期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
云南羊肚菌rDNA的ITS序列与亲缘关系分析 被引量：28
1
作者 沈洪 陈明杰 +1 位作者 赵永昌 潘迎捷 《食用菌学报》 2007年第2期15-22,共8页
采用ITS（Internal Transcribed Spacers）序列比对技术分析了根据形态挑选的14个羊肚菌子实体（其中11个来自云南，3个来自浙江）。结果表明，云南的11个羊肚菌子实体（M1～M11）可分为4个种；高羊肚菌（Morchella elata），尖顶羊肚菌... 采用ITS（Internal Transcribed Spacers）序列比对技术分析了根据形态挑选的14个羊肚菌子实体（其中11个来自云南，3个来自浙江）。结果表明，云南的11个羊肚菌子实体（M1～M11）可分为4个种；高羊肚菌（Morchella elata），尖顶羊肚菌（Morchella conica），粗柄羊肚菌（Morchella crassipes）和大孔（宽肋）羊肚菌（Morchella　costata）。浙江的3个羊肚菌子实体（M12～M14）经鉴定为未知羊肚菌种。14个羊肚菌子实体样品和GenBank中黑脉（小顶）羊肚菌[Morchella　angusticeps（AJ698476）]、美味羊肚菌[Morchella　esculenta（AJ698475）]以及羊肚菌科常见属钟菌属Verpa　conica（AJ544206）的ITS序列聚类，以钟菌（AJ544206）作为外类群，可分为三大聚类群：高羊肚菌、大孔（宽肋）羊肚菌和黑脉（小顶）羊肚菌为第1类群（Group1）；美味羊肚菌和尖顶羊肚菌为第2类群（Group2）；粗柄羊肚菌和浙江的3个羊肚菌为第3类群（Group3）。 展开更多
关键词 羊肚菌 INTERNAL Transcribed spacers序列 相似性
下载PDF
我国不同地区白木香核糖体DNA内转录间隔区碱基序列分析 被引量：12
2
作者 申彦晶 谭雪梅 +2 位作者 赵翾 庞启华 赵树进 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期539-541,共3页
目的:研究我国不同地区白木香核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)碱基序列的差异。方法:运用PCR法对白木香的ITS(包括ITS1,5.8S,ITS2)序列扩增后直接测序,用软件CLUSTALX和MEGA分析测序结果。结果:白木香ITS区总长度为680bp,其中ITS1为24... 目的:研究我国不同地区白木香核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)碱基序列的差异。方法:运用PCR法对白木香的ITS(包括ITS1,5.8S,ITS2)序列扩增后直接测序,用软件CLUSTALX和MEGA分析测序结果。结果:白木香ITS区总长度为680bp,其中ITS1为246bp,5.8S为163bp,ITS2为271bp。ITS序列在白木香种内的变异很小,只有6个变异位点,种内遗传距离为0.0%-1.1%。结论:ITS序列的差异为鉴别不同产区白木香及其近缘种提供了依据。 展开更多
关键词 白木香 云南沉香 INTERNAL transcribed spacers序列 分子鉴别
原文传递
多杀性巴氏杆菌CRISPR-Cas系统生物信息学分析
3
作者 李佳富 莫小兵 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1742-1753,共12页
【目的】了解多杀性巴氏杆菌中CRISPR-Cas系统的结构特征及cas基因的分布,为不同CRISPR亚型的应用及多杀巴氏杆菌的抗病毒进化研究提供基础。【方法】通过CRISPRCasfinder在线网站筛选多杀性巴氏杆菌基因组中的CRISPR簇和cas基因;通过... 【目的】了解多杀性巴氏杆菌中CRISPR-Cas系统的结构特征及cas基因的分布,为不同CRISPR亚型的应用及多杀巴氏杆菌的抗病毒进化研究提供基础。【方法】通过CRISPRCasfinder在线网站筛选多杀性巴氏杆菌基因组中的CRISPR簇和cas基因;通过生物信息学方法对各亚型系统中repeat和spacer序列保守性、repeat二级结构、cas基因核苷酸序列保守性、CRISPR簇相似性等进行分析。【结果】在选取的19株多杀性巴氏杆菌基因组中均存在Ⅰ-F、Ⅱ-C、Ⅲ-A亚型CRISPR系统。在相同亚型的CRISPR系统中repeat序列有着较保守的回文重复序列,但在不同CRISPR亚型中repeat序列差异较大。Ⅱ-C亚型的tracrRNA可以与crRNA形成保守的结构。在各亚型CRISPR系统中,新获取的spacer序列可以插入到CRISPR簇的5′-端、3′-端或中间位置。通过对各菌株spacer序列分析发现,在菌株内或菌株间的CRISPR序列中均存在着相同的spacer序列,这可能与细菌在遗传进化过程中repeat-spacer发生序列重组或基因水平转移产生的趋同进化有关。【结论】19株多杀性巴氏杆菌中含有Ⅰ-F、Ⅱ-C、Ⅲ-A 3种CRISPR-Cas系统,不同CRISPR亚型中repeat序列差异较大,spacer特征性重复的分布可能与多杀性巴氏杆菌在遗传进化过程中repeat-spacer发生序列重组有关。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 CRISPR-Cas系统 repeat序列 spacer序列 生物信息学
下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部