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题名番茄SlMAPK9-2基因分离及表达分析
被引量：6
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作者
王洁
王燕
潘长田
何艳军
刘雪
卢钢
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机构
浙江大学农业与生物技术学院园艺系
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出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1480-1490,共11页
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基金
国家自然科学基金项目(31471878)
浙江省重点科技创新团队项目(2013TD05)
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文摘
促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号途径在植物生长发育以及多种逆境胁迫响应和激素调控过程中发挥着至关重要的作用。为了研究MAPK基因的结构和功能,利用生物信息学分析以及PCR扩增方法从番茄中分离了1个新的MAPK基因,克隆其c DNA全长序列,命名为Sl MAPK9-2;利用NCBI数据库Blast P工具和在线软件MEME分析发现其具有MAPK保守的结构域和保守基序。系统进化树分析显示Sl MAPK9-2属于D组MAPK,与茄科植物马铃薯和烟草MAPK9位于同一进化树分支。利用数据库PGDD分析发现,Sl MAPK9-2与Sl MAPK16以及Pm MAPK9之间发生了大片段复制事件,且2个基因对的Ka/Ks均小于1,说明经历了达尔文纯化选择。实时荧光定量PCR分析发现,Sl MAPK9-2在不同组织器官中均有表达,在开放花中表达量最高。非生物逆境(高温和盐胁迫)和外源激素(脱落酸和水杨酸)处理可以显著改变Sl MAPK9-2的表达水平。启动子预测分析也发现,Sl MAPK9-2启动子区含有大量响应病原菌、激素、高温及脱水的顺式作用元件。综上,Sl MAPK9-2可能在番茄逆境胁迫应答中发挥重要调控作用。本研究为进一步探索Sl MAPK9-2的生物学功能及作用机制奠定了基础。
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关键词
番茄
促分裂原活化蛋白激酶
slmapk9-2
生物信息学分析
表达分析
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Keywords
Solanum lycopersicum L. , mitogen activated protein kinase, SIMAPK9-2, bioinformatic analysis, expressionprofiles
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分类号
S641.2
[农业科学—蔬菜学]
Q943.2
[农业科学—园艺学]
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