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牛卵巢黄体细胞增殖和孕酮分泌相关基因的筛选及其表达研究 被引量：1
1
作者 赵园园 孟金柱 +1 位作者 伍春亚 潘春威 《河南农业科学》 北大核心 2022年第10期125-133,共9页
旨在筛选牛卵巢大黄体细胞(LLC,直径>25μm)和小黄体细胞(SLC,直径12~25μm)之间的差异表达基因,获得黄体细胞增殖和孕酮分泌的特征性基因。使用R软件limma包对GSE83524芯片数据进行分析,筛选出LLC和SLC中的差异表达基因;使用DAVID... 旨在筛选牛卵巢大黄体细胞(LLC,直径>25μm)和小黄体细胞(SLC,直径12~25μm)之间的差异表达基因,获得黄体细胞增殖和孕酮分泌的特征性基因。使用R软件limma包对GSE83524芯片数据进行分析,筛选出LLC和SLC中的差异表达基因;使用DAVID软件对差异基因进行GO功能注释及KEGG信号通路分析;利用在线软件String和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并将其可视化;利用软件Cytoscape中的Cyto-Hubba插件筛选其中节点度最高的10个关键(Hub)基因;采用实时荧光定量PCR方法对获得的黄体细胞增殖和孕酮分泌的特征性基因在思南黄牛上进行验证。结果表明,在牛卵巢LLC和SLC中共筛选出226个差异表达基因;GO功能注释结果显示,226个差异表达基因注释到3个类别,共39组;KEGG分析结果表明,显著富集的通路有25条,其中PI3K-Akt信号通路与黄体细胞增殖和孕酮分泌密切相关;PPI网络分析获得10个节点度最高的Hub基因;实时荧光定量PCR检测结果表明,VWF、CYP19A1、CYP17A1、PRLR、BMPR2在LLC和SLC中的表达趋势与GEO芯片数据结果一致。 展开更多
关键词 思南黄牛 PI3K-AKT信号通路 小黄体细胞 大黄体细胞 孕酮
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