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题名热带雨林土壤真菌18S rRNA基因多样性分析
被引量：3
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作者
赵志祥
肖敏
郑芬
梁延坡
谢丙炎
陈绵才
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机构
海南省农业科学院农业环境与植物保护研究所
海南省植物病虫害综合防控重点实验室
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第11期6378-6382,共5页
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基金
国家自然科学基金(31160024)
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文摘
[目的]探讨热带雨林土壤真菌群落结构,阐释微生物与植物之间的互作关系,以期为开发利用热带雨林这一特殊生态环境中丰富的微生物基因资源提供理论依据。[方法]运用扩增18S rDNA限制性分析(Amplified 18S ribosomal DNA restriction analysis,ARDRA)和18S rRNA基因序列分析技术,分析了热带雨林土壤真菌物种丰度、优势种群和进化关系等群落结构特征。试验采用PVPP洗涤-CTAB-溶菌酶-蛋白酶K-SDS热处理等方法,提纯微生物总DNA,构建真菌18S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行ARDRA分析,选取有代表性的克隆测序,利用DOTUR软件将真菌序列按照97%相似性的标准分成若干个可操作分类单元(Operational taxonomic u-nit,OTU)。[结果]构建的克隆文库包含21个OTU,其中以子囊菌和担子菌为主,各占克隆文库的64.7%和15.5%。子囊菌中以盘菌为主,占到整个克隆文库的47.4%;担子菌中以伞菌为主,占到整个克隆文库的10.4%。接合菌和壶菌均有少量克隆出现在文库中。首次从海南岛热带雨林土壤中发现牛肝菌。研究显示该环境真菌多样性极其丰富,涵盖了真菌主要门的绝大多数。[结论]该研究结果为揭示热带雨林土壤真菌群落结构多样性、挖掘该环境样品的真菌基因资源提供了参考依据。
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关键词
热带雨林土壤真菌
18S
rRNA基因克隆文库
酶切分型
系统进化分析
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Keywords
soil fungi in tropical rain forest
18S rRNA gene cloning library
Amplified 18S ribosomal DNA restriction analysis
Phylogenetic analysis
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分类号
S432.41
[农业科学—植物病理学]
Q93
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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