期刊文献+
共找到13篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
利用生物信息学技术构建分析甜菜M14品系盐胁迫下参考转录组数据库 被引量:5
1
作者 吕笑言 金英 《黑龙江大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2017年第2期208-212,共5页
生物信息学(Bioinformatics)是一门计算机科学技术与生命科学的交叉学科,它通过综合利用生物学、计算机科学和信息技术揭示大量生物数据所赋有的生物学意义。目前利用生物信息技术对植物逆境环境下的基因组学、转录组学及蛋白质组学的... 生物信息学(Bioinformatics)是一门计算机科学技术与生命科学的交叉学科,它通过综合利用生物学、计算机科学和信息技术揭示大量生物数据所赋有的生物学意义。目前利用生物信息技术对植物逆境环境下的基因组学、转录组学及蛋白质组学的数据挖掘,已成为功能基因组学的研究热点。甜菜M14品系具有野生白花甜菜(Beta corolliflora Zoss.)的耐盐性优良性状。为了对盐胁迫下的甜菜M14品系进行转录组分析及差异基因筛选,本研究构建了甜菜M14品系盐胁迫参考转录组文库,并对文库进行了测序以及数据的生物信息学分析,在参考转录组中鉴定得到54 843个Unigenes,并对这些Unigenes进行功能注释、GO及COG功能分类,为下一步研究甜菜M14品系耐盐基因资源挖掘奠定了重要基础。 展开更多
关键词 生物信息学 甜菜M14品系 盐胁迫 转录组数据库 转录因子
下载PDF
甜菜保卫细胞应答NaCl胁迫气孔变化及富集优化 被引量:5
2
作者 马春泉 陶鑫 +3 位作者 关萍 王猛 姜月 李洪丽 《黑龙江大学工程学报》 2019年第1期84-90,共7页
气孔由两个特殊分化的保卫细胞构成,在植物抗逆境胁迫过程中发挥着重要作用。以具有优良抗逆能力的甜菜M14品系为研究对象,通过对活体植株叶片气孔孔径观察方法的比较,确定先采用撕取法获取表皮后再进行固定的方法更适合于甜菜保卫细胞... 气孔由两个特殊分化的保卫细胞构成,在植物抗逆境胁迫过程中发挥着重要作用。以具有优良抗逆能力的甜菜M14品系为研究对象,通过对活体植株叶片气孔孔径观察方法的比较,确定先采用撕取法获取表皮后再进行固定的方法更适合于甜菜保卫细胞的观察。采用该方法对盐胁迫前后活体植株叶片气孔孔径进行观察,发现200 mM NaCl胁迫处理下甜菜M14品系气孔响应最佳时间点为20 min,400 mM NaCl胁迫处理下气孔响应最佳时间点为30 min。此外,进一步对甜菜M14品系保卫细胞的富集进行了方法优化,通过比较透明胶带撕取法和搅拌机搅碎法,经过对叶肉细胞特异性表达基因ATPase-1的qRT-PCR鉴定发现其在叶片中的表达量是富集后保卫细胞中的70倍,最终确定采用搅拌机搅碎法获取表皮后再经4.2%纤维素酶R10、0.15%离析酶R10及0.2%果胶酶Y23的协同处理可实现甜菜保卫细胞快速富集,以满足后续分子生物学及蛋白质组学实验的需求。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 保卫细胞 NACL胁迫 ATPase-1
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-SAMS2基因的克隆及表达特异性分析 被引量:4
3
作者 谷丹 朱哲浩 +3 位作者 马春泉 于冰 陈思学 李海英 《黑龙江大学工程学报》 2014年第2期62-67,共6页
甜菜M14品系富含丰富的优质基因资源,对盐、寒冷、干旱等非生物胁迫具有极强的耐受性,是研究逆境胁迫极为难得的材料。课题组前期以甜菜M14品系为试验材料,在500mmol/L NaCl胁迫下,从蛋白质水平筛选获得了76个差异蛋白质点,在转录水平... 甜菜M14品系富含丰富的优质基因资源,对盐、寒冷、干旱等非生物胁迫具有极强的耐受性,是研究逆境胁迫极为难得的材料。课题组前期以甜菜M14品系为试验材料,在500mmol/L NaCl胁迫下,从蛋白质水平筛选获得了76个差异蛋白质点,在转录水平筛选获得了58个Unigenes序列,二者匹配得到了蛋白质点——BvM14-SAMS2。试验采用RACE技术,克隆获得甜菜M14品系BvM14-SAMS2基因cDNA全长1 538bp,包含最大开放阅读框ORF 1 182bp,编码393个氨基酸。采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术对甜菜M14品系BvM14-SAMS2基因的表达特异性进行分析,结果表明,在正常生长条件下,BvM14-SAMS2基因在甜菜M14品系根、茎、叶、花中的表达量大小依次为:根>叶>花>茎。受盐胁迫诱导,BvM14-SAMS2基因在甜菜M14品系叶片中的表达量随着盐浓度的增大而增大,根中的表达量随着盐浓度的增大无明显变化。研究结果表明,BvM14-SAMS2基因在甜菜M14品系叶片中受盐胁迫诱导表达,该基因在胁迫下的表达量增加可能有利于植物抵御盐胁迫损伤。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-SAMS2基因 盐、氧化胁迫
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-Dof3.4基因的克隆及响应盐胁迫表达分析 被引量:3
4
作者 马春泉 黄园园 李海英 《中国农学通报》 2020年第13期36-41,共6页
为进一步研究BvM14-Dof3.4基因响应盐胁迫的功能,以甜菜M14品系根为材料,通过PCR技术获得BvM14-Dof3.4基因cDNA全长序列并进行生物信息学以及盐胁迫应答分析。结果表明:该基因最大ORF为408 bp,编码135个氨基酸,蛋白分子量为12646.63 Da... 为进一步研究BvM14-Dof3.4基因响应盐胁迫的功能,以甜菜M14品系根为材料,通过PCR技术获得BvM14-Dof3.4基因cDNA全长序列并进行生物信息学以及盐胁迫应答分析。结果表明:该基因最大ORF为408 bp,编码135个氨基酸,蛋白分子量为12646.63 Da,理论等电点为4.68,为亲水性蛋白;BvM14-Dof3.4蛋白质二级结构和三级结构主要由延伸链和无规卷曲组成;BvM14-Dof3.4蛋白氨基酸序列与NCBI数据库中甜菜(Beta vulgaris)的氨基酸序列相似度为99.26%;系统进化分析表明BvM14-Dof3.4蛋白与菠菜(Spinacia oleracea)Dof3.4蛋白亲缘性较高。结合实验室前期盐胁迫下甜菜M14品系根的转录组数据分析,BvM14-Dof3.4基因参与甜菜M14品系应答盐胁迫过程,在200 mmol/L NaCl处理下上调2.05倍,在400 mmol/L NaCl处理下上调1.41倍。实验成功获得BvM14-Dof3.4基因cDNA全长,并确定该基因响应盐胁迫,该结果对挖掘甜菜M14品系优质基因和提高栽培甜菜抗逆性等方面具有重要意义,为后续进一步开展BvM14-Dof3.4基因响应盐胁迫功能研究提供参考。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-Dof3.4基因 克隆 盐胁迫 响应
下载PDF
转录因子BvM14-Dof3.4响应盐胁迫的功能研究 被引量:3
5
作者 杜晓雪 黄园园 +1 位作者 马春泉 李海英 《中国农学通报》 2021年第21期119-125,共7页
Dof(DNA binding with one finger)家族转录因子是植物特异的转录因子,在胁迫响应、种子发芽、氮同化、光合作用等多种生物学过程中发挥着重要作用。为了探究转录因子BvM14-Dof3.4在响应盐胁迫过程中的生物学功能,本研究以具有强耐盐特... Dof(DNA binding with one finger)家族转录因子是植物特异的转录因子,在胁迫响应、种子发芽、氮同化、光合作用等多种生物学过程中发挥着重要作用。为了探究转录因子BvM14-Dof3.4在响应盐胁迫过程中的生物学功能,本研究以具有强耐盐特性的甜菜M14品系为试验材料,用花序浸染法将BvM14-Dof3.4基因在野生型拟南芥植株中异源表达,经150 mmol/L NaCl处理后发现,BvM14-Dof3.4基因的异源表达促进了盐胁迫下转基因拟南芥植株根的生长,提高了异源表达植株的鲜重和干重,与野生型拟南芥相比异源表达植株中K^(+)/Na^(+)比值增加1.3倍、甜菜碱含量增加1.1倍以及SOD和POD的酶活性分别上调1.3和1.2倍,从而减少了盐胁迫对异源表达拟南芥植株的损伤。这些结果表明了BvM14-Dof3.4基因响应盐胁迫,并且BvM14-Dof3.4基因的异源表达能够提高拟南芥植株的耐盐能力,该结果对甜菜M14品系优质基因资源的挖掘以及开展栽培甜菜抗逆性的遗传改良工作具有重要意义。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 转录因子 BvM14-Dof3.4 盐胁迫 异源表达
下载PDF
甜菜M14品系硫氧还蛋白过氧化物酶(BvM14-Tpx)基因在原核及真核细胞中的抗氧化及抗盐能力分析 被引量:3
6
作者 赵晨曦 南景东 +3 位作者 马春泉 于冰 陈思学 李海英 《黑龙江大学工程学报》 2015年第3期62-67,83,共7页
甜菜M14品系是在栽培甜菜染色体基础上附加了野生白花甜菜第9号染色体的单体附加系,具有抗逆、无融合生殖等优异特性。在前期工作中,通过RACE技术获得了甜菜M14品系硫氧还蛋白过氧化物酶(Thioredoxin peroxidase,Tpx)编码基因BvM14-Tpx... 甜菜M14品系是在栽培甜菜染色体基础上附加了野生白花甜菜第9号染色体的单体附加系,具有抗逆、无融合生殖等优异特性。在前期工作中,通过RACE技术获得了甜菜M14品系硫氧还蛋白过氧化物酶(Thioredoxin peroxidase,Tpx)编码基因BvM14-Tpx的cDNA全长,此基因参与各种过氧化物的清除反应从而提高植物的抗逆性。构建了BvM14-Tpx基因的大肠杆菌表达体系,对转BvM14-Tpx基因的大肠杆菌BL21(DE3)菌体在H2O2胁迫下的生长曲线进行了测定,结果显示转基因菌株比对照菌株提前1h进入生长期,说明BvM14-Tpx基因能够缓解H2O2对大肠杆菌生长的抑制;同时构建了BvM14-Tpx基因的酿酒酵母表达体系,对H2O2及NaCl胁迫下的转基因酿酒酵母的研究表明,转基因酵母的生长好于对照,说明BvM14-Tpx基因可以提高转基因酵母的抗氧化及耐盐能力。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 硫氧还蛋白过氧化物酶 大肠杆菌 酿酒酵母
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-STPK基因的生物信息学分析及响应盐胁迫的表达分析 被引量:2
7
作者 赵冬美 张咏雪 李海英 《中国农学通报》 2020年第1期35-42,共8页
旨在进一步研究BvM14-STPK蛋白激酶对盐胁迫的应答反应,本研究以甜菜M14品系为材料,使用特异性引物通过聚合酶链式反应进行扩增,获得BvM14-STPK基因cDNA全长,并进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR探究该基因响应盐胁迫的表达分析。生... 旨在进一步研究BvM14-STPK蛋白激酶对盐胁迫的应答反应,本研究以甜菜M14品系为材料,使用特异性引物通过聚合酶链式反应进行扩增,获得BvM14-STPK基因cDNA全长,并进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR探究该基因响应盐胁迫的表达分析。生物信息学分析结果表明,BvM14-STPK基因cDNA全长1668 bp,包含1527 bp的最大ORF,编码508个氨基酸;BvM14-STPK蛋白激酶具有典型的蛋白激酶保守结构域。实时荧光定量PCR结果表明,BvM14-STPK基因在甜菜M14品系叶、根中均有广泛表达,叶中的表达量高于根中。该基因在200、400 mmol/L NaCl处理下,在叶片和根中呈现不同的表达状态,表明该基因可以应答盐胁迫,但在不同组织中应答盐胁迫的表达量存在差异。本项研究在挖掘甜菜M14品系优质基因和提高栽培甜菜抗逆性等方面具有重要指导意义,为进一步开展甜菜遗传改良工作奠定基础。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-STPK 生物信息学分析 荧光定量PCR 盐胁迫
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-Tpx基因克隆及原核表达体系下应答氧化胁迫功能的初步研究 被引量:2
8
作者 张庭跃 赵晨曦 +1 位作者 陈思学 李洪丽 《中国农学通报》 2020年第32期30-38,共9页
为了研究甜菜M14品系BvM14-Tpx基因的抗氧化功能,本试验以带有野生白花甜菜第9号染色体的单体附加系M14品系为试验材料,利用RACE技术获得甜菜M14品系硫氧还蛋白过氧化物酶基因(BvM14-Tpx) cDNA全长,对其进行生物信息学分析,利用Real-tim... 为了研究甜菜M14品系BvM14-Tpx基因的抗氧化功能,本试验以带有野生白花甜菜第9号染色体的单体附加系M14品系为试验材料,利用RACE技术获得甜菜M14品系硫氧还蛋白过氧化物酶基因(BvM14-Tpx) cDNA全长,对其进行生物信息学分析,利用Real-time PCR和半定量RT-PCR技术对该基因进行组织特异性表达分析,在原核表达体系下进行BvM14-Tpx基因应答氧化胁迫研究。生物信息学分析结果表明,BvM14-Tpx基因cDNA全长为1044 bp,包含最大的ORF为489 bp,编码162个氨基酸;含有过氧化物酶Ⅱ(PrxⅡ)型的保守结构域;BvM14-Tpx蛋白与豌豆(Pisum sativum L.)和苜蓿(Medicago truncatula L.)中Tpx蛋白的亲缘性较高。组织特异性表达分析结果表明,BvM14-Tpx基因在甜菜M14品系各组织表达量从高到低的顺序是根、茎、叶、花。通过原核表达体系下BvM14-Tpx基因应答氧化胁迫的研究,表明BvM14-Tpx基因能够提高大肠杆菌对于环境中氧化胁迫的适应能力,减轻H2O2对细菌生长的抑制。本研究对挖掘甜菜M14品系优质基因,提高甜菜对于非生物胁迫的抗性以及开展甜菜遗传改良工作具有重要意义。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 硫氧还蛋白过氧化物酶基因 生物信息学 原核表达 氧化胁迫
下载PDF
盐胁迫下甜菜M14品系膜蛋白的提取和检验 被引量:2
9
作者 潘钰 李金娜 +1 位作者 陈思学 李海英 《黑龙江大学工程学报》 2013年第2期45-49,共5页
盐胁迫是限制植物生长、降低植物产量的主要非生物胁迫之一,膜蛋白是盐胁迫时细胞最先受到危害的部位,且丰度低、疏水性强水溶性不好,且大部分膜蛋白存在糖基化、磷酸化等翻译后修饰,造成膜蛋白的微观不均一性,研究盐胁迫下膜蛋白的变... 盐胁迫是限制植物生长、降低植物产量的主要非生物胁迫之一,膜蛋白是盐胁迫时细胞最先受到危害的部位,且丰度低、疏水性强水溶性不好,且大部分膜蛋白存在糖基化、磷酸化等翻译后修饰,造成膜蛋白的微观不均一性,研究盐胁迫下膜蛋白的变化将有利于研究植物耐盐机制。甜菜M14品系是研究植物耐盐性的很好的材料,提取盐胁迫下甜菜M14品系叶片及根的膜蛋白,定量后进行Western Blot鉴定,检验膜蛋白的质量,为后续利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术研究甜菜M14品系盐胁迫下差异表达膜蛋白质奠定基础。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 盐胁迫 膜蛋白 WESTERN BLOT
下载PDF
转录因子BvM14-GAI耐盐功能研究 被引量:1
10
作者 马慧敏 孙培琳 马春泉 《中国农学通报》 2021年第34期34-42,共9页
转录因子在植物应答逆境胁迫过程中发挥着重要作用,GAI蛋白是植物转录因子家族的重要一员,对其研究主要集中在光响应机制领域,而该蛋白响应耐盐机制研究报道较少。实验室前期已经获得甜菜M14品系盐胁迫转录组中上调表达基因BvM14-GAI的c... 转录因子在植物应答逆境胁迫过程中发挥着重要作用,GAI蛋白是植物转录因子家族的重要一员,对其研究主要集中在光响应机制领域,而该蛋白响应耐盐机制研究报道较少。实验室前期已经获得甜菜M14品系盐胁迫转录组中上调表达基因BvM14-GAI的cDNA全长,本研究试图阐明该基因参与盐胁迫的功能。通过构建该基因植物表达载体,利用农杆菌介导花序浸染法转化拟南芥野生型和GAI基因突变株,检测150 mmol/L NaCl胁迫下异源表达和异源互补拟南芥植株的表型和生理生化指标。0 mmol/L NaCl处理时,以拟南芥野生型和GAI基因突变株为对照,异源表达和异源互补植株的根长、鲜重和干重均显著低于对照,说明BvM14-GAI基因为生长负调控因子;150 mmol/L NaCl胁迫处理后的根长、鲜重、干重及K+/Na+差异不显著,但甜菜碱、SOD和POD酶活性的含量显著增加,表明转录因子BvM14-GAI通过增强渗透调节和抗氧化酶系统提高异源表达和异源互补拟南芥植株的耐盐功能。研究结果不仅拓展了植物GAI基因响应非生物胁迫的功能,而且对阐明甜菜M14品系耐盐分子机制和培育耐盐作物品系具有一定研究价值。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-GAI基因 盐胁迫 转录因子 抗氧化酶
下载PDF
BvM14-GAI基因的克隆及亚细胞定位 被引量:1
11
作者 马春泉 孙培琳 李海英 《中国农学通报》 2020年第16期28-33,共6页
GAI蛋白属于GRAS家族中的DELLA亚家族,参与植物发育、光合、抗逆等重要的植物生长过程。实验室前期在盐胁迫的转录组数据中发现甜菜M14品系GAI基因(BvM14-GAI)受盐胁迫上调表达,为了进行该基因生物学功能的研究,本研究以甜菜M14品系为材... GAI蛋白属于GRAS家族中的DELLA亚家族,参与植物发育、光合、抗逆等重要的植物生长过程。实验室前期在盐胁迫的转录组数据中发现甜菜M14品系GAI基因(BvM14-GAI)受盐胁迫上调表达,为了进行该基因生物学功能的研究,本研究以甜菜M14品系为材料,通过PCR技术获得BvM14-GAI基因cDNA全长序列,并进行生物信息学以及亚细胞定位分析。研究成功获得了BvM14-GAI基因cDNA序列;生物信息学分析显示,BvM14-GAI基因开放阅读框为1824 bp(包括终止密码子),编码607个氨基酸,理论分子量为66 kDa,等电点为5.37;蛋白多重序列比对和系统进化树分析显示,BvM14-GAI蛋白与菠菜(Spinacia oleracea)和藜麦(Chenopodium quinoa)中GAI蛋白亲缘关系最近;亚细胞定位预测显示定位在细胞核。进一步将BvM14-GAI基因与pCAMIA2300-eYFP载体重组,构建亚细胞定位载体,利用冻融法转化农杆菌EHA105,进行烟草注射,结果显示BvM14-GAI蛋白定位在细胞核。本研究成功获得BvM14-GAI基因的cDNA全长,并确定该基因的烟草亚细胞定位在细胞核中,结果为后续该基因功能的研究提供了重要参考。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-GAI基因 生物信息学分析 亚细胞定位
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-STPK蛋白激酶在原核表达系统中的低温诱导表达及纯化
12
作者 于冰 刘祥 李海英 《中国农学通报》 2019年第3期58-61,共4页
为获得纯化的BvM14-STPK蛋白激酶,采用低温16℃,0.5 mmol/L IPTG对转Bv M14-STPK的大肠杆菌进行诱导,利用Ni2+亲和层析技术对菌液上清进行纯化,并利用SDS-PAGE对纯化蛋白进行检测。结果表明37℃,0.5 mmol/L IPTG诱导后,BvM14-STPK蛋白... 为获得纯化的BvM14-STPK蛋白激酶,采用低温16℃,0.5 mmol/L IPTG对转Bv M14-STPK的大肠杆菌进行诱导,利用Ni2+亲和层析技术对菌液上清进行纯化,并利用SDS-PAGE对纯化蛋白进行检测。结果表明37℃,0.5 mmol/L IPTG诱导后,BvM14-STPK蛋白以包涵体形式存在,不能对目的蛋白进行纯化分析研究;通过优化诱导条件,在低温16℃,0.5 mmol/L IPTG过夜诱导,在上清中获得大量BvM14-STPK可溶性目的蛋白,对菌液上清纯化并经SDS-PAGE检测到BvM14-STPK目的蛋白。在目的蛋白纯化过程中,发现150 mmol/L咪唑洗脱液纯化BvM14-STPK目的蛋白效果最好。本研究成功纯化出目的蛋白BvM14-STPK。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-STPK 低温诱导 纯化
下载PDF
甜菜M14品系BvM14-RIN4基因的克隆及应答盐胁迫分析
13
作者 贾惠旭 李海英 端木慧子 《中国农学通报》 2021年第14期27-33,共7页
为了研究甜菜单体附加系M14品系RIN4基因耐盐功能,本研究以甜菜M14品系为实验材料,通过PCR技术获得BvM14-RIN4基因cDNA全长序列,对BvM14-RIN4基因进行了生物信息学分析、组织特异性和应答盐胁迫分析。BvM14-RIN4基因ORF长度为264 bp,编... 为了研究甜菜单体附加系M14品系RIN4基因耐盐功能,本研究以甜菜M14品系为实验材料,通过PCR技术获得BvM14-RIN4基因cDNA全长序列,对BvM14-RIN4基因进行了生物信息学分析、组织特异性和应答盐胁迫分析。BvM14-RIN4基因ORF长度为264 bp,编码87个氨基酸,蛋白分子量为9.67 kDa,理论等电点为9.64,初步鉴定该蛋白为亲水性蛋白;BvM14-RIN4蛋白质二级结构主要由延伸链和无规卷曲组成;BvM14-RIN4蛋白质三级结构预测出该蛋白的保守结构域和疏水区;系统进化树分析结果表明BvM14-RIN4蛋白与菠菜SoRIN4和藜麦CqRIN4蛋白亲缘关系最近;荧光定量PCR结果显示,BvM14-RIN4基因在根中表达量是叶的2.26倍,说明其具有组织特异性;该基因在200 mmol/L NaCl处理后的根中上调表达,说明它参与甜菜M14品系应答盐胁迫过程。本研究在挖掘甜菜M14品系优质基因和开展甜菜遗传改良工作等方面具有重要意义,为后续该基因的功能研究提供了重要参考。 展开更多
关键词 甜菜M14品系 BvM14-RIN4 基因克隆 生物信息学分析 荧光定量PCR
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部