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分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用
被引量:
5
1
作者
孙浩
蒋勇军
+1 位作者
俞庆森
邹建卫
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期635-639,共5页
用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一...
用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键,无法维持磷酸根转移所需的线性关系;由于失去了氢键网络的稳定作用,Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动,并导致Arg96的侧链发生偏转,使Arg96无法保持与Arg180和Lys205之间正常的相对位置,最终影响GSK-3β与底物的结合.
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关键词
糖原合成酶激酶-3Β
结构水分子
分子动力学模拟
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职称材料
题名
分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用
被引量:
5
1
作者
孙浩
蒋勇军
俞庆森
邹建卫
机构
浙江大学化学系
浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期635-639,共5页
基金
国家高技术研究发展计划(863)(2007AA02Z301)
国家自然科学基金(20803063)资助项目
文摘
用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键,无法维持磷酸根转移所需的线性关系;由于失去了氢键网络的稳定作用,Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动,并导致Arg96的侧链发生偏转,使Arg96无法保持与Arg180和Lys205之间正常的相对位置,最终影响GSK-3β与底物的结合.
关键词
糖原合成酶激酶-3Β
结构水分子
分子动力学模拟
Keywords
Glycogen
synthase
kinase-3β
structural
water
molecule
molecul
ar
dynamics
simulation
分类号
O629.8 [理学—有机化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用
孙浩
蒋勇军
俞庆森
邹建卫
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
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