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芝麻热胁迫响应基因SiHsfB-2b的克隆及表达特性分析
1
作者
田媛
苏小雨
+7 位作者
王东勇
李丰
张鹏钰
付锦州
戎亚思
王龙
高桐梅
吴寅
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期8-15,共8页
为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析...
为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析其在芝麻不同器官和热胁迫下的表达特性,并对其进行亚细胞定位。结果表明:SiHsfB-2b基因CDS序列全长为936 bp,编码311个氨基酸;系统进化树分析表明SiHsfB-2b与松蒿、独脚金和锈鳞木樨榄的同源蛋白关系较近,含保守DNA结合结构域;亚细胞定位于细胞核内;SiHsfB-2b基因启动子区域含有13类顺式作用元件,其中与胁迫响应和激素响应相关的各有3类。RT-qPCR分析结果显示,热胁迫可诱导SiHsfB-2b在芝麻根、茎和叶中上调表达,叶中相对表达量最高;在持续高温胁迫下,SiHsfB-2b在芝麻茎和叶中的表达量呈上升趋势,且在胁迫后期的叶中表现出显著上调,而根中的表达量呈现出先上升后下降趋势。综上推测,SiHsfB-2b基因可能通过介导胁迫和激素信号等通路积极响应热胁迫,这可为后期深入研究芝麻耐热性的分子机制奠定理论基础。
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关键词
芝麻
耐热性
sihsfb
-
2
b
基因
基因
克隆
定量表达分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
芝麻热胁迫响应基因SiHsfB-2b的克隆及表达特性分析
1
作者
田媛
苏小雨
王东勇
李丰
张鹏钰
付锦州
戎亚思
王龙
高桐梅
吴寅
机构
河南省农业科学院芝麻研究中心
神农种业实验室
河南省农业科学院中药材研究所
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期8-15,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(32301952)
国家特色油料产业技术体系项目(CARS-14-1-14)
+4 种基金
2022年度河南省重点研发与推广专项(222102110084)
河南省农业科学院优秀青年科技基金项目(2022YQ01)
河南省农业科学院自主创新项目(2023ZC082)
中国博士后科学基金资助项目(2020M672239)
河南省科技攻关项目(222102110084)。
文摘
为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析其在芝麻不同器官和热胁迫下的表达特性,并对其进行亚细胞定位。结果表明:SiHsfB-2b基因CDS序列全长为936 bp,编码311个氨基酸;系统进化树分析表明SiHsfB-2b与松蒿、独脚金和锈鳞木樨榄的同源蛋白关系较近,含保守DNA结合结构域;亚细胞定位于细胞核内;SiHsfB-2b基因启动子区域含有13类顺式作用元件,其中与胁迫响应和激素响应相关的各有3类。RT-qPCR分析结果显示,热胁迫可诱导SiHsfB-2b在芝麻根、茎和叶中上调表达,叶中相对表达量最高;在持续高温胁迫下,SiHsfB-2b在芝麻茎和叶中的表达量呈上升趋势,且在胁迫后期的叶中表现出显著上调,而根中的表达量呈现出先上升后下降趋势。综上推测,SiHsfB-2b基因可能通过介导胁迫和激素信号等通路积极响应热胁迫,这可为后期深入研究芝麻耐热性的分子机制奠定理论基础。
关键词
芝麻
耐热性
sihsfb
-
2
b
基因
基因
克隆
定量表达分析
亚细胞定位
Keywords
Sesame
Heat tolerance
sihsfb
-
2
b
gene
Gene cloning
Quantitative expression analysis
Su
b
cellular localization
分类号
S565.3 [农业科学—作物学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
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1
芝麻热胁迫响应基因SiHsfB-2b的克隆及表达特性分析
田媛
苏小雨
王东勇
李丰
张鹏钰
付锦州
戎亚思
王龙
高桐梅
吴寅
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
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