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运用SwissDock预测黄芩素与BMP受体蛋白的对接构象
被引量:
2
1
作者
唐爽捷
饶丽
+1 位作者
陈珺
卢丽
《中国生化药物杂志》
CAS
2017年第3期34-36,共3页
目的 以实例详述Swiss Dock系统在蛋白质-小分子对接预测中的应用,为科研工作者运用此系统提供参考。方法以黄芩素(小分子)与BMPII型受体(靶蛋白)为研究对象,详细介绍Swiss Dock系统的相关操作,并进行结果分析。结果 Swiss Dock系...
目的 以实例详述Swiss Dock系统在蛋白质-小分子对接预测中的应用,为科研工作者运用此系统提供参考。方法以黄芩素(小分子)与BMPII型受体(靶蛋白)为研究对象,详细介绍Swiss Dock系统的相关操作,并进行结果分析。结果 Swiss Dock系统预测结果显示黄芩素与BMPII型受体相对接的氨基酸残基是第338位天冬酰胺(ASN338),而黄芩素与ASN338之间的距离为3.5?,对接模型G=-13.17 kcal/mol。结论 Swiss Dock系统能帮助使用者提交对接物及检索小分子与靶蛋白预测复合物的三维构象,其操作界面简单、人机交互性强,是对原子尺度的分子识别过程开展研究的有力工具。
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关键词
SWISS
DOCK
蛋白质-小分子对接预测
黄芩素
BMPII型受体
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职称材料
题名
运用SwissDock预测黄芩素与BMP受体蛋白的对接构象
被引量:
2
1
作者
唐爽捷
饶丽
陈珺
卢丽
机构
广东药科大学生命科学与生物制药学院广东省生物技术候选药物研究重点实验室
出处
《中国生化药物杂志》
CAS
2017年第3期34-36,共3页
基金
国家自然科学基金青年基金(81203003,81400853)
文摘
目的 以实例详述Swiss Dock系统在蛋白质-小分子对接预测中的应用,为科研工作者运用此系统提供参考。方法以黄芩素(小分子)与BMPII型受体(靶蛋白)为研究对象,详细介绍Swiss Dock系统的相关操作,并进行结果分析。结果 Swiss Dock系统预测结果显示黄芩素与BMPII型受体相对接的氨基酸残基是第338位天冬酰胺(ASN338),而黄芩素与ASN338之间的距离为3.5?,对接模型G=-13.17 kcal/mol。结论 Swiss Dock系统能帮助使用者提交对接物及检索小分子与靶蛋白预测复合物的三维构象,其操作界面简单、人机交互性强,是对原子尺度的分子识别过程开展研究的有力工具。
关键词
SWISS
DOCK
蛋白质-小分子对接预测
黄芩素
BMPII型受体
Keywords
swissdock
swissdock
protein-small molecule docking prediction
baicalin
BMPRII
分类号
Q74 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
运用SwissDock预测黄芩素与BMP受体蛋白的对接构象
唐爽捷
饶丽
陈珺
卢丽
《中国生化药物杂志》
CAS
2017
2
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