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题名线粒体Cyt b基因在鲑科品种鉴定中的可靠性分析
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作者
费延堻
薛晗玥
王诗慧
熊雄
熊晓辉
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机构
南京工业大学食品与轻工学院
江苏省食品安全快速检测公共技术服务中心
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出处
《生物加工过程》
CAS
2024年第2期219-228,共10页
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基金
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(21KJB550011)。
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文摘
为探究Cyt b基因在鲑科鱼类品种鉴定中的可靠性,本研究从GenBank数据库中下载9种鲑科鱼类品种的Cyt b基因序列共997条。以Cyt b全基因和文献报道的两组Cyt b基因短片段(359和200 bp)为研究对象,对其序列变异和分子系统进化树进行分析,并筛选鲑科鱼类品种的微型DNA条形码。结果表明,仅当选用200 bp片段时,银鲑的最大种内遗传距离大于最小种间遗传距离,不存在条形码间隙(barcode gap)。同时,根据分子系统进化树分析,同一品种在基于不同Cyt b基因片段的邻接树中均聚为单系,且每一个分支的结点置信度均大于70%。因此,Cyt b可以作为条形码基因用于鲑科鱼类品种鉴定。本研究筛选获得的微型DNA条形码对鲑科鱼类品种具有良好的特异性。
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关键词
DNA条形码
鲑科鱼类
细胞色素B基因
系统进化树
遗传距离
食品安全
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Keywords
DNA barcode
salmonidae fish
cytochrome b gene
phylogenetic tree
genetic distance
food safety
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分类号
Q789
[生物学—分子生物学]
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