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基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病的潜在分子机制
1
作者
李亚蒙
侯亚威
+1 位作者
徐玉坤
李芮
《中国医药导报》
2021年第23期22-28,46,F0004,共9页
目的基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病(DN)的潜在分子机制。方法药物活性成分来源于中药系统药理学数据库、TCMID数据库,同时结合在中国知网、万方中搜集2015年1月至2020年9月文献获得成分靶点;借助Cytoscape 3.7....
目的基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病(DN)的潜在分子机制。方法药物活性成分来源于中药系统药理学数据库、TCMID数据库,同时结合在中国知网、万方中搜集2015年1月至2020年9月文献获得成分靶点;借助Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络图;基于GeneCards、TTD、OMIM及DRUGBANK寻找DN靶点;利用R包绘制“药物-疾病”靶点维恩图;采用Cytoscape 3.7.2结合STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用互作分析;使用Metascape结合生物信息平台进行GO及KEGG通路分析;主要通过Autodockvina联合PyMol进行分子对接。结果从水陆二仙丹中共获得7个活性成分,包括槲皮素、山柰酚、叶红素等,获得DN靶点1261个,获得交集靶点70个,GO与KEGG分析发现交集靶点主要参与调控脂多糖的反应、活化氧代谢过程、血管生成等多个生物学功能,并富集在AGE-RAGE、HIF-1、ErbB等多条通路。分子对接验证槲皮素与MAPK1、CCND1及叶红素与AKT1、VEGFA均有较好的对接活性。结论水陆二仙丹主要通过槲皮素、叶红素,调控AKT1、MAPK1、VEGFA等相关靶点的表达,进而干预AGE-RAGE、HIF-1、ErbB等多条通路,调控脂多糖的反应、活化氧代谢过程、血管生成等多个生物学功能,进而发挥治疗DN的作用。
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关键词
网络药理学
水陆二仙丹
糖尿病肾病
分子对接
机制
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题名
基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病的潜在分子机制
1
作者
李亚蒙
侯亚威
徐玉坤
李芮
机构
山东中医药大学中医学院
山东中医药大学附属医院老年医学科
出处
《中国医药导报》
2021年第23期22-28,46,F0004,共9页
基金
山东中医药科技发展计划项目(20190105)。
文摘
目的基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病(DN)的潜在分子机制。方法药物活性成分来源于中药系统药理学数据库、TCMID数据库,同时结合在中国知网、万方中搜集2015年1月至2020年9月文献获得成分靶点;借助Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络图;基于GeneCards、TTD、OMIM及DRUGBANK寻找DN靶点;利用R包绘制“药物-疾病”靶点维恩图;采用Cytoscape 3.7.2结合STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用互作分析;使用Metascape结合生物信息平台进行GO及KEGG通路分析;主要通过Autodockvina联合PyMol进行分子对接。结果从水陆二仙丹中共获得7个活性成分,包括槲皮素、山柰酚、叶红素等,获得DN靶点1261个,获得交集靶点70个,GO与KEGG分析发现交集靶点主要参与调控脂多糖的反应、活化氧代谢过程、血管生成等多个生物学功能,并富集在AGE-RAGE、HIF-1、ErbB等多条通路。分子对接验证槲皮素与MAPK1、CCND1及叶红素与AKT1、VEGFA均有较好的对接活性。结论水陆二仙丹主要通过槲皮素、叶红素,调控AKT1、MAPK1、VEGFA等相关靶点的表达,进而干预AGE-RAGE、HIF-1、ErbB等多条通路,调控脂多糖的反应、活化氧代谢过程、血管生成等多个生物学功能,进而发挥治疗DN的作用。
关键词
网络药理学
水陆二仙丹
糖尿病肾病
分子对接
机制
Keywords
Network
pharmacology
shuulu
erxiandan
Diabetic
nephropathy
Molecular
docking
Mechanism
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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1
基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病的潜在分子机制
李亚蒙
侯亚威
徐玉坤
李芮
《中国医药导报》
2021
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