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SOCS基因家族在肝细胞癌中的表达及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
卜文超
曾宪智
+4 位作者
关云茜
谢思源
陈世新
汤挺兵
曹明国
《山东第一医科大学（山东省医学科学院）学报》
CAS
2022年第10期740-747,共8页
目的基于高通量生物信息学方法系统分析细胞因子信号抑制物(suppressor of cytokine signaling,SOCS)基因家族在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展中的作用机制。方法使用Oncomine、UNLCAN、cBioPortal、Kaplan-Meier p...
目的基于高通量生物信息学方法系统分析细胞因子信号抑制物(suppressor of cytokine signaling,SOCS)基因家族在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展中的作用机制。方法使用Oncomine、UNLCAN、cBioPortal、Kaplan-Meier plotter、David等多个在线数据库对SOCS家族分子在肝癌细胞中的表达差异、临床病理特征、生存分析、基因突变、生物学功能方面进行综合分析。String在线数据库用于构建SOCS家族基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果大部分SOCS家族基因在HCC中存在表达差异,SOCS5和SOCS7表达显著上调(P<0.05),而SOCS2、SOCS3、SOCS6、CISH表达下调(P<0.05)。该家族基因SOCS1、SOCS2、SOCS4、SOCS5、SOCS7、SOCS8与预后相关(P<0.05)。SOCSs家族成员在HCC患者中的基因改变形式主要包括扩增、突变和多重基因等类型。在HCC与SOCS家族相关的生物学过程主要富集在Jak-STAT、炎症反应等方面。结论SOCS基因家族大部分成员在HCC中差异表达,可能是治疗肝细胞癌潜在的新靶点。
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关键词
肝细胞癌
socs
家族
生物信息学
下载PDF
职称材料
细胞因子信号阻抑蛋白SOCS家族
被引量：
2
2
作者
谢漪
张红
郝冀芳
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2009年第3期274-277,共4页
大量实验研究和临床观察资料证明，SOCS蛋白与细胞信号转导和多种重要疾病的发生发展有着密切的关系。同时随着对JAK／STAT通路和单个SOCS蛋白功能研究的深入，SOCS蛋白在辐射导致细胞周期阻滞信号传导以及与细胞DNA损伤和修复机制相关...
大量实验研究和临床观察资料证明，SOCS蛋白与细胞信号转导和多种重要疾病的发生发展有着密切的关系。同时随着对JAK／STAT通路和单个SOCS蛋白功能研究的深入，SOCS蛋白在辐射导致细胞周期阻滞信号传导以及与细胞DNA损伤和修复机制相关作用机理将成为未来的研究方向之一。近年来随着重离子治癌临床应用的展开，重离子对细胞辐射损伤和修复信号转导可能与SOCS蛋白相关的研究对于重离子的安全应用提供了理论和实验依据。
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关键词
socs
蛋白家族
细胞信号传导
原文传递
题名
SOCS基因家族在肝细胞癌中的表达及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
卜文超
曾宪智
关云茜
谢思源
陈世新
汤挺兵
曹明国
机构
丽水学院医学院
出处
《山东第一医科大学（山东省医学科学院）学报》
CAS
2022年第10期740-747,共8页
文摘
目的基于高通量生物信息学方法系统分析细胞因子信号抑制物(suppressor of cytokine signaling,SOCS)基因家族在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展中的作用机制。方法使用Oncomine、UNLCAN、cBioPortal、Kaplan-Meier plotter、David等多个在线数据库对SOCS家族分子在肝癌细胞中的表达差异、临床病理特征、生存分析、基因突变、生物学功能方面进行综合分析。String在线数据库用于构建SOCS家族基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果大部分SOCS家族基因在HCC中存在表达差异,SOCS5和SOCS7表达显著上调(P<0.05),而SOCS2、SOCS3、SOCS6、CISH表达下调(P<0.05)。该家族基因SOCS1、SOCS2、SOCS4、SOCS5、SOCS7、SOCS8与预后相关(P<0.05)。SOCSs家族成员在HCC患者中的基因改变形式主要包括扩增、突变和多重基因等类型。在HCC与SOCS家族相关的生物学过程主要富集在Jak-STAT、炎症反应等方面。结论SOCS基因家族大部分成员在HCC中差异表达,可能是治疗肝细胞癌潜在的新靶点。
关键词
肝细胞癌
socs
家族
生物信息学
Keywords
hepatocellular
carcinoma
socs
family
bioinformatics
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [医药卫生—临床医学]
下载PDF
职称材料
题名
细胞因子信号阻抑蛋白SOCS家族
被引量：
2
2
作者
谢漪
张红
郝冀芳
机构
中国科学院近代物理研究所
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2009年第3期274-277,共4页
基金
国家自然科学基金重点项目（No.10835011）,国家自然科学基金面上项目（No.10675151）,甘肃省2007年重大专项（No.0702NKDA045）,甘肃省2008年重大专项（No.0801NKDA001）,兰州市科技攻关项目（No.07-2-07）.
文摘
大量实验研究和临床观察资料证明，SOCS蛋白与细胞信号转导和多种重要疾病的发生发展有着密切的关系。同时随着对JAK／STAT通路和单个SOCS蛋白功能研究的深入，SOCS蛋白在辐射导致细胞周期阻滞信号传导以及与细胞DNA损伤和修复机制相关作用机理将成为未来的研究方向之一。近年来随着重离子治癌临床应用的展开，重离子对细胞辐射损伤和修复信号转导可能与SOCS蛋白相关的研究对于重离子的安全应用提供了理论和实验依据。
关键词
socs
蛋白家族
细胞信号传导
Keywords
socs
protein
family
cellular
signaling
transduction
分类号
Q26 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SOCS基因家族在肝细胞癌中的表达及生物信息学分析
卜文超
曾宪智
关云茜
谢思源
陈世新
汤挺兵
曹明国
《山东第一医科大学（山东省医学科学院）学报》
CAS
2022
1
下载PDF
职称材料
2
细胞因子信号阻抑蛋白SOCS家族
谢漪
张红
郝冀芳
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2009
2
原文传递
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