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题名多花黑麦草遗传连锁图的构建
被引量：6
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作者
丁成龙
沈益新
顾洪如
三浦优一
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机构
南京农业大学动物科技学院
江苏省农业科学院畜牧研究所
日本畜产草地种子协会饲料作物研究所
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出处
《草地学报》
CAS
CSCD
2006年第3期223-230,共8页
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基金
中日合作项目"饲料作物基因组解析"
日本赛马协会提供资助
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文摘
利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135 cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14 cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0 cM,相邻标记之间的平均距离为1.89 cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。
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关键词
多花黑麦草(Lolium
multiflorum)
遗传连锁图
ssr(简单重复序列)
AFLP(扩增片段长度多态性)
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Keywords
Lolium multiflorum
Genetic map
Simple sequence repeat markers （ssr）
Amplified fragmentlength polymorphism markers （AFLP）
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分类号
S812
[农业科学—草业科学]
Q943
[农业科学—畜牧学]
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题名华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发
被引量：2
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作者
秦玥
傅大立
吴硕
刘梦培
朱高浦
赵罕
马履一
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机构
中国林科院经济林研究开发中心
北京林业大学
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出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期517-520,共4页
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基金
国家林业局948项目(2011-4-37)
河南省重点攻关项目(92102110037)
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文摘
随着生物科技的进步,ESTs(表达序列标签)已经成为开发SSR(简单重复序列)标记的重要资源。本文利用NCBI公共数据库下载蔷薇科EST序列22 458条,使用SSRHunter1.3软件进行了SSR搜索,从中获得22 527条SSR,应用Primer5.0软件设计并经由Oligo7.0软件检测,共得到61对EST-SSR引物。利用这些引物对8个华仁杏品种进行了PCR扩增及检测,得到10对能产生清晰多态性条带的EST-SSR标记,标明了10对引物的序列,为进一步开展华仁杏SSR分子标记辅助育种研究奠定了基础。
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关键词
华仁杏
EST序列(表达序列标签)
ssr(简单重复序列)分子标记
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Keywords
Armeniaca cathayana
EST（expressed sequence tag）
ssr（simple sequence repeat）
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分类号
S662.2
[农业科学—果树学]
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