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SPP1基因多态性与广西壮族人群鼻咽癌易感相关性研究 被引量:4
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作者 韦宝斌 陈华泰 +5 位作者 覃海媚 王荣 覃永斗 陈启威 韦贵将 王俊利 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2017年第20期1405-1409,共5页
目的鼻咽癌是我国南方较常见的头颈部恶性肿瘤之一,具有遗传易感性。本研究探讨骨桥蛋白SPP1基因单核苷酸多态性位点rs2853750和rs11730582与广西壮族人群鼻咽癌易感性的关系。方法本研究采用病例对照方法,选取2013-04-01-2015-04-01在... 目的鼻咽癌是我国南方较常见的头颈部恶性肿瘤之一,具有遗传易感性。本研究探讨骨桥蛋白SPP1基因单核苷酸多态性位点rs2853750和rs11730582与广西壮族人群鼻咽癌易感性的关系。方法本研究采用病例对照方法,选取2013-04-01-2015-04-01在右江民族医学院附属医院就诊的139例鼻咽癌患者作为病例组,并选取同期在右江民族医学院附属医院进行常规体检的143名健康人作为对照。采用单碱基延伸PCR技术和DNA测序法,检测病例组和鼻咽癌组的SPP1基因位点rs2853750和rs11730582单核苷酸多态性,并分析SPP1基因单倍型频率。结果广西壮族人群SPP1基因位点rs2853750基因型GG、GA和AA及其等位基因C、T均不增加鼻咽癌的易感性;rs11730582基因型CC、CT和TT以及等位基因C、T不增加广西壮族人群鼻咽癌的易感性;单倍型分析在对照组和鼻咽癌组中分布频率差异并无统计学意义。结论广西壮族人群中SPP1基因位点rs2853750和rs11730582基因多态性可能与鼻咽癌易感性无关联。 展开更多
关键词 鼻咽癌 spp1基因 多态性 易感性
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基于基因芯片的前列腺癌转移高表达基因SPP1的生物信息学分析 被引量:3
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作者 李铁求 滕伊漓 +3 位作者 邹亚光 杨宇 李琦 毛向明 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2014年第11期984-990,共7页
目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protp... 目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protparam、Motif Scan、Signal P4.0、TMHMM、Net Phos2.0、Predict Protein、GO、KEGG、STRING等生物信息学工具进行数据挖掘及生物信息学分析。结果:共筛选出前列腺癌转移共同差异基因73个,表达上调21个,表达下调52个(P<0.01),其中对前列腺癌转移高表达基因SPP1进行生物信息学分析发现,SPP1蛋白由314个氨基酸组成,该蛋白含有2个N-连接糖基化位点、8个酪蛋白激酶II磷酸化位点、3个PKC磷酸化位点,主要参与细胞外基质结合、骨化、成骨细胞分化、细胞黏附、PI3K-Akt信号通路、黏着斑、ECM受体相互作用、Toll样受体信号通路等分子功能和信号通路。结论:利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,SPP1可能在前列腺癌转移中发挥重要作用,有望成为前列腺癌转移的早期诊断标志物和治疗的新靶点。 展开更多
关键词 spp1基因 生物信息学 前列腺癌 转移相关基因 基因芯片
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绵羊SPP1和PLCB3基因多态性与产羔数的关联分析 被引量:3
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作者 刁婉莹 狄冉 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2021年第1期8-12,共5页
试验旨在探究SPP1基因g.36651870T>C位点多态性、PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔羊(小尾寒羊、湖羊... 试验旨在探究SPP1基因g.36651870T>C位点多态性、PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔羊(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊)和单羔羊(滩羊、苏尼特羊、萨福克羊和草原型藏羊)7个绵羊品种SPP1、PLCB3基因的2个位点进行多态性检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:2个位点均存在TT、TC和CC三种基因型。SPP1基因g.36651870T>C位点的基因型频率和等位基因频率在两类绵羊品种间差异极显著(P<0.01);PLCB3基因g.41871219T>C位点基因型频率在两类绵羊品种间差异不显著(P>0.05),等位基因频率差异显著(P<0.05)。群体遗传学分析表明,SPP1基因g.36651870T>C位点在小尾寒羊、苏尼特羊、萨福克羊和湖羊中均表现为中度多态(0.25≤PIC<0.5),在滩羊、策勒黑羊和草原型藏羊中表现为低度多态(PIC<0.25);PLCB3基因g.41871219T>C位点在滩羊中表现为中度多态(0.25≤PIC<0.5),在其余6个绵羊品种中均表现为低度多态(PIC<0.25)。卡方适合性检验表明,SPP1基因g.36651870T>C位点在7个绵羊品种中均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05);PLCB3基因g.41871219T>C位点在小尾寒羊、滩羊、苏尼特羊、策勒黑羊、草原型藏羊5个品种中处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析表明,PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与小尾寒羊第1胎产羔数有显著关联(P<0.05),TT基因型个体产羔数显著高于CC基因型个体;SPP1基因g.36651870T>C位点多态性与小尾寒羊不同胎次产羔数之间无显著关联(P>0.05)。综上,PLCB3基因g.41871219T>C位点对小尾寒羊产羔数性状选育具有一定的参考意义,SPP1基因g.36651870T>C位点不适用于小尾寒羊产羔数性状选育。 展开更多
关键词 绵羊 spp1基因 PLCB3基因 产羔数 SNP分型
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spp1基因在肺癌组织中表达的定量检测及其意义 被引量:2
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作者 曹惠芳 满晓波 +6 位作者 蒋虹 徐志飞 唐亮 邱秀华 谈冶雄 吴孟超 王红阳 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 2003年第2期119-121,共3页
目的 :探讨定量检测骨桥蛋白编码基因在原发性肺癌中的表达及其意义。方法 :制备 2 4例肺癌患者癌及癌周正常肺组织中总RNA ,采用RT PCR及实时荧光定量PCR技术分析spp1基因的mRNA表达水平。 结果 :在所有 2 4例肺癌中肺癌组织的骨桥蛋... 目的 :探讨定量检测骨桥蛋白编码基因在原发性肺癌中的表达及其意义。方法 :制备 2 4例肺癌患者癌及癌周正常肺组织中总RNA ,采用RT PCR及实时荧光定量PCR技术分析spp1基因的mRNA表达水平。 结果 :在所有 2 4例肺癌中肺癌组织的骨桥蛋白表达高于相邻的癌周正常肺组织 ,并且全部在 6倍以上 ,其中 7例在 10 0倍以上。结论 :肺癌组织中骨桥蛋白的表达明显升高 ,是肺癌诊断的重要标志物。 展开更多
关键词 spp1基因 肺癌组织 表达 定量检测
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Mdx小鼠骨骼肌纤维化及Spp1基因表达 被引量:1
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作者 陈雪晓 王雪 +6 位作者 宋学琴 吴红然 崔红颖 要萌萌 陈秀晓 张亚 侯志刚 《脑与神经疾病杂志》 2016年第9期578-582,共5页
目的通过观察Duchenne型肌营养不良的模型鼠mdx小鼠骨骼肌中纤维化情况,研究Spp1基因在mdx小鼠及其对照鼠中不同时期的表达,探讨在mdx小鼠中Spp1与肌纤维化的关系。方法选取雄性C57BL/10Sc Sn-Dmdmdx/JNju鼠为实验组,雄性C57BL/6Sc Sn... 目的通过观察Duchenne型肌营养不良的模型鼠mdx小鼠骨骼肌中纤维化情况,研究Spp1基因在mdx小鼠及其对照鼠中不同时期的表达,探讨在mdx小鼠中Spp1与肌纤维化的关系。方法选取雄性C57BL/10Sc Sn-Dmdmdx/JNju鼠为实验组,雄性C57BL/6Sc Sn小鼠为对照组,根据年龄分为2w组、4w组、8w组、12w组。每组选取6只,3只用于冰冻切片的苏木精-伊红染色及马松(masson)染色,3只用于基因芯片及q RT-PCR。结果 2w及4w时mdx小鼠无明显结缔组织增生,8w时,mdx小鼠可见轻度结缔组织增生;12w时,mdx小鼠结缔组织增生程度较8w稍加重,仍为小片状区域的纤维化,对照组小鼠不同时期均未见纤维化;mdx小鼠2w与12w股四头肌基因芯片表达谱对比,其中Spp1基因在mdx小鼠2w与12w相比fold-change值为-15.1354,变化明显;Spp1在mdx小鼠股四头肌不同时期表达量比较:8w组较4w组明显升高,12w组较8w组表达量下降,但仍高于4w组,8w组与12w组Spp1表达量较同期对照组明显升高,差异具有统计学意义。结论 mdx小鼠早期(2w^4w)肌纤维化表现不明显,8w时骨骼肌内可见少量结缔组织增生,随后缓慢进展。2 Spp1基因在mdx小鼠成熟期(8w^12w)表达量明显增加,推测其在mdx小鼠肌纤维化中发挥一定作用。 展开更多
关键词 DUCHENNE型肌营养不良 骨骼肌纤维化 spp1基因 mdx小鼠 基因芯片
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江西汉族人群SPP1基因SNPs与鼻咽癌易感性的关系
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作者 彭宽 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第S01期222-225,共4页
目的检测分泌磷酸蛋白1(SPP1)基因在江西汉族鼻咽癌病例/对照样本中的频率分布,用χ2检验分析SPP1基因单核苷酸多态性(SNP)与鼻咽癌发病的相关性。方法采用多重单碱基延伸分子生物学技术,检测SPP1基因在江西汉族鼻咽癌病例/对照样本中... 目的检测分泌磷酸蛋白1(SPP1)基因在江西汉族鼻咽癌病例/对照样本中的频率分布,用χ2检验分析SPP1基因单核苷酸多态性(SNP)与鼻咽癌发病的相关性。方法采用多重单碱基延伸分子生物学技术,检测SPP1基因在江西汉族鼻咽癌病例/对照样本中的频率分布,用χ2检验分析这些SNPs与鼻咽癌发病的相关性。结果SSP1基因的rs1126772位点(G为低频等位基因)与鼻咽癌的易感性存在显著关联。显性模型χ2=4.192,P=0.041,与健康对照组相比具有显著差异。杂合子AG基因型为鼻咽癌的保护性因素,AG携带者可以降低鼻咽癌易感性。其余3个位点与鼻咽癌易感性无显著相关性。3个位点rs11730582、rs2853750、rs11728697可形成单倍型,在鼻咽癌疾病组和健康对照组之间分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论在SPP1基因中,携带了AG基因型的江西汉族世居人群可降低鼻咽癌的易感性。 展开更多
关键词 鼻咽癌 spp1基因 单核苷酸多态性
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