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运用变性高效液相色谱对肺炎克雷伯菌产ESBL进行基因分型
被引量:
20
1
作者
刘朝晖
王汉平
+3 位作者
陈劲龙
杨银梅
叶惠芬
曾军
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期764-767,共4页
目的通过运用变性高效液相色谱(DHPLC)技术对前期研究已确认产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的肺炎克雷伯菌临床分离株TEM型质粒进行基因分型,试图建立一种方便快捷的用于ESBL分子诊断及其流行病学监测的新方法。方法利用PCR技术从肺炎克雷...
目的通过运用变性高效液相色谱(DHPLC)技术对前期研究已确认产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的肺炎克雷伯菌临床分离株TEM型质粒进行基因分型,试图建立一种方便快捷的用于ESBL分子诊断及其流行病学监测的新方法。方法利用PCR技术从肺炎克雷伯菌临床分离株中扩增出TEM型质粒的编码序列,扩增产物运用DHPLC技术进行分析,分析提示,异常的样本通过测序确定其基因突变的类型,最后通过比对确定其基因型。结果共分析了101例肺炎克雷伯菌临床分离株,全部样本均扩增出TEM型质粒的编码序列,经过DHPLC分析,52例(51.4%)样本表现为单一的洗脱峰,其形态与TEM-1标准菌株的峰型相一致,测序确定它们的碱基序列亦相一致,不存在变异,为TEM-1型;49例(48.6%)样本表现为异常的洗脱峰,它们均为双峰,形态一致,但异源双链峰的高度有差异,测序结果表明它们均存在四种相同的基因突变,在NCBI网站比对后确定为TEM-116;测序结果还提示,部分样本中TEM-1和TEM-116混合存在,其比例的不同表现为DHPLC时异源双链峰高度的差异;文献检索表明,本次确定的TEM-116为一新的基因亚型,为国内首次报道。结论DHPLC具有简便快捷、高通量和自动化的特点,重复性好,不仅可对已知突变作出即时诊断,还可发现新的基因亚型,不失为一种较好的ESBL分子诊断方法及其流行病学监测手段。
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关键词
变性高效液相色谱
肺炎克雷伯菌
超广谱β-内酰胺酶
tem
型
质粒
基因分
型
变性高效液相色谱
肺炎克雷伯菌
ESBL
基因分
型
产超广谱β-内酰胺酶
tem
-1
型
流行病学监测
临床分离株
DHPLC
原文传递
题名
运用变性高效液相色谱对肺炎克雷伯菌产ESBL进行基因分型
被引量:
20
1
作者
刘朝晖
王汉平
陈劲龙
杨银梅
叶惠芬
曾军
机构
广州市第一人民医院
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期764-767,共4页
基金
广东省科技计划项目(项目编号:2002C30404)
文摘
目的通过运用变性高效液相色谱(DHPLC)技术对前期研究已确认产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的肺炎克雷伯菌临床分离株TEM型质粒进行基因分型,试图建立一种方便快捷的用于ESBL分子诊断及其流行病学监测的新方法。方法利用PCR技术从肺炎克雷伯菌临床分离株中扩增出TEM型质粒的编码序列,扩增产物运用DHPLC技术进行分析,分析提示,异常的样本通过测序确定其基因突变的类型,最后通过比对确定其基因型。结果共分析了101例肺炎克雷伯菌临床分离株,全部样本均扩增出TEM型质粒的编码序列,经过DHPLC分析,52例(51.4%)样本表现为单一的洗脱峰,其形态与TEM-1标准菌株的峰型相一致,测序确定它们的碱基序列亦相一致,不存在变异,为TEM-1型;49例(48.6%)样本表现为异常的洗脱峰,它们均为双峰,形态一致,但异源双链峰的高度有差异,测序结果表明它们均存在四种相同的基因突变,在NCBI网站比对后确定为TEM-116;测序结果还提示,部分样本中TEM-1和TEM-116混合存在,其比例的不同表现为DHPLC时异源双链峰高度的差异;文献检索表明,本次确定的TEM-116为一新的基因亚型,为国内首次报道。结论DHPLC具有简便快捷、高通量和自动化的特点,重复性好,不仅可对已知突变作出即时诊断,还可发现新的基因亚型,不失为一种较好的ESBL分子诊断方法及其流行病学监测手段。
关键词
变性高效液相色谱
肺炎克雷伯菌
超广谱β-内酰胺酶
tem
型
质粒
基因分
型
变性高效液相色谱
肺炎克雷伯菌
ESBL
基因分
型
产超广谱β-内酰胺酶
tem
-1
型
流行病学监测
临床分离株
DHPLC
Keywords
Denaturing high-performance liquid chromatography(DHPLC)
Klebsiella pneumoniae
Extended spectrum beta-lactam(ESBL)
tem
-type plasmid
C, ene analysis
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
运用变性高效液相色谱对肺炎克雷伯菌产ESBL进行基因分型
刘朝晖
王汉平
陈劲龙
杨银梅
叶惠芬
曾军
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
20
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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