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番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析 被引量:3
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作者 于丽丽 刘伟伟 +4 位作者 方媛 周莹 王如意 李洋 周波 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期271-279,共9页
以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的c DNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄Lemi R390前体基因及其预测靶... 以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的c DNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄Lemi R390前体基因及其预测靶基因Le TAS3;采用定量PCR技术检测Lemi R390及其预测靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育阶段的表达情况,利用RLM 5′RACE技术验证Lemi R390对靶基因m RNA的剪切作用。结果表明,克隆到两个Lemi R390的前体,分别与MIR390a和MIR390b一致,含有完整的茎环结构。Lemi R390与其靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育时期表达量不同,果实发育前期特别是花后1~2周幼果期表达量高,发育后期均下降为微量表达,并且在幼果期Lemi R390与Le TAS3表达呈负调控关系。Lemi R390能够靶作用于Le TAS3的转录本调控其降解,其剪切位点为Lemi R390序列5′端的第10位碱基。 展开更多
关键词 番茄 Lemi R390 LE tas3 基因表达 MI RNA
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菊花TAS3 tasi-RNA靶基因CmARF4的鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 时春美 朱文静 +4 位作者 田畅 蒋甲福 宋爱萍 陈发棣 陈素梅 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1006-1014,共9页
[目的]本文旨在鉴定菊花TAS3 tasi-RNA的靶基因生长素响应因子CmARF4,并探讨该基因的表达特性。[方法]以菊花品种‘神马’为材料,利用高保真PCR方法克隆CmARF4基因全长,采用5′RLM-RACE技术验证CmARF4基因是否含有TAS3剪切位点,通过qPC... [目的]本文旨在鉴定菊花TAS3 tasi-RNA的靶基因生长素响应因子CmARF4,并探讨该基因的表达特性。[方法]以菊花品种‘神马’为材料,利用高保真PCR方法克隆CmARF4基因全长,采用5′RLM-RACE技术验证CmARF4基因是否含有TAS3剪切位点,通过qPCR分析CmARF4基因在不同组织器官中和生长素处理及盐处理条件下的表达水平。[结果]CmARF4为TAS3 tasi-RNA的靶基因,其剪切位点位于TAS35′端的第10与第11位碱基之间。CmARF4基因包含开放阅读框(ORF)2322 bp,编码773个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为85.7×103,理论pI为6.44,且与刺菜蓟的同源性最高(78.63%)。在营养生长期,芽中CmARF4的表达量最高,茎中次之;在盛花期舌状花中CmARF4的表达量最高,其次是茎。亚细胞定位与转录激活活性分析结果显示:CmARF4蛋白定位在细胞核上,且无转录激活活性。CmARF4响应生长素处理,当萘乙酸(NAA)浓度为5μmol·L^-1时,CmARF4基因的相对表达量在12 h时明显升高;当NAA浓度为15μmol·L^-1时,CmARF4的相对表达量呈上升趋势。200 mmol·L^-1 NaCl处理下,CmARF4的相对表达量在盐胁迫1 h时升至最高,之后逐渐下降。[结论]CmARF4基因为TAS3 tasi-RNA的靶基因,CmARF4的转录水平受生长素及盐处理的诱导。 展开更多
关键词 菊花 tas3 tasi-RNA CmARF4基因 生长素 盐胁迫
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草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析 被引量:4
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作者 李贺 毛健鑫 +2 位作者 戚华彩 张志宏 纪明山 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期2153-2158,共6页
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;... 以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。 展开更多
关键词 草莓 tas3基因 miR390 实时定量RT—PCR
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TAS-3A润滑剂在PVC电缆料及PE色母料中的应用
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作者 侯元春 《塑料》 CAS CSCD 2000年第1期20-21,19,共3页
在分析TAS3A 结构特征的基础上,提出该特征的产品在软质PVC 电缆料和PE色母料中良好的分散润滑光亮作用。
关键词 tas-3A 润滑剂 电缆料 色母料 聚氯乙烯 聚乙烯
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羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 周明 余姣姣 +2 位作者 李彪 欧阳菠 杨建东 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1957-1968,共12页
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3... Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。 展开更多
关键词 羚牛 苦味受体 tas2R3基因 克隆 生物信息学分析
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鲜味受体TAS1R1/TAS1R3对从江香猪肌内前体脂肪细胞自噬及脂质代谢的调控研究
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作者 徐永健 冯贤辀 +3 位作者 蒙利洁 高艺 杨艺 龚婷 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第10期100-105,111,共7页
实验旨在研究鲜味受体(Taste Receptor Family 1 Subunit 1/Taste Receptor Family 1 Subunit 3,TAS1R1/TAS1R3)对从江香猪肌内前体脂肪细胞自噬及脂质代谢的影响,为发掘从江香猪肉质优良性状的形成机制提供思路。实验通过构建TAS1R3 sh... 实验旨在研究鲜味受体(Taste Receptor Family 1 Subunit 1/Taste Receptor Family 1 Subunit 3,TAS1R1/TAS1R3)对从江香猪肌内前体脂肪细胞自噬及脂质代谢的影响,为发掘从江香猪肉质优良性状的形成机制提供思路。实验通过构建TAS1R3 shRNA干扰载体,并转染至从江香猪前体脂肪细胞以干扰TAS1R1/TAS1R3的表达水平;通过添加低浓度(2.5 mmol/L)、中浓度(5 mmol/L)、高浓度(10 mmol/L)L-谷氨酸作用于细胞不同时间以激活鲜味受体TAS1R1/TAS1R3,用qRT-PCR检测自噬相关基因以及脂质代谢相关基因的表达水平。结果表明:构建的干扰载体可有效干扰细胞内TAS1R1/TAS1R3的mRNA表达水平(P<0.01);哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)表达水平下降(P<0.01),自噬关键因子微管相关蛋白1轻链3B (MAP1LC3B)和Beclin 1表达水平上升(P<0.01);脂质代谢相关基因神经肽Y (NPY)、乙酰辅酶A羧化酶α(ACACA)表达水平均下降(P<0.01),脂蛋白脂肪酶(LPL)表达水平上升(P<0.01);10 mmol/L L-谷氨酸处理细胞6 h后,细胞内TAS1R1/TAS1R3的mRNA表达水平升高(P <0.01),mTOR表达水平上调(P<0.05),MAP1LC3B和Beclin1的表达水平下降(P<0.01),NPY、ACACA的表达水平升高(P<0.05),LPL表达水平下降(P<0.01)。本研究表明TAS1R1/TAS1R3调节从江香猪肌内前体脂肪细胞自噬和脂质代谢过程,但这两个过程是否相关仍需后续研究。 展开更多
关键词 从江香猪 tas1R1/tas1R3 肌内脂肪前体细胞 自噬 脂质代谢
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