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CUTIN SYNTHASE 2 Maintains Progressively Developing Cuticular Ridges in Arabidopsis Sepals
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作者 Lilan Hong Joel Brown +2 位作者 Nicholas A. Segerson Jocelyn K.C. Rose Adrienne H.K. Roeder 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2017年第4期560-574,共15页
The cuticle is a crucial barrier on the aerial surfaces of land plants, in many plants, including Arabidopsis, the sepals and petals form distinctive nanoridges in their cuticles. However, little is known about how th... The cuticle is a crucial barrier on the aerial surfaces of land plants, in many plants, including Arabidopsis, the sepals and petals form distinctive nanoridges in their cuticles. However, little is known about how the formation and maintenance of these nanostructures is coordinated with the growth and development of the underlying cells. Here we report the characterization of the Arabidopsis cutin synthase 2 (cus2) mutant, which causes a great reduction in cuticular ridges on the mature sepal epidermis, but only a moderate effect on petal cone cell ridges. Using scanning electron microscopy and confocal live imaging combined with quantification of cellular growth, we find that cuticular ridge formation progresses down the sepal from tip to base as the sepal grows, pCUS2::GFP-GUS reporter expression coincides with cutic- ular ridge formation, descending the sepal from tip to base. Ridge formation also coincides with the reduction in growth rate and termination of cell division of the underlying epidermal cells. Surprisingly, cuticular ridges at first form normally in the cus2 mutant, but are lost progressively at later stages of sepal development, indicating that CUS2 is crucial for the maintenance of cuticular ridges after they are formed~ Our results reveal the dynamics of both ridge formation and maintenance as the sepal grows. 展开更多
关键词 Arabidopsis thaliana cellular growth CUTIN synthase2 (CUS2 cuticular ridges nanoridges sepal
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前列腺素内过氧化物合酶2基因的研究进展 被引量:43
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作者 王训翠 储明星 陈宏权 《生命科学》 CSCD 2004年第1期31-34,共4页
前列腺素内过氧化物合酶2是前列腺素生物合成的限速酶。本文介绍了前列腺素内过氧化物合酶2基因的结构、表达、调控机理及其与繁殖性能的关系。
关键词 前列腺素内过氧化物合酶2基因 调控机理 繁殖性能
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柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的网络药理学研究 被引量:31
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作者 盛蕾 刘元月 +13 位作者 胡丹 范琪琪 朱亦诚 张晓浩 凌志香 江雪梅 丁彩霞 肖婧 汤银燕 李传游 张兰坤 李婷婷 朱羽佳 陆茵 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期3509-3515,共7页
目的用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用OMIM、TTD和Pharm Gkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采... 目的用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用OMIM、TTD和Pharm Gkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用Excel筛选分子和靶标,Cytoscape软件建立柴胡疏肝散的中药成分-靶点网络图,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析。结果从数据库筛选出柴胡疏肝散122个中药成分与卒中后抑郁的42个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体(ESR1)、前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、SLC6A4和白三烯A4水解酶(LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。结论通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。 展开更多
关键词 柴胡疏肝散 卒中后抑郁 雌激素受体 前列素内环氧化物合成酶2 糖原合成酶激酶3Β 5-羟色胺 白三烯A4水解酶
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Ferrostatin-1 protects HT-22 cells from oxidative toxicity 被引量:26
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作者 Jun Chu Chen-Xu Liu +1 位作者 Rui Song Qing-Lin Li 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期528-536,共9页
Ferroptosis is a type of programmed cell death dependent on iron.It is different from other forms of cell death such as apoptosis,classic necrosis and autophagy.Ferroptosis is involved in many neurodegenerative diseas... Ferroptosis is a type of programmed cell death dependent on iron.It is different from other forms of cell death such as apoptosis,classic necrosis and autophagy.Ferroptosis is involved in many neurodegenerative diseases.The role of ferroptosis in glutamate-induced neuronal toxicity is not fully understood.To test its toxicity,glutamate(1.25–20 mM)was applied to HT-22 cells for 12 to 48 hours.The optimal experimental conditions occurred at 12 hours after incubation with 5 mM glutamate.Cells were cultured with 3–12μM ferrostatin-1,an inhibitor of ferroptosis,for 12 hours before exposure to glutamate.The cell viability was detected by 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay.Autophagy was determined by monodansylcadaverine staining and apoptosis by caspase 3 activity.Damage to cell structures was observed under light and by transmission electron microscopy.The release of lactate dehydrogenase was detected by the commercial kit.Reactive oxygen species were measured by flow cytometry.Glutathione peroxidase activity,superoxide dismutase activity and malondialdehyde level were detected by the appropriate commercial kit.Prostaglandin peroxidase synthase 2 and glutathione peroxidase 4 gene expression was detected by real-time quantitative polymerase chain reaction.Glutathione peroxidase 4 and nuclear factor erythroid-derived-like 2 protein expression was detected by western blot analysis.Results showed that ferrostatin-1 can significantly counter the effects of glutamate on HT-22 cells,improving the survival rate,reducing the release of lactate dehydrogenase and reducing the damage to mitochondrial ultrastructure.However,it did not affect the caspase-3 expression and monodansylcadaverine-positive staining in glutamate-injured HT-22 cells.Ferrostatin-1 reduced the levels of reactive oxygen species and malondialdehyde and enhanced superoxide dismutase activity.It decreased gene expression of prostaglandin peroxidase synthase 2 and increased gene expression of glutathione peroxidase 4 and prote 展开更多
关键词 ferroptosis ferrostatin-1 GLUTAMATE glutathione PEROXIDASE 4 HT-22 cell OXIDATIVE TOXICITY PROSTAGLANDIN PEROXIDASE synthase 2 reactive oxygen species
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The Isogene 1-Deoxy-D-Xylulose 5-Phosphate Synthase 2 Controls Isoprenoid Profiles, Precursor Pathway Allocation, and Density of Tomato Trichomes 被引量:13
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作者 Heike Paetzold Stefan Garms +7 位作者 Stefan Bartram Jenny Wieczorek Eva-Maria Uros-Gracia Manuel Rodriguez-Concepcion Wilhelm Boland Dieter Strack Bettina Hause Michael H. Walter 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2010年第5期904-916,共13页
Plant isoprenoids are formed from precursors synthesized by the mevalonate (MVA) pathway in the cytosol or by the methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP) pathway in plastids. Although some exchange of precursors occ... Plant isoprenoids are formed from precursors synthesized by the mevalonate (MVA) pathway in the cytosol or by the methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP) pathway in plastids. Although some exchange of precursors occurs, cytosolic sesquiterpenes are assumed to derive mainly from MVA, while plastidial monoterpenes are produced preferentially from MEP precursors. Additional complexity arises in the first step of the MEP pathway, which is typically catalyzed by two divergent 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase isoforms (DXS1, DXS2). In tomato (Solanum lycopersicum), the SIDXS1 gene is ubiquitously expressed with highest levels during fruit ripening, whereas SIDXS2 transcripts are abundant in only few tissues, including young leaves, petals, and isolated trichomes. Specific down-regulation of SIDXS2 expression was performed by RNA interference in transgenic plants to investigate feedback mechanisms. SIDXS2 down-regulation led to a decrease in the monoterpene β-phellandrene and an increase in two sesquiterpenes in trichomes. Moreover, incorporation of MVA-derived precursors into residual monoterpenes and into sesquiterpenes was elevated as determined by comparison of ^13C to ^12C natural isotope ratios. A compensatory up-regulation of SIDXS1 was not observed. Down-regulated lines also exhibited increased trichome density and showed less damage by leaf-feeding Spodoptera littoralis caterpillars. The results reveal novel, non-redundant roles of DXS2 in modulating isoprenoid metabolism and a pronounced plasticity in isoprenoid precursor allocation. 展开更多
关键词 Isoprenoid biosynthesis methyI-D-erythritol 4-phosphate (MEP) pathway 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase 2 (DXS2 RNA interference (RNAi) TRICHOMES cross-talk feedback regulation GC-C-IRMS.
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基于网络药理学的黄精抗肿瘤成分筛选研究 被引量:13
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作者 党艳妮 黄壮壮 +3 位作者 苏英英 杜霞 魏小亮 刘峰 《药物评价研究》 CAS 2020年第3期468-472,共5页
目的探讨黄精抗肿瘤的药效物质基础及分子作用机制。方法采用中药网络药理学数据库和分析平台(TCMSP)对黄精的化学成分进行收集,借助计算机辅助预测吸收、分布、代谢和排泄(ADME)性质并结合obioavail 1.1和pre-Caco-2预测模型对活性成... 目的探讨黄精抗肿瘤的药效物质基础及分子作用机制。方法采用中药网络药理学数据库和分析平台(TCMSP)对黄精的化学成分进行收集,借助计算机辅助预测吸收、分布、代谢和排泄(ADME)性质并结合obioavail 1.1和pre-Caco-2预测模型对活性成分群进行初筛;对所有潜在活性成分进行靶点识别;采用Cytoscape3.6.1软件进行"活性成分-靶标"网络的构建,并利用"network analyzer"插件对网络的拓扑性质进行分析;采用在线分析工具DAVID进行KEGG通路富集分析。结果黄精中已鉴定的39个化合物,其中18个具有良好的ADME性质的化合物,这些潜在的活性成分中,共有14个活性成分及其对应的19靶标与黄精抗肿瘤的活性密切相关。通过构建"活性成分-靶点"网络及对网络进行分析,共获得个4关键化合物:黄芩素、3’-甲氧基大豆苷元、异甘草素、(2R)-7-羟基-2-(4-羟苯基)-4-苯丙二氢呋喃;2个关键靶标:前列腺素G/H合酶2、热休克蛋白90AA1。在对靶点进行KEGG通路分析时,共获得12条与抗肿瘤相关的通路。结论黄精可通过多成分、多靶点及多通路的作用机制发挥其抗肿瘤活性。 展开更多
关键词 网络药理学 黄精 抗肿瘤 黄芩素、3’-甲氧基大豆苷元、异甘草素、(2R)-7-羟基-2-(4-羟苯基)-4-苯丙二氢呋喃 前列腺素G/H合酶2 热休克蛋白90AA1
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神经鞘磷脂合成酶2基因的缺失有抗动脉粥样硬化及抗炎作用 被引量:8
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作者 秦睿 陈明亮 +2 位作者 朱珂 邓锦波 石渊渊 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期333-338,共6页
本文以神经鞘磷脂合成酶2基因敲除(sphingomyelin synthase 2 knockout,SMS2-/-)小鼠为研究对象,旨在探讨神经鞘磷脂(sphingomyelin,SM)代谢与动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)发生之间的关系。雄性3月龄SMS2-/-小鼠为实验组,同性别同... 本文以神经鞘磷脂合成酶2基因敲除(sphingomyelin synthase 2 knockout,SMS2-/-)小鼠为研究对象,旨在探讨神经鞘磷脂(sphingomyelin,SM)代谢与动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)发生之间的关系。雄性3月龄SMS2-/-小鼠为实验组,同性别同月龄C57BL/6J(wild-type,WT)小鼠为对照组。用高脂高胆固醇饮食喂养两组小鼠,并给予胆盐以促进AS斑块的形成。喂养3个月后解剖观察小鼠主动脉弓,剖开胸腹主动脉进行油红染色以观察AS斑块发生情况;同时收集小鼠腹腔巨噬细胞,用脂多糖刺激后,提取核蛋白用Western blot方法检测核因子κB(nuclear factor-κB,NFκB)p65含量;高脂饮食喂养前后,小鼠断尾取血,酶法测定血清SM水平,用血脂检测试剂盒检测血脂水平。结果显示,高脂饮食喂养3个月后,SMS2-/-小鼠的主动脉弓和胸腹主动脉很少形成AS斑块,而WT小鼠则产生了较多AS斑块;高脂饮食喂养前后,SMS2-/-小鼠血清SM水平均明显低于WT小鼠(P<0.05),而血脂水平并无显著性差异(P>0.05);高脂饮食喂养后,SMS2-/-小鼠腹腔巨噬细胞经过脂多糖刺激产生的NFκBp65含量明显低于WT小鼠。以上结果提示,SMS2基因的缺失有抗AS及抗炎作用,因而可能成为临床治疗的新策略。 展开更多
关键词 神经鞘磷脂合成酶2 神经鞘磷脂 动脉粥样硬化 核因子ΚB
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GYS2与p53抑制HBV相关肝癌的研究 被引量:10
8
作者 赵新军 李循 +1 位作者 王书恒 李九智 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2021年第3期1-8,共8页
本文基于Hill动力学与Michaelis-Menten方程,建立理论模型研究糖原合酶2 (GYS2)与p53蛋白抑制乙肝病毒(HBV)相关肝癌的发展.理论模型考虑乙肝病毒x蛋白(HB_(x))、组蛋白脱乙酰基酶1(HDAC1)与乙酰化的p53(p53_(AC))结合形成复合体,抑制G... 本文基于Hill动力学与Michaelis-Menten方程,建立理论模型研究糖原合酶2 (GYS2)与p53蛋白抑制乙肝病毒(HBV)相关肝癌的发展.理论模型考虑乙肝病毒x蛋白(HB_(x))、组蛋白脱乙酰基酶1(HDAC1)与乙酰化的p53(p53_(AC))结合形成复合体,抑制GYS2表达,以及GYS2通过调控增强稳态p53(Sp53)表达,进而抑制肝癌(HCC)的发生发展.研究发现,GYS2灵敏地调控Sp53表达上调,从而使得未乙酰化的Sp53(FSp53)表达提升,抑制HCC的发生发展.部分Sp53经过p300蛋白乙酰化后与HBx、HDAC1结合形成复合体,通过负反馈抑制GYS2表达.通过考察不同浓度HBx条件下GYS2与FSp53的动力学特性,我们发现,较高浓度的HBx减弱了GYS2表达,进而弱化了下游FSp53的表达水平.另外,p300与部分Sp53结合,也在一程度上调低了FSp53的表达水平,减弱了FSp53对HCC的抑制程度,从而促进了HCC发生发展.理论结果符合实验,并进一步揭示GYS2与p53调控的HCC的抑癌机理,可为设计阻断乙型肝炎向HCC转变通路的治疗方案提供理论依据. 展开更多
关键词 糖原合酶2(GYS2)与p53蛋白 乙肝病毒(HBV) 肝癌(HCC)
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花青素对阿尔兹海默病关键药理途径的生物信息学分析及实验验证 被引量:9
9
作者 罗连响 黄芳芳 +4 位作者 吴锐剑 林浩雯 王渠 李晓玲 黄宇戈 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期2217-2224,共8页
目的:采用网络药理学和分子对接技术研究花青素治疗阿尔兹海默病(AD)的潜在机制,并通过实验对预测关键靶点进行验证。方法:在药物靶点预测平台Swiss Target Prediction、Chembl数据库和CTD数据库上预测花青素的靶点,借助OMIM数据库和Gen... 目的:采用网络药理学和分子对接技术研究花青素治疗阿尔兹海默病(AD)的潜在机制,并通过实验对预测关键靶点进行验证。方法:在药物靶点预测平台Swiss Target Prediction、Chembl数据库和CTD数据库上预测花青素的靶点,借助OMIM数据库和GeneCards数据库检索AD的靶点;将化合物靶点与疾病靶点作交集得到花青素作用于AD的潜在靶点。使用STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选核心靶点。在Metascape平台中对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后进行分子对接及实验验证,进一步明确花青素作用于AD的核心靶点。结果:花青素与AD的靶点取交集后获得71个共同靶点,PPI网络拓扑分析发现血管内皮生长因子A(VEGFA),IL-6,原癌基因酪氨酸蛋白激酶src(SRC),肿瘤坏死因子(TNF),信号转导和转录激活因子3(STAT3),人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2),丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶AKT(AKT1)等是花青素治疗AD的关键靶点。同时,分子对接及实验结果显示花青素与靶点PTGS2具有较好的亲和力,并且花青素可降低LPS诱导的BV2细胞中PTGS2蛋白的表达。KEGG通路富集分析结果显示,花青素治疗AD的通路涉及PI3K/AKT信号通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路等。结论:花青素可能通过调控PI3K/AKT、Rap1、Ras、MAPK等多条信号通路,发挥减轻神经炎症反应、抑制细胞凋亡和氧化应激以及调节tau蛋白等多种作用,从而对AD起治疗作用。 展开更多
关键词 花青素 阿尔兹海默病 网络药理学 分子对接 人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2) PI3K/AKT信号通路
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隔药饼灸调节大鼠免疫抑制机制的转录组测序分析
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作者 田岳凤 熊罗节 +2 位作者 王慧芳 翟春涛 李玮 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期978-988,共11页
背景:免疫抑制会导致机体免疫功能受损,加重病情。隔药饼灸能有效调节机体免疫功能,提高机体免疫力,但其调节机制目前仍不清楚。目的:基于转录组学的生物信息学技术对隔药饼灸干预的免疫抑制模型大鼠进行测序,探究隔药饼灸调控免疫的机... 背景:免疫抑制会导致机体免疫功能受损,加重病情。隔药饼灸能有效调节机体免疫功能,提高机体免疫力,但其调节机制目前仍不清楚。目的:基于转录组学的生物信息学技术对隔药饼灸干预的免疫抑制模型大鼠进行测序,探究隔药饼灸调控免疫的机制。方法:将24只SD大鼠随机分为空白组、模型组和隔药饼灸组,每组8只,模型组与隔药饼灸组采用腹腔注射环磷酰胺制备免疫抑制模型,35 mg/kg,连续3 d,造模结束后空白组与模型组不做干预,隔药饼灸组在大鼠中脘、神阙、关元及足三里穴位进行艾炷与药饼结合的隔药饼灸干预,连续10 d,1次/d,干预结束后次日取材。取各组大鼠外周血进行白细胞数量检测;采用Illumina测序平台进行RNA-seq,筛选差异基因,结合GO与KEGG数据库,对差异基因进行生物信息学相关分析。结果与结论:①与空白组比较,模型组白细胞数量显著减少(P<0.001)。②RNA-seq共筛选出模型组与空白组间差异基因3026个,其中1565个上调、1461个下调,隔药饼灸组与模型组间差异基因535个,其中280个上调、255个下调。③韦恩图分析获得模型组与空白组159个下调基因经隔药饼灸干预后上调,蛋白互作网络分析获得Oasl,Oas2,Isg15,Herc6,Mx2,Helz2,Mx1,Syk,Hspa1a及Ret等10个核心靶点;④GO与KEGG分析隔药饼灸调节机体的机制有免疫应答途径、病毒相关、血管新生和自身免疫系统等通路。⑤上述结果证实,实验筛选出隔药饼灸干预免疫抑制与Oasl,Oas2,Isg15,Herc6,Mx2,Helz2及Mx1靶点有明显关联,并且在免疫应答、病毒相关及血管新生等通路中发挥调控作用。 展开更多
关键词 免疫抑制 隔药饼灸 转录组测序 寡腺苷酸合成酶样蛋白 寡腺苷酸合成酶2 干扰素诱导基因15 E3泛素蛋白连接酶家族成员6 抗黏病毒蛋白2 锌指解旋酶2 抗黏病毒蛋白1
NOS2基因单核苷酸多态性与单纯尘螨过敏性鼻炎相关性研究 被引量:8
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作者 李景云 张媛 张罗 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2018年第1期51-56,共6页
目的本研究探讨NOS2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与单纯尘螨过敏性鼻炎(house dust mite-sensitive allergic rhinitis,HDM-sensitive AR)发生的相关性。方法研究募集了HDM-sensitive AR患者385例和健康对... 目的本研究探讨NOS2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与单纯尘螨过敏性鼻炎(house dust mite-sensitive allergic rhinitis,HDM-sensitive AR)发生的相关性。方法研究募集了HDM-sensitive AR患者385例和健康对照受试者424例。采集外周静脉血,提取基因组DNA。Sequenom i PLEX Mass ARRAY质谱法对NOS2基因上的6个标签SNPs(rs2297516,rs7406657,rs3794764,rs2872753,rs2779249,rs3794766)进行基因分型。结果等位基因分析显示6个SNPs的等位基因频率在HDM-sensitive AR组与正常对照组间差异无统计学意义。基因型分析显示rs3794764的(AA+AG)基因型分布在HDM-sensitive AR患者组和正常对照组间差异存在统计学意义(P=0.047),相对GG基因型是HDM-sensitive AR的危险因素(OR=1.413,95%CI:1.005~1.987)。多元线性回归分析显示在健康对照人群中rs3794766基因型与血清总Ig E浓度具有显著相关性(P=0.019,β=-0.131,95%CI:-0.229^-0.021)。结论 NOS2基因可能是中国汉族人群HDM-sensitive AR的易感基因。 展开更多
关键词 单纯尘螨过敏性鼻炎 一氧化氮合成酶2 单核苷酸多态性 关联分析
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Post-translational modifications of prostaglandin-endoperoxide synthase 2 in colorectal cancer:An update 被引量:7
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作者 Rafael I Jaén Patricia Prieto +2 位作者 Marta Casado Paloma Martín-Sanz Lisardo Boscá 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第48期5454-5461,共8页
The biosynthesis of prostanoids is involved in both physiological and pathological processes. The expression of prostaglandin-endoperoxide synthase 2(PTGS2; also known as COX-2) has been traditionally associated to th... The biosynthesis of prostanoids is involved in both physiological and pathological processes. The expression of prostaglandin-endoperoxide synthase 2(PTGS2; also known as COX-2) has been traditionally associated to the onset of several pathologies, from inflammation to cardiovascular, gastrointestinal and oncologic events. For this reason, the search of selective PTGS2 inhibitors has been a focus for therapeutic interventions. In addition to the classic non-steroidal anti-inflammatory drugs, selective and specific PTGS2 inhibitors, termed coxibs, have been generated and widely used. PTGS2 activity is less restrictive in terms of substrate specificity than the homeostatic counterpart PTGS1, and it accounts for the elevated prostanoid synthesis that accompanies several pathologies. The main regulation of PTGS2 occurs at the transcription level. In addition to this, the stability of the mRNA is finely regulated through the interaction with several cytoplasmic elements, ranging from specificmicroR NAs to proteins that control mR NA degradation. Moreover, the protein has been recognized to be the substrate for several post-translational modifications that affect both the enzyme activity and the targeting for degradation via proteasomal and non-proteasomal mechanisms. Among these modifications, phosphorylation, glycosylation and covalent modifications by reactive lipidic intermediates and by free radicals associated to the proinflammatory condition appear to be the main changes. Identification of these post-translational modifications is relevant to better understand the role of PTGS2 in several pathologies and to establish a correct analysis of the potential function of this protein in diseases progress. Finally, these modifications can be used as biomarkers to establish correlations with other parameters, including the immunomodulation dependent on molecular pathological epidemiology determinants, which may provide a better frame for potential therapeutic interventions. 展开更多
关键词 PROSTAGLANDINS Prostaglandin-endoperoxide synthase 2 POST-TRANSLATIONAL modifications GLYCOSYLATION Colorectal cancer Inflammation
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黄连-葛根药对治疗2型糖尿病的网络药理学研究 被引量:6
13
作者 李吉庆 林道斌 张永杰 《世界中医药》 CAS 2021年第6期896-900,共5页
目的:运用网络药理学研究方法对黄连-葛根药对治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制进行分析。方法:采用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出黄连-葛根(C... 目的:运用网络药理学研究方法对黄连-葛根药对治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制进行分析。方法:采用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出黄连-葛根(Coptis Chinensis-Pueraria Lobata,C-P)药对的有效活性成分及作用靶点蛋白,再使用Unipro数据库将筛选出的靶点蛋白转换为基因名,通过GeneCards数据库收集T2DM疾病基因,然后对药物作用基因及疾病相关基因进行韦恩(Venn)分析,寻找交集靶点,用交集靶点与对应活性成分构建活性成分-靶点相互作用网络,并对交集基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:研究得到13个作用于T2DM疾病靶点的活性成分和146个作用靶点,GO功能富集分析确定了284个条目,KEGG通路分析共发现77条作用通路。结论:本研究结果初步探讨了C-P药对治疗T2MD的基本药理作用及其机制,并为进一步的试验研究奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 网络药理学 黄连 葛根 2型糖尿病 作用机制 前列腺素G/H合酶1 前列腺素G/H合酶2 PI3K-AKT信号通路
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加味丹参饮预防心肌缺血再灌注损伤作用机制的网络药理学分析与实验验证研究 被引量:6
14
作者 胡旭东 彭木子 +2 位作者 陈铭 廖菁 陈聪 《湖南中医药大学学报》 CAS 2023年第3期473-482,共10页
目的 基于网络药理学预测加味丹参饮预防心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia reperfusion injury, MIRI)的活性成分、作用靶点及信号通路,并进行实验验证研究。方法 通过TCMSP、UniProt等数据库搜集加味丹参饮相关成分及靶点;通过G... 目的 基于网络药理学预测加味丹参饮预防心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia reperfusion injury, MIRI)的活性成分、作用靶点及信号通路,并进行实验验证研究。方法 通过TCMSP、UniProt等数据库搜集加味丹参饮相关成分及靶点;通过GeneCards、OMIM以及DRUGBANK数据库获取MIRI疾病相关靶点;利用STRING平台分析构建蛋白互作网络模型;通过Metascape平台分析“药物-成分-靶点”及其参与的生物学过程及信号通路,而后采用Cytoscape 3.7.1软件构建“加味丹参饮成分-MIRI靶点-通路”网络。加味丹参饮预防性给药灌胃1周后,采用结扎大鼠左前降支的方法,建立实验性MIRI大鼠模型。通过ELISA观察MIRI大鼠血清丙二醛(malonic dialdehyde, MDA)、肌酸激酶同工酶MB(creatinekinase-MB, CK-MB)、乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase, LDH)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)水平,HE染色观测心肌病理改变,qRT-PCR、Western blot检测大鼠血清心肌组织环氧合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2, PTGS2)、蛋白激酶B1(akt serine/threonine kinase 1, Akt1)表达水平。结果 初步筛选获得加味丹参饮中的活性成分102个,药物疾病交集基因140个,核心靶点54个;其中,Akt1、原癌基因JUN(Jun proto-oncogene, JUN)、信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3, STAT3)、PTGS2等靶点可能与MIRI密切相关,富集分析预测加味丹参饮预防MIRI主要涉及调节癌症相关通路等20条通路,并且其中5条通路中Akt1处于PTGS2上游。动物实验结果显示,加味丹参饮能够显著提高MIRI大鼠血清MDA、CK-MB、LDH水平(P<0.05),同时降低SOD水平(P<0.05),抑制心肌组织中Akt1、PTGS2表达水平(P<0.05),减轻心肌组织坏死。结论 加味丹参饮可能同时抑制Akt1、PTGS2两个靶点,缓解过度心肌损伤,发挥预防MIRI作用。 展开更多
关键词 心肌缺血再灌注损伤 加味丹参饮 网络药理学 MIRI大鼠模型 作用机制 蛋白激酶B1 环氧合酶2
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熊果酸通过调控PTGS2对小鼠肝缺血/再灌注损伤的保护作用 被引量:7
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作者 侯文 卢建森 +1 位作者 左怀文 刘宏胜 《实用器官移植电子杂志》 2022年第4期353-359,共7页
目的探索植物提取物熊果酸(ursolic acid,UA)减轻肝缺血/再灌注损伤(hepatic ischemia reperfusion injury,HIRI)的作用及初步作用机制。方法C57雄性小鼠分为假手术组、假手术组+UA组、HIRI组、HIRI低剂量组和HIRI高剂量组。通过动物实... 目的探索植物提取物熊果酸(ursolic acid,UA)减轻肝缺血/再灌注损伤(hepatic ischemia reperfusion injury,HIRI)的作用及初步作用机制。方法C57雄性小鼠分为假手术组、假手术组+UA组、HIRI组、HIRI低剂量组和HIRI高剂量组。通过动物实验、网络药理学和分子生物学等方法进行分析验证。结果动物实验显示UA显著降低HIRI小鼠血清中AST、ALT的活性。利用TCMSP、Pharm Mapper、Swiss Target Prediction、GeneCards等数据库获取熊果酸与HIRI对应的靶基因,再利用DAVID、STRING以及Cytoscape得到初步关键靶基因,它们是PPARG(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARG)、MAPK3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)及PTGS2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2)。最后,根据分子对接得分、受体与配体结合的氢键数目,确定PTGS2为本研究的hub靶基因。后经免疫组化实验验证,与假手术组比较,PTGS2在HIRI组中高表达(P<0.01);与HIRI组比较,PTGS2在HIRI低剂量组及HIRI高剂量组的表达明显降低(P<0.01)。结论熊果酸通过调控PTGS2对小鼠肝缺血/再灌注损伤的保护作用,该研究为临床研制干预HIRI的新药提供了参考。 展开更多
关键词 熊果酸 肝缺血/再灌注损伤 PTGS2 保护作用 分子对接
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转录组测序分析黄连总碱抗脑缺血的作用机制
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作者 田良良 周瑞 +1 位作者 曹光昭 张晶晶 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第19期4161-4171,共11页
背景:黄连清热燥湿、泻火解毒,黄连及其成分对脑缺血有显著的保护作用,基于网络药理学和转录组测序探究黄连总碱抗脑缺血的作用机制。目的:在明确黄连总碱对脑缺血大鼠保护作用的基础上,基于网络药理学和转录组测序技术探讨黄连总碱干... 背景:黄连清热燥湿、泻火解毒,黄连及其成分对脑缺血有显著的保护作用,基于网络药理学和转录组测序探究黄连总碱抗脑缺血的作用机制。目的:在明确黄连总碱对脑缺血大鼠保护作用的基础上,基于网络药理学和转录组测序技术探讨黄连总碱干预脑缺血的作用机制。方法:将SD大鼠随机分为假手术组、缺血再灌注组、阳性药物组和黄连总碱组,后3组采用改良线栓法制备大脑中动脉阻塞的缺血再灌注模型,假手术组不插入线栓,其余手术操作相同。通过TTC染色、Longa 5神经功能缺损评分、苏木精-伊红染色、尼氏染色评价黄连总碱对脑缺血再灌注模型大鼠的脑保护作用。对假手术组、缺血再灌注组、黄连总碱组大鼠脑组织进行转录组测序,通过差异表达基因筛选、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析以及转录组学与网络药理学关联分析,阐明黄连总碱干预脑缺血的作用特点,最后通过ELISA检测及免疫荧光染色对黄连总碱干预脑缺血的关键靶点进行验证。结果与结论:①黄连总碱可降低缺血再灌注模型大鼠Longa 5神经功能缺损评分及脑梗死面积,增加神经元、尼氏小体数目;②黄连总碱治疗后差异表达基因的基因本体论功能富集分析包括炎症反应、分裂原活化蛋白激酶级联的正调控等生物学过程;京都基因与基因组百科全书通路富集分析主要涉及白细胞介素17信号通路、神经活性配体-受体相互作用、环磷腺苷信号通路等通路;③转录组分析发现黄连总碱主要调控的基因有前列腺素内过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子、瞬间受体电位A1等;④采用网络药理学分析发现,黄连总碱中9个成分可能通过87个成分靶点关联到过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子及瞬间受体电位A1而发挥作用;⑤ELISA检测及免疫荧光染色结果进一步证实,黄连总碱调控脑缺� 展开更多
关键词 黄连总碱 脑缺血 转录组测序 过氧化物合酶2 脑源性神经营养因子 瞬间受体电位A1
小胶质细胞PTGS2/Hepcidin炎症通路在神经元铁死亡中的作用机制 被引量:2
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作者 杨晓玲 何宗源 +3 位作者 章琦鑫 王鱼浩 李雪莲 段晓霞 《西南医科大学学报》 2024年第1期39-44,共6页
目的探讨BV2小胶质细胞前列腺素内过氧化物酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)对HT22海马神经元铁死亡的调控及可能的分子机制。方法DMEM培养基培养BV2细胞,待BV2小胶质细胞进入对数生长期后,将其分为模型组(CELE组、CEL... 目的探讨BV2小胶质细胞前列腺素内过氧化物酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)对HT22海马神经元铁死亡的调控及可能的分子机制。方法DMEM培养基培养BV2细胞,待BV2小胶质细胞进入对数生长期后,将其分为模型组(CELE组、CELE+LPS组和LPS组)与对照组(Control组),Control组继续常规培养,CELE组和CELE+LPS组加入2.5μmol/L塞来昔布,LPS组加入等体积完全培养基。24 h后换液,LPS组和CELE+LPS组给予脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)(100 ng/mL)孵育12 h。收集各组培养液上清,以1∶1比例与完全培养基混合培养对应各组HT22细胞24 h。MTT法检测细胞活力,酶联免疫吸附测定法(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay,ELISA)检测ROS及炎症因子TNF-α等。比色法检测神经元铁含量。Western blotting、qPCR法检测相关蛋白及mRNA表达。结果LPS处理后,BV2细胞活化标志物离子化钙结合适配分子1(ionized calcium binding adapter molecule 1,IBA-1)、PTGS2表达升高,其培养基上清液中炎症因子TNF-α、IL-1β、IL-6表达增加,与对照组比差异具有统计学意义(P<0.01)。CELE+LPS组PTSG2、TNF-α、IL-1β、IL-6表达降低,与LPS组比差异具有统计学意义(P<0.05)。LPS组HT22细胞活力降低,丙二醛(malonic dialdehyde,MDA)、Fe2+水平升高,铁转运蛋白1(ferroportin 1,FPN1)、铁调素(hepcidin)表达增加,STAT3磷酸化(p-STAT3)增加,与对照组相比差异具有统计学意义(P<0.01),CELE+LPS组HT22细胞活力增加,铁死亡水平降低,FPN1、hepcidin及p-STAT3减少。结论小胶质细胞PTGS2上调细胞炎症,促进神经元铁死亡。其机制可能与PTGS2促进STAT3磷酸化,增加hepcidin表达,诱导神经元铁稳态失衡有关。 展开更多
关键词 铁死亡 小胶质细胞 前列腺素内过氧化物酶2 铁调素 铁稳态
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酒精诱导小鼠海马齿状回神经细胞的增殖:神经酰胺的可能作用 被引量:5
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作者 邓同兴 王志新 +4 位作者 高晓群 石渊渊 马战友 金海啸 邓锦波 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期479-490,共12页
本文旨在探讨神经酰胺(ceramide,Cer)在酒精诱导神经细胞增殖及新生神经元形成过程中的作用及机制。因为Cer主要的代谢途径是经神经鞘磷脂合成酶(sphingomyelin synthase,SMS)作用转化成神经鞘磷脂(sphingomyelin,SM),所以我们用SMS2基... 本文旨在探讨神经酰胺(ceramide,Cer)在酒精诱导神经细胞增殖及新生神经元形成过程中的作用及机制。因为Cer主要的代谢途径是经神经鞘磷脂合成酶(sphingomyelin synthase,SMS)作用转化成神经鞘磷脂(sphingomyelin,SM),所以我们用SMS2基因敲除(sphingomyelin synthase2knockout,SMS2/)和野生型(wild type,WT)雌性小鼠建立孕期酒精暴露模型,将模型孕鼠所生仔鼠作为研究对象。用酶学法检测仔鼠SM水平,利用免疫荧光染色法观察各组仔鼠齿状回神经细胞增殖、新生神经元及蛋白激酶Cα(protein kinase Cα,PKCα)在脑组织中的表达,免疫印迹技术检测出生后7天(postnatal day7,P7)仔鼠海马组织PKCα蛋白的相对表达量。结果显示,由于SMS2基因的缺失,SMS2/P0仔鼠血液SM水平明显低于WT仔鼠(P<0.01)。无论SMS2/还是WT P0仔鼠,酒精暴露剂量依赖性地降低其血液SM水平降低。无论SMS2/仔鼠还是WT仔鼠,其齿状回神经细胞增殖的数量及新生神经元随年龄的增长而减少且一直持续到成年。在P0、P7、P14和P30时间点,与WT仔鼠相比,SMS2/仔鼠齿状回神经细胞增殖的数量及新生神经元较多(P<0.05);酒精暴露可剂量依赖性地增加两基因型仔鼠齿状回神经细胞增殖的数量及新生神经元。PKCα是神经酰胺-神经酰胺-1-磷酸(Cer-C1P)通路中重要的激活蛋白,其表达于胞膜及胞核,在海马、齿状回、脑皮质中均有表达;与WT P7仔鼠相比,SMS2/P7仔鼠海马组织PKCα蛋白的表达量较低(P<0.05);而酒精暴露可剂量依赖性地增加两基因组仔鼠海马组织PKCα蛋白的表达量。以上结果提示,孕期酒精暴露能够诱导神经细胞发生代偿性增殖及新生神经元的形成,Cer-C1P通路参与酒精诱导细胞增殖的过程;同时,PKCα是Cer-C1P通路中重要的激活蛋白,可上调C1P调控酒精诱导神经细胞增殖及新生神经元形成的作用。 展开更多
关键词 神经酰胺 神经细胞增殖 神经鞘磷脂合成酶2 神经酰胺-1-磷酸
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川西獐牙菜SmSLS2基因的克隆、生物信息学及表达分析 被引量:5
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作者 李文静 冯雨 +5 位作者 侯晓强 孙艳香 韩美玲 李晓雪 王勇 向蓓蓓 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期431-440,共10页
裂环马钱子苷合成酶(SLS)是环烯醚萜类化合物合成途径的限速酶。该研究根据川西獐牙菜转录组信息获得SmSLS2基因序列,对该基因进行克隆、生物信息分析、原核表达载体构建及蛋白体外诱导。结果表明SmSLS2 cDNA全长1 566 bp(GenBank编号MH... 裂环马钱子苷合成酶(SLS)是环烯醚萜类化合物合成途径的限速酶。该研究根据川西獐牙菜转录组信息获得SmSLS2基因序列,对该基因进行克隆、生物信息分析、原核表达载体构建及蛋白体外诱导。结果表明SmSLS2 cDNA全长1 566 bp(GenBank编号MH535904),编码521个氨基酸,推测其蛋白相对分子质量为59. 79kDa,等电点为8. 92。结构域分析表明SmSLS2含一个跨膜结构域,SmSLS2的gDNA全长为2 576 bp,含5个外显子和4个内含子。SmSLS2蛋白与其他植物中SLS蛋白具有高度的相似性。进一步将SmSLS2构建到原核表达载体pET-28a-sumo上,转入大肠杆菌BL21(DE3)中,在37℃、0. 5 mmol·L^(-1)IPTG条件下进行原核表达,诱导出与预测蛋白大小一致的目的蛋白。该研究成功从川西獐牙菜中克隆了SmSLS2,为进一步阐明该基因在环烯醚萜合成途径中的作用和通过基因工程手段改良环烯醚萜类化合物产量提供了理论基础。 展开更多
关键词 川西獐牙菜 裂环马钱子苷合成酶2 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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基于化学成分差异的不同干燥方式熊胆粉镇痛作用研究 被引量:5
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作者 杨俊莉 钟林江 +5 位作者 雷阳 邓妍 高天赐 徐玉玲 刘涛 张坤 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期5569-5580,共12页
目的采用超高效液相-三重四极杆-线性离子阱质谱(UPLC-QTRAP-MS)方法鉴定常压及减压干燥熊胆粉的化学成分,明确其差异成分,并以网络药理学理念为指导,探索熊胆粉镇痛作用机制。方法基于UPLC-MS/MS检测平台、数据库以及多元统计分析相结... 目的采用超高效液相-三重四极杆-线性离子阱质谱(UPLC-QTRAP-MS)方法鉴定常压及减压干燥熊胆粉的化学成分,明确其差异成分,并以网络药理学理念为指导,探索熊胆粉镇痛作用机制。方法基于UPLC-MS/MS检测平台、数据库以及多元统计分析相结合的手段研究熊胆粉的化学成分差异;借助PharmMapper、Uniprot、GeneCards数据库及文献,获取熊胆粉成分和病毒性肝炎、胆囊炎及冠心病的作用靶点,并采用动物试验对其药效进行验证;对疾病靶标-药物靶标集做拓扑分析获得核心靶标,并进行基因本体(GO)功能和基因与信号通路分析(KEGG)通路富集,通过Cytoscape3.8.2软件构建成分-靶标-通路网络图。结果常压干燥、减压干燥熊胆粉共有成分721个,差异成分8个(L-焦谷氨酸、鸟苷5′-单磷酸水合物、5,6-二氢胸腺嘧啶、7-甲基黄嘌呤、左旋甲状腺素、甲基间酪氨酸、大黄素8-葡萄糖苷、益母草碱),搜索得到差异成分潜在靶点共1605个;检索得到病毒性肝炎靶点7444个、胆囊炎靶点636个、冠心病靶点7563个;熊胆粉对病毒性肝炎、胆囊炎及冠心病的共同靶点有282个,GO功能富集分析得到GO条目759个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目717个,细胞组成(CC)条目21个,分子功能(MF)条目21个;熊胆粉中的鸟苷5′-单磷酸水合物、甲基间酪氨酸、左旋甲状腺素及大黄素8-葡萄糖苷等成分可能通过二氢硫辛酸脱氢酶(dihydrolipoyl dehydrogenase,DLD)、过氧化氢酶(atalase,CATC)及一氧化氮合酶2(nitric oxide synthase 2,NOS2)等靶点,调节代谢通路和癌症通路等信号通路发挥其镇痛作用。药效试验结果表明常压、减压干燥熊胆粉均对热板及醋酸所致小鼠疼痛有抑制作用,且减压组镇痛作用强于常压组,有显著性差异(P<0.05)。结论干燥方式使得熊胆粉化学成分变异,从而导致其镇痛作用差异,初步探索了熊胆粉镇痛作用的机制,建议大生产中采用� 展开更多
关键词 熊胆粉 干燥方式 差异成分 镇痛作用 网络药理学 超高效液相-三重四极杆-线性离子阱质谱(UPLC-QTRAP-MS) 常压干燥 减压干燥 L-焦谷氨酸 鸟苷5′-单磷酸水合物 5 6-二氢胸腺嘧啶 7-甲基黄嘌呤 左旋甲状腺素 甲基间酪氨酸 大黄素8-葡萄糖苷 益母草碱 二氢硫辛酸脱氢酶 过氧化氢酶 一氧化氮合酶2
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