目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片（single nucleotide polymorphism array, SNP-array）在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用价值。方法对181例生长迟缓的患儿，采用Illumina Human Cyto SNP-12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异（copy ...目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片（single nucleotide polymorphism array, SNP-array）在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用价值。方法对181例生长迟缓的患儿，采用Illumina Human Cyto SNP-12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异（copy number variations，CNVs）检测，结合查询国际病理性CNVs数据库（ClinGen、ClinVar、DECIPHER、OMIM）、正常人基因组变异数据库（Database of Genomic Variants, DGV）以及PubMed文献数据库等对检出的CNVs的致病性进行分析。结果共检出47例变异阳性患儿，检出率约26％，其中包括已知的微缺失／重复综合征12例（占26％）、明确致病的CNVs（非综合征）10例（21％）、染色体数目异常3例（6％）、染色体非平衡易位3例（6％）、致病性嵌合4例（9％）、临床意义不明的CNVs15例（32％）。剔除染色体水平明显可见的数目与结构异常后，共检出15例小于5Mb的明确致病性CNVs，这是常规染色体核型分析所无法检出的。此外，还检出3例包含已知或预测为印迹基因的杂合性丢失（loss of heterozygosity,LOH）患儿以及2例亲本可能存在血缘关系的患儿。结论SNP-array技术具有分辨率高、准确性好等优点，是生长迟缓患儿遗传学诊断的有力工具。展开更多
文摘目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片（single nucleotide polymorphism array, SNP-array）在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用价值。方法对181例生长迟缓的患儿，采用Illumina Human Cyto SNP-12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异（copy number variations，CNVs）检测，结合查询国际病理性CNVs数据库（ClinGen、ClinVar、DECIPHER、OMIM）、正常人基因组变异数据库（Database of Genomic Variants, DGV）以及PubMed文献数据库等对检出的CNVs的致病性进行分析。结果共检出47例变异阳性患儿，检出率约26％，其中包括已知的微缺失／重复综合征12例（占26％）、明确致病的CNVs（非综合征）10例（21％）、染色体数目异常3例（6％）、染色体非平衡易位3例（6％）、致病性嵌合4例（9％）、临床意义不明的CNVs15例（32％）。剔除染色体水平明显可见的数目与结构异常后，共检出15例小于5Mb的明确致病性CNVs，这是常规染色体核型分析所无法检出的。此外，还检出3例包含已知或预测为印迹基因的杂合性丢失（loss of heterozygosity,LOH）患儿以及2例亲本可能存在血缘关系的患儿。结论SNP-array技术具有分辨率高、准确性好等优点，是生长迟缓患儿遗传学诊断的有力工具。
文摘目的探讨染色体核型分析与单核苷酸多态性微阵列芯片技术(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)在颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚胎儿遗传学检查中的应用价值。方法回顾分析130例妊娠早期(11~13+6周)NT≥3.0 mm为NT增厚,行介入性产前诊断绒毛标本的临床资料,统计并分析胎儿染色体核型分析与染色体微阵列芯片检测情况。染色体微阵列分析采用Illumina Human Cyto SNP12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测,结合查询国际病理性CNVs数据库(ClinGen,ClinVar,DECIPHER,OMIM)、正常人基因组变异数据库(database of genomic variants,DGV)以及PubMed文献数据库等对检出的CNVs的致病性进行分析。结果130例胎儿NT增厚的胎儿样本中,检出染色体核型异常35例,检出率26.9%(35/130),检出SNP-array异常44例,检出率33.8%(44/130),SNP-array异常检出率明显高于染色体核型异常检出率,并且差异具有统计学意义(χ^2=6.23,P<0.05)。且染色体微阵列技术检出了染色体核型分析未能检出的8例微缺失,4例微重复以及1例单亲二倍体。结论对超声检测胎儿NT增厚的胎儿样本,行SNP-array检测有助于发现染色体核型分析无法检出的染色体亚显微结构异常,且SNP-array有利于提高对颈项透明层增厚胎儿遗传病因的诊断。
