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19株海水鱼致病性弧菌OmpK基因序列及其抗原性分析 被引量:15
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作者 杨智慧 李宁求 +5 位作者 白俊杰 石存斌 潘厚军 叶星 劳海华 吴淑勤 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期807-813,共7页
从哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)、溶藻弧菌(V.alginolyticus)、副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)克隆、测定了共19株海水鱼类致病性弧菌外膜蛋白OmpK基因序列,探讨其作为海水鱼类致病性弧菌共同抗原的分子基础。根据已知的弧菌外膜蛋白Omp... 从哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)、溶藻弧菌(V.alginolyticus)、副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)克隆、测定了共19株海水鱼类致病性弧菌外膜蛋白OmpK基因序列,探讨其作为海水鱼类致病性弧菌共同抗原的分子基础。根据已知的弧菌外膜蛋白OmpK序列设计1对简并引物,利用聚合酶链式反应(PCR)方法从19株弧菌总DNA中分别扩增得到约800 bp外膜蛋白OmpK的基因片段,将其克隆到pDM18-T Vector载体筛选阳性重组子进行序列测定。结果显示,OmpK基因分别含有786 bp^849 bp的开放读码框,编码261~282个氨基酸,其核苷酸序列之间的相似性在72%~100%,推测氨基酸序列的相似性为71%~100%,且种内OmpK氨基酸序列的相似性比种间高。序列分析还表明,每一种弧菌OmpK基因都有一段特异性序列,可用于设计核酸探针或特异性引物来诊断、检测哈维氏弧菌等海水鱼致病性弧菌。本研究不仅从基因水平上证实了外膜蛋白OmpK广泛存在于海水鱼致病性弧菌中,而且证明了它们之间具有较高的相似性。由结果推测外膜蛋白OmpK是哈维氏弧菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌等致病性弧菌的一种共同抗原,是较好的亚单位疫苗候选成分,为进一步研制广谱的海水鱼类致病性弧菌外膜蛋白基因工程亚单位疫苗提供了理论基础。 展开更多
关键词 弧菌 外膜蛋白OmpK 序列分析 相似性 共同抗原
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鹅IGF-Ⅰ基因5’调控区序列的克隆与分析 被引量:6
2
作者 王雷 王宝维 +5 位作者 贾晓晖 杨志刚 刘光磊 张名爱 张旭晖 龙芳羽 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第3期71-73,共3页
根据鸡、鸭等的IGF-Ⅰ基因5’调控区的保守区序列设计一对兼并引物,从五龙鹅的基因组DNA中扩增了IGF-Ⅰ基因5’调控区序列,将其克隆到pMD18-T载体上进行测序,结果得到长796bp的序列。五龙鹅IGF-Ⅰ基因5’调控区序列与鸭、鸡的同源性分别... 根据鸡、鸭等的IGF-Ⅰ基因5’调控区的保守区序列设计一对兼并引物,从五龙鹅的基因组DNA中扩增了IGF-Ⅰ基因5’调控区序列,将其克隆到pMD18-T载体上进行测序,结果得到长796bp的序列。五龙鹅IGF-Ⅰ基因5’调控区序列与鸭、鸡的同源性分别为98.1%、93.0%,充分显示了IGF-Ⅰ基因在进化上的高保守性;与鸭相比有4处碱基缺失和7处碱基插入;与鸡相比有4处碱基缺失和3处碱基插入。对其序列进行酶切图谱分析发现,共有5种常见的限制性内切酶的酶切位点。 展开更多
关键词 IGF-I基因 5’调控区 克隆 序列分析
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花生Clp蛋白酶基因(AhClpP)的克隆与序列分析 被引量:6
3
作者 纪鸿飞 彭振英 +1 位作者 马敬 毕玉平 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第B12期5-8,共4页
Clp蛋白酶通过蛋白质水解作用来清除细胞内由逆境引起的异常和具有潜在毒性的蛋白或多肽,从而保证细胞正常的生理功能。从优质大花生鲁花14种子不同发育时期混合cDNA文库中发现一条序列,全长为1 212 bp,3′端含有polyA尾,通过blastx搜... Clp蛋白酶通过蛋白质水解作用来清除细胞内由逆境引起的异常和具有潜在毒性的蛋白或多肽,从而保证细胞正常的生理功能。从优质大花生鲁花14种子不同发育时期混合cDNA文库中发现一条序列,全长为1 212 bp,3′端含有polyA尾,通过blastx搜索得知其为Clp蛋白酶基因。该序列与GenBank中EZ736390.1的序列相似性达到99%。以该花生cDNA序列为模板设计引物,以花生幼嫩种子cDNA为模板克隆得到花生Clp蛋白酶基因。序列分析表明,AhClpP基因的开放阅读框长度为843 bp,编码280个氨基酸,预测其分子量为30.9 kDa,等电点为9.07,编码的蛋白包含S14-ClpP-2保守结构域,无信号肽,定位于线粒体。通过与其他植物Clp蛋白酶的氨基酸序列比对,发现与拟南芥、蓖麻的Clp蛋白酶同源性较高。花生AhClpP基因的克隆为进一步研究其生物学功能和应用奠定了基础。 展开更多
关键词 花生 Clp蛋白酶 克隆 序列分析
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坛紫菜别藻蓝蛋白α,β亚基基因的克隆和序列分析 被引量:4
4
作者 左正宏 邓元告 +2 位作者 陈奕欣 赵扬 郑微云 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期148-153,共6页
以野生坛紫菜色素体DNA为模板,通过PCR扩增获得编码坛紫菜别藻蓝蛋白α亚基和β亚基的序列及两者之间的间隔序列,该序列全长为1055bp,其中编码α和β亚基的序列均为486bp,间隔序列为83bp,该序列与GenBank收录的其他4种红藻相关序... 以野生坛紫菜色素体DNA为模板,通过PCR扩增获得编码坛紫菜别藻蓝蛋白α亚基和β亚基的序列及两者之间的间隔序列,该序列全长为1055bp,其中编码α和β亚基的序列均为486bp,间隔序列为83bp,该序列与GenBank收录的其他4种红藻相关序列的同源性在75.6%~87.4%,与2种蓝藻的同源性分别为66.9%,68.5%,其中编码区同源性更高。 展开更多
关键词 坛紫菜 别藻蓝蛋白 基因克隆 序列分析
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细粒棘球蚴内蒙株疫苗候选基因EG95克隆 被引量:4
5
作者 李志伟 王志钢 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期56-57,共2页
目的克隆细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,并进行序列分析。方法根据GenBank中细粒棘球蚴EG95-1基因DNA序列设计引物,提取细粒棘球蚴基因组DNA,PCR扩增目的基因,目的基因克隆到pMD19-T载体,经PCR、酶切及测序鉴定后,进行序列分析。结果克隆到... 目的克隆细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,并进行序列分析。方法根据GenBank中细粒棘球蚴EG95-1基因DNA序列设计引物,提取细粒棘球蚴基因组DNA,PCR扩增目的基因,目的基因克隆到pMD19-T载体,经PCR、酶切及测序鉴定后,进行序列分析。结果克隆到的EG95-NM基因序列长1262bp,与EG95-1基因DNA序列同源性为98%。结论克隆到细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,序列分析表明,EG95-NM基因属于EG95基因家族并具有地理株特点。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 EG95基因 序列分析
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家鸽mtDNA ATPase8和ATPase6基因的分子克隆及序列分析 被引量:3
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作者 张慧霞 吴建平 +1 位作者 张利平 宗卉 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2007年第5期9-15,共7页
利用特异引物,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,从家鸽(Columbalivia)肝脏组织的总DNA中扩增到目的片段,并将扩增产物克隆到pMD18-T载体中,经菌落PCR与酶切鉴定、序列测定及序列分析.结果表明:克隆得到了家... 利用特异引物,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,从家鸽(Columbalivia)肝脏组织的总DNA中扩增到目的片段,并将扩增产物克隆到pMD18-T载体中,经菌落PCR与酶切鉴定、序列测定及序列分析.结果表明:克隆得到了家鸽ATPase8-ATPase6基因842 bp及COII的部分序列共861 bp.用DNA分析软件对家鸽ATPase8和ATPase6基因与Genbank中的5种鸟类的ATPase8和ATPase6基因序列进行比较分析,表明家鸽与其他5种鸟类的ATPase8和ATPase6基因具有较高的同源性(88.1%~75.0%),其中与山斑鸠(Streptopelia orientalis)的同源性最高,分别为88.1%和86.5%.家鸽ATPase8和ATPase6基因核苷酸序列的组成中,(A+T)含量分别为55.95%和54.68%,与其它5种鸟类的(A+T)含量(53.5%~60.12%)和(51.9%~54.24%)相近,说明鸟类ATPase8和ATPase6基因序列组成对A+T核苷酸的偏倚程度比较低;而且家鸽该片段的基因组织结构与其他鸟类的基本一致,显示鸟类线粒体基因排列的保守性.家鸽与其他5种鸟类的ATPase8和ATPase6基因序列同源性的分子进化树聚类结果表明家鸽与山斑鸠亲缘关系最近. 展开更多
关键词 家鸽 线粒体基因组 克隆 序列分析
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鸡γ-干扰素基因的克隆与序列分析 被引量:3
7
作者 敖艳华 任涛 孔令辰 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期86-89,共4页
为了研究鸡γ-干扰素(ChIFN-γ)基因的功能并进一步探究其在控制家禽传染病方面的应用,根据GenBank已发表的ChIFN-γcDNA基因序列自行设计引物,应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术从伴刀豆球蛋白A(Co-nA)刺激培养鸡脾淋巴细胞中提... 为了研究鸡γ-干扰素(ChIFN-γ)基因的功能并进一步探究其在控制家禽传染病方面的应用,根据GenBank已发表的ChIFN-γcDNA基因序列自行设计引物,应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术从伴刀豆球蛋白A(Co-nA)刺激培养鸡脾淋巴细胞中提取的总RNA中扩增得到ChIFN-γ,然后连接到pMD18-T载体上并转化到Top10感受态细胞中,获得阳性重组质粒并进行正确性序列测序.核甘酸序列结果表明,试验得到了长为513 bp的ChIFN-γ基因,与原鸡(Gu llus)IFN-γ的同源性可高达100%,其含有1个495 bp的开放性阅读框架,编码164个氨基酸,推测其成熟蛋白的相对分子质量约为18 000. 展开更多
关键词 鸡γ-干扰素 克隆 序列分析
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Eotaxin原核表达载体的构建及初步表达 被引量:3
8
作者 周锦川 朱瑾 《医学研究生学报》 CAS 2006年第8期678-681,共4页
目的:获得人嗜酸性粒细胞趋化因子Eotaxin基因,构建其原核表达载体,并初步表达成熟的Eotaxin,为进一步构建其N-端突变体,检测其生物学活性作准备。方法:提取外周血单个核细胞细胞总RNA,经RT-PCR扩增编码人Eotaxin全长cDNA序列,并将其克... 目的:获得人嗜酸性粒细胞趋化因子Eotaxin基因,构建其原核表达载体,并初步表达成熟的Eotaxin,为进一步构建其N-端突变体,检测其生物学活性作准备。方法:提取外周血单个核细胞细胞总RNA,经RT-PCR扩增编码人Eotaxin全长cDNA序列,并将其克隆至T载体进行序列测定,然后构建于原核表达载体PET30 a+中,并转入大肠杆菌表达。结果:RT-PCR扩增得到了400 bp左右的DNA片段,序列分析发现其中包含了GenBank中报道的编码Eotaxin cDNA序列,并获得了正确表达。结论:Eotaxin cDNA的克隆及其原核表达载体的构建及表达,为进一步构建其N-端突变体,纯化和检测其生物学活性奠定了基础。 展开更多
关键词 EOTAXIN 逆转录聚合酶链反应 序列分析
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细粒棘球蚴中国大陆株Eg10基因片段的分子克隆和序列分析 被引量:3
9
作者 张炜 王娅娜 +3 位作者 丁淑琴 王健 赵巍 杨玉荣 《宁夏医学院学报》 2006年第1期1-3,16,共4页
目的获得细粒棘球蚴(E.granulosus)Eg10基因片段,并进行序列分析。方法从包虫病患者体内获取细粒棘球蚴原头蚴,提取总RNA,根据GeneBank公布的细粒棘球蚴Eg10基因片段已知序列,设计一对引物,采用RT-PCR技术扩增出细粒棘球蚴中国大陆株Eg1... 目的获得细粒棘球蚴(E.granulosus)Eg10基因片段,并进行序列分析。方法从包虫病患者体内获取细粒棘球蚴原头蚴,提取总RNA,根据GeneBank公布的细粒棘球蚴Eg10基因片段已知序列,设计一对引物,采用RT-PCR技术扩增出细粒棘球蚴中国大陆株Eg10基因片段,将纯化后的PCR产物克隆到pGEM-T载体,进行序列测定和分析。结果成功扩增出细粒棘球蚴中国大陆株Eg10基因片段,测序为938bp,该基因序列与检索基因核苷酸序列同源性为100%,推导编码氨基酸序列同源性亦为100%。结论测序的Eg10基因序列有完整的编码框(765bp),对于进一步研究其结构和功能及对包虫病的免疫预防具有重要意义。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 Eg10 分子克隆 序列分析
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口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析 被引量:2
10
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期496-500,共5页
以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸... 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 China/99P2区 核苷酸序列 比较分析
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靶向bcl-2基因转录shRNA重组质粒的构建和序列分析 被引量:1
11
作者 张玉诺 周琦 +1 位作者 刘方欣 何清义 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期434-435,共2页
目的利用pgenesil-1质粒载体,以bcl-2为靶基因,设计构建重组体,以用于后继的RNA干扰研究。方法设计3对有小发夹结构的两条DNA序列,经退火形成互补双链,克隆至转录载体pgenesil-1上构建重组体,转化DH5a菌株,提取质粒行酶切电泳鉴定后,进... 目的利用pgenesil-1质粒载体,以bcl-2为靶基因,设计构建重组体,以用于后继的RNA干扰研究。方法设计3对有小发夹结构的两条DNA序列,经退火形成互补双链,克隆至转录载体pgenesil-1上构建重组体,转化DH5a菌株,提取质粒行酶切电泳鉴定后,进行测序分析。结果将合成的DNA片段退火后克隆至载体上,经酶切及序列鉴定为目的序列。结论靶向bcl-2基因转录shRNA的重组质粒可以在体外成功构建,为下一步利用该重组体干扰肿瘤细胞中bcl-2的mRNA转录,探索肿瘤基因治疗的新途径打下基础。 展开更多
关键词 BCL-2基因 SHRNA 重组质粒 序列分析
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口蹄疫病毒诱导的牛α-干扰素基因cDNA的克隆及序列分析 被引量:1
12
作者 李冬 刘在新 +1 位作者 王超英 谢庆阁 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2003年第10期3-6,共4页
参照已发表的牛α 干扰素基因cDNA序列设计了 1对引物 ,用感染口蹄疫病毒的牛外周血为材料 ,提取总RNA。经RT PCR ,获得与预期大小相符的DNA片段。所获得的PCR产物长度是 6 0 4bp ,与参考序列的同源性是 99.7%。第 2 3位~ 91位的 6 9... 参照已发表的牛α 干扰素基因cDNA序列设计了 1对引物 ,用感染口蹄疫病毒的牛外周血为材料 ,提取总RNA。经RT PCR ,获得与预期大小相符的DNA片段。所获得的PCR产物长度是 6 0 4bp ,与参考序列的同源性是 99.7%。第 2 3位~ 91位的 6 9个碱基为信号肽序列 ,编码2 3个氨基酸。与参考序列比较 ,第 4 3位的碱基由C变为A ,即由TTC→TTA ,对应的氨基酸由苯丙氨酸 (F)变为亮氨酸 (L)。第 4 5位的碱基由G变为C ,即由CGA→CCA ,对应的氨基酸由精氨酸(R)变为脯氨酸 (P)。第 92~ 5 89位的 4 98个碱基为牛α 干扰素成熟蛋白基因序列 ,编码 16 6个氨基酸 ,与参考序列完全相同 ,即同源性为 10 0 %。第 5 90~ 5 92位的碱基为TGA终止子。整个牛α 干扰素前体蛋白基因共 5 70个碱基 ,编码 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 α-干扰素基因 基因克隆 序列分析
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牛分支杆菌ESAT-6基因的克隆与序列分析 被引量:1
13
作者 李海涛 刘艳环 +2 位作者 李艳 王志刚 苗利光 《特产研究》 2008年第4期10-13,共4页
从患结核病鹿的肺组织中粗分离牛分支杆菌制备DNA模板,用PCR对牛分支杆菌ESAT-6基因进行了扩增,将扩增的产物连接于测序载体pGEM-TE上克隆,经测序确定无误;并使用分子生物学软件对ESAT-6基因进行了分析。结果显示:ESAT-6基因编码的蛋白... 从患结核病鹿的肺组织中粗分离牛分支杆菌制备DNA模板,用PCR对牛分支杆菌ESAT-6基因进行了扩增,将扩增的产物连接于测序载体pGEM-TE上克隆,经测序确定无误;并使用分子生物学软件对ESAT-6基因进行了分析。结果显示:ESAT-6基因编码的蛋白有较好的抗原性;ESAT-6基因在结核分支杆菌和牛分支杆菌各基因型中具有高度保守性。本研究为下—步研制重组标记疫苗奠定了基础。 展开更多
关键词 牛分支杆菌 ESAT-6基因 克隆 序列分析
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混合血迹中不同个体成份逐一分离识别的研究
14
作者 侯光伟 姜先华 +2 位作者 刘锋 黄斌 于蛟 《中国法医学杂志》 CSCD 2006年第5期269-271,共3页
目的 研究法庭科学混合血迹物证中不同个体成份逐一分离、识别的问题,建立适合混合血迹个体识别的分析技术。方法 采用PCR-SSCP及测序技术,选择mtDNA D-loop区的HVI 16030~16481区域452bp片段作为分析目标,对中国汉族两无关个体、... 目的 研究法庭科学混合血迹物证中不同个体成份逐一分离、识别的问题,建立适合混合血迹个体识别的分析技术。方法 采用PCR-SSCP及测序技术,选择mtDNA D-loop区的HVI 16030~16481区域452bp片段作为分析目标,对中国汉族两无关个体、三无关个体混合血迹进行分析。结果 100份两个体混合血迹样品mtDNA 452bp的PCR产物经SSCP电泳分离,结果有95份样品完全分离开,分离成功率达95%;30份三个体混合血迹样品452bp片段经SSCP电泳分离,结果有26份样品有1—3个个体完全分离开,分离成功率达84%。对其中3份两个体混合血样、2份三个体混合血样SSCP电泳分离后的谱带进行回收、测序分析,两个体混合血样每一份均可准确获得其中单一个体序列及以另一个体主要成份(峰值比达4:1以上)的序列结果;三个体混合血迹中不同个体成份可以达到初步分离,1份可准确确定单一个体序列。对两个体不同比例混合样品SSCP分析,结果可以检测到较少成份的最低比例为20:80。结论 本研究建立的PCR-SSCP及测序分析混合血迹综合技术,是对混合血迹中不同个体成份逐一分离、识别的一种有效技术手段。 展开更多
关键词 法医物证学 混合血迹 MTDNA PCR—SSCP 序列分析 个体识别
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口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析
15
作者 张显升 赵启祖 +7 位作者 刘在新 刘相涛 常惠芸 江鹏斐 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《中国病毒学》 CSCD 2002年第2期158-162,共5页
以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7... 以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7%、15 .5 6 %、15 .5 6 %和 15 .49% ;氨基酸序列差异率分别为 8.2 9%、8.76 %、9.2 2 %和 10 .14%。五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸 (Gly) /异亮氨酸 (Ile)。序列比较表明 ,T C、A G和A C转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸 ,是影响氨基酸稳定的因素之一。第 43 5 3、95 10 5、10 8 111、146 15 3、16 1 173、183 188和 182 187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心 ,第 48位的H、5 1的C、6 5位的E、95位的H、10 9位的H、138位的H、148位的H和 16 5位的E可能是L蛋白酶的活性位点 。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒株 China/99L区段 核苷酸序列测定 比较分析
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rhPLD2与GPI-PLD的比较生物学信息分析
16
作者 朱玲 余传星 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期566-569,共4页
采用Vector NTI、DNATools等计算机分析软件及信息库对人重组磷脂酶D2(rhPLD2)与糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D(GPI-PLD)进行比较生物学信息分析。rhPLD2不仅保留有PLD2的重要生物学活性和功能,而且可能可作为分泌型GPI-PLD蛋白的活性... 采用Vector NTI、DNATools等计算机分析软件及信息库对人重组磷脂酶D2(rhPLD2)与糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D(GPI-PLD)进行比较生物学信息分析。rhPLD2不仅保留有PLD2的重要生物学活性和功能,而且可能可作为分泌型GPI-PLD蛋白的活性竞争分子,从而在炎症反应性疾病中发挥重要作用。 展开更多
关键词 人磷脂酶D2 重组体 糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D 生物信息学 序列分析
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千里光α输入蛋白(α-Importin)的序列特征、结构与功能分析
17
作者 储士润 徐德林 +3 位作者 张林 乔晓颖 罗绍媛 钱刚 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期748-754,共7页
α输入蛋白存在于胞质溶胶中,是核孔转运复合体的重要组成部分,与核定位信号结合,通过受体介导蛋白物质转入和转出,在此过程中起连接器的作用。该研究以千里光全长c DNA文库为基础,对α输入蛋白的序列、结构、性质和功能进行了分析,并... α输入蛋白存在于胞质溶胶中,是核孔转运复合体的重要组成部分,与核定位信号结合,通过受体介导蛋白物质转入和转出,在此过程中起连接器的作用。该研究以千里光全长c DNA文库为基础,对α输入蛋白的序列、结构、性质和功能进行了分析,并在千里光α输入蛋白核苷酸序列的基础上,采用生物信息学软件,分析α输入蛋白的氨基酸序列结构和基因进化树,得到了α输入蛋白的一级、二级、三级等结构和结构域特征,以此为依据,系统分析千里光α输入蛋白的理化性质、结构和功能。结果表明:千里光α输入蛋白基因编码529个氨基酸,与烟草(Gen Bank登录号:ABM05487.1)的同源性最高,为84%;蛋白质分子量58.46 k Da,理论等电点5.08;二级结构由α螺旋、无规则卷曲和延伸主链构成;高级结构域由IBB和ARM结构构成;三级结构是4个功能结构域构成的空间立体结构。此外,还发现千里光α输入蛋白具有调控激素反应、传输信号、细胞生长、信息转录和转录调控功能的概率较高,推测可能与细胞非凋亡性死亡、抗病性防御反应、激素受体反应以及基因转录调控表达密切相关。该研究结果可为其他物种α输入蛋白结构与功能关系的分析提供参考。 展开更多
关键词 千里光 序列分析 结构预测
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基因序列相似程度的LCS算法研究 被引量:14
18
作者 王映龙 杨炳儒 +2 位作者 宋泽锋 陈卓 唐建军 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第31期45-47,共3页
首先重新审视了采用穷举法求解LCS问题的困难,以及对应的优点;随后针对穷举法的优点进行了两类优化;最后给出了算法实现的图示以及算法的结论。通过实验证明,算法的效率较传统的动态规划的LCS算法有了很大的提升。
关键词 最长公共子序列 穷举法 基因序列排比
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生物信息学中的MicroRNA预测研究 被引量:8
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作者 赵东宇 王岩 +2 位作者 罗迪 周春光 梁艳春 《吉林大学学报(信息科学版)》 CAS 2008年第3期276-280,共5页
为microRNA预测的研究提供参考,讨论了生物信息学中有关MicroRNA预测研究的若干问题。根据最新的研究成果,由MicroRNA预测的特征信息和数据源,从结构序列分析方法、比较基因组方法和机器学习方法等方面对MicroRNA预测的生物信息学方法... 为microRNA预测的研究提供参考,讨论了生物信息学中有关MicroRNA预测研究的若干问题。根据最新的研究成果,由MicroRNA预测的特征信息和数据源,从结构序列分析方法、比较基因组方法和机器学习方法等方面对MicroRNA预测的生物信息学方法做了回顾和展望,指出了该领域研究的趋势。通过对3类方法的比较结果表明,采用机器学习方法的效果更优越,能较精确地预测出MicroRNA。 展开更多
关键词 MicroRNA预测 结构序列分析 比较基因组 机器学习
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销售预测模型在ERP系统中的应用 被引量:1
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作者 李天放 张洪波 田扬 《有色矿冶》 2002年第3期52-55,共4页
ERP系统是当今国际上先进的企业管理模式。目前 ,该管理模式正在逐步为国内企业采纳。简要介绍了ERP系统中销售预测模型的作用。较为详细的介绍了销售预测方法中的时间序列分解法 ,以及该模型在ERP系统中的实现方法 ,并以某铝材厂 1999-... ERP系统是当今国际上先进的企业管理模式。目前 ,该管理模式正在逐步为国内企业采纳。简要介绍了ERP系统中销售预测模型的作用。较为详细的介绍了销售预测方法中的时间序列分解法 ,以及该模型在ERP系统中的实现方法 ,并以某铝材厂 1999- 2 0 0 1年销售数据为实例对所采用的销售模型予以验证 ,同时给出了用ERP软件实现的 2 0 0 2年预测结果。篇中给出了部分程序脚本 (节选自笔者参与开发的ERP软件 ) ,系用PowerBuilder 7. 展开更多
关键词 销售预测模型 时间序列分解法 ERP 企业资源计划
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