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Neuregulin1基因433E1006及rs3924999位点多态性与精神分裂症关联的meta分析 被引量:5
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作者 张红星 董召 +5 位作者 寇延娜 李倩 晁阳阳 司亚静 张海三 吕路线 《中华行为医学与脑科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1141-1143,共3页
目的探讨Neuregulin1(NRG1)基因433E1006(G/A)和rs3924999(A/G)位点多态性与精神分裂症的关联。方法在pubmed,metstr,EMBASE、万方、CNKI数据库检索并筛选与所研究位点相关的文献,采用meta分析的方法对符合录入标准的文献进... 目的探讨Neuregulin1(NRG1)基因433E1006(G/A)和rs3924999(A/G)位点多态性与精神分裂症的关联。方法在pubmed,metstr,EMBASE、万方、CNKI数据库检索并筛选与所研究位点相关的文献,采用meta分析的方法对符合录入标准的文献进行meta分析,采用Revman5.0统计软件分析数据。结果纳入的与433E1006有关的研究包括5个病例对照研究,总计2501例患者和2283例健康对照;纳入的与rs3924999有关的研究包括9个病例对照研究,总计3256例患者和4143例健康对照。433E1006及rs3924999两个位点多态性的等位基因频率在病例与对照组分布均差异无统计学意义(P〉0.05),G等位基因OR值分别为1.14、1.04;95%C1分别为:0.95—1.37、0.91—1.19;Z值分别为1.45和0.62;P值分别为0.15和0.54。结论不支持NRG1基因rs3924999及433E1006多态位点多态性与精神分裂症存在关联。 展开更多
关键词 精神分裂症 神经调节蛋白基因 单核苷酸多态性 关联分析 META分析
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国人确诊及疑似Brugada综合征患者SCN5A基因变异筛查 被引量:4
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作者 仇晓亮 刘文玲 +4 位作者 胡大一 路亚枫 李蕾 孙艺红 李翠兰 《中国心脏起搏与心电生理杂志》 北大核心 2009年第3期204-208,共5页
目的探讨国人Brugada综合征(BrS)患者及疑似者中SCN5A基因变异情况。方法对5例确诊和12例疑似BrS患者及部分家属进行临床分析并随访,用直接测序法检测SCN5A基因多态/突变情况。结果在1例确诊者中发现R1913C错义突变;在17例患者中共发现1... 目的探讨国人Brugada综合征(BrS)患者及疑似者中SCN5A基因变异情况。方法对5例确诊和12例疑似BrS患者及部分家属进行临床分析并随访,用直接测序法检测SCN5A基因多态/突变情况。结果在1例确诊者中发现R1913C错义突变;在17例患者中共发现10种单核苷酸多态性(SNPs)位点,分别为G87A、703+130G>A、1141-3C>A、A1673G、G3578A、3840+73G>A、4245+81G>T、4245+82A>G、4299+53T>C、T5457C。其中在1例疑似患者中发现的位点4245+81G>T为首次报道。结论首次在BrS患者中发现R1913C突变;同时在一例疑似患者中发现了1种新SNP4245+81G>T。 展开更多
关键词 心血管病学 BRUGADA综合征 SCN5A 突变 单核苷酸多态性
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汉族人群脂联素基因-11377C/G多态性与子痫前期的相关性研究 被引量:4
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作者 闵羡蕙 黄美霞 +1 位作者 姚祺 林莉莉 《中国优生与遗传杂志》 2011年第1期13-15,共3页
目的探讨福建莆田地区汉族人群脂联素基因(APN)单核苷酸多态性(SNP)和子痫前期(pre-eclampsi-a)及其血脂水平的关联性。方法研究对象516例,包括对照组260例,子痫前期病例组256例。采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法鉴... 目的探讨福建莆田地区汉族人群脂联素基因(APN)单核苷酸多态性(SNP)和子痫前期(pre-eclampsi-a)及其血脂水平的关联性。方法研究对象516例,包括对照组260例,子痫前期病例组256例。采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法鉴定APN基因启动子-11377C/G单核苷酸多态性并测定血脂水平。结果 APN基因启动子-11377C/G位点G等位基因频率和GG+CG基因型频率在子痫前期病例组明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。子痫前期病例组内GG+CG基因型患者血清甘油三酯(TG)、血浆总胆固醇(TC)和低密度脂蛋白(LDL)值均高于CC基因型(P<0.05)。结论 APN基因启动子-11377C/G位点GG+CG基因型与子痫前期及其血浆TG、TC和LDL水平升高关联,C-G多态性提高了子痫前期合并血脂代谢紊乱的风险性。 展开更多
关键词 脂联素基因 单核苷酸多态性 子痫前期 血脂
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SNP分型方法及在法医学等领域的应用 被引量:3
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作者 郭宏 畅晶晶 李莉 《中国司法鉴定》 2007年第6期22-25,共4页
随着单倍型图的产生,SNP越来越受到关注。不仅仅在Y染色体和线粒体,常染色体和X染色体上的SNPs的应用潜能也将被发现。SNPs具有比较低的突变率和适合于降解DNA分析的特点,在法医学领域也受到关注。本文综合介绍了SNPs和X-SNPs的一般特... 随着单倍型图的产生,SNP越来越受到关注。不仅仅在Y染色体和线粒体,常染色体和X染色体上的SNPs的应用潜能也将被发现。SNPs具有比较低的突变率和适合于降解DNA分析的特点,在法医学领域也受到关注。本文综合介绍了SNPs和X-SNPs的一般特性、分型方法及其在法医学的应用。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 X-染色体 snp-分型
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宁夏地区染色体8q24区域和MAFB基因多态性与非综合征型唇腭裂的关联研究 被引量:3
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作者 周忠伟 马丽娟 +5 位作者 黄永清 姜敏 马坚 信燕华 翟堃 朱晋芳 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期230-234,共5页
目的:研究染色体8q24区段的rs987525位点及MAFB基因的rs13041247位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与非综合征型唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的相关性。方法:收集宁夏地... 目的:研究染色体8q24区段的rs987525位点及MAFB基因的rs13041247位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与非综合征型唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的相关性。方法:收集宁夏地区病例组非综合征型唇腭裂患儿369例,患儿父亲303例,母亲311例,完整3人核心家系158个。对照组收集在校正常大学生433例。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法检测这2个SNPs的基因型,运用卡方检验,传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT)等统计学方法分析评价以上SNPs的基因型频率和等位基因频率在患儿,患儿父母及对照组人群中的分布,评价其与NSCL/P的关联。结果:病例对照研究发现:MAFB基因的rs13041247位点在本研究人群的单纯唇裂组及唇裂伴或不伴腭裂组中基因型与等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P=0.02,P=0.04,P=0.01,P=0.04),而在单纯腭裂组中不存在统计学差异(P=0.25,P=0.51)。染色体8q24区域的rs987525位点基因型与等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P=0.07,P=0.20,P=0.58,P=0.33,P=0.35,P=0.59)。TDT发现rs13041247位点C等位基因在单纯唇裂组中存在过传递(P=0.03),rs987525位点A等位基因在唇裂,腭裂及唇裂伴或不伴腭裂组中存在过传递(P=0.00,P=0.04,P=0.00)。结论:MAFB的rs13041247位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂有关。 展开更多
关键词 非综合征型唇腭裂(NSCL P) 8q24 MAFB 单核苷酸多态性(snp)
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树鼩脂肪转录组SNP位点发掘及其功能注释 被引量:2
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作者 罕园园 孙晓梅 +6 位作者 匡德宣 陆彩霞 仝品芬 王文广 李娜 余波 代解杰 《实验动物科学》 2016年第3期13-19,共7页
从正常笼养树鼩腹部的脂肪转录组数据开发SNP分子标记。检测了6只动物共计274 278 568条unigene(总长度43 138 417 bp)序列信息后,在262 980条unigene(5.75%)中发现SNP位点263 071个,SNP发生频率为1/164 bp,其中转换(transition)177 562... 从正常笼养树鼩腹部的脂肪转录组数据开发SNP分子标记。检测了6只动物共计274 278 568条unigene(总长度43 138 417 bp)序列信息后,在262 980条unigene(5.75%)中发现SNP位点263 071个,SNP发生频率为1/164 bp,其中转换(transition)177 562个,颠换(transversion)85 509个。在所有变异类型中,A/G和C/T发生频率最高,分别达33.85%和33.66%。将包含SNP位点的262 980条unigene通过参比序列进行注释,并对其进行GO分类、COG分类注释和代谢通路注释(KEGGpathway),结合已有研究,分别筛选到1 187个有GO注释、77个有COG注释和1 080条个有KEGG通路注释的脂肪转录组中的可能与脂肪形成和代谢有关的SNP标记。 展开更多
关键词 树鼩 转录组 单核苷酸多态性 功能注释
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牙本质磷蛋白基因突变和序列多态性分析 被引量:1
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作者 王英 张莹 史俊南 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 2006年第6期323-326,共4页
目的:检测牙本质磷蛋白基因在牙本质发育不全Ⅱ型患者中是否存在突变,并对其序列多态性进行分析。方法:采用PCR方法扩增牙本质磷蛋白基因编码区,通过DNA直接测序方法对其核苷酸序列进行分析。结果:在牙本质磷蛋白基因序列中未发现与疾... 目的:检测牙本质磷蛋白基因在牙本质发育不全Ⅱ型患者中是否存在突变,并对其序列多态性进行分析。方法:采用PCR方法扩增牙本质磷蛋白基因编码区,通过DNA直接测序方法对其核苷酸序列进行分析。结果:在牙本质磷蛋白基因序列中未发现与疾病相关的特异性改变,但检测到该基因的核苷酸序列在不同个体间具有多态性,存在部分核苷酸的缺失以及广泛的单核苷酸多态现象。结论:牙本质磷蛋白基因在牙本质发育不全Ⅱ型患者中不存在突变,但牙本质磷蛋白基因序列具有多态性。 展开更多
关键词 牙本质磷蛋白 单核苷酸多态
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云南彝族Fetuin A基因多态性与2型糖尿病合并下肢动脉硬化的相关性研究 被引量:1
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作者 刘娜 杨秋萍 张健伟 《医学研究杂志》 2018年第6期45-51,共7页
目的研究云南彝族人群中Fetuin A基因rs4917、rs4918、rs1071592、rs2248690单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的基因型、等位基因频率分布特征,及其与2型糖尿病合并下肢动脉硬化的相关性。方法采用聚合酶链反应-... 目的研究云南彝族人群中Fetuin A基因rs4917、rs4918、rs1071592、rs2248690单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的基因型、等位基因频率分布特征,及其与2型糖尿病合并下肢动脉硬化的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和等位基因特异引物-聚合酶链反应(ASP-PCR)技术检测120例健康对照组、61例2型糖尿病组、67例糖尿病合并下肢动脉硬化组Fetuin A基因4个位点的SNP。结果 Fetuin A基因rs1071592(C/A)位点的C/C型基因频率及C等位基因频率在2型糖尿病合并下肢动脉粥样硬化组高于健康对照组(P<0.01);rs4917(C/T)、rs4918(C/G)、rs2248690(A/T)在3组中其基因型及等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。Logistic回归分析显示糖尿病下肢动脉粥样硬化的发生与Fetuin A基因rs1071592位点CC基因型相关。结论在中国楚雄地区彝族中存在Fetuin A基因rs4917(C/T)、rs4918(C/G)、rs1071592(C/A)、rs2248690(A/T)多态性。在云南彝族人群Fetuin A基因rs1071592位点CC基因型可能是糖尿病下肢动脉粥样硬化的危险因素。 展开更多
关键词 FETUIN A基因 单核苷酸多态性 2型糖尿病 动脉粥样硬化 彝族
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FGFR1基因单核苷酸多态性与中国北方汉族女性乳腺癌发病风险及临床病理特征的关系 被引量:1
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作者 王宇航 孙姗姗 +2 位作者 梁孝栓 庞达 姜永冬 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第18期2866-2871,共6页
目的:探究成纤维生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor-1,FGFR1)基因单核苷酸多态性与中国北方汉族女性乳腺癌发病风险和临床病理特征的相关性。方法:采用多重单碱基延伸单核苷酸多态性分型技术检测747例乳腺癌患者和716例... 目的:探究成纤维生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor-1,FGFR1)基因单核苷酸多态性与中国北方汉族女性乳腺癌发病风险和临床病理特征的相关性。方法:采用多重单碱基延伸单核苷酸多态性分型技术检测747例乳腺癌患者和716例健康女性人群FGFR1基因rs13317和rs3213849多态位点基因型,并比较不同基因型与乳腺癌发病风险和临床病理特征的关系。结果:FGFR1基因rs13317和rs3213849多态位点基因型频率在乳腺癌组和对照组中的分布无统计学差异(P>0.05)。与TT基因型携带者相比,rs13317位点的CT基因型、CC基因型和CT+CC基因型携带者与乳腺癌发病风险无关(P=0.464、P=0.136、P=0.103)。与GG基因型携带者相比,rs3213849位点的GA基因型、AA基因型和GA+AA基因型携带者与乳腺癌发病风险无关(P=0.642、P=0.222、P=0.416)。临床病理分析结果显示,rs13317位点多态性与乳腺癌患者的临床分期、肿瘤大小、组织学分级、淋巴结转移、ER、PR、HER2、Ki67及p53无关(P>0.05)。在共显性模型下,rs3213849位点在Ki67分布上可能存在差异(P=0.055);在显性模型下,rs3213849位点与Ki67表达情况具有相关性(P=0.023),与其他临床病理因素之间均不相关(P>0.05)。结论:在目前的样本条件下,FGFR1基因rs3213849位点与Ki67表达可能相关,而rs13317和rs3213849多态性与中国北方汉族女性乳腺癌易感性及其他临床病理特征之间无明显相关性。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 FGFR1基因 单核苷酸多态性 临床病理特征
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大规模单核苷酸多态性位点验证的集群解决方案
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作者 刘青焱 庄海滨 +1 位作者 夏永静 刘湘军 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2007年第1期34-36,39,共4页
随着高通量的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测技术的发展,世界各地的实验研究积累了大量的SNP数据,但是目前尚无一个全面综合的SNP数据库。SNP在致病基因发现、司法鉴定、个体化医疗等方面的应用得到了极大的... 随着高通量的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测技术的发展,世界各地的实验研究积累了大量的SNP数据,但是目前尚无一个全面综合的SNP数据库。SNP在致病基因发现、司法鉴定、个体化医疗等方面的应用得到了极大的关注和发展,因此有必要建立一个整合的人类SNP数据库。在整合中需要进行大规模的单核苷酸多态性位点的验证,该工作通过一个自主开发的、健壮的、用户友好的生物信息学集群计算工具包EasyC luster在集群系统上得以高效完成。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 集群计算 OSCAR PBS
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