环境DNA(eDNA)技术在水生生态系统中的应用研究进展 被引量：38

1

作者 单秀娟 李苗 王伟继 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2018年第3期23-29,共7页

环境DNA(Environmental DNA,eDNA)是指从皮肤、黏液、唾液、精子、分泌物、卵、粪便、尿液、血液、根、叶、果实、花粉和腐烂体等释放出来的、普遍存在的、游离的DNA分子。环境DNA技术是指从环境样品(土壤、沉积物和水体等)中直接提取DN... 环境DNA(Environmental DNA,eDNA)是指从皮肤、黏液、唾液、精子、分泌物、卵、粪便、尿液、血液、根、叶、果实、花粉和腐烂体等释放出来的、普遍存在的、游离的DNA分子。环境DNA技术是指从环境样品(土壤、沉积物和水体等)中直接提取DNA片段后利用测序技术进行定性或定量分析的方法。近年来随着分子生物学的发展,环境DNA技术已经成为一种新的水生生物调查方法,其主要被用来进行生物入侵的防治、濒危物种的保护、生物多样性的评价以及生物量的评估等。作者综述了环境DNA技术的发展历程、操作流程、在水生生态系统中的应用、优势以及存在的问题,同时对环境DNA在生态学领域中的应用前景进行了展望。 展开更多

关键词 环境DNA 物种监测 生物多样性 生物量评估

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近海鱼类多样性调查新方法—环境DNA分析技术 被引量：14

2

作者 高天翔 陈治 王晓艳 《浙江海洋大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2018年第1期1-7,共7页

由于受传统调查手段的限制,长期以来国内缺乏快速、有效的方法对近海鱼类多样性进行准确评估。环境DNA是一种稳定、高效、高灵敏度的物种监测新技术。近年来,已成为监测物种多样性、生物量及其时空分布的重要手段。本文首先综述了环境DN... 由于受传统调查手段的限制,长期以来国内缺乏快速、有效的方法对近海鱼类多样性进行准确评估。环境DNA是一种稳定、高效、高灵敏度的物种监测新技术。近年来,已成为监测物种多样性、生物量及其时空分布的重要手段。本文首先综述了环境DNA分析技术的概念、方法及该技术在水生生物调查和物种多样性分析中的研究现状。随后以舟山近海为典型研究区域,探讨了环境DNA metabarcoding技术在该海域鱼类多样性调查研究中的实际意义和应用前景。 展开更多

关键词 环境DNA 生物多样性 物种监测 舟山海域 metabarcoding

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环境DNA及其在水生生物多样性调查中的应用 被引量：10

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作者 葛玉双 闫永斌 程起群 《渔业信息与战略》 2020年第1期55-62,共8页

环境DNA(environmental DNA,eDNA)是指生物释放到水、空气及土壤等环境中的短DNA片段。这些eDNA可能来源于生物体表皮细胞经皮肤、尿液、粪便、粘液等释放到环境中的胞内DNA,或者是细胞死亡后裂解释放到环境中的胞外DNA。与传统调查方... 环境DNA(environmental DNA,eDNA)是指生物释放到水、空气及土壤等环境中的短DNA片段。这些eDNA可能来源于生物体表皮细胞经皮肤、尿液、粪便、粘液等释放到环境中的胞内DNA,或者是细胞死亡后裂解释放到环境中的胞外DNA。与传统调查方法相比,环境DNA调查法具有准确率高、对资源和环境友好、稀有种易检测、非入侵式调查等优点,近年来已在重现古生物群落演替、物种监测及预测、生物多样性调查和种群动态研究等诸多方面得到较为广泛的应用。通过对环境DNA特性、检测方法以及在水生生物多样性调查中的应用及应用中存在的不足等进行了综述,以期为进一步开展环境DNA检测提供有益的借鉴。 展开更多

关键词 环境DNA 非入侵式 物种监测 生物多样性 资源调查

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环境DNA技术在河流生态系统中的应用研究进展 被引量：9

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作者 陶洁 曹阳 左其亭 《水资源保护》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期150-156,共7页

利用CiteSpace文献数据可视化软件分析了环境DNA技术在河流生态系统中的应用研究发文数量、发文趋势、关键词频次和突现状况;对环境DNA技术在河流生态中的应用研究重点进行了综述,主要包括生物入侵和珍稀物种检测与监测、生物量估测、... 利用CiteSpace文献数据可视化软件分析了环境DNA技术在河流生态系统中的应用研究发文数量、发文趋势、关键词频次和突现状况;对环境DNA技术在河流生态中的应用研究重点进行了综述,主要包括生物入侵和珍稀物种检测与监测、生物量估测、生物多样性检测与分析和产卵繁殖调查等,指出环境DNA技术未来在河流生态系统中的应用应着重在环境DNA浓度与影响因素的量化关系、公共数据库的丰富、通用引物的设计以及环境DNA技术全过程标准的制定等方面。 展开更多

关键词 环境DNA 河流生态系统 生物多样性 生物入侵 物种监测 文献计量

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环境DNA技术在水域环境中的应用进展 被引量：1

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作者 刘科均 赖锡勋 +2 位作者 向劲 桂雨婷 葛玲瑞 《水产养殖》 CAS 2023年第11期16-21,27,共7页

简述了环境DNA发展进程,介绍了环境DNA应用领域,包括物种及物种多样性研究、生物量评估、珍稀物种和入侵物种监测。归纳了环境DNA研究方法,样品的采集与保存、eDNA捕获、提取、分析。指出了eDNA技术的优势和存在的问题。提出,在今后的环... 简述了环境DNA发展进程,介绍了环境DNA应用领域,包括物种及物种多样性研究、生物量评估、珍稀物种和入侵物种监测。归纳了环境DNA研究方法,样品的采集与保存、eDNA捕获、提取、分析。指出了eDNA技术的优势和存在的问题。提出,在今后的环境DNA研究中,一方面要大力发展并推广eDNA技术;另一方面应尽快制定一个统一的eDNA监测方法标准化框架,将eDNA技术和传统调查方法相结合,才能更好地对水生生物进行监测,在水生生态文明建设中发挥更为重要的作用。 展开更多

关键词 环境DNA 水生生态系统 渔业资源 物种监测

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基于环境DNA的日本河流生物多样性文献计量分析及其进展 被引量：1

6

作者 贺凯 刘泽军 +3 位作者 胡茂川 刘丙军 郝爱民 井芹宁 《西北水电》 2022年第5期57-65,共9页

传统生物监测方法在物种监测尤其是生活习性具有时空变化的物种监测具有局限性,同时作为一种强介入性的手段将对个体生物、种群和栖息地环境造成不可逆的破坏性影响。环境DNA技术作为一种前沿分子生物学方法,通过PCR和基因测序进行物种... 传统生物监测方法在物种监测尤其是生活习性具有时空变化的物种监测具有局限性,同时作为一种强介入性的手段将对个体生物、种群和栖息地环境造成不可逆的破坏性影响。环境DNA技术作为一种前沿分子生物学方法,通过PCR和基因测序进行物种定性或定量分析,使用非介入性采样方法,能对传统生物监测方法进行一定补充甚至在技术发展的前提下取代当前传统监测方法,在生物环境评估方面具有重大潜力。目前,环境DNA技术主要应用于濒危物种的监测、生物多样性调查、外来物种入侵和生物量评估等方面。日本对环境DNA技术的研究和应用起步较早,其针对环境DNA技术的检测条件和引物特异性等因素进行了广泛研究,并制定了一系列环境DNA在生物多样性监测中的相关标准及其研究与应用推广。通过对环境DNA技术操作流程和影响因素进行介绍的基础上,梳理总结了环境DNA技术在日本水生态系统中生物多样性、外来和濒危物种监测等方面的研究及其应用案例,结合文献计量学研究方法分析研究趋势和热点,为后续我国在水生态系统研究提供素材和参考。 展开更多

关键词 环境DNA 物种监测 生物多样性 水生生态系统

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DNA宏条形码技术在海洋浮游动物多样性和生态学研究中的应用 被引量：1

7

作者 冯芸芝 孙栋 +1 位作者 邵倩文 王春生 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第21期8544-8554,共11页

浮游动物是海洋生态系统的关键类群,其覆盖门类广泛,多样性高。传统形态鉴定技术需要检测人员具备专业的形态鉴定知识,且费时费力。宏条形码技术无需分离生物个体,而是提取拖网采集到的浮游动物混合样本的总DNA,或者水体中的环境DNA (eD... 浮游动物是海洋生态系统的关键类群,其覆盖门类广泛,多样性高。传统形态鉴定技术需要检测人员具备专业的形态鉴定知识,且费时费力。宏条形码技术无需分离生物个体,而是提取拖网采集到的浮游动物混合样本的总DNA,或者水体中的环境DNA (eDNA),依托高通量测序平台测序,能够实现对大规模样本快速、准确、经济的分析,在海洋浮游动物生态学研究中得到越来越广泛的应用。分析了DNA宏条形码技术常用的核糖体和线粒体分子标记,在浮游动物多样性和数量研究中的可靠性和不足,并给出在海洋浮游动物群落监测,食物关系分析及生物入侵早期预警等研究中的应用。未来,开发多基因片段组合条形码,发展完备的参考数据库及实现准确的量化研究是DNA宏条形码技术发展的重要方向。 展开更多

关键词 浮游动物 宏条形码 环境DNA 多样性 物种监测

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物种相对多度指数在红外相机数据分析中的应用及局限 被引量：61

8

作者 陈立军 肖文宏 肖治术 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期243-248,共6页

多度是衡量物种种群数量的参数之一,多度的动态及其影响因素是种群生态学研究的经典问题。物种相对多度指数(relative abundance index,RAI)作为一种简单、便利的指标,广泛应用于动物本底清查中。但RAI易受物种自身特征、探测率和环境... 多度是衡量物种种群数量的参数之一,多度的动态及其影响因素是种群生态学研究的经典问题。物种相对多度指数(relative abundance index,RAI)作为一种简单、便利的指标,广泛应用于动物本底清查中。但RAI易受物种自身特征、探测率和环境因素的影响,需要结合其他物种数量分析方法,以验证其与种群大小的相关性。随着红外相机技术在野生动物调查中的广泛应用,用红外相机数据估计动物种群数量的研究越来越多。目前,基于红外相机数据计算RAI的方法有多种,不同计算方法和应用范围存在差异,亟需对现有方法和应用进行梳理。本文综述了根据红外相机数据计算物种相对多度的4种主要方法:(1)拍摄一张有效照片所需要的天数;(2)基于单位调查强度的物种拍摄率;(3)每个位点每天的物种拍摄率;(4)某一物种的照片数占所有物种的比例。总结了我国野生动物监测调查中采用红外相机方法计算RAI的应用现状。国内的研究主要采用第2种和第4种计算方法,其中约72.5%的研究论文应用第2种计算方法,而第4种方法一般适用于群落中的物种组成比较。我们建议根据红外相机数据计算RAI时尽量使用第2种计算方法,这有助于研究或管理人员对不同研究中的物种RAI进行比较分析。 展开更多

关键词 种群数量调查 相对多度指数 红外相机 物种编目

原文传递

“高分五号”高光谱互花米草遥感识别与制图研究 被引量：10

9

作者 任广波 周莉 +5 位作者 梁建 路峰 王安东 王建步 李晓敏 马毅 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期312-326,共15页

基于高分五号卫星上搭载的世界上首个同时具有大刈幅、宽谱段的高光谱遥感载荷获取的遥感图像,以黄河三角洲滨海湿地为研究区,开展了对外来入侵物种互花米草的分类和制图。通过对比代表不同分类思想的SVM,SCM,ANN和MLC方法在全波段参与... 基于高分五号卫星上搭载的世界上首个同时具有大刈幅、宽谱段的高光谱遥感载荷获取的遥感图像,以黄河三角洲滨海湿地为研究区,开展了对外来入侵物种互花米草的分类和制图。通过对比代表不同分类思想的SVM,SCM,ANN和MLC方法在全波段参与分类和特征波段分类中的结果,发现SVM分类方法在不同的数据中均能得到最好的分类效果,总体分类精度达到了94.23%。虽然利用特征波段的分类结果总体精度较全波段低(约3%),但更节省计算资源和计算时间。根据分类结果,在研究区内互花米草的分布面积达到了3863.16 hm^(2),占调查区域潮间带总面积的21.23%,但却占据了海岸线总长度的51.47%,其中121平台以北海岸线被100%占据,而该平台以南的海岸却几乎没有互花米草。结合现场调查数据和NDVI等植被指数的分析结果,发现互花米草的生长状态好坏与其淤泥底质的形成时间点相关,即越新形成的淤泥质潮滩上互花米草的长势越好,且好、中、差三种类型互花米草的面积比率是7∶4∶3,表明了该区域的互花米草仍有较为旺盛的生命力和入侵扩展能力。 展开更多

关键词 高分五号卫星 高光谱遥感 入侵物种监测 黄河三角洲

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水质监测的重要指示生物——毛翅目幼虫 被引量：4

10

作者 李再培 周晏敏 《黑龙江环境通报》 2001年第1期77-78,共2页

通过对松花江、嫩江两大河流中毛翅目幼虫调查 ,共采集到毛翅目幼虫40种 ,它们隶属14科。

关键词 毛翅目幼虫 指示生物 生物监测 松花江 嫩江

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基于混沌变异粒子群的物种物联网监测技术研究

11

作者 林桂亚 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2012年第4期1371-1373,共3页

研究了各类生物物种及其生存环境的监测和保护物联网技术。针对已有的生物物种监测系统存在大规模监测数据冗余度高、汇聚融合粗糙、系统部署及维护较难等问题,提出了一种基于混沌变异粒子群的物联网物种监测技术。该技术根据监测区域... 研究了各类生物物种及其生存环境的监测和保护物联网技术。针对已有的生物物种监测系统存在大规模监测数据冗余度高、汇聚融合粗糙、系统部署及维护较难等问题,提出了一种基于混沌变异粒子群的物联网物种监测技术。该技术根据监测区域内物种种类进行区分建立监测分簇,构建监测子系统,结合种群状态及其环境变化进行粒子变异操作,子系统间通过移动代理节点汇聚和转发数据,对全局数据实施混沌扰动以达到高精度数据挖掘和融合。此外,对于监测节点设计了高效和具有自判读功能模块,使系统具有自适应调节能力。仿真实验和数学分析表明,该技术对复杂物种监测实现了自适应维护和全局数据融合判读功能,有效改善了通信性能。 展开更多

关键词 物联网 物种监测 粒子群 混沌变异

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遥感图像变化检测在外来植物种入侵上的应用 被引量：1

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作者 热比古丽.艾散 贾振红 +2 位作者 覃锡忠 杨杰 胡英杰 《激光杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期29-30,共2页

外来植物种入侵给生态系统带来了诸多正面和负面影响,并成为了当前学术界关注的热点问题之一。为了有效地监测和控制外来入侵植物以及合理地开发利用外来入侵植物,变害为利,需要对外来入侵植物的空间分布和动态变化进行监测。本文将用... 外来植物种入侵给生态系统带来了诸多正面和负面影响,并成为了当前学术界关注的热点问题之一。为了有效地监测和控制外来入侵植物以及合理地开发利用外来入侵植物,变害为利,需要对外来入侵植物的空间分布和动态变化进行监测。本文将用于处理遥感图像变化检测时所采用的非下采样Contourlet变换和模糊C均值聚类算法相结合的方法,引用到生物物种入侵的动态监测,已取得更佳的检测结果。 展开更多

关键词 外来入侵植物 动态监测 非下采样CONTOURLET变换 模糊C均值聚类算法

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