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基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征
1
作者
吴日宝
陈良颢
+1 位作者
景子涵
邹春林
《广西医科大学学报》
CAS
2023年第4期624-630,共7页
目的:基于单细胞RNA测序探究人正常肾脏中SOX9阳性祖细胞的转录组特征,为肾脏再生医学研究提供依据。方法:从GEO数据库中收集已发表的人类正常肾脏的单细胞RNA测序数据,结合差异基因分析、功能富集分析和拟时序分析探究SOX9阳性祖细胞...
目的:基于单细胞RNA测序探究人正常肾脏中SOX9阳性祖细胞的转录组特征,为肾脏再生医学研究提供依据。方法:从GEO数据库中收集已发表的人类正常肾脏的单细胞RNA测序数据,结合差异基因分析、功能富集分析和拟时序分析探究SOX9阳性祖细胞的转录组特征,通过免疫组化实验和免疫荧光实验验证相关分析结果。结果:在人正常肾脏组织中,SOX9阳性细胞主要存在于近端小管中;GO分析结果显示,近端小管中的SOX9阳性细胞仍维持祖细胞样特性;进一步的亚群分析显示,近端小管SOX9阳性细胞可分为C1、C2和C33个亚群,其中C2亚群高表达SOX4、HES1、MYC、KLF4等与干细胞状态维持的相关基因,并在SOX9阳性细胞分化轨迹中处于起始位置。结论:人正常肾脏SOX9阳性细胞中仍有一部分细胞维持祖细胞样特性,具有潜在的再生医学研究价值。
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关键词
单细胞RNA测序
肾脏
sox
9
阳性祖细胞
再生医学
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职称材料
题名
基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征
1
作者
吴日宝
陈良颢
景子涵
邹春林
机构
广西医科大学基础医学院转化医学研究中心“长寿与老年相关疾病”教育部重点实验室、神经科学研究所“广西脑科学研究”重点实验室
广西医科大学第一临床医学院
广西医科大学肿瘤医学院
广西医科大学再生医学与医用生物资源开发应用省部共建协同创新中心广西再生医学重点实验室
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2023年第4期624-630,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81971191,No.81670750)
山东省自然科学基金资助项目(No.ZR2019ZD39)
大学生创新训练项目(No.202210598010,No.202210598033)。
文摘
目的:基于单细胞RNA测序探究人正常肾脏中SOX9阳性祖细胞的转录组特征,为肾脏再生医学研究提供依据。方法:从GEO数据库中收集已发表的人类正常肾脏的单细胞RNA测序数据,结合差异基因分析、功能富集分析和拟时序分析探究SOX9阳性祖细胞的转录组特征,通过免疫组化实验和免疫荧光实验验证相关分析结果。结果:在人正常肾脏组织中,SOX9阳性细胞主要存在于近端小管中;GO分析结果显示,近端小管中的SOX9阳性细胞仍维持祖细胞样特性;进一步的亚群分析显示,近端小管SOX9阳性细胞可分为C1、C2和C33个亚群,其中C2亚群高表达SOX4、HES1、MYC、KLF4等与干细胞状态维持的相关基因,并在SOX9阳性细胞分化轨迹中处于起始位置。结论:人正常肾脏SOX9阳性细胞中仍有一部分细胞维持祖细胞样特性,具有潜在的再生医学研究价值。
关键词
单细胞RNA测序
肾脏
sox
9
阳性祖细胞
再生医学
Keywords
single-
cell
RNA
sequencing
kidney
sox
9
-
positive
progenitor
cells
regenerative
medicine
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征
吴日宝
陈良颢
景子涵
邹春林
《广西医科大学学报》
CAS
2023
0
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参考文献
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