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基因探针和PCR方法在菌痢流行病学研究中的应用 被引量:3
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作者 夏桂枝 叶礼燕 +2 位作者 王红 白石山 俞守义 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第12期1062-1064,1067,共4页
目的 探讨基因探针和PCR方法在F2a志贺氏菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对 4 3株自患者粪便和食物中分离到的F2a志贺氏菌进行 16srRNA、ipaH基因Southern杂交 ,随机PCR和set1/set2毒力基因PCR分析。 结果 随机PCR、ipaH基因S... 目的 探讨基因探针和PCR方法在F2a志贺氏菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对 4 3株自患者粪便和食物中分离到的F2a志贺氏菌进行 16srRNA、ipaH基因Southern杂交 ,随机PCR和set1/set2毒力基因PCR分析。 结果 随机PCR、ipaH基因Southern杂交将 4 3株F2a志贺氏菌分为两个不同的基因型 ,set1/set2毒力基因PCR分为三个不同的基因型 ,16srRNA基因Southern杂交均为同一基因型。结论 基因分型方法能更准确、深入地揭示菌痢暴发过程中各分离株之间的流行病学联系。其中set1/set2毒力基因PCR方法具有较高的分辨率 ,在F2a志贺氏菌的分子流行病学研究中具有重要的作用。 展开更多
关键词 志贺氏菌 基因探针 随机PCR 志贺氏肠毒素
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志贺菌痢暴发菌株的分子流行病学分析 被引量:1
2
作者 夏桂枝 叶礼燕 +2 位作者 王红 俞守义 白石山 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1296-1298,共3页
目的 探讨 4种基因分型方法在一起F2a志贺菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对 43株从患者粪便和食物中分离菌株进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、set1/set2毒力基因PCR分析。结果 随机PCR将 43株F2a志贺... 目的 探讨 4种基因分型方法在一起F2a志贺菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对 43株从患者粪便和食物中分离菌株进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、set1/set2毒力基因PCR分析。结果 随机PCR将 43株F2a志贺菌分为 2个不同的谱型 ,质粒图谱、set1/set2毒力基因PCR分为 3个不同的谱型 ,而质粒DNA酶切图谱分为 4个不同的谱型。其中基因型完全相同的菌株 3 5株 ,为引起本次菌痢暴发的流行株。7株基因型不同的菌株是本次暴发期间同时存在的散发病例。从食物中分离的菌株基因型与流行株相同 ,证明此次暴发是通过污染的食物而引起传播的。食堂炊事员粪便中虽然分离出了F2a志贺菌 ,但基因型与流行株不同 ,不是本次暴发的传染源。结论 DNA水平上的分型方法能更为准确。 展开更多
关键词 志贺菌痢 质粒图谱 限制性内切酶图谱 随机PCR 志贺菌肠毒素 分子流行病学调查
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福氏2a志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因分型在同源克隆鉴定系统中的应用 被引量:2
3
作者 郝加虎 王红 +4 位作者 叶冬青 钟文龙 夏桂枝 王玉琴 俞守义 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2002年第6期34-38,31,共6页
目的 对福氏 2a志贺菌肠毒素ShET1和肠毒素ShET2进行基因分型 ,提高福氏 2a志贺菌同源克隆鉴定系统的分析水平。方法 综合运用质粒DNA分析、16srRNA基因探针分析及随机PCR分析方法对 93株分离自不同地区 ,不同时间的福氏 2a志贺菌进... 目的 对福氏 2a志贺菌肠毒素ShET1和肠毒素ShET2进行基因分型 ,提高福氏 2a志贺菌同源克隆鉴定系统的分析水平。方法 综合运用质粒DNA分析、16srRNA基因探针分析及随机PCR分析方法对 93株分离自不同地区 ,不同时间的福氏 2a志贺菌进行多生物学标志分型 ,同时引入志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因PCR分析法检测福氏 2a志贺菌。结果 质粒DNA分析、RAPD分析、16srRNA基因探针分析三种方法联合运用 ,可将 93株S flexneri 2a分成 19个克隆群 ,克隆分辨率为 2 0 4 3% (19/ 93) ,引入毒素ShET1/ShET2基因PCR分析 ,可新增加 8个克隆群 ,克隆分辨率为 2 9 0 3% (2 7/ 93) ,克隆分辨率提高 8 6 0 % (8/ 93)。 93株福氏 2a志贺菌按志贺菌肠毒素分为 4种基因型 ,即 12株ShET1(- ) /ShET2 (+) ,14株ShET1(+) /ShET2 (- ) ,5 9株ShET1(+) /ShET2 (+) ,8株ShET1(- ) /ShET2 (- )。结论 在应用多生物学标志进行福氏 2a志贺菌同源克隆鉴定系统研究时 ,肠毒素ShET1/ShET2基因PCR分析是不可或缺的分析指标。 展开更多
关键词 克隆 随机PCR 志贺菌肠毒素 基因分型 生物学 细菌性痢疾
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志贺氏菌痢暴发菌株的分子流行病学分析
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作者 夏桂枝 叶礼燕 +2 位作者 王红 俞守义 白石山 《福州总医院学报》 2003年第4期199-201,共3页
目的:探讨四种基因分型方法在一起F2a志贺氏菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法:对43株分离自患者粪便和食物的菌株分别进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、setl/set2毒力基因PCR分析.结果:随机PCR将43株F2a志贺... 目的:探讨四种基因分型方法在一起F2a志贺氏菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法:对43株分离自患者粪便和食物的菌株分别进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、setl/set2毒力基因PCR分析.结果:随机PCR将43株F2a志贺氏菌分为西个不同的谱型,质粒图谱、setl/set2毒力基因PCR分为三个不同的谱型。而质粒DNA酶切图谱分为四个不同谱型。其中基因型完全相同的菌株35株,为引起本次菌痢暴发的流行株。7株基因型不同菌株是本次暴发期间同时存在的散发病例。从食物中分离的菌株基因型与流行株相同.证明此次暴发是通过污染的食物而引起传播的。食堂炊事员粪便中虽然分离出了F2a志贺氏菌.但基因型与流行株不同。不是本次暴发的传染源。结论:DNA水平上的分型方法能更为准确、深入地揭示菌痢暴发过程中各分离株之间的流行病学联系。 展开更多
关键词 暴发 菌痢 志贺氏菌 随机PCR 食物 毒力基因 基因型 流行株 菌株 分子流行病学
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福氏2a志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因分型在菌痢暴发研究中的应用 被引量:1
5
作者 郝加虎 叶冬青 +4 位作者 王红 钟文龙 夏桂枝 吴爱军 俞守义 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2002年第10期1190-1192,共3页
目的 对福氏 2a志贺菌肠毒素ShET1(Shigellaenterotoxinl)和肠毒素ShET2 (Shigellaenterotoxin2 )进行基因分型 ,提高菌痢暴发流行时同源克隆的鉴定分析水平。方法 对在菌痢暴发期间分离的 8株福氏 2a志贺菌用PCR法检测志贺菌肠毒素Sh... 目的 对福氏 2a志贺菌肠毒素ShET1(Shigellaenterotoxinl)和肠毒素ShET2 (Shigellaenterotoxin2 )进行基因分型 ,提高菌痢暴发流行时同源克隆的鉴定分析水平。方法 对在菌痢暴发期间分离的 8株福氏 2a志贺菌用PCR法检测志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因 ,进行基因分型和同源克隆鉴定。结果  8株福氏 2a志贺菌可分为 3种基因型 ,即 2株ShET1(- ) /ShET2 (+) ,1株ShET1(+) /ShET2 (- ) ,5株ShET1(+) /ShET2 (+)。结论 本次菌痢暴发部分患者可能并非真正的暴发病例 ,之所以被归入暴发事件之中 ,可能是一种与暴发事件在空间。 展开更多
关键词 福氏2A志贺菌 志贺肠毒素 基因分型 菌痢
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福氏2a志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因分型在菌痢快速诊断中的应用 被引量:5
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作者 郝加虎 叶冬青 +6 位作者 王红 黄芬 方益荣 张国庆 钟文龙 夏桂枝 俞守义 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第2期100-104,共5页
目的对福氏2a志贺菌肠毒素ShET1(Shigellaenterotoxin1)和肠毒素ShET2(Shigellaenterotoxin2)进行基因分型,提高菌痢爆发流行时同源克隆的鉴定分析水平。方法对93株分离自不同地区,不同时间的福氏2a志贺菌用PCR法检测志贺菌肠毒素ShET1/... 目的对福氏2a志贺菌肠毒素ShET1(Shigellaenterotoxin1)和肠毒素ShET2(Shigellaenterotoxin2)进行基因分型,提高菌痢爆发流行时同源克隆的鉴定分析水平。方法对93株分离自不同地区,不同时间的福氏2a志贺菌用PCR法检测志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因,进行基因分型和同源克隆鉴定。结果93株福氏2a志贺菌按志贺菌肠毒素ShET1/ShET2基因可分为4种基因型,即12株ShET1(-)/ShET2(+),14株ShET1(+)/ShET2(-),59株ShET1(+)/ShET2(+),8株ShET1(-)/ShET2(-)。93株福氏2a志贺菌ShET1检出率为89.24%(83/93),ShET2为65.59%(61/93)。二者至少有一种基因被检出的检出率为91.39%(85/93)。结论福氏2a志贺菌的快速诊断可应用ShET1、ShET2双基因PCR检测,具有较高的敏感性与特异性。在应用多生物学标志进行福氏2a志贺菌同源克隆鉴定系统研究时,肠毒素ShET1/ShET2基因PCR分析是不可或缺的分析指标。 展开更多
关键词 福氏2A志贺菌 分子流行病学 志贺菌肠毒素
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