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基于高通量测序分析牛粪堆肥中细菌群落动态变化
被引量:
19
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作者
许修宏
成利军
+7 位作者
许本姝
门梦琪
孙瑜
张文浩
邓利廷
姜欣
武晓桐
盛思远
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期10-20,共11页
文章以奶牛粪便和玉米秸秆作好氧堆肥,堆肥持续36 d。采用16S rRNA基因高通量测序技术分析堆肥过程中细菌群落特征,通过Alpha多样性分析、样本层级聚类分析和距离热图(Heatmap)分析,结果表明,堆肥过程中细菌群落结构发生显著变化。门分...
文章以奶牛粪便和玉米秸秆作好氧堆肥,堆肥持续36 d。采用16S rRNA基因高通量测序技术分析堆肥过程中细菌群落特征,通过Alpha多样性分析、样本层级聚类分析和距离热图(Heatmap)分析,结果表明,堆肥过程中细菌群落结构发生显著变化。门分类水平细菌群落结构分析表明,变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)在堆肥前期和高温期相对丰度较高,酸酐菌门(Acidobacteria)在堆肥后期相对丰度较高;属分类水平细菌群落结构分析表明,在堆肥初始阶段各属相对丰度相近,环脂酸芽孢杆菌属(Tumebacillus)在堆肥升温期占优势,肠杆菌属(Enterobacter)、未命名细菌(norank_c_OPB54)和玫瑰弯菌属(Roseiflexus)为堆肥高温期优势类群,类似芽球菌属(Blastocatella)出现在堆肥高温期末期,在降温期和腐熟期成为优势菌属。Spearman相关性分析表明,除肠杆菌属(Enterobacter)、未命名细菌(norank_c_OPB54)、假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)外剩余11个属均与含水率、有机物降解率、C/N和NH_4^+-N/NO_3^--N之间呈显著相关,肠杆菌属与pH呈极显著正相关(P<0.001),未命名细菌(norank_c_OPB54)与温度呈极显著正相关(P<0.001)。研究表明,在牛粪堆肥期间细菌群落结构发生显著变化,细菌群落结构变化与堆肥理化因子存在相关关系。
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关键词
奶牛粪便
高通量测序
理化参数
细菌群落
spearman
相关性
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职称材料
题名
基于高通量测序分析牛粪堆肥中细菌群落动态变化
被引量:
19
1
作者
许修宏
成利军
许本姝
门梦琪
孙瑜
张文浩
邓利廷
姜欣
武晓桐
盛思远
机构
东北农业大学资源与环境学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期10-20,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31372351
31672469)
文摘
文章以奶牛粪便和玉米秸秆作好氧堆肥,堆肥持续36 d。采用16S rRNA基因高通量测序技术分析堆肥过程中细菌群落特征,通过Alpha多样性分析、样本层级聚类分析和距离热图(Heatmap)分析,结果表明,堆肥过程中细菌群落结构发生显著变化。门分类水平细菌群落结构分析表明,变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)在堆肥前期和高温期相对丰度较高,酸酐菌门(Acidobacteria)在堆肥后期相对丰度较高;属分类水平细菌群落结构分析表明,在堆肥初始阶段各属相对丰度相近,环脂酸芽孢杆菌属(Tumebacillus)在堆肥升温期占优势,肠杆菌属(Enterobacter)、未命名细菌(norank_c_OPB54)和玫瑰弯菌属(Roseiflexus)为堆肥高温期优势类群,类似芽球菌属(Blastocatella)出现在堆肥高温期末期,在降温期和腐熟期成为优势菌属。Spearman相关性分析表明,除肠杆菌属(Enterobacter)、未命名细菌(norank_c_OPB54)、假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)外剩余11个属均与含水率、有机物降解率、C/N和NH_4^+-N/NO_3^--N之间呈显著相关,肠杆菌属与pH呈极显著正相关(P<0.001),未命名细菌(norank_c_OPB54)与温度呈极显著正相关(P<0.001)。研究表明,在牛粪堆肥期间细菌群落结构发生显著变化,细菌群落结构变化与堆肥理化因子存在相关关系。
关键词
奶牛粪便
高通量测序
理化参数
细菌群落
spearman
相关性
热图
Keywords
cow manure
high throughput sequencing
physicochemical parameter
bacterial community
spearman
correlation heatmap
分类号
S141.4 [农业科学—肥料学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序分析牛粪堆肥中细菌群落动态变化
许修宏
成利军
许本姝
门梦琪
孙瑜
张文浩
邓利廷
姜欣
武晓桐
盛思远
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
19
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职称材料
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参考文献
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