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系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平分析
1
作者 邱劲军 眭维国 +3 位作者 曹翠辉 何慧燕 张扬 戴勇 《风湿病与关节炎》 2014年第4期19-25,共7页
目的:探讨超保守区域转录因子与系统性红斑狼疮的相关性。方法:采用T-UCR芯片技术分析了15名系统性红斑狼疮患者和15名健康人群的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平。结果:比较系统性红斑狼疮组与健康对照组,发现8个T-UCRs(uc.2... 目的:探讨超保守区域转录因子与系统性红斑狼疮的相关性。方法:采用T-UCR芯片技术分析了15名系统性红斑狼疮患者和15名健康人群的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平。结果:比较系统性红斑狼疮组与健康对照组,发现8个T-UCRs(uc.285+,uc.234+,uc.102+,uc.341+,uc.267+,uc.221-,uc.290-and uc.90+)表达水平上调,29个T-UCRs表达水平下调,在表达上调和下调的T-UCRs中,对应的超保守区域uc.186-表达水平最显著(P=3.29,FC=-38.648 61),其相关基因为HNRNPH1。结论:通过GO分析后,发现uc.186-可能是系统性红斑狼疮潜在的诊断和预后的生物标志物,HNRNPH1可能是系统性红斑狼疮潜在的关键基因。 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 单个核细胞 生物标志物
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β-地中海贫血患者超保守区域转录的表达水平
2
作者 陶春荣 韦庆成 曹翠辉 《广东医学》 CAS 2018年第S2期89-90,93,共3页
目的分析β-地中海贫血(β-thalassemia)的超保守区域转录表达情况,找到其潜在的诊断生物标志物。方法采用T-UCR芯片技术分析β-地中海贫血患者(20例)和健康正常对照组(20例)的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平。结果发现59个... 目的分析β-地中海贫血(β-thalassemia)的超保守区域转录表达情况,找到其潜在的诊断生物标志物。方法采用T-UCR芯片技术分析β-地中海贫血患者(20例)和健康正常对照组(20例)的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平。结果发现59个超保守区域转录子(T-UCRs)表达水平上调,28个T-UCRs表达水平下调,在以上表达水平上调下调的T-UCRs中,相对应的超保守区域uc.45-表达水平最显著(P=2.474 89E-28;FC=1 870.235 374),其相关基因为HNRNPU。结论通过GO分析后,表明uc.45-可能是β-地中海贫血潜在的诊断生物标志物,HNRNPU可能是其潜在的关键基因。 展开更多
关键词 T-ucrs Β-地中海贫血 生物标志物
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nPTB基因座上T-uc.33在小鼠神经系统发育中的功能 被引量：1
3
作者 朱丽媛 赵阿妮 +3 位作者 张靖 侯琳 阴彬 彭小忠 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第7期962-968,共7页
目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-... 目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-uc.33的RNA转录本全长;用实时荧光定量PCR检测T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织发育及神经干细胞分化不同时间点的表达谱;用siRNAs转染细胞法检测T-uc.33对n PTB所起的调控作用。结果筛选并鉴定了n PTB基因座上的T-uc.33为真实转录的超保守长非编码RNA,全长为807 nt;T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织中的表达呈显著正相关(P<0.01),并随着脑组织发育从胚胎到成年期呈现先升高后降低的趋势,在体外神经干细胞分化过程也存在差异表达;敲低T-uc.33可显著降低n PTB的表达(P<0.01)。结论 T-uc.33为n PTB基因座上的超保守长非编码RNA,对n PTB起到正向调控作用,潜在地影响小鼠脑组织发育和神经干细胞的分化过程。 展开更多
关键词 超保守区域(UCR) nPTB 神经发育 长非编码RNA(lncRNA)
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