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菠菜NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析
被引量：
3
1
作者
折红兵
范桂彦
+4 位作者
张合龙
王晓武
武剑
钱伟
徐兆生
《中国蔬菜》
北大核心
2017年第5期26-33,共8页
依据已知NBS-LRR类抗病基因的P-loop和GLPL两个保守结构域设计简并引物,对抗菠菜霜霉病商业杂交种RZ51-147、自交系12S3和12S4的基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,共获得23条具有完整开放阅读框且含有NBS结构的抗病基因同源序列(re...
依据已知NBS-LRR类抗病基因的P-loop和GLPL两个保守结构域设计简并引物,对抗菠菜霜霉病商业杂交种RZ51-147、自交系12S3和12S4的基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,共获得23条具有完整开放阅读框且含有NBS结构的抗病基因同源序列(resistancegeneanalogs,RGAs),编号为SP1~SP17、SP19~SP24,其在NCBI中的登录号为KX914865~KX914887。核苷酸比较分析结果表明,这23条RGAs大多与甜菜中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有较高的同源性,其中SP1、SP2、SP5、SP6、SP10、SP11、SP12、SP13等8条序列均与甜菜RF45类抗病蛋白有着86%以上的同源性;SP3、SP4、SP8、SP9、SP24等5条序列与甜菜RPP13类抗病蛋白的同源性在85%以上,与向日葵抗霜霉病基因PI8相应区域的氨基酸序列相似性为32.20%~33.52%,且在进化树上聚为一类,推测其可能与抗霜霉病相关。同源进化分析结果表明,除SP7外,其余序列均为non-TIR-NBS-LRR类抗病基因,并与推导的氨基酸序列多重比较结果一致。
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关键词
菠菜
抗病基因同源序列
NBS-LRR
菠菜霜霉病
下载PDF
职称材料
菠菜霜霉病菌快速分子检测方法研究
被引量：
2
2
作者
李京
张祥林
+2 位作者
王翀
李亚伟
张小菊
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期346-351,共6页
【目的】菠菜霜霉病,由专性寄生病原菌Peronospora farinosa f.sp.Spinaciae引起,是世界上菠菜Spinacia oleracea种植中最为重要的经济型病害。建立菠菜霜霉病菌快速分子检测方法。【方法】将菠菜霜霉病菌进行显微镜的形态鉴定;提取DNA...
【目的】菠菜霜霉病,由专性寄生病原菌Peronospora farinosa f.sp.Spinaciae引起,是世界上菠菜Spinacia oleracea种植中最为重要的经济型病害。建立菠菜霜霉病菌快速分子检测方法。【方法】将菠菜霜霉病菌进行显微镜的形态鉴定;提取DNA、PCR扩增、克隆、酶切、测序、序列比对与分析;采用巢式PCR技术检测菠菜霜霉病:第一轮采用通用引物ITS1/ITS4,第二轮采用特异性引物SMPF/SMPR。【结果】该菌与霜霉属的形态特征描述一致,确定菠菜患有霜霉病;测序结果经Blast比对分析与Peronospora effusa同源性达100%;巢式PCR技术也特异性的检测到了菠菜霜霉病菌。【结论】建立针对菠菜霜霉病的快速分子检测技术。
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关键词
菠菜霜霉病
酶切
巢式PCR
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职称材料
题名
菠菜NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析
被引量：
3
1
作者
折红兵
范桂彦
张合龙
王晓武
武剑
钱伟
徐兆生
机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
中蔬种业科技(北京)有限公司
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2017年第5期26-33,共8页
基金
国家"十二五"科技支撑计划项目(2012BAD02B04
2014BAD01B08)
+2 种基金
国家自然科学基金项目(31401872)
中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS)
农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目
文摘
依据已知NBS-LRR类抗病基因的P-loop和GLPL两个保守结构域设计简并引物,对抗菠菜霜霉病商业杂交种RZ51-147、自交系12S3和12S4的基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,共获得23条具有完整开放阅读框且含有NBS结构的抗病基因同源序列(resistancegeneanalogs,RGAs),编号为SP1~SP17、SP19~SP24,其在NCBI中的登录号为KX914865~KX914887。核苷酸比较分析结果表明,这23条RGAs大多与甜菜中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有较高的同源性,其中SP1、SP2、SP5、SP6、SP10、SP11、SP12、SP13等8条序列均与甜菜RF45类抗病蛋白有着86%以上的同源性;SP3、SP4、SP8、SP9、SP24等5条序列与甜菜RPP13类抗病蛋白的同源性在85%以上,与向日葵抗霜霉病基因PI8相应区域的氨基酸序列相似性为32.20%~33.52%,且在进化树上聚为一类,推测其可能与抗霜霉病相关。同源进化分析结果表明,除SP7外,其余序列均为non-TIR-NBS-LRR类抗病基因,并与推导的氨基酸序列多重比较结果一致。
关键词
菠菜
抗病基因同源序列
NBS-LRR
菠菜霜霉病
Keywords
Spinacia
oleracea
L.
Resistance
gene
analogs
Nucleotide
binding
site-leucine
rich
repeat
(NBS-LRR)
spinach
downy
mildew
分类号
S436.36 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
菠菜霜霉病菌快速分子检测方法研究
被引量：
2
2
作者
李京
张祥林
王翀
李亚伟
张小菊
机构
新疆出入境检验检疫局
新疆农业大学农学院
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期346-351,共6页
基金
国家质检总局科研项目(201310091)~~
文摘
【目的】菠菜霜霉病,由专性寄生病原菌Peronospora farinosa f.sp.Spinaciae引起,是世界上菠菜Spinacia oleracea种植中最为重要的经济型病害。建立菠菜霜霉病菌快速分子检测方法。【方法】将菠菜霜霉病菌进行显微镜的形态鉴定;提取DNA、PCR扩增、克隆、酶切、测序、序列比对与分析;采用巢式PCR技术检测菠菜霜霉病:第一轮采用通用引物ITS1/ITS4,第二轮采用特异性引物SMPF/SMPR。【结果】该菌与霜霉属的形态特征描述一致,确定菠菜患有霜霉病;测序结果经Blast比对分析与Peronospora effusa同源性达100%;巢式PCR技术也特异性的检测到了菠菜霜霉病菌。【结论】建立针对菠菜霜霉病的快速分子检测技术。
关键词
菠菜霜霉病
酶切
巢式PCR
Keywords
spinach
downy
mildew
enzyme
digestion
nested-PCR
分类号
S41 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
菠菜NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析
折红兵
范桂彦
张合龙
王晓武
武剑
钱伟
徐兆生
《中国蔬菜》
北大核心
2017
3
下载PDF
职称材料
2
菠菜霜霉病菌快速分子检测方法研究
李京
张祥林
王翀
李亚伟
张小菊
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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职称材料
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