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3D-Cube T2序列联合颅底CT平扫对脑脊液鼻漏的诊断价值 被引量：5
1
作者 甘慧 张松 +2 位作者 姜利伶 葛晓东 邹利光 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期969-973,共5页
目的评价磁共振3D-Cube T2序列、颅底CT平扫及两者联合对脑脊液鼻漏的诊断价值,探讨二者联用对提高脑脊液鼻漏检出率及漏口定位的作用。方法回顾性分析2016年2月至2018年10月本院经手术或临床证实的22例脑脊液鼻漏患者的影像学资料,22... 目的评价磁共振3D-Cube T2序列、颅底CT平扫及两者联合对脑脊液鼻漏的诊断价值,探讨二者联用对提高脑脊液鼻漏检出率及漏口定位的作用。方法回顾性分析2016年2月至2018年10月本院经手术或临床证实的22例脑脊液鼻漏患者的影像学资料,22例均行常规头颅磁共振MRI平扫及矢状面或冠状面3D-Cube T2序列检查,其中13例还进行了颅底CT平扫检查,研究二者结合对脑脊液鼻漏的检出率。结果 22例脑脊液鼻漏患者中,3D-Cube T2序列诊断17例(17/22,检出率77.3%),颅底CT平扫诊断9例(9/13,检出率69.2%)。13例联合3D-Cube T2序列检查及颅底CT平扫的病例中,脑脊液鼻漏共检出12例(12/13,检出率92.3%)。3D-Cube T2序列结合颅底CT平扫共发现21个可疑漏口,分别位于筛窦顶壁及上鼻道10个、额窦7个、蝶窦及鞍旁2个、筛板2个。结论磁共振3D-Cube T2序列可通过后处理多平面重组清晰显示脑脊液鼻漏漏口的准确位置,颅底CT平扫可观察鼻窦或鼻腔局部骨质连续性中断、分离或者脑组织疝入骨缺损处的情况,两者结合能提高脑脊液鼻漏检出率。 展开更多
关键词 磁共振成像 3D-Cube T2序列 体层摄影技术 颅底CT平扫 脑脊液鼻漏
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磁共振3D-Cube T2序列成像对脑脊液鼻漏的诊断价值 被引量：3
2
作者 甘慧 邹利光 +3 位作者 葛晓东 姜利伶 舒通胜 张松 《创伤外科杂志》 2019年第2期85-88,共4页
目的探讨磁共振3D-Cube T2序列成像在脑脊液鼻漏中的临床应用。方法回顾性分析2017年2月—2018年8月陆军军医大学第二附属医院收治的脑脊液鼻漏患者17例,其中10例为颅脑创伤,7例为垂体瘤术后。行MRI常规检查及3D-Cube T2序列成像,研究3D... 目的探讨磁共振3D-Cube T2序列成像在脑脊液鼻漏中的临床应用。方法回顾性分析2017年2月—2018年8月陆军军医大学第二附属医院收治的脑脊液鼻漏患者17例,其中10例为颅脑创伤,7例为垂体瘤术后。行MRI常规检查及3D-Cube T2序列成像,研究3D-Cube T2序列脑脊液鼻漏的表现,总结3D-Cube T2序列成像对脑脊液鼻漏诊断的优势。结果 17例患者发现脑脊液鼻漏14例,表现为鼻腔或鼻窦内与颅内脑脊液信号一致的高信号影,并可见沟通二者相连的线状高信号影。14例鼻漏患者一共发现漏口16个,分别位于右侧前组筛窦及上鼻道7个、额窦6个、蝶窦及鞍旁2个、筛板1个。结论磁共振3D-Cube T2序列为重T2加权水成像,脑脊液在此序列图像上表现为高信号,通过图像后处理能多角度展示脑脊液鼻漏漏口的确切位置。 展开更多
关键词 脑脊液鼻漏 磁共振成像 3D-Cube T2序列
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DWI在肝脏占位性病变应用的现状 被引量：2
3
作者 张虎 秦东京 《国际医学放射学杂志》 2011年第5期445-447,共3页
扩散加权成像(DWI)是利用水分子的扩散运动特性进行成像的技术,使MRI对人体的研究深入到分子水平,反映人体组织的微观几何结构以及细胞内外水分子的运动等变化。现就DWI在肝脏占位性病变诊断和疗效评估中的应用现状及其与MR常规序列的... 扩散加权成像(DWI)是利用水分子的扩散运动特性进行成像的技术,使MRI对人体的研究深入到分子水平,反映人体组织的微观几何结构以及细胞内外水分子的运动等变化。现就DWI在肝脏占位性病变诊断和疗效评估中的应用现状及其与MR常规序列的比较予以综述。 展开更多
关键词 扩散加权成像 肝脏占位性病变 诊断 疗效评估 T2序列
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基于ITS2序列鉴定川贝母及其混伪品基原植物 被引量：34
4
作者 罗焜 马培 +3 位作者 姚辉 宋经元 陈科力 刘义梅 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2012年第1期1153-1158,共6页
本研究对川贝母5种不同基原植物ITS2序列进行PCR扩增和测序;同时扩大研究范围,从GenBank上下载川贝母及其常见混伪品共10个物种13个样本的ITS2序列。用MEGA4.1计算其种间、种内的K-2-P距离,并分析各样本间ITS2序列二级结构的差异,最后利... 本研究对川贝母5种不同基原植物ITS2序列进行PCR扩增和测序;同时扩大研究范围,从GenBank上下载川贝母及其常见混伪品共10个物种13个样本的ITS2序列。用MEGA4.1计算其种间、种内的K-2-P距离,并分析各样本间ITS2序列二级结构的差异,最后利用ITS2序列重构其系统发育树。结果显示川贝母基原植物种内最大K-2-P距离为0.0276,与混伪品的种间最小K-2-P距离为0.0583;川贝母及其混伪品的ITS2二级结构存在明显差异;重构的系统发育树显示川贝母不同基原物种聚为一支,能较好与混伪品区分。研究结果表明ITS2条形码序列能够成功鉴定川贝母及其混伪品的原植物,为川贝母混伪鉴别提供了新工具。 展开更多
关键词 川贝母 ITS2序列 分子鉴定
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象耳豆根结线虫的PCR鉴定和检测方法(英文) 被引量：30
5
作者 龙海 刘昊 徐建华 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期109-115,共7页
象耳豆根结线虫是一种在中国具有潜在经济重要性的农作物病原物。为提供有助于控制象耳豆根结线虫传播扩散的方法,研制了该线虫的快速PCR鉴定和检测法。该方法PCR引物的扩增目标为rDNA-IGS2区域,其设计依据象耳豆根结线虫与南方、爪哇... 象耳豆根结线虫是一种在中国具有潜在经济重要性的农作物病原物。为提供有助于控制象耳豆根结线虫传播扩散的方法,研制了该线虫的快速PCR鉴定和检测法。该方法PCR引物的扩增目标为rDNA-IGS2区域,其设计依据象耳豆根结线虫与南方、爪哇、花生和北方根结线虫在该区域核酸序列的差异。通过对6种近似根结线虫的不同地理群体及自然土壤线虫群体的测试,验证了设计的PCR引物针对象耳豆根结线虫的特异性和可靠性。本方法具有快速灵敏的特点,可用于象耳豆根结线虫单条线虫的直接鉴定以及混合土壤线虫群体中象耳豆根结线虫的检测。 展开更多
关键词 象耳豆根结线虫 IGS2序列 PCR鉴定和检测法
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中国黄芪属药用植物DNA条形码(ITS2)鉴定 被引量：26
6
作者 高婷 姚辉 +2 位作者 马新业 朱英杰 宋经元 《世界科学技术-中医药现代化》 2010年第2期222-227,共6页
中国黄芪属植物种类繁多,具有重要的药用及生物学价值。本文采用了植物DNA条形码候选序列之一的ITS2片段来探讨在黄芪属药用植物中的鉴定能力。结果显示,ITS2基因区通用性强,序列在黄芪属物种间的差异较大,具有明显的Barcoding Gap,能... 中国黄芪属植物种类繁多,具有重要的药用及生物学价值。本文采用了植物DNA条形码候选序列之一的ITS2片段来探讨在黄芪属药用植物中的鉴定能力。结果显示,ITS2基因区通用性强,序列在黄芪属物种间的差异较大,具有明显的Barcoding Gap,能够正确鉴定41个黄芪属植物物种,仅6个物种不能鉴定。此外,ITS2的二级结构也具有一定的系统学及分类学意义。本研究表明ITS2能够作为黄芪属药用植物鉴定的DNA条形码序列,具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 ITS2序列 黄芪属 鉴定 DNA条形码
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中药材DNA条形码技术研究进展 被引量：22
7
作者 郭慧 王谦博 +3 位作者 贾力维 丁常宏 郭盛磊 王振月 《中国药师》 CAS 2016年第3期566-570,共5页
药用植物滥用现象带来的众多有害反应已经引起了国内外广泛的关注。药物安全使用问题亟待解决。DNA条形码是一种强有力的分子鉴定技术,它能弥补传统形态学和化学方法鉴定中药材的不足之处。近年,DNA条形码技术给中药材的鉴定带来了新的... 药用植物滥用现象带来的众多有害反应已经引起了国内外广泛的关注。药物安全使用问题亟待解决。DNA条形码是一种强有力的分子鉴定技术,它能弥补传统形态学和化学方法鉴定中药材的不足之处。近年,DNA条形码技术给中药材的鉴定带来了新的视野也获得了众多突出性成绩。一些热门的DNA条形码候选序列如ITS,ITS2,psb A-trn H,rbc L,mat K已经用于中药材的鉴定。 展开更多
关键词 DNA条形码 中药材 ITS序列 ITS2序列 PSB A-trn H序列
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我国八代按蚊及其近缘种rDNA-ITS2序列差异和分类地位的探讨 被引量：14
8
作者 马雅军 瞿逢伊 +1 位作者 雷心田 曹毓存 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2000年第1期35-39,共5页
对采用自四川、辽宁、山东及韩国的八代按蚊和四川的筠连按蚊,进行核糖体DNA第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)序列差异分析。结果显示:四川、辽宁及对照韩国八代按蚊群体间的ITS2序列同源性达96.7%～99.6%;筠连按蚊与各地(除山东外)八代按蚊... 对采用自四川、辽宁、山东及韩国的八代按蚊和四川的筠连按蚊,进行核糖体DNA第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)序列差异分析。结果显示:四川、辽宁及对照韩国八代按蚊群体间的ITS2序列同源性达96.7%～99.6%;筠连按蚊与各地(除山东外)八代按蚊间序列同源性达96.2%～99.8%,与四川同域的八代按蚊除一个碱基缺失外,rDNA-ITS2序列完全相同,显然属于种内变异水平,筠连按蚊可能是八代按蚊的同物异名:而山东八代按蚊与各地八代按蚊相比则同源性仅70.4%～71.1%,差异明显增大,提示山东的“八代按蚊”为一存疑蚊种,其分类地位尚需要进一步研究确定。 展开更多
关键词 八代按蚊 核糖体DNA 分类地位 ITS2序列 近缘种
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基于ITS2序列的人参及同属易混品西洋参种子的分子鉴定 被引量：19
9
作者 林凤越 曹辉 +1 位作者 任欢欢 姚丽 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2188-2193,共6页
目的基于DNA条形码技术建立人参与西洋参种子的分子鉴别方法。方法采用生药鉴定方法研究其性状、显微特征,并结合DNA条形码技术,基于中药材DNA条形码数据库,通过ITS2序列比对、遗传距离比较和构建临接(NJ)系统发育树,对人参与西洋参的... 目的基于DNA条形码技术建立人参与西洋参种子的分子鉴别方法。方法采用生药鉴定方法研究其性状、显微特征,并结合DNA条形码技术,基于中药材DNA条形码数据库,通过ITS2序列比对、遗传距离比较和构建临接(NJ)系统发育树,对人参与西洋参的种子进行鉴别研究。结果人参与西洋参种子的种内遗传距离分别小于种间遗传距离,系统发育树图中各物种均聚为一支,来自9个产地的42份人参及西洋参的种子均为正品,且容易区分。结论基于ITS2序列DNA条形码技术可以快速、准确、有效地鉴别人参与西洋参种质资源。 展开更多
关键词 中药材种子 人参 西洋参 DNA条形码技术 ITS2序列
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微小按蚊复合体rDNA-ITS2序列差异及遗传多态性研究 被引量：15
10
作者 史慧勤 赵彤言 +2 位作者 朱礼华 王善青 陆宝麟 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2003年第2期83-88,共6页
本研究对我国微小按蚊广西、云南、海南 6个地理株和越南Caonguen株rDNA ITS2PCR扩增片段和序列差异作分析 ,获得基因片段总长为 5 6 1bp～ 5 6 3bp ,发现地理株间ITS2序列差异程度不同 ,分析表明元江株为微小按蚊C型 ;其余 6个地理株为... 本研究对我国微小按蚊广西、云南、海南 6个地理株和越南Caonguen株rDNA ITS2PCR扩增片段和序列差异作分析 ,获得基因片段总长为 5 6 1bp～ 5 6 3bp ,发现地理株间ITS2序列差异程度不同 ,分析表明元江株为微小按蚊C型 ;其余 6个地理株为A型。应用限制性内切酶Sau96Ⅰ对微小按蚊复合体rDNA ITS2PCR扩增片段作酶切分型 ,结果同样显示两型差异 。 展开更多
关键词 微小按蚊 rDNA-ITS2序列 差异 遗传多态性 限制性酶切
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ITS2序列鉴定筋骨草及其近缘种 被引量：16
11
作者 韩建萍 石林春 +3 位作者 陈士林 钱俊 罗焜 陈科力 《世界科学技术-中医药现代化》 2008年第6期86-89,81,共5页
本研究对筋骨草ITS2区段测序,探讨该片段用于中药筋骨草、白苞筋骨草、白毛夏枯草和夏枯草种间分子鉴别和系统学研究中的意义,我们对核基因ITS2区段进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,所得序列用软件MEGA4.0进行相关分析。测得... 本研究对筋骨草ITS2区段测序,探讨该片段用于中药筋骨草、白苞筋骨草、白毛夏枯草和夏枯草种间分子鉴别和系统学研究中的意义,我们对核基因ITS2区段进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,所得序列用软件MEGA4.0进行相关分析。测得筋骨草、白苞筋骨草、夏枯草和白毛夏枯草的ITS2片段长度分别为312bp,304bp,303bp,304bp。四个物种ITS2片段序列的遗传距离(Kimura2)为0.010～0.175,各个筋骨草种内的不同产地该序列无差异。用MP法根据ITS2序列的遗传距离建立系统发生树,聚类结果和形态分类相符。根据ITS2序列特征,能有效区分筋骨草和其他易混中药材。ITS2具有做为鉴定的条形码序列的潜力。应用该序列可以有效鉴定筋骨草及其近缘种。 展开更多
关键词 ITS2序列 筋骨草 序列分析 鉴定
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我国多斑按蚊复合体成员种的分子鉴别研究 被引量：15
12
作者 马雅军 瞿逢伊 +1 位作者 董学书 周红宁 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期321-324,共4页
目的 建立我国多斑按蚊复合体5成员种的分子鉴别方法。 方法 测定并分析各成员种的rDNA-ITS2序列,并设计种特异引物,应用PCR法鉴别。结果 多斑按蚊复合体5成员种的ITS2序列长度和GC含量分别为伪威氏按蚊328 bp、58.54％、多斑按蚊330 bp... 目的 建立我国多斑按蚊复合体5成员种的分子鉴别方法。 方法 测定并分析各成员种的rDNA-ITS2序列,并设计种特异引物,应用PCR法鉴别。结果 多斑按蚊复合体5成员种的ITS2序列长度和GC含量分别为伪威氏按蚊328 bp、58.54％、多斑按蚊330 bp、57.85％、威氏按蚊337 bp、59.05％、达罗毗按蚊334 bp、58.68％和塞沃按蚊338 bp、57.69％,各种内的ITS2序列保守,而种间的差异率范围为9.7％～18.9％。应用5.8S引物和5个种特异引物可以分别扩增出119、186、231、327和406 bp等5条清晰不同的种特异条带,以鉴别各蚊种。 结论 基于ITS2序列差异建立的我国多斑按蚊复合体5成员种的PCR鉴别简便易行、可靠。 展开更多
关键词 多斑按蚊复合体 成员种 分子鉴别 rDNA-ITS2序列
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木香、川木香、土木香、青木香和红木香药材的ITS2条形码分子鉴定 被引量：15
13
作者 马晓冲 姚辉 +3 位作者 邬兰 向丽 陈晓辰 宋经元 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2169-2175,共7页
通过分析木香、川木香、土木香、青木香、红木香药材的ITS2(internal transcribed spacer 2)条形码序列,探讨木香类药材鉴定新方法。对60份样品提取基因组DNA,PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEG... 通过分析木香、川木香、土木香、青木香、红木香药材的ITS2(internal transcribed spacer 2)条形码序列,探讨木香类药材鉴定新方法。对60份样品提取基因组DNA,PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间遗传距离(K2P),构建邻接树(neighbor-joing tree,NJ Tree)。结果表明,无论是菊科的木香、川木香、土木香,还是马兜铃科的青木香和五味子科的红木香,ITS2序列种内变异均小于种间变异,ITS2序列所有单倍型比对后长度为272 bp,变异位点达到162个;遗传距离显示物种种内平均K2P远远小于种间平均K2P;NJ树结果显示木香、川木香、土木香、青木香和红木香药材可明显区分,且能鉴别川木香的2个基原物种。因此,ITS2序列可用于鉴定木香、川木香、土木香、青木香、红木香药材,为临床安全用药提供依据。 展开更多
关键词 DNA条形码 物种鉴定 ITS2序列 菊科 马兜铃科 五味子科
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应用DNA条形码ITS2序列对市售药材黄柏的鉴定研究 被引量：15
14
作者 汤欢 向丽 +2 位作者 赵莎 孙伟 叶萌 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第2期184-190,共7页
目的:应用DNA条形码ITS2序列鉴定市售黄柏药材及其混伪品,保障药材质量及用药安全。方法:对90份药材及其基原植物样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,运用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图进行校对... 目的:应用DNA条形码ITS2序列鉴定市售黄柏药材及其混伪品,保障药材质量及用药安全。方法:对90份药材及其基原植物样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,运用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图进行校对拼接,去除低质量区和引物区,得到ITS2序列,运用MEGA 6.1对序列进行比对分析,基于K2P遗传距离构建系统聚类树。结果:90份实验样品均能提取到DNA,其DNA经PCR扩增、测序,序列拼接剪切后均能得到高质量ITS2序列。川黄柏和关黄柏基原物种黄皮树和黄檗的种内最大K2P遗传距离分别为0.018和0.004,均远小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离(0.051和0.056);NJ树结果显示川黄柏和关黄柏聚为一支,其混伪品各自聚为一支。结论:基于ITS2序列的DNA条形码技术可准确、有效地鉴定市售黄柏药材及其混伪品,为其市场监管及用药安全提供了一种高效的技术方法。 展开更多
关键词 DNA条形码 ITS2序列 黄柏 混伪品
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普通小麦基因组最可能的4个供体的ITS1和ITS2序列及其亲缘关系 被引量：10
15
作者 张文驹 瞿礼嘉 +3 位作者 高巍 顾红雅 陈家宽 陈章良 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1998年第11期994-1000,共7页
对普通小麦（ＴｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍＬ．）基因组（ＡＡＢＢＤＤ）最可能的供体———Ｔ．ｕｒａｒｔｕＴｈｕｍ．（ＡＡ）、Ｔ．ｍｏｎｏｃｏｃｕｍｖａｒ．ｂｏｅｏｔｉｃｕｍ（Ｂｏｉｓ．）ＭＫ（ＡＡ）、Ａｅｇｉｌｏｐ... 对普通小麦（ＴｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍＬ．）基因组（ＡＡＢＢＤＤ）最可能的供体———Ｔ．ｕｒａｒｔｕＴｈｕｍ．（ＡＡ）、Ｔ．ｍｏｎｏｃｏｃｕｍｖａｒ．ｂｏｅｏｔｉｃｕｍ（Ｂｏｉｓ．）ＭＫ（ＡＡ）、ＡｅｇｉｌｏｐｓｓｐｅｌｔｏｉｄｅｓＴａｕｓｃｈ．和Ａｅ．ｔａｕｓｃｈｉＣｏｓ．（ＤＤ）的核糖体ＲＮＡ基因ＩＴＳ区进行了ＰＣＲ扩增和克隆，并测定了ＩＴＳ１和ＩＴＳ２的ＤＮＡ序列，讨论和纠正了前人的结论。四个种中，ＩＴＳ１长２２１～２２３ｂｐ，ＩＴＳ２长２１６～２１７ｂｐ。ＩＴＳ１序列的种间分化距离范围为０．０２９０～０．０６４０，ＩＴＳ２的为０．００９３～０．０５８０。根据ＩＴＳ１、ＩＴＳ２以及ＩＴＳ１＋ＩＴＳ２序列都得出相同的一个最大简约树，所揭示的亲缘关系与这些种的形态学和细胞学特征相一致。在每一个分支树中，Ｔ．ｕｒａｒｔｕ和Ｔ．ｍｏｎｏｃｏｃｕｍｖａｒ．ｂｏｅｏｔｉｃｕｍ构成一个单系类群，Ａｅ．ｓｐｅｌｔｏｉｄｅｓ和Ａｅ．ｔａｕｓｃｈｉ构成另一个单系类群，前一分支的ｂｏｏｔｓｔｒａｐ值高于后一分支。 展开更多
关键词 二倍体 小麦 基因组 ITS1序列 ITS2序列
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基于ITS2序列及二级结构对药用黄芪及混伪品的鉴别研究 被引量：14
16
作者 刘亚令 耿雅萍 +4 位作者 王芳 解潇冬 张鹏飞 梁建萍 刘德旺 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期522-529,共8页
为了有效地进行药用黄芪及其混伪品的分类鉴定,本实验对收集的蒙古黄芪、膜荚黄芪共32份材料进行了ITS2序列的扩增及双向测序,测序结果经CExpress软件拼接,去除两端5.8S和28S序列后,获得完整的ITS2序列;并从GenBank上下载黄芪混伪品蓝... 为了有效地进行药用黄芪及其混伪品的分类鉴定,本实验对收集的蒙古黄芪、膜荚黄芪共32份材料进行了ITS2序列的扩增及双向测序,测序结果经CExpress软件拼接,去除两端5.8S和28S序列后,获得完整的ITS2序列;并从GenBank上下载黄芪混伪品蓝花棘豆、锦鸡儿、红芪、蜀葵的ITS2序列各3条,利用MEGA7计算种内、种间遗传距离,对各序列进行差异性分析;利用Neighbor-joining(NJ)法基于ITS2序列(一级结构)和基于联合ITS2序列及其二级结构构建系统发育树。结果表明:蒙古黄芪与膜荚黄芪平均ITS2序列长度均为216 bp,平均GC含量分别为50.00%、50.46%,两种药用黄芪与蓝花棘豆在ITS2序列的长度和GC含量的相似性最高,与蜀葵存在较大的差异;药用黄芪与蓝花棘豆的种间距离最小,与红芪、锦鸡儿、蜀葵遗传距离较大;基于ITS2序列(一级结构)和基于联合ITS2序列与其二级结构构建的系统发育树表明:两种系统发育树的拓扑关系基本一致,都可以有效地鉴别药用黄芪及其混伪品;此外二级结构信息的加入,也使得ITS2序列在构建系统发育树中末端分支变多,分辨率与支持率上也有所提高,对药用黄芪以及混伪品的亲缘关系得到了进一步的体现。为药用黄芪及其混伪品的分类与准确鉴定提供了一定的科学依据。 展开更多
关键词 黄芪 ITS2序列 二级结构 分子鉴定
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基于ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘混伪品 被引量：14
17
作者 郭力城 胡志刚 +6 位作者 凃媛 张卫东 金慧子 孙伟 贺海波 马孝熙 黄必胜 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第2期307-312,共6页
目的:应用ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘种混伪品,以确保药材质量,保障临床安全用药。方法:通过对金沸草、旋覆花等药材的3个基原物种条叶旋覆花、旋覆花和欧亚旋覆花及其同属近缘物种进行DNA提取、PCR扩增ITS2序列并双向测... 目的:应用ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘种混伪品,以确保药材质量,保障临床安全用药。方法:通过对金沸草、旋覆花等药材的3个基原物种条叶旋覆花、旋覆花和欧亚旋覆花及其同属近缘物种进行DNA提取、PCR扩增ITS2序列并双向测序,用CodonCode Aligner对测序峰图进行拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,并构建NJ系统聚类树以直观反映鉴定结果。结果:各基原物种ITS2序列变异位点稳定,其种内平均K2P距离均远小于各自药材以及同属近缘混伪品的种间平均K2P距离;基于ITS2序列的NJ树可以将金沸草和旋覆花药材与同属其它近缘混伪品明显区分开。结论:ITS2序列可准确鉴别中药材金沸草和旋覆花及其同属近缘混伪品。 展开更多
关键词 金沸草 旋覆花 ITS2序列 鉴定 近缘物种
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我国南黄海海域漂浮铜藻的分子生物学鉴定 被引量：14
18
作者 蔡永超 孙彬 +2 位作者 马家海 何培民 张勤 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2014年第2期102-106,共5页
为探究南黄海海域漂浮马尾藻属(Sargassum)的种类,以2013年5月采自南黄海海域漂浮马尾藻属藻类为研究对象。采用PCR技术扩增出其ITS2序列,并用Clustal X和Mega 4.0软件对其进行序列分析和N-J系统发育树的构建。结果表明,南黄海海域漂浮... 为探究南黄海海域漂浮马尾藻属(Sargassum)的种类,以2013年5月采自南黄海海域漂浮马尾藻属藻类为研究对象。采用PCR技术扩增出其ITS2序列,并用Clustal X和Mega 4.0软件对其进行序列分析和N-J系统发育树的构建。结果表明,南黄海海域漂浮的马尾藻属藻类为铜藻(Sargassum horneri),其ITS2序列大小为700 bp左右。 展开更多
关键词 南黄海海域 马尾藻属 ITS2序列 铜藻
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中药材半夏及其混伪品的DNA条形码鉴定研究 被引量：14
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作者 张雅琴 宋明 +6 位作者 孙伟 向丽 马孝熙 樊佳佳 王俊 张晓存 刘霞 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第8期1725-1729,共5页
目的:采用ITS2序列对中药材半夏及其混伪品进行DNA条形码鉴定研究,为规范中药材半夏的市场流通,保障临床用药安全及疗效提供参考依据。方法:对半夏及其混伪品共59份样品,通过DNA提取及聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列,并采用Mega6.0... 目的:采用ITS2序列对中药材半夏及其混伪品进行DNA条形码鉴定研究,为规范中药材半夏的市场流通,保障临床用药安全及疗效提供参考依据。方法:对半夏及其混伪品共59份样品,通过DNA提取及聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列,并采用Mega6.0软件进行多序列比对,计算种内及种间K2P遗传距离,采用邻接(NJ)法构建NJ系统聚类树。采用相似性搜索法、最小距离法、NJ树法考察ITS2序列的鉴定能力。结果:半夏药材的ITS2序列长度为251 bp,应用相似性搜索法表明ITS2序列能够准确鉴定半夏药材及其混伪品;半夏种内最大K2P距离小于半夏与混伪品间的最小K2P距离;NJ树显示半夏药材可与其混伪品明显分开。结论:ITS2序列能准确、稳定鉴定中药材半夏药材及其混伪品。 展开更多
关键词 半夏 DNA条形码 ITS2序列 混伪品
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ITS2序列鉴定小茴香及其常见混伪品 被引量：14
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作者 刘义梅 罗焜 +1 位作者 陈科力 陈士林 《环球中医药》 CAS 2011年第4期260-263,共4页
目的探讨基于ITS2序列鉴定小茴香及其混伪品的新方法。方法对小茴香4份样品的ITS2序列进行PCR扩增和测序,同时从GenBank上下载小茴香及其常见混伪品共6个物种42个样本。用MEGA4.1计算其种间、种内的K-2-P距离,并分析各物种间ITS2序列二... 目的探讨基于ITS2序列鉴定小茴香及其混伪品的新方法。方法对小茴香4份样品的ITS2序列进行PCR扩增和测序,同时从GenBank上下载小茴香及其常见混伪品共6个物种42个样本。用MEGA4.1计算其种间、种内的K-2-P距离,并分析各物种间ITS2序列二级结构的差异,最后利用ITS2序列构建其系统发育树。结果小茴香种内最大K-2-P距离为0.0307,与混伪品的种间最小K-2-P距离为0.0405;小茴香及其混伪品的ITS2二级结构存在明显差异;构建的系统发育树显示小茴香的不同来源样本聚在一支,能很好与混伪品区分。结论 ITS2序列能够成功鉴定小茴香及其易混伪品,可以作为小茴香及其混伪品的分子鉴定方法。 展开更多
关键词 小茴香 ITS2序列 分子鉴定
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