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牛ANGPTL3基因的电子克隆与序列分析
1
作者 马云 李芬 +2 位作者 王启钊 尤兰兰 左春生 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第2期98-102,共5页
运用生物信息学方法,对牛ANGPTL3基因的cDNA进行了序列分析,并对推导的牛AN-GPTL3蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛ANGPTL3基因的cDNA由1 566个核苷酸构成,包括1 380 bp的开放阅读框,80 bp的完整的5′非翻译区和106 bp 3′完... 运用生物信息学方法,对牛ANGPTL3基因的cDNA进行了序列分析,并对推导的牛AN-GPTL3蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛ANGPTL3基因的cDNA由1 566个核苷酸构成,包括1 380 bp的开放阅读框,80 bp的完整的5′非翻译区和106 bp 3′完整的非翻译区,编码460个氨基酸。该基因cDNA编码区序列与野猪、狗、黑猩猩、人以及恒河猴编码区序列的相似性分别为90%,88%,87%,87%和86%,而推导出的氨基酸序列与野猪、狗、黑猩猩、人以及恒河猴的相似性分别为86%,86%,83%,83%和80%。利用该基因编码序列翻译的氨基酸序列与野猪、狗、黑猩猩、恒河猴和人同源基因相应序列构建分子进化树,结果表明,牛的ANGPTL3基因在上述5个物种中,与野猪的分子进化关系最近。 展开更多
关键词 牛 血管生成素样蛋白-3(ANGPTL3) dna序列分析 Cdna
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鲍曼不动杆菌对亚胺培南耐药分子机制的研究 被引量：71
2
作者 张永 唐英春 +1 位作者 陆坚 张扣兴 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期217-221,240,共6页
目的了解鲍曼不动杆菌对亚胺培南产生耐药的分子机制.方法收集对亚胺培南耐药的鲍曼不动杆菌(imipenem resistant Acinetobacter baumannii,IRAB)无重复株共9株,采用琼脂稀释法进行药敏检测,协同抑制试验、质粒接合试验、Southern杂交... 目的了解鲍曼不动杆菌对亚胺培南产生耐药的分子机制.方法收集对亚胺培南耐药的鲍曼不动杆菌(imipenem resistant Acinetobacter baumannii,IRAB)无重复株共9株,采用琼脂稀释法进行药敏检测,协同抑制试验、质粒接合试验、Southern杂交、等电聚焦电泳、PCR扩增blaVIM、blaIMP、blaOXA-23、blaOXA-24相关基因及整合子编码序列及其分子克隆和测序,以阐述其分子耐药机制.结果本组IRAB具有多重耐药性;耐药基因分子克隆、测序并结合等电聚焦分析证实均产OXA-23型碳青霉烯酶,质粒接合试验、Southern杂交显示其编码基因定位在染色体上.9株细菌均检测出Ⅰ型整合子基因结构(大小约1.2～4kb);3株菌检测出Ⅱ型整合子基因结构(1.8～2kb),均携带了多种耐药基因.结论产OXA-23型β-内酰胺酶是本组鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药性的重要原因;IRAB整合子基因携带的多种耐药基因与其多重耐药性相关. 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 耐药 亚胺培南 p内酰胺酶类 dna序列分析 整合子
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动物线粒体DNA的特异结构及应用分子系统学分析的方法 被引量：10
3
作者 徐其放 陈嘉昌 +3 位作者 朱世杰 申煜 刘运忠 常弘 《中国比较医学杂志》 CAS 2005年第5期315-319,共5页
动物线粒体是一种存在真核生物细胞质中的细胞器,根据已经测序的动物线粒体DNA,它可编码13种蛋白质,2种rRNA,22种tRNA,和非编码区(D-Loop),已有报道发现了新的R-Loop结构,呈现母性遗传特点,且其平均进化速度是核基因组的10倍,尤其是D-L... 动物线粒体是一种存在真核生物细胞质中的细胞器,根据已经测序的动物线粒体DNA,它可编码13种蛋白质,2种rRNA,22种tRNA,和非编码区(D-Loop),已有报道发现了新的R-Loop结构,呈现母性遗传特点,且其平均进化速度是核基因组的10倍,尤其是D-Loop区.同时在线粒体DNA控制区中发现的重复序列在种间甚至种内存在着差异可作为动物特异的分子标记。根据线粒体的结构和遗传特点,借助生物信息学手段和丰富的数据库资源,对动物种间及种内群体进行分子系统学的研究,并确定分类地位,亲缘关系。 展开更多
关键词 线粒体 控制区序列 序列分析 dna 分子系统学 生物信息学
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结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变的研究 被引量：1
4
作者 姚孟晖 罗映辉 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2001年第3期195-196,共2页
目的 :了解我国结核分枝杆菌耐异烟肼 (INH)分离株katG基因突变情况 ,探讨快速检测结核分枝杆菌耐药基因型的分子药敏检测方法。方法 :用PCR单链构象多态性 (PCR SSCP)和PCR直接测序法 (PCR DS)检测 30株结核分枝杆菌临床分离株的katG... 目的 :了解我国结核分枝杆菌耐异烟肼 (INH)分离株katG基因突变情况 ,探讨快速检测结核分枝杆菌耐药基因型的分子药敏检测方法。方法 :用PCR单链构象多态性 (PCR SSCP)和PCR直接测序法 (PCR DS)检测 30株结核分枝杆菌临床分离株的katG基因。结果 :以结核分枝杆菌H3 7RV 标准株对照观察所有INH敏感株的PCR SSCP和PCR DS图谱 ,均未发现异常 ;而在 12株INH耐药株中 ,有 4株无PCR SSCP和PCR DS图谱异常 ,占INH耐药株的33 4% ;有 5株在 94位发生核苷酸错义突变 ,占INH耐药株 41 7% ,有 3株在 96位发生核苷酸同义突变 ,占INH耐药株的 2 5 %。结论 :多数结核分枝杆菌耐INH是由于其katG基因突变所致 ,可先用PCR SSCP筛选突变株 ,再用PCR DS方法测定其突变位点 。 展开更多
关键词 结核杆菌 分枝杆菌属 药物耐受性 聚合酶链反应 脱氧核糖核酸 基因突变 异胭肼 序列分析
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