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活动性肺结核患者α/βTCR基因重排及CDR3谱型分析 被引量:11
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作者 张建波 方毅敏 +5 位作者 黄艳 江丽芳 董涛 朱晓敏 方丹云 赖小敏 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1136-1139,1143,共5页
目的:建立多重PCR方法扩增α/βTCR全长序列,分析活动性肺结核患者病变局部T淋巴细胞α/βTCR基因重排特点及CDR3谱型。方法:分离结核患者肺泡灌洗液中的淋巴细胞,提取RNA后用SMART方法逆转录,运用根据现有文献设计的α和βTCR扩增引物... 目的:建立多重PCR方法扩增α/βTCR全长序列,分析活动性肺结核患者病变局部T淋巴细胞α/βTCR基因重排特点及CDR3谱型。方法:分离结核患者肺泡灌洗液中的淋巴细胞,提取RNA后用SMART方法逆转录,运用根据现有文献设计的α和βTCR扩增引物,进行多重PCR扩增以获得其全长序列,构建重组质粒并测序,利用DNAstar及网上TCR资源分析序列。结果:3例患者共获得24个α链序列,13个β链序列。α链以AV1S2(54%)、AV12S3(41%)、AV12S2(5%)为主;β链以BV2(38%)、BV29S1(46%)、BV14(3%)、BV4S2(3%)为主。同一病例及不同病例之间CDR3区呈现多样性,但是标本1、标本3各有一条β链的CDR3氨基酸序列相同:SVGTGTLHQETQY;标本2和标本3的各有2条α链CDR3序列相同:AVRDWAGNMLT;标本2的一个α链和标本3的一个α链的CDR3均有:AV…DNN…RLM序列。结论:建立了TCRα和β链全长序列的多重PCR扩增方法。结核患者病变局部克隆性增殖的TCRα和β链谱型呈限制性取用,克隆增生的T淋巴细胞来自不同的亚群,但是相同的CDR3序列对于识别MTB多肽可能具有特异性。 展开更多
关键词 活动性肺结核 T细胞受体 基因重排 CDR3 多重PCR
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对T细胞受体克隆型肽类的免疫应答(英文) 被引量:9
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作者 董子明 张义国 +2 位作者 杨洪艳 赵明耀 王念慈 《河南医科大学学报》 1999年第1期2-7,共6页
目的:皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)是记忆性诱导T细胞肿瘤,表达独特的T细胞受体(TCR)的α和β链,两者各含有克隆性独特蛋白序列。这些序列由独特型或第3决定簇互补区(CDR3)组成。理论上,来源于TCRCDR3的肽类... 目的:皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)是记忆性诱导T细胞肿瘤,表达独特的T细胞受体(TCR)的α和β链,两者各含有克隆性独特蛋白序列。这些序列由独特型或第3决定簇互补区(CDR3)组成。理论上,来源于TCRCDR3的肽类可作为由主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类分子提呈的肿瘤特异抗原。本研究旨在确定细胞毒性T淋巴细胞(CTL)是否识别CDR3来源的肽类。方法:首先培育出能裂解2例CTCL病人自身的肿瘤细胞的CTL(CD8+)细胞株,然后检测这些CTL对由原始B淋巴细胞提呈的源于自身恶性细胞TCRCDR3序列的合成肽产生应答的能力。结果:CTL分泌肿瘤坏死因子(TNFα),对自身TCRβ链独特型肽产生应答,但对来源于其他TCRβ链独特型区的肽或对照肽不产生应答。抗MHCⅠ类分子的单克隆抗体(W6/32)能阻断其肽的识别。结论:首先表明CTL可识别具有CTCL病人个体独特性的恶性淋巴细胞克隆的特异MHCⅠ类分子相关肽并对其产生应答;又提示起刺激作用的肽来源于TCRβ链独特型区。该研究建立了这种机制,其他T细胞可通过此机制调解既定的抗原特异性T细胞。CTCL的肿瘤特异性表位的鉴定,可能有助开发强化或启动CD8介导的? 展开更多
关键词 皮肤肿瘤 T细胞 受体 免疫应答 克隆型肽类
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肿瘤精准靶向免疫治疗的关键:T细胞受体抗原筛选技术
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作者 朱润棣 李贵登 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期10-18,共9页
过继性T细胞疗法在实体瘤治疗中展现了良好的前景,成为目前肿瘤治疗领域的一大研究热点。其中,TCR-T疗法主要通过T细胞受体(TCR)与抗原肽-主要组织相容性复合体(pMHC)的特异性识别,进而激活过继性T细胞的抗肿瘤免疫反应。因此,全面解析... 过继性T细胞疗法在实体瘤治疗中展现了良好的前景,成为目前肿瘤治疗领域的一大研究热点。其中,TCR-T疗法主要通过T细胞受体(TCR)与抗原肽-主要组织相容性复合体(pMHC)的特异性识别,进而激活过继性T细胞的抗肿瘤免疫反应。因此,全面解析TCR所靶向的抗原信息有助于提高TCR-T疗法在临床应用中的有效性及安全性。然而,高效、高通量的TCR抗原筛选技术的缺乏限制了TCR-T疗法的发展。近年来,随着高通量测序技术、质谱流式细胞技术和计算生物学的快速发展,研究人员开发了多种TCR抗原筛选技术用于解析TCR及其特异性识别的抗原信息。本文从抗原定向筛选、TCR定向筛选以及双向筛选三方面对TCR抗原筛选技术进行归纳总结,系统介绍其优缺点,展望TCR抗原筛选技术领域的发展前景,为未来抗原筛选技术的开发提供了新思路。 展开更多
关键词 肿瘤 T细胞受体 抗原 tcr抗原筛选技术 tcr-T疗法
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αβ T cell receptors as predictors of health and disease 被引量:5
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作者 Meriem Attaf Eric Huseby Andrew K Sewell 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期391-399,共9页
The diversity of antigen receptors and the specificity it underlies are the hallmarks of the cellular arm of the adaptive immune system. T and B lymphocytes are indeed truly unique in their ability to generate recepto... The diversity of antigen receptors and the specificity it underlies are the hallmarks of the cellular arm of the adaptive immune system. T and B lymphocytes are indeed truly unique in their ability to generate receptors capable of recognizing virtually any pathogen. It has been known for several decades that T lymphocytes recognize short peptides derived from degraded proteins presented by major histocompatibility complex (MHC) molecules at the cell surface. Interaction between peptide-MHC (pMHC) and the T cell receptor (TCR) is central to both thymic selection and peripheral antigen recognition. It is widely assumed that TCR diversity is required, or at least highly desirable, to provide sufficient immune coverage. However, a number of immune responses are associated with the selection of predictable, narrow, or skewed repertoires and public TCR chains. Here, we summarize the current knowledge on the formation of the TCR repertoire and its maintenance in health and disease. We also outline the various molecular mechanisms that govern the composition of the pre-selection, naive and antigen-specific TCR repertoires. Finally, we suggest that with the development of high-throughput sequencing, common TCR 'signatures' raised against specific antigens could provide important diagnostic biomarkers and surrogate predictors of disease onset, progression and outcome. 展开更多
关键词 T cell receptor tcr tcr repertoire tcr diversity tcr clonotype tcr bias Deep sequencing
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临床肿瘤免疫治疗技术的突破和问题 被引量:7
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作者 王歈 《医学与哲学(B)》 2015年第2期10-12,34,共4页
通过干预、改造肿瘤患者T细胞进行肿瘤免疫治疗的方法,在部分类型的肿瘤患者取得了长期缓解的疗效。其中包括非特异性解除患者T细胞免疫抑制(阻断免疫检查点)可以使约20%的黑色素瘤和非小细胞肺癌患者获得长期缓解;通过基因转染赋予患者... 通过干预、改造肿瘤患者T细胞进行肿瘤免疫治疗的方法,在部分类型的肿瘤患者取得了长期缓解的疗效。其中包括非特异性解除患者T细胞免疫抑制(阻断免疫检查点)可以使约20%的黑色素瘤和非小细胞肺癌患者获得长期缓解;通过基因转染赋予患者T细胞识别肿瘤细胞抗原和活化的信号,嵌合抗原受体-T细胞(CAR-T)治疗在致死性儿童急性淋巴细胞白血病中取得了约90%的疗效。长期疗效达到75%。这些临床成果,使得肿瘤免疫治疗逐步成为部分肿瘤治疗的一线治疗方案。然而,受到肿瘤高度异质性、能够选择肿瘤抗原的有限性、肿瘤免疫逃逸多重机制的影响,肿瘤免疫治疗仍有许多关键问题需要基础和临床研究进行尝试和解决。 展开更多
关键词 肿瘤免疫治疗 免疫检查点 嵌合抗原受体-T细胞 T细胞受体
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基于TCR组库分析流程的非小细胞肺癌特征分析
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作者 赵卓明 刘振浩 +3 位作者 鲁曼曼 张钰 许林锋 谢鹭 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1520-1528,共9页
目的·探究非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)免疫相关特征,发掘V-J基因中的肿瘤潜在标志物,为建立T细胞受体(T-cell receptor,TCR)-抗原识别预测模型提供基础。方法·收集704例NSCLC样本,用于构建一套系统的TCR... 目的·探究非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)免疫相关特征,发掘V-J基因中的肿瘤潜在标志物,为建立T细胞受体(T-cell receptor,TCR)-抗原识别预测模型提供基础。方法·收集704例NSCLC样本,用于构建一套系统的TCR组库分析流程,涵盖从原始数据到质控、过滤、TCR序列的识别和提取等上游分析部分,以及组库克隆分布、克隆分型、V-J基因共享性、互补决定区3(CDR3)分布特征以及克隆追踪等下游分析流程。使用Shannon-Weiner指数、Chao1等指数分析样本克隆分布。根据克隆扩增数目进行克隆分型,以探索不同分型间的差异。选取2例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)样本进行去克隆扩增权重V-J基因共享分析,以探究低频克隆型对V-J基因共享性的影响。最后,通过分析V基因及高频克隆型CDR3分布特征和克隆追踪分析,监测肿瘤免疫前后克隆型频率的变化,寻找潜在的肿瘤标志物。结果·①NSCLC不同组织间克隆分布和克隆分型均存在显著差异,且在不同年龄与性别间存在显著差异。②在V-J基因共享性分析中发现了特定高共享V-J基因,同时在CDR3分布特征分析中存在非正态分布的高克隆V基因与氨基酸高频克隆型。③高频克隆型克隆追踪分析中,观察到NSCLC中高表达或新表达的高频克隆型,提示这些克隆型可作为潜在的肿瘤相关抗原或新抗原结合CDR3参考序列。④通过去克隆扩增权重V-J基因共享分析,发现原本低表达的TRBJ2-5基因表达频率显著增加,提示该基因可能为肿瘤免疫反应的潜在低频关键基因。结论·TRAV21和TRBV6.5基因在NSCLC中高克隆扩增,可作为潜在肿瘤标志物。 展开更多
关键词 T细胞受体 tcr组库 肿瘤免疫 非小细胞肺癌
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增强型金黄色葡萄球菌肠毒素C2突变体及其超抗原活性 被引量:5
7
作者 张国俊 徐明恺 +4 位作者 孙健 李洪义 杨宏丽 张惠文 张成刚 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期803-813,共11页
金黄色葡萄球菌肠毒素C2(Staphylococcal enterotoxin C2,SEC2)作为一种超级抗原蛋白,极微量即可有效激活机体免疫系统,这一特性可应用于对肿瘤和感染性疾病的辅助治疗。为了增强SEC2的超抗原活性,应用over-lap PCR方法将SEC2中的102~... 金黄色葡萄球菌肠毒素C2(Staphylococcal enterotoxin C2,SEC2)作为一种超级抗原蛋白,极微量即可有效激活机体免疫系统,这一特性可应用于对肿瘤和感染性疾病的辅助治疗。为了增强SEC2的超抗原活性,应用over-lap PCR方法将SEC2中的102~106位GKVTG氨基酸残基分别突变为WWH、WWT和WWP,获得3种突变体ST-1、ST-2和ST-3。三种突变体刺激小鼠淋巴细胞增殖活性和肿瘤细胞生长抑制活性与野生型SEC2相比均有显著提高。ST-1和ST-3的致热活性与野生型SEC2相当,而ST-2的致热活性明显高于野生型SEC2。此外,三种突变体体外刺激淋巴细胞分泌IL-2、IFN-γ和TNF-α的水平也显著提高,这可能是导致突变体具有较高肿瘤细胞生长抑制活性的原因。进一步实验发现,三种突变体刺激下,小鼠脾淋巴细胞mVβ8.2基因的转录水平较野生型SEC2显著增加,暗示突变体对TCR mVβ8.2分子亲和力的提高,可能是其超抗原活性增强的主要原因。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌肠毒素C2 超抗原活性 T细胞受体(T cell receptor tcr) 致热活性 细胞因子
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T细胞过继免疫治疗法在肿瘤疾病治疗中的应用进展 被引量:5
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作者 郭宁宁 王辉 肖兰凤 《广东药学院学报》 CAS 2011年第4期441-444,F0003,共5页
目前T细胞过继免疫治疗技术已应用于治疗各种疾病,尤其是在肿瘤领域的应用,具有肿瘤抗原特异性的T细胞过继免疫疗法不仅可以在体外实验中诱导肿瘤细胞死亡,而且已经部分应用于临床患者并达到一定的治疗效果,有望成为从基因水平上解决肿... 目前T细胞过继免疫治疗技术已应用于治疗各种疾病,尤其是在肿瘤领域的应用,具有肿瘤抗原特异性的T细胞过继免疫疗法不仅可以在体外实验中诱导肿瘤细胞死亡,而且已经部分应用于临床患者并达到一定的治疗效果,有望成为从基因水平上解决肿瘤疾病的前沿武器。本文对近年来T细胞过继免疫疗法在肿瘤疾病治疗方面的研究进行综述。 展开更多
关键词 T细胞过继免疫治疗 T细胞受体(tcr) 基因治疗 肿瘤
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银屑病T细胞应答及TCRCDR3谱系研究进展 被引量:5
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作者 秦欢 马龙 +1 位作者 潘雨蓉 姚新生 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1068-1069,1072,共3页
银屑病是一种与免疫应答异常有关的慢性复发性炎症性疾病,其发病机制至今未完全阐明。目前普遍认为T细胞介导的细胞免疫功能紊乱在银屑病发生及持续发展中发挥了重要作用。本文将从T细胞应答及TCR CDR3谱型分布特征入手,对TCR偏向及CDR... 银屑病是一种与免疫应答异常有关的慢性复发性炎症性疾病,其发病机制至今未完全阐明。目前普遍认为T细胞介导的细胞免疫功能紊乱在银屑病发生及持续发展中发挥了重要作用。本文将从T细胞应答及TCR CDR3谱型分布特征入手,对TCR偏向及CDR3组库特征和银屑病发病的关系进行综述,为银屑病的发病机制研究和个体化治疗提供新思路。 展开更多
关键词 银屑病 T细胞应答 T细胞受体 CDR3
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乙型肝炎病毒抗原诱导T细胞受体Vβ基因亚家族特异性扩增与多样性 被引量:4
10
作者 黄树林 曹茂开 +2 位作者 罗利琼 李依娜 李菁华 《中华实验和临床病毒学杂志》 CSCD 1998年第4期318-321,共4页
目的对乙型肝炎疫苗注射前后及HepG22215上清HBsAg、HBeAg感染淋巴细胞,T细胞受体(TCR)Vβ基因亚家族表达特征与多样性,为研究识别机制提供依据。方法采用RT-PCR-Southern印迹扫描。结果乙... 目的对乙型肝炎疫苗注射前后及HepG22215上清HBsAg、HBeAg感染淋巴细胞,T细胞受体(TCR)Vβ基因亚家族表达特征与多样性,为研究识别机制提供依据。方法采用RT-PCR-Southern印迹扫描。结果乙肝疫苗注射后Vβ6、14增高,HepG22215上清感染后Vβ6、15增高。结论Vβb为两种抗原共同识别亚家族。Vβ14。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 T细胞受体 基因表达
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肿瘤患者T细胞受体多样性和克隆性的高通量测序分析
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作者 杨黎 张茹 +3 位作者 黄建敏 宋亚东 张志新 张毅 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期55-64,共10页
目的:探讨肺癌和食管癌患者外周血T细胞受体(T cell receptor,TCR)多样性和克隆分布,以及食管癌外周血和肿瘤浸润淋巴细胞中T细胞TCR的差异情况。方法:收集自2019年4月至2021年5月郑州大学第一附属医院未行放、化疗,并排除严重感染性疾... 目的:探讨肺癌和食管癌患者外周血T细胞受体(T cell receptor,TCR)多样性和克隆分布,以及食管癌外周血和肿瘤浸润淋巴细胞中T细胞TCR的差异情况。方法:收集自2019年4月至2021年5月郑州大学第一附属医院未行放、化疗,并排除严重感染性疾病、自身免疫性疾病以及近期使用免疫抑制剂治疗史的8例食管癌、8例肺癌患者的外周血标本,选取其中1例食管癌患者肿瘤组织标本进行TCR测序。17例健康人外周血标本作为对照组。分析肿瘤患者与健康人之间以及早期、晚期肿瘤患者之间TCR多样性指数(D50)、VJ基因使用频率以及CDR3序列克隆型频率的差异。结果:食管癌、肺癌患者外周血TCR CDR3序列的D50值[分别为(0.031±0.028)和(0.077±0.034)],均低于健康人[(0.145±0.057),P<0.000 1和P=0.005 3]。食管癌、肺癌外周血TCR CDR3最大克隆比例[分别为(10.640±7.640)%和(8.334±5.575)%],均高于健康人[(4.070±2.341)%, P=0.003 1和P=0.011 9]。且TCR CDR3序列的最大克隆比例与D50值呈负相关。食管癌和肺癌患者早期外周血T细胞TCR多样性(D50)[分别为(0.057±0.028)和(0.106±0.007)]明显高于晚期患者[分别为(0.015±0.014,P=0.028 5)和(0.059±0.030,P=0.041 7)]。随着疾病进展,肺癌和食管癌患者外周血TCR CDR3中TRBV和TRBJ基因组合使用减少,单个或多个TCR克隆型占比明显增高,存在明显的单一性。结论:肺癌和食管癌中外周血TCR谱多样性低于健康人,且存在克隆性增殖。在肿瘤发展中,TCR谱多样性降低,提示TCR谱为肿瘤的诊断、免疫评估提供了潜在的生物标志物,具有重要的临床指导意义。 展开更多
关键词 T细胞受体 高通量测序 多样性 克隆性 生物标志物
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T细胞受体(TCR)组库多样性及其在肺癌防治中的应用进展 被引量:1
12
作者 罗斌 楚小鸽 +1 位作者 于盼 田建辉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期939-943,共5页
免疫检查点抑制剂已成为晚期肺癌的标准治疗,但在转移防治中尚无明确突破。T细胞受体(TCR)是识别癌细胞表面新生抗原的关键“信号感受器”,我们从TCR组库多样性及其识别肿瘤抗原机制的角度,总结了基因工程编辑的T细胞受体T(TCR-T)细胞... 免疫检查点抑制剂已成为晚期肺癌的标准治疗,但在转移防治中尚无明确突破。T细胞受体(TCR)是识别癌细胞表面新生抗原的关键“信号感受器”,我们从TCR组库多样性及其识别肿瘤抗原机制的角度,总结了基因工程编辑的T细胞受体T(TCR-T)细胞疗法在肺癌防治中的研究进展,以期提高肺癌转移防治疗效。 展开更多
关键词 免疫组库 T细胞受体(tcr) 肿瘤转移 免疫治疗 免疫正常化 综述
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PML-RARα多肽诱导脐血TCR VβT细胞增殖研究 被引量:3
13
作者 汤冀 李扬秋 +2 位作者 杨力建 陈少华 周羽竝 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期529-532,共4页
目的了解PMLRARα多肽诱导脐血T细胞的T细胞受体(TCR)Vβ谱系表达和克隆性情况。方法以不同浓度(16.7μg/mL,33.3μg/mL或50μg/mL)的PMLRARα多肽联合IL2、抗CD3单抗以及抗CD28单抗诱导脐血T细胞增殖,利用RTPCR基因扫描技术分析诱导后... 目的了解PMLRARα多肽诱导脐血T细胞的T细胞受体(TCR)Vβ谱系表达和克隆性情况。方法以不同浓度(16.7μg/mL,33.3μg/mL或50μg/mL)的PMLRARα多肽联合IL2、抗CD3单抗以及抗CD28单抗诱导脐血T细胞增殖,利用RTPCR基因扫描技术分析诱导后第3、6、9、12天后的脐血TCRVβ亚家族的利用和克隆性增殖的特点。结果限制性表达和克隆性增殖TCRVβ亚家族T细胞可见于PMLRARα多肽诱导后脐血T细胞。结论PMLRARα多肽可在体外诱导脐血T细胞呈克隆性增殖,此优势增殖的克隆性T细胞可能具有特异性细胞毒作用。 展开更多
关键词 脐血 急性早幼粒细胞白血病 T细胞受体 克隆性
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一种高效扩增人T细胞受体β链可变区基因的方法建立 被引量:2
14
作者 叶海燕 王琳 +4 位作者 范振平 钟彦伟 苏何玲 刘永明 徐东平 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期644-647,共4页
目的:建立一种高效扩增人T细胞受体(TCR)β链可变区(Vβ)基因的方法。方法:根据TCRVβ26个亚家族基因序列特点设计扩增Vβ基因的上游内引物34条、上游外引物37条,并将内、外上游引物各分为8个简并组。在恒定区(C区)设计下游内、外和测... 目的:建立一种高效扩增人T细胞受体(TCR)β链可变区(Vβ)基因的方法。方法:根据TCRVβ26个亚家族基因序列特点设计扩增Vβ基因的上游内引物34条、上游外引物37条,并将内、外上游引物各分为8个简并组。在恒定区(C区)设计下游内、外和测序引物各1条以及扩增Cβ基因的上游引物1条。提取细胞RNA,用PolyA介导反转录后,采用巢式PCR扩增正常人CD8T细胞TCRVβ26个亚家族基因,并用JurkatT淋巴瘤细胞作为对照。用T-easy载体克隆RT-PCR产物,对克隆基因进行测序。结果:从正常人的CD8T细胞中扩增到所有TCRVβ亚家族基因,克隆后测序与相应的参考序列同源。从Jurkat细胞扩增出TCRVβ8基因,经测序验证与文献报道一致,且最少可从10个细胞提取的RNA模板中扩增成功。结论:建立的巢式RT-PCR方法可以高效、广谱地扩增人TCRVβ基因,为进一步进行抗原特异性细胞毒T淋巴细胞的TCR克隆和功能研究打下了良好基础。 展开更多
关键词 CD8 T细胞 T细胞受体(tcr) 反转录PCR 基因克隆
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鸡T细胞受体γ链基因位点重新测序和组装
15
作者 马俊平 杨犀 +3 位作者 律娜 刘飞 陈燕 朱宝利 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期568-574,共7页
动物T细胞受体(T cell receptor,TCR)基因由多个不同的高度同源的基因家族组成,通过全基因组测序很难获得准确的基因序列和排列位置。文章通过在NCBI中发布的鸡TCR的γ链(TCRγ或TRG)基因片段序列定位了鸡TRG基因所在区域,并确定了与鸡... 动物T细胞受体(T cell receptor,TCR)基因由多个不同的高度同源的基因家族组成,通过全基因组测序很难获得准确的基因序列和排列位置。文章通过在NCBI中发布的鸡TCR的γ链(TCRγ或TRG)基因片段序列定位了鸡TRG基因所在区域,并确定了与鸡TRG基因位点对应的细菌人工染色体(BAC)克隆(CH261-174P24)。对该克隆进行高通量的重新测序和组装后,得到含有10个scaffolds的基因组草图,较完整地覆盖了鸡TRG基因位点及两侧区域。通过PCR扩增和测序证明了scaffold内部结构的正确性,校正了鸡参考基因组TRG基因位点一个可变基因和一个缺口序列(gap)附近各一处错误序列,以及可变基因区多处序列错误。文章通过校正鸡参考基因组TRG基因位点的序列,为鸡TRA/D和TRB基因位点的基因组序列分析提供了新方法。 展开更多
关键词 T细胞受体(tcr) 伽马链(tcrγ或TRG)基因位点 测序 组装
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T细胞受体Vβ亚家族基因表达特点与特发性血小板减少性紫癜临床疗效的相关性
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作者 范建新 《中国中医药咨讯》 2010年第9期80-82,共3页
目的研究特发性血小板减少性紫癫(ITP)患者T细胞受体p链可变区互补决定区3(TCRβVCDR3)基因表达的变化,与ITP临床治疗效果之间的关系。方法采用RT—PCR方法分析15例缓解组ITP患者、10例复发难治组ITP患者和6例正常对照组T细胞受体... 目的研究特发性血小板减少性紫癫(ITP)患者T细胞受体p链可变区互补决定区3(TCRβVCDR3)基因表达的变化,与ITP临床治疗效果之间的关系。方法采用RT—PCR方法分析15例缓解组ITP患者、10例复发难治组ITP患者和6例正常对照组T细胞受体β链(TCRβ)的可变区(V)的24个家族的互补决定区3(CDR3)基因序列。结果15例缓解组ITP患者见部分CDR3基因谱型异常,平均每个患者基因异常的家族数为2.55±0.38个,未见T细胞克隆增生。10例复发难治组ITP患者中,在8V8、BV13.1、BV14和BV17等亚家族都出现了克隆性增生,平均每个患者异常家族为7.1±3.15个,明显高于正常对照组,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论ITP的发病及预后与T细胞免疫状态有关,TCRBVCRD3基因谱型分析可以发现异常增生克隆,有助于判断ITP的治疗效果和预后。 展开更多
关键词 特发性血小板减少性紫癜 T细胞受体tcr β链V区 互补决定区3
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PDIA3对人Jurkat T细胞TCR信号通路的调控 被引量:1
17
作者 周云 刘海龙 靳照宇 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第3期301-306,共6页
为了研究蛋白质二硫键异构酶A3前体(protein disulfide isomerase A3 precursor,PDIA3)在T细胞受体(T cell receptor,TCR)信号通路中的具体功能,利用电穿孔法将T细胞内的PDIA3蛋白水平敲低,通过Western blotting检测ζ-链相关蛋白70(zet... 为了研究蛋白质二硫键异构酶A3前体(protein disulfide isomerase A3 precursor,PDIA3)在T细胞受体(T cell receptor,TCR)信号通路中的具体功能,利用电穿孔法将T细胞内的PDIA3蛋白水平敲低,通过Western blotting检测ζ-链相关蛋白70(zeta-chain associated protein 70,ZAP70)的磷酸化修饰水平,酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)实验检测细胞因子IL-2的分泌情况,流式细胞术分析分化抗原簇69(cluster of differentiation 69,CD69)表达水平及荧光素酶报告基因检测NF-κB信号通路.结果显示:T细胞中PDIA3蛋白下调后导致ZAP70蛋白的磷酸化水平、CD69表达和IL-2的分泌都明显降低,并且影响了NF-κB信号通路,表明PDIA3蛋白对T细胞的活化有促进作用,参与T细胞TCR信号通路的调控,为进一步深入研究PDIA3与TCR下游一些功能蛋白的相互作用打下了基础. 展开更多
关键词 蛋白质二硫键异构酶A3前体(PDIA3) T细胞受体(tcr) T细胞
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高通量测序分析脓毒症患者早期T细胞抗原受体β链CDR3的组成及多态性 被引量:1
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作者 江意春 袁丰华 +4 位作者 赵颖 黄泽伟 刘振密 刘晓君 刘雪燕 《中国急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期976-981,I0001,共7页
目的 采用高通量测序的方法探讨脓毒症患者早期T细胞抗原受体(TCR)β链互补决定区3(CDR3)的组成及多态性。 方法 从深圳市人民医院重症医学科收集脓毒症患者6例,从体检科收集年龄匹配的对照患者9例,入科后留取其静脉血,分离外周... 目的 采用高通量测序的方法探讨脓毒症患者早期T细胞抗原受体(TCR)β链互补决定区3(CDR3)的组成及多态性。 方法 从深圳市人民医院重症医学科收集脓毒症患者6例,从体检科收集年龄匹配的对照患者9例,入科后留取其静脉血,分离外周血单核细胞并提取DNA,对TCR β链CDR3进行多重PCR扩增,然后对产物进行高通量测序及数据分析。 结果 脓毒症组(S组)和对照组(N组)的TCR β链CDR3长度呈高斯分布,且两组前60种特有核苷酸序列和特有氨基酸表达水平存在很大差异;针对TRβV片段59个基因的表达水平进行比较,其中TRBV 10-2、TRBV 10-3、TRBV 12-1、TRBV 5-7的表达水平差异有统计学意义(P<0.05);对TRβJ片段中的14个基因的表达水平进行了F检验,其中TRBJ 1-1、TRBJ 1-2、TRBJ 2-1、TRBJ 2-5的表达水平差异有统计学意义(P<0.05)。 结论 脓毒症患者早期T细胞TCR β链CDR3的多态性发生了明显改变,提示其与脓毒症的免疫发病机制有关,这将为脓毒症的发病机制研究、治疗和预后的判断提供新的方法和手段。 展开更多
关键词 高通量测序 脓毒症 T细胞抗原受体(tcr) 互补决定区3(CDR3)
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CD8^+CIK细胞表面NKG2D及TCR抗原识别受体的功能分析 被引量:2
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作者 王耀玲 刘建华 《中国妇幼健康研究》 2018年第4期428-435,共8页
目的探讨CD8^+细胞因子诱导的杀伤细胞(CIK细胞)亚群表面T细胞受体(TCR)和NKG2D(即CD314)抗原识别受体在发挥抗肿瘤特别是卵巢癌免疫效应中的功能。方法 CIK细胞由卵巢癌志愿者外周血单个核细胞(PBMCs)制备而成,采用磁性细胞分选(MACS)... 目的探讨CD8^+细胞因子诱导的杀伤细胞(CIK细胞)亚群表面T细胞受体(TCR)和NKG2D(即CD314)抗原识别受体在发挥抗肿瘤特别是卵巢癌免疫效应中的功能。方法 CIK细胞由卵巢癌志愿者外周血单个核细胞(PBMCs)制备而成,采用磁性细胞分选(MACS)技术从培养1周的CIK细胞中富集CD8^+亚群并继续培养扩增,获得高度均质性的CD8^+CIK细胞后进行表型检测。将CD8^+CIK细胞分别在CD3抗体和NKG2D抗体包被的培养板中进行培养,以CD137为CD8^+CIK细胞激活标志物,应用流式细胞术(FCM)检测CD137表达,评估CD8^+CIK细胞的激活状况。并检测经CD3抗体、NKG2D抗体刺激或与红白血病细胞株人类白细胞抗原(HLA)-主要组织相容性复合体-Ⅰ类相关分子(MIC)A/B+K562细胞共培养对CD8^+CIK细胞分泌γ-干扰素(IFN-γ)的影响。选用K562细胞作为CD8^+CIK细胞作用的靶细胞,应用NKG2D抗体阻断NKG2D与MICA/B相互作用,测试激活的CD8^+CIK细胞在NKG2D阻断状态下对靶细胞K562的杀伤能力。结果 TCR能够提供CD8^+CIK细胞的激活信号,而NKG2D不具备该功能。外周血单个核细胞(PBMC)中CD8^+细胞占24.2%,该细胞群中NKG2D阳性率为16.3%。CIK培养后CD8^+细胞比例增至88.1%,这些CD8^+CIK细胞均表达NKG2D,但其中仍含10%左右的CD8-细胞;CD3抗体组中CD137阳性率为88.8%;CD3抗体刺激后24h,约50%的CD8^+CIK细胞呈IFN-γ染色阳性,而NKG2D抗体刺激后,IFN-γ阳性率(4.8%和5.6%)高于对照组(2.9%),但明显低于CD3抗体;CD8^+CIK细胞经CD3抗体刺激24h后IFN-γ检测阳性率为41.9%,但与K562细胞按1:1比例共培养后阳性率仅为0.5%。CD8^+CIK细胞对K562细胞具有杀伤功能,即能够以HLA非限制的方式杀伤靶细胞。而在CD3-TCR复合物激活的CD8^+CIK细胞上阻断NKG2D与MICA/B相互作用后,CD8^+CIK细胞杀伤活性受到抑制。结论 CD8^+CIK细胞的激活主要通过CD3-TCR受体复合物,而非通过NKG2D受体。CD8^+CIK细胞的NKG2D受体与靶细胞表面相应� 展开更多
关键词 细胞因子诱导的杀伤细胞 CD8^+CIK T细胞受体 NKG2D
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T淋巴瘤EL-4细胞双受体表达研究
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作者 张媛 罗微 马骊 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期404-408,共5页
目的:检测T淋巴瘤EL-4细胞T细胞受体(T cell receptor,TCR)的表达情况,为进一步研究T细胞等位基因排斥机制奠定基础。方法:以小鼠脾细胞作为阳性对照,分别提取脾细胞和EL-4细胞mRNA,逆转录为cDNA,RT-PCR扩增24个TCR BV家族CDR3区,结合... 目的:检测T淋巴瘤EL-4细胞T细胞受体(T cell receptor,TCR)的表达情况,为进一步研究T细胞等位基因排斥机制奠定基础。方法:以小鼠脾细胞作为阳性对照,分别提取脾细胞和EL-4细胞mRNA,逆转录为cDNA,RT-PCR扩增24个TCR BV家族CDR3区,结合基因扫描(GeneScan)和基因测序技术,对有表达的TCR BV家族进行CDR3谱型和序列分析。结果:小鼠脾细胞24 BV家族均有表达,各TCR BV家族CDR3谱型均呈高斯分布(Gaussian distribution),表明24 BV家族均为多克隆性。EL-4细胞被同时检测到TCR BV10和BV12家族表达,CDR3谱型均呈单峰,两个家族的RT-PCR产物经测序鉴定证实确属TCR序列,且均为框内编码。结论:EL-4细胞存在两套框内重排的TCRβ链,表明其TCRβ链可能存在等位基因排斥"缺陷"现象。本研究为探索T细胞等位基因排斥机制奠定了基础。 展开更多
关键词 EL-4细胞株 T细胞受体(tcr) 等位基因排斥“缺陷” 框内重排
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