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自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展
被引量：
8
1
作者
王光华
刘俊杰
Makoto Kimura
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期732-739,共8页
过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋...
过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋白基因g23为目标,综述了近年来T4型噬菌体在海洋、湖泊和稻田中基因多样性的研究进展。研究结果表明T4型噬菌体g23基因分布与其生存环境关系很大,许多g23基因按获取环境不同划分为几个新类群。同时文中也指出了针对环境中T4型噬菌体g23基因研究应该注意的几点问题及未来的研究发展趋势。
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关键词
噬菌体
T
4
型噬菌体
g23基因
病毒生态
稻田
原文传递
纳帕海高原湿地T4类噬菌体遗传多样性分析
被引量：
1
2
作者
袁小恬
徐志伟
+4 位作者
秦堃豪
张琦
魏云林
唐兵
季秀玲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期2621-2627,共7页
噬菌体在微生物中分布较广。为研究T4类噬菌体在纳帕海高原湿地的分布情况,本研究从纳帕海湿地分别采集水样和淤泥土样,采用g23基因为分子探针,利用MZIA1和MZIA6引物对其进行扩增,共获得92条基因序列,并与其他不同生境的g23基因进行比...
噬菌体在微生物中分布较广。为研究T4类噬菌体在纳帕海高原湿地的分布情况,本研究从纳帕海湿地分别采集水样和淤泥土样,采用g23基因为分子探针,利用MZIA1和MZIA6引物对其进行扩增,共获得92条基因序列,并与其他不同生境的g23基因进行比对和遗传多样性研究。结果显示,纳帕海高原湿地的T4类噬菌体与海洋基因序列相距较远,而与淡水湖泊和稻田土壤及平原基因序列相距较近。但也有部分序列独立聚簇,推测其为纳帕海地区的独有基因序列。本研究充分说明纳帕海地区拥有独特而丰富的微生物资源,为研究高原淡水湖泊中噬菌体的生态功能提供了理论依据。
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关键词
高原湿地
遗传多样性
g23基因
T
4
类噬菌体
原文传递
东北湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性
3
作者
李想
孙岩
+2 位作者
刘俊杰
姚钦
王光华
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期364-373,共10页
【目的】揭示我国东北典型湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性,明确湿地环境T4型噬菌体群落分布特征,为噬菌体生态学研究提供数据支撑。【方法】采用简并性引物MZIA1bis和MZIA6对采自东北6个地点不同类型湿地沉积物土壤DNA进行PCR扩...
【目的】揭示我国东北典型湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性,明确湿地环境T4型噬菌体群落分布特征,为噬菌体生态学研究提供数据支撑。【方法】采用简并性引物MZIA1bis和MZIA6对采自东北6个地点不同类型湿地沉积物土壤DNA进行PCR扩增,采用克隆测序方法,解析沉积物中T4型噬菌体g23基因组成,通过UniFrac分析T4型噬菌体群落结构在湿地沉积物中与其他环境中的差异。【结果】在东北湿地沉积物中共得到262条不同的g23基因序列,构建的系统进化树分析表明,我国东北湿地沉积物T4型噬菌体g23基因分布与海洋、湖泊及稻田生态系统中g23基因亲缘关系较近,而与东北旱地黑土g23基因分布较远;以g23基因群集表征的T4型噬菌体群落在不同地点湿地中分异明显。【结论】东北湿地生态系统T4型噬菌体群落结构复杂多样,存在着一些未知的噬菌体类群。
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关键词
T
4
型噬菌体
g23基因
湿地沉积物
系统进化树
Unifrac分析
原文传递
题名
自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展
被引量：
8
1
作者
王光华
刘俊杰
Makoto Kimura
机构
中国科学院黑土区农业生态重点实验室中国科学院东北地理与农业生态研究所
中国科学院研究生院
Graduate School of Bioagricultural Sciences
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期732-739,共8页
基金
国家自然科学基金(41071172)
中国科学院"百人计划"项目~~
文摘
过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋白基因g23为目标,综述了近年来T4型噬菌体在海洋、湖泊和稻田中基因多样性的研究进展。研究结果表明T4型噬菌体g23基因分布与其生存环境关系很大,许多g23基因按获取环境不同划分为几个新类群。同时文中也指出了针对环境中T4型噬菌体g23基因研究应该注意的几点问题及未来的研究发展趋势。
关键词
噬菌体
T
4
型噬菌体
g23基因
病毒生态
稻田
Keywords
phage
T
4
-
type
bacteriophage
g23
gene
virus
ecology
paddy
field
分类号
Q939.48 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
纳帕海高原湿地T4类噬菌体遗传多样性分析
被引量：
1
2
作者
袁小恬
徐志伟
秦堃豪
张琦
魏云林
唐兵
季秀玲
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
武汉大学生命科学学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期2621-2627,共7页
基金
国家自然科学基金(31700324,31860347)
云南省教育厅重点基金(2017ZZX132)
病毒学国家重点实验室开放研究基金(2018KF003)共同资助。
文摘
噬菌体在微生物中分布较广。为研究T4类噬菌体在纳帕海高原湿地的分布情况,本研究从纳帕海湿地分别采集水样和淤泥土样,采用g23基因为分子探针,利用MZIA1和MZIA6引物对其进行扩增,共获得92条基因序列,并与其他不同生境的g23基因进行比对和遗传多样性研究。结果显示,纳帕海高原湿地的T4类噬菌体与海洋基因序列相距较远,而与淡水湖泊和稻田土壤及平原基因序列相距较近。但也有部分序列独立聚簇,推测其为纳帕海地区的独有基因序列。本研究充分说明纳帕海地区拥有独特而丰富的微生物资源,为研究高原淡水湖泊中噬菌体的生态功能提供了理论依据。
关键词
高原湿地
遗传多样性
g23基因
T
4
类噬菌体
Keywords
Plateau
wetland
Genetic
diversity
g23
gene
T
4
-
type
bacteriophage
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
东北湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性
3
作者
李想
孙岩
刘俊杰
姚钦
王光华
机构
中国科学院东北地理与农业生态研究所中国科学院黑土区农业生态重点实验室
中国科学院大学
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期364-373,共10页
基金
国家自然科学基金(41571246)~~
文摘
【目的】揭示我国东北典型湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性,明确湿地环境T4型噬菌体群落分布特征,为噬菌体生态学研究提供数据支撑。【方法】采用简并性引物MZIA1bis和MZIA6对采自东北6个地点不同类型湿地沉积物土壤DNA进行PCR扩增,采用克隆测序方法,解析沉积物中T4型噬菌体g23基因组成,通过UniFrac分析T4型噬菌体群落结构在湿地沉积物中与其他环境中的差异。【结果】在东北湿地沉积物中共得到262条不同的g23基因序列,构建的系统进化树分析表明,我国东北湿地沉积物T4型噬菌体g23基因分布与海洋、湖泊及稻田生态系统中g23基因亲缘关系较近,而与东北旱地黑土g23基因分布较远;以g23基因群集表征的T4型噬菌体群落在不同地点湿地中分异明显。【结论】东北湿地生态系统T4型噬菌体群落结构复杂多样,存在着一些未知的噬菌体类群。
关键词
T
4
型噬菌体
g23基因
湿地沉积物
系统进化树
Unifrac分析
Keywords
T
4
-
type
bacteriophage
g23
gene
wetland
sediment
phylogenetic
tree
Unifrac
analysis
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展
王光华
刘俊杰
Makoto Kimura
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
8
原文传递
2
纳帕海高原湿地T4类噬菌体遗传多样性分析
袁小恬
徐志伟
秦堃豪
张琦
魏云林
唐兵
季秀玲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
原文传递
3
东北湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性
李想
孙岩
刘俊杰
姚钦
王光华
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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