白,可识别大多数病原微生物并激起免疫应答,牛TLR2基因多态性较高,且与多种疾病有关联,如乳腺炎、结核病、子宫内膜炎等。本文综述了牛TLR2基因的结构、功能特点以及调控机理,对研究现状进行总结分析... TLR2(Toll样受体2)是一种跨膜受体蛋白,可识别大多数病原微生物并激起免疫应答,牛TLR2基因多态性较高,且与多种疾病有关联,如乳腺炎、结核病、子宫内膜炎等。本文综述了牛TLR2基因的结构、功能特点以及调控机理,对研究现状进行总结分析,同时对牛TLR2基因的深入发展进行展望,为牛抗病育种提供理论参考。 展开更多

关键词 tlr2基因 结构特点 调控机理 研究现状

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中国美利奴羊TLR2基因多态性及其与布鲁氏菌病的相关性分析

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作者 罗成 王元元 +3 位作者 王会敏 谭君 周光普 高剑峰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第5期1145-1152,共8页

试验旨在研究Toll样受体2(Toll-like receptor,TLR2)基因的多态性及其与中国美利奴羊布鲁氏菌病易感性的相关性。利用生物信息学方法对NCBI上公布的绵羊TLR2基因序列进行比对,选出多态位点丰富的片段进行扩增,运用PCR-SSCP的方法对206... 试验旨在研究Toll样受体2(Toll-like receptor,TLR2)基因的多态性及其与中国美利奴羊布鲁氏菌病易感性的相关性。利用生物信息学方法对NCBI上公布的绵羊TLR2基因序列进行比对,选出多态位点丰富的片段进行扩增,运用PCR-SSCP的方法对206个中国美利奴布鲁氏菌病阴性样本和80个中国美利奴羊布鲁氏菌病阳性样本进行TLR2基因的多态性检测,然后对不同等位基因的PCR产物进行测序,确定该基因的多态性位点,经卡方检验分析每个SNP位点的等位基因频率、基因型频率及其多态性与布鲁氏菌病易感性的相关性,利用生物信息学软件分析RNA二级结构及蛋白质的二级结构。结果表明,在279bp的序列中共检测到3个SNPs,分别为:C1731T、G1737C和G1749T,均未引起对应氨基酸的改变,属于无义突变。这些位点在病例组和对照组之间的等位基因频率及基因型频率均不存在显著差异(P>0.05)。各突变位点均能引起RNA二级结构和最小自由能的改变,而蛋白质的二级结构均未改变。由此得出,中国美利奴羊TLR2基因的3个SNPs位点(C1731T、G1737C和G1749T)与中国美利奴羊布鲁氏菌病易感性无相关性。 展开更多

关键词 中国美利奴羊 tlr2基因 PCR-SSCP 多态性 布鲁氏菌病

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